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串联质谱技术已经广泛的用于分析混合物和分子结构鉴定，其过程的完成至少需要经过3个质量分离器串联而成，所以在大型质质谱仪应用串联质谱技术成本会较高，而且操作比较复杂，从而限制了该技术的应用，但随着离子阱质谱的出现，解决了这一难题。利用其可实现时间串联的特点，即串联质谱的每个阶段在不同时间段进行，使用一个离子阱质量分离装置就可以完成串联质谱分析，甚至可以进行多级质谱分析。这样不仅使串联质谱分析的成本降低，还使该分析的操作变得十分容易。
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