生物化学名词解释

精品文档 1欢迎下载 生物化学名词解释 第一章蛋白质的结构与功能 1 肽键 一分子氨基酸的氨基和另一分子氨基酸的羧基通过脱去水分子后所形成的酰胺 键 称为肽键 2 等电点 在某一 pH 溶液中 氨基酸或蛋白质解离成阳离子和阴离子的趋势或程度相 等 成为兼性离子 成点中性 此时溶液的 pH 称为该氨基酸或蛋白质的等 电点 3 模体 在蛋白质分子中 由两个或两个以上具有二级结构的肽段在空间上相互接近 形成一个特殊的空间构象 并发挥特殊的功能 称为模体 4 结构域 分子量较大的蛋白质三级结构常可分割成多个结构紧密的区域 并行使特定 的功能 这些区域被称为结构域 5 亚基 在蛋白质四级结构中每条肽链所形成的完整三级结构 6 肽单元 在多肽分子中 参与肽键的 4 个原子及其两侧的碳原子位于同一个平面内 称为肽单元 7 蛋白质变性 在某些理化因素影响下 蛋白质的空间构象破坏 从而改变蛋白质的理 化性质和生物学活性 称之为蛋白质变性 第二章核酸的结构与功能 1 DNA 变性 在某些理化因素作用下 DNA 分子稳定的双螺旋空间构象破环 双链解 链变成两条单链 但其一级结构仍完整的现象称 DNA 变性 2 Tm 即溶解温度 或解链温度 是指核酸在加热变性时 紫外吸收值达到最大值 50 时的温度 在 Tm时 核酸分子 50 的双螺旋结构被破坏 3 增色效应 核酸加热变性时 由于大量碱基暴露 使 260nm 处紫外吸收增加的现 象 称之为增色效应 精品文档 2欢迎下载 4 HnRNA 核内不均一 RNA 在细胞核内合成的 mRNA 初级产物比成熟的 mRNA 分子 大得多 称为核内不均一 RNA hnRNA 在细胞核内存在时间极短 经过剪 切成为成熟的 mRNA 并依靠特殊的机制转移到细胞质中 5 核酶 也称为催化性 RNA 一些 RNA 具有催化能力 可以催化自我拼接等反应 这 种具有催化作用的 RNA 分子叫做核酶 6 核酸分子杂交 不同来源但具有互补序列的核酸分子按碱基互补配对原则 在适宜条 件下形成杂化双链 这种现象称核酸分子杂交 第三章酶 1 酶 由活细胞产生的具有催化功能的一类特殊的蛋白质 2 酶的活性中心与必需基团 与酶的活性密切相关的必需基团在空间结构上彼此靠近组 成具有特定空间结构的区域 能与底物特异地结合并将底 物转化为产物 这一区域称为酶的活性中心 必需基团是 指酶分子中存在的各种化学基团并不一定都与酶的活性 相关 其中那些与酶活性密切相关的基团称为酶的必需基 团 3 酶原与酶原的激活 有些酶在细胞内初合成或初分泌时只是酶的无活性前体 必须在 一定条件下 这些酶的前体水解一个或几个特定的肽键 致使构 象发生改变 表现出酶的活性 这种无活性酶的前体称做酶原 酶原向酶的转化过程称为酶原的激活 实际上就是酶的活性中心 的形成或暴露的过程 4 同工酶 具有相同催化作用 但酶分子结构 理化性质和免疫学性质不同的一类酶 5 Km值 米氏常数 单底物反应中酶与底物可逆地生成中间产物和中间产物转化为产 物这三个反应的速度常数的综合 是酶的特征性常数之一 其值等于反应速 度为最大速度一半时的底物浓度 精品文档 3欢迎下载 第四章糖代谢 1 糖酵解 在缺氧情况下葡萄糖或糖原分解成乳酸的过程 2 活性葡萄糖 1 磷酸葡萄糖与 UTP 作用形成的 UDPG 为活性葡萄糖 在体内作为葡萄 糖供体 3 血糖 血液中的葡萄糖称为血糖 正常人空腹血糖浓度为 3 9 6 1mmol L 4 糖异生 是指非糖物质如氨基酸 乳酸及甘油等转变为葡萄糖或糖原的过程 5 三羧酸循环 乙酰 CoA 与草酰乙酸生成柠檬酸 在经过一系列反应又生成草酰乙 酸 同时产生 NADH H FADH2 GTP CO2 H2O 6 巴斯德效应 糖的有氧氧化抑制生醇发酵及糖酵解的现象 7 乳酸循环 肌糖原酵解产生的乳酸经血液运至肝经糖异生合成肝糖原或葡萄糖 以补 充血糖 血糖又可供肌肉利用 此过程即称乳酸循环 Cori 循环 8 底物水平磷酸化 直接将代谢物分子中的能量转移至 ADP 或 GDP 产生 ATP 或 GTP 的过程 称为底物水平磷酸化 第五章脂类代谢 1 载脂蛋白 血浆脂蛋白中的蛋白质部分称载脂蛋白 在血浆中起运载脂质的作用 还 能识别脂蛋白受体 调节血浆脂蛋白代谢酶的活性 2 脂肪动员 储存在脂肪细胞中的脂肪 被脂肪酶逐步水解为游离脂肪酸及甘油并释放 入血以供其他组织氧化利用 该过程称为脂肪动员 3 脂酸的 氧化 脂肪酸在体内的氧化分解是从脂肪酸羧基端的 碳原子开始 每次 断裂两个碳原子 整个过程叫做 氧化 4 血浆脂蛋白 血浆中的脂类与蛋白质结合成脂蛋白的形式在血液中运输 5 酮体 乙酰乙酸 羟丁酸及丙酮三者统称酮体 酮体是脂肪酸在肝脏氧化分解时产 生的特有的中间代谢产物 精品文档 4欢迎下载 6 ACAT 脂酰 CoA 胆固醇脂酰转移酶 分布于细胞内质网 能将脂酰 CoA 上的脂酰基 转移至游离胆固醇的 3 位羟基上 使胆固醇酯化 7 LCAT 卵磷脂胆固醇脂酰基转移酶 可催化将卵磷脂的 2 位脂酰基转移至胆固醇 3 位 羟基 生成溶血卵磷脂及胆固醇脂的反应 8 柠檬酸 丙酮酸循环 是将线粒体内的乙酰 CoA 带到胞液中以合成脂肪酸或胆固醇的 途径 在此循环中 乙酰 CoA 首先在线粒体内与草酰乙酸缩合 生成柠檬酸 柠檬酸通过线粒体内膜上的载体转运进入胞液 胞液中柠檬酸裂解酶催化柠檬酸裂解释放出乙酰 CoA 和草酰乙 酸 乙酰 CoA 即被带到胞液中 草酰乙酸则还原成苹果酸 通 过线粒体内膜的载体回到线粒体内 苹果酸也可在苹果酸酶作 用下 分解为丙酮酸进入线粒体 最终均形成线粒体内的草酰 乙酸 再参与转运乙酰 CoA 第六章生物氧化 1 磷酸甘油穿梭 是将胞液中的 NADH 携带的 2 个 H 转移进入线粒体的一种方式 因该系统中有 磷酸甘油 故名 磷酸甘油穿梭 2 苹果酸 天冬氨酸穿梭 是胞液中的 NADH 携带的 2 个 H 转移进入线粒体的一种方式 因该系统中有苹果酸和天冬氨酸 故名苹果酸 天冬氨酸穿梭 3 呼吸链 代谢物脱下的成对氢离子通过线粒体内膜上一系列按一定顺序排列的酶和辅 基的催化 最终与氧结合生成水 这些酶和辅基组成的反应链称为呼吸链 4 生物氧化 物质在生物体内进行氧化分解的过程称为生物氧化 它主要是指糖 脂 肪 蛋白质等在体内分解时逐步释放能量 最终生成 CO2和 H2O 的过程 5 氧化磷酸化 代谢物脱下 2 个 H 在呼吸链传递过程中偶联 ADP 磷酸化并生成 ATP 的过 程 称为氧化磷酸化 是体内产生 ATP 的主要方式 精品文档 5欢迎下载 第七章氨基酸代谢 1 营养必需氨基酸 指机体不能自身合成必须由食物供应的氨基酸 2 谷氨酰基循环 是氨基酸吸收的一个重要途径 其反应过程首先由谷胱甘肽对氨 基酸的转运 然后是谷胱甘肽的再生 由此构成一个循环 3 转氨基作用 指在转氨酶的作用下 一对 氨基酸与一对 酮酸之间的相互转变 转氨 基作用既是氨基酸的分解代谢过程 也是体内某些非必需氨基酸合成的 重要途径 4 联合脱氨基作用 联合脱氨基作用是肝 肾 脑等组织中的一种重要的脱氨基方式 这种脱氨基作用由转氨酶催化的转氨基作用与 L 谷氨酸脱氢酶催 化的谷氨酸氧化脱氨基作用联合进行 5 一碳单位 某些氨基酸在分解代谢过程中产生的含有一个碳原子的基团称一碳单位 CO2 除外 6 活性甲硫氨酸 也称 S 腺苷甲硫氨酸 SAM 有甲硫氨酸与 ATP 作用 甲硫氨酸腺 苷转移酶催化生成 活性甲硫氨酸可作为甲基的直接供体提供甲基 使其他物质甲基化 第八章核苷酸代谢 1 核苷酸从头合成途径 利用磷酸核糖 氨基酸 一碳单位和 CO 等非碱基的小分子化 合物为原料 经过一系列复杂的酶促反应合成单核苷酸的过程 2 核苷酸抗代谢物 指某些嘌呤 嘧啶 叶酸及氨基酸类似物具有通过竞争性抑制方式 干扰或阻断核苷酸的正常合成代谢 从而进一步抑制核酸 蛋白质 的 合成以及细胞增殖的作用 这些物质即为核苷酸抗代谢物 3 核苷酸补救合成途径 机体细胞利用已有碱基 核苷为原料合成单核苷酸的过程 精品文档 6欢迎下载 第九章物质代谢的联系与调节 1 变构调节 当某些物质与酶的非催化部分以非公价键形式结合后 可改变酶蛋白分子 的构象 进而改变酶的活性 这种调节方式称为变构调节 2 化学修饰 酶蛋白肽链上某些氨基酸残基在酶的催化下发生可逆的共价修饰从而引起 酶活性的改变 3 限速酶 指整个代谢过程中 催化反应速度最慢的酶 它不仅可影响整个代谢途径的 总速度 而且还可改变代谢方向 是代谢途径的关键酶或调节酶 第十章DNA 的生物合成 1 DNA 半保留复制 以两条 DNA 单链为模板 dNTP 为原料 在 DNA 聚合酶等催化 下 按照碱基互补原则合成子代 DNA 的过程 子代 DNA 双链中的 一条链来自母链 模版 另一条互补 DNA 链是新合成的 故称半 保留复制 2 冈崎片段 DNA 复制过程中 以 5 3 方向 DNA 单链为模版 指导合成的随从链中有 许多不连续的片段 该现象是日本科学家冈崎发现的 故称为冈崎片段 3 领头链和随从链 复制时 DNA 双链解开各自作为模板 其中一条子链的复制方向 与解链方向一致 可以连续进行合成 此链称为领头链 双链 DNA 复制时 其中一条子链的合成方向与解链方向相反 不能连 续进行 需待模板解开一段再复制一段 称此链为随从链 4 DNA 的切除修复 是细胞内最重要和有效的修复方式 其过程包括去除损伤的 DNA 填补空隙和连接 需要特异的核酸内切酶 DNA 聚合酶及 DNA 连 接酶完成 5 DNA 的重组修复 用于损伤面积太大又不能及时修复的 由错误的模板复制的子链 带有错误甚至缺口 重组蛋白 RecA 将另一股健康的母链与缺口部 分进行交换 以填补缺口 不断复制后其比例就越来越低 把损伤 精品文档 7欢迎下载 链稀释掉 6 Klenow 片段 是大肠杆菌 DNA pol 经特殊蛋白酶水解后得到的大片段 具有 DNA 聚合酶活性和 3 5 核酸外切酶活性 是分子生物学研究中常用的工具 酶 7 逆转录 以单链 RNA 为模板 dNTP 为原料 在逆转录酶的催化下 合成双链 DNA 的 反应 8 逆转录酶 是催化以 RNA 为模板合成双链 DNA 的酶 全称依赖 RNA 的 DNA 聚合酶 具有 RNA 或 DNA 作模板的聚合活性和 RNA 酶活性 第十一章RNA 的生物合成 1 模板链 转录时 转录单位的 DNA 双链中仅有一条链作为转录的模板 称为转录的 模板链 而另一条链无转录功能 2 编码链 转录时 转录单位的 DNA 双链中有一条不作为转录的模板 无转录功能 但此链的走行方向和碱基排列顺序与转录生成的 RNA 链基本相同 只是 DNA 中的碱基 T 在 RNA 中为 U 所以称此链为编码链 3 不对称转录 以 DNA 为模板合成 RNA 的过程叫转录 转录时只能以 DNA 双链中一条 链为模板进行转录 而另一条链无转录功能 另外 DNA 双链的多个 基因进行转录的模板并不总在同一条 DNA 链上 故称之为不对称转录 4 转录单位 转录是不连续 分区段进行的 每一转录区段可视为一个转录单位 包括 结构基因及其上游和下游的调控序列 原核生物的转录单位又叫操纵子 5 内含子 隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列 6 外显子 在断裂基因及其初级转录产物上出现 并表达为成熟 RNA 的核酸序列 7 RNA 编辑 某些 RNA 特别是 mRNA 转录后还需插入 删除和取代某些核苷酸残 基 使遗传信息在转录水平发生改变 从而扩大原有 DNA 模板的信息 量 称为 RNA 编辑 通常是点突变形式 精品文档 8欢迎下载 第十二章 蛋白质的生物合成 1 摆动配对 mRNA 上的密码子与 tRNA 上的反密码子相互辨认 大多数情况是遵从碱 基配对规律的 但密码子的第三位与反密码子的第一位碱基之间常出现不 严格的配对 这种现象称为摆动配对 2 开放阅读框 ORF 从 mRNA5 端起始密码子 AUG 至 3 端终止密码子之间的核苷酸 序列 各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链 称为开 放阅读框 3 密码子与反密码子 在 mRNA 的编码区 每 3 个相邻的核苷酸可代表氨基酸的种 类 翻译起始和终止信号 这 3 个连续的核苷酸称为密码子 所 有的密码子统称为遗传密码 在 tRNA 上存在能与 mRNA 密码子 相互补的 3 个核苷酸 称为反密码子 携带某种氨基酸的 tRNA 只能识别相应的 mRNA 上的密码子 4 SD 序列 在原核生物 mRNA 起始密码 AUG 的上游 相距 8 13 个核苷酸处 有一段 由 4 6 个富含嘌呤的序列 以 AGGA 为核心 是 S Dalgarno 发现 故名 SD 序列 又因原核生物核蛋白体小亚基上的 16SrRNA 近 3 末端有一段 UCCU 序列互补 这与翻译起始识别有关 所以 mRNA 上的 SD 序列也称核蛋白体 结合位点 RBS 第十三章 基因的表达调控 1 基因表达 遗传信息从 DNA 传递 RNA 再以 mRNA 为模板翻译成蛋白质的过程称为 基因的表达 2 顺式作用元件 指可影响自身基因表达活性的真核 DNA 序列 根据顺式作用元件在 基因中的位置 转录激活作用的性质及发挥作用的方式 可将其分为 精品文档 9欢迎下载 启动子 增强子和沉默子 3 反式作用因子 为一类细胞核内蛋白质因子 主要功能是使基因开放或关闭 通过与 特异的顺式作用元件相互作用 反式激活另一基因的转录 故称反式 作用因子 4 启动子 位于 DNA 双链上与 RNA 聚合酶识别 结合和开始转录有关的一段特殊序 列 包括转录识别部位 结合部位和起始部位 5 操纵子 原核生物绝大多数基因按功能相关性成簇地串联排列 连同其前面的操纵区 及调节序列共同组成的转录单位 第十四章 基因工程与基因重组 1 DNA 克隆 DNA 克隆又称基因克隆 分子克隆或重组 DNA 就是应用酶学的方法 在体外将目的基因与载体 DNA 结合成一具有自我复制能力的 DNA 分子 复制子 继而经过转化或转染宿主细胞 筛选出含目的基因的转化子细胞 再进行扩增 提取获得同一 DNA 分子的过程 2 质粒 是指存在于细胞染色体外的小型环状 DNA 分子 质粒是常用的基因载体 具 有在宿主细胞体内自我复制的特性 3 聚合酶链反应 PCR 是在反应体系中加入模板 DNA dNTP 特别设计的引物及耐 热的 DNA 聚合酶 经多次变性 退火 延伸循环反应 使目的 DNA 约 呈指数形式合成的过程 4 限制性核酸内切酶 指能够识别 DNA 的特异序列 并在识别位点或其周围切割双链 DNA 的一类内切酶 基因重组中常用的限制性内切酶是 类酶 5 基因载体 为携带外源 DNA 实现外源 DNA 的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用 的一些 DNA 分子 第十六章 血液的生物化学 精品文档 10欢迎下载 1 非蛋白氮 NPN 指血浆中非蛋白类含氮化合物包括尿素 尿酸 肌酸 肌酐 氨 胆红素等中氮的总称 其中尿素 BUN 含量最多 2 尿素氮 BUN 指血浆中尿素所含的氮 占血浆非蛋白氮的 50 3 2 3 BPG 旁路 又称糖酵解旁路 成熟红细胞中 1 3 BPG 在 2 磷酸甘油酸变位酶作 用 生成 2 3 BPG 在 2 3 BPG 磷酸酶作用生成 3 磷酸甘油酸继续沿糖酵 解途径继续分解 糖酵