pubmed生物医学信息资源及其检索

医学信息检索,PubMed主要内容,PubMed概况 PubMed数据来源PubMed检索机制PubMed检索运算符PubMed检索方法结果的显示、保存其他辅助功能,PubMed概况,创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1997年6月开始向全球开放特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及收录文献数量不同。,PubMed数据来源,MEDLINE： pubmed-indexed for medlineIn Process Citations：每天收录，尚未经规范处理的数据。pubmed-in processPublisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有PubMed-as supplied by Publisher。,自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表(MeSH Translation Table)、期刊刊名表(Journal Translation Table)、短语表(Phrase list)、作者索引(Author Index)。如果在以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词，则用单个词在所有字段查找，各个词之间也是AND逻辑关系。,PubMed检索机制,短语检索(Phrase Searching)也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。,PubMed检索机制,PubMed检索运算符,逻辑运算符：逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT。当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从左至右，括号可以改变运算顺序。截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符，chem*表示用词根进行检索。双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。检索字段标识符：tag，tag为字段名称。 ti，au，ta， la，pt。,常用字段组成,标识符 字段名称 中文释义TI Title 题目AU Author 作者AD Affiliation 作者单位AB Abstract 文摘DP Publication Date 出版日期TA Journal Title Abbreviation 刊名缩写MH MeSH Terms 主题词PT Publication Type 出版类型,/pubmed/,PubMed 网址,高级检索,主题检索,期刊检索,文献匹配,临床咨询,特定主题咨询,PubMed检索方法,基本检索高级检索主题检索辅助检索,基本检索,默认检索字段为主题、作者、期刊,关键词、词(词组)或短语： 输入任意关键词：liver cancer、Lung cancer； 带有双引号” ”作为短语检索：”cancer therapy”； 带有连接号”-”作为一个词组检索：interleukin-6。限制检索字段：如liver cancerti作者：Smith J 、 Smithau2002年以后的文献如果作者有全称，可用全称,基本检索,期刊刊名： 可用期刊全称：GENE THERAPYTA； 可用期刊简称：JAMATA；(The Journal of the American Medical Association) 刊名中含有特殊字符，如、&等，要去掉： 如J HAND SURGAM 输入时要写成J HAND SURG AM 截词：chemo*复杂表达式：liver cancer AND therapy带有摘要文献的检索 ：liver cancer AND hasabstract,基本检索,分析该检索课题，包含两个方面： 肝癌：liver cancer；治疗：therapy两个主题之间的逻辑关系是AND，即liver cancer AND therapy,基本检索举例1：肝癌的治疗,分析该检索课题，包含两个方面： 作者为：马大龙（ma dl）；作者单位为： 北京大学（peking universityad）。,基本检索举例2：北京大学医学部马大龙教授发表的文献,得到了两个检索结果：作者为：马大龙（ma dl）的检索结果作者单位为：北京大学（peking universityad）的检索结果利用检索史把这两个检索结果用AND组合起来,基本检索举例2：北京大学医学部马大龙教授发表的文献,高级检索,限制检索或条件检索：Limit (1) 全文、摘要 (2)动物、人类 (3)文献类型 (4)语种 (5)数据库子集的限定 (6)年龄组,分析该课题：主题为肝癌治疗，即liver cancer and therapy限制条件有两个：语种为英文（English）；文献类型为综述（Review）,高级检索举例：原文为英文的肝癌治疗方面的综述文献,主题检索,medline数据主题标引规范，用主题词检索，可以提高查全率、查准率,点击MeSH Database打开主题检索界面,主题检索,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,该检索课题有两个概念：长春新碱（Vincristine ） 、白血病（leukemia）长春新碱治疗疾病，组配副主题词治疗应用（therapeutic use）白血病药物治疗，组配副主题词药物疗法（drug therapy）这两个概念之间是AND的关系,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第1步：检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第1步：检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第1步：检索长春新碱/治疗应用,副主题词,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第1步：检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第1步：检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第1步：检索长春新碱/治疗应用,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第2步：检索白血病/药物疗法,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第2步：检索白血病/药物疗法,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第2步：检索白血病/药物疗法,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第2步：检索白血病/药物疗法,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第2步：检索白血病/药物疗法,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,第2步：检索白血病/药物疗法,通过两个主题检索得到：“长春新碱/治疗应用” 的检索结果“白血病/药物疗法” 的检索结果两个检索结果用AND组合起来，需要用到检索史,主题检索举例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献,文献匹配器临床咨询和系统评价,辅助检索,文献匹配器,系统提供有两种用来查找特定文献的方式：单篇文献匹配器（Single Citation Matcher）和多篇文献匹配器（Batch Citation Matcher）。如果要查找某一篇文献，点击单篇引文匹配器，输入刊名、日期、卷、期、页码、作者、题目中的一项或多项内容进行检索，系统返回文献记录结果。如果要同时查找多篇文献，则点击多篇引文匹配器，然后在输入框内分行输入每篇文献的查询项目。其中刊名为必需项，其他项目没有时可省略。,单篇文献匹配器（Single Citation Matcher）,多篇文献匹配器（Batch Citation Matcher）,输入格式,临床咨询和系统评价,用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献，如临床疾病的诊断、治疗、病因和预后等；检索临床实践过程中的问题，如系统综述、多元分析、临床试验、循证医学、实践指导、遗传学方面。,临床咨询和系统评价,临床咨询,临床咨询和系统评价,系统评价,PubMed Clinical Queries临床咨询,Directory of Topic-Specific PubMed Queries PUBMED学科、专题数据库/bsd/special_queries.html,Clinical Queries using Research Methodology Filters 临床研究方法,Clinical Queries using Research Methodology Filters临床研究方法的检索/entrez/query/static/clinicaltable.html,Summary of Enhancements for Clinical Queries for MEDLINE for Studies MEDLINE数据库如何强化临床信息检索功能？/pubs/techbull/jf04/cq_info.html,NLM Resources for Informing Comparative Effectiveness医学科研信息检索/nichsr/cer/cerqueries.html#pubmed,/sites/myncbi/recentactivity/PUBMED上检索当天全球医学科研活动,科学网许培扬博客/home.php?mod=space&uid=280034&do=blog&view=me&from=space,PUBMED数据库高效科研信息的检索方法 /home.php?mod=space&uid=280034&do=blog&quickforward=1&id=417271,医学语义智能检索平台/v2/search?s=r&query=Genome-sequencing&so_a=&so_j=,全球语言翻译支持,全文链接 BioMed Central PubMed Pubget,结果的显示、保存,显示保存,结果的显示,显示格式：系统提供的显示格式很多，一般较常用的有以下3种：（1）Summary：为默认显示格式。显示的信息包括文献的标题、著者、出处、PMID、综述出版类型、非英文文献的原文语种等。（2）Abstract：显示信息除了文献标题、著者、出处等基本信息外，还包括摘要信息，以便用户了解文献详细内容。,（3）MEDLINE：以MEDLINE数据库的记录格式来显示检索结果。字段内容主要包括PMID、题目、摘要、作者、作者地址、语种、出版类型、出处、MeSH、文献ID、出版状态等。,结果