Bibexcel进行文献计量分析和引文分析快速指南

BibexcelBibexcel 进行文献计量分析和引文分析快速指南进行文献计量分析和引文分析快速指南 AlanAlan PilkingtonPilkington a pilkington rhul ac uka pilkington rhul ac uk 概述与安装概述与安装 本人使用 Bibexcel 业已多年 一直向大家推荐这个工具 但是 总是被 人们问及如何上手使用 每次拿它进行分析的时候 总是要回头再次读一读自 己手写的笔记 所以 我感到有必要就如何利用 Bibexcel 进行文献计量分析写 出一个介绍性的东西 希望能给大家提供有用的信息 如果有任何建议或者发 现任何错误 请通知我 Bibexcel 是一个用于文献计量分析 特别是引文分析的完美工具 用户 可以在 www umu se inforsk 网站上获得最新版本 其安装也十分简单 只需要 把文件拷贝到硬盘的目录下即可 记住要把帮助文档也放在一个目录下 如果 本指南不能满足你的需求请到该网站上浏览网页 利用利用 BibexcelBibexcel 进行引文分析进行引文分析 第一步要有用于分析的来源数据 在引文分析中 来源数据就是从 科学 引文索引 社会科学引文索引 中检索到来源文献 这两个数据库是商业 数据库 是 Web of Science 或者 ISI 数据服务的组成部分 你所在的大学可能 已经订购了它们 科学引文索引科学引文索引 和和 社会科学引文索引社会科学引文索引 的使用的使用 和平时一样 使用 WOS ISI 检索功能检索到来源文献 在开始下载文献之 前 必须了解你研究的内容 如果是对一种期刊的文章内容进行分析 其来源 文献很容易确认下来 比较复杂的研究有可能是针对某一作者或者大学的某个 系的文献记录 无论你的计划是什么 如果你是要从 科学引文索引 和 社 会科学引文索引 中下载数据 下载和准备数据的步骤都是一样的 在 WOS 下载前需要对要下载的记录进行标记 然后开始下载所选择的论 文 保证下载项目中包括论文的引文 可以通过 download for future analy sis 为进一步分析而下载 或者通过电子邮件发给自己 两种方式都生成纯 文本文件 如果下载的文献记录过多 下载中有的时候会导致数据传输超时 可以打 开已经得到的文件查看 可以用 Bibexcel 中左上角的窗口找到文件 在左下角 的窗口中可以看到文件的内容 也可以使用文本编辑器 找到文件的最后几 行 看看是否存在 HTML 格式错误 如果有错误就表明下载中出现了超时 如果 出现超时 解决的办法只有重新下载并注意减少下载记录的数量 比如减少检 索的年限 如果是分段下载的 必须记住 在下一步分析之前 要把分离的文 件重新组合到一起 用文本编辑器 如记事本 打开这些文件 剪切和粘贴 要保证在合成的文件的顶部只有一个文件头 而不是在已下载的每一个部分的 开头 FN ISI Export Format VR 1 0 利用文本编辑器可以很容易查看纯文本中的数据 但是在使用诸如 MS wo rd 之类的字处理器时候要当心 因为它们会增加字符 重新定义过的行格式和 其他可以在后来引起问题的东西 需要注意观察的是 unix 和 Windows 的行末尾和换行是不同的 而 Bibexc el 是采用 Windows 格式 所以需要在 Bibexcel 中打开来源文件 在左上区域 然后观察文件是否只含有一行文字 在右下角 而不是整整齐齐的文字块 这时你需要把换行改为 Windows 格式 利用 editpad lite 完成这项工作 该 软件可以在 JGSoft 上免费下载 为了进一步准备和分析 在 Bibexcel 或者文本编辑器中打开的原始数据 文件应该是下面这个样子 FN ISI Export Format VR 1 0 PT Journal AU Brown S Blackmon K TI Aligning manufacturing strategy and business level competitive strategy in new competitive environments The case for strategic resonance SO JOURNAL OF MANAGEMENT STUDIES NR 190 CR 1998 IND WEEK 1207 V247 P22 YOUNDT MA 1996 ACAD MANAGE J V39 P836 ZAJAC EJ 2000 STRATEGIC MANAGE J V21 P429 ZAJAC EJ 1989 STRATEGIC MANAGE J V10 P413 BP 793 EP 815 PG 23 JI J Manage Stud PY 2005 PD JUN VL 42 IS 4 GA 929TJ J9 J MANAGE STUD OXFORD UT ISI 0004 ER PT Journal AU Brown S Cousins PD TI Supply and operations Parallel paths and integrated strategies SO BRITISH JOURNAL OF MANAGEMENT NR 105 CR ANDERSON JC 1991 INT J OPER PROD MAN V11 P86 BADRI MA 2000 OMEGA V2 P155 BEACH R 2000 INT J OPER PROD MAN V20 P7 WOMACK J 1996 LEAN THINKING WOMACK J 1990 MACHINE CHANGED WORL ZAIRI M 1992 INT J OPER PROD MAN V12 P34 BP 303 EP 320 PG 18 JI BRIT J MANAGE PY 2004 PD DEC VL 15 IS 4 GA 874LZ J9 BRIT J MANAGE UT ISI 0002 ER PT Journal AU Laycock M TI Transforming Rover renewal against the odds 1981 1994 Pilkington A SO LONG RANGE PLANNING NR 1 CR PILKINGTON A 1994 T ROVER RENEWAL ODDS BP 738 EP 739 PG 2 JI Long Range Plan PY 1996 PD OCT VL 29 IS 5 GA VW288 J9 LONG RANGE PLANN UT ISI A1996VW ER 现在 你可以开始使用 Bibexcel 了 开始分析开始分析 Bibexcel 因其灵活性而十分强大 但过于灵活会在刚开始使用的时候会 带来一点点困惑 有的时候好几件事情通过一个步骤就完成了 有的时候需要 把几种不同数据集结合在一起来处理文件 使用 Bibexcel 过程中需要帮助的时 候可以按 F1 获得帮助 但是这个帮助往往是面向比较熟练的用户 老用户明确 自己要做什么因而需要略加指点后在 Bibexcel 下完成的任务 幸运的是还有一 些笔记来填充教程和快速指南留下的空缺 首先 确定要分析的数据 按照上述步骤已经下载了文本文件中 有一个 字段标识符为 CR 或者 CD 表示引文 在下载来源文献记录时 你需要明确指 出要下载引文 因为这是文献计量学最关注的内容 很多分析会使用到这个 数据 但是你也可以利用软件分析其他感兴趣的字段 转换到转换到 DialogDialog 格式格式 为了把你的数据转换成 Bibexcel 可以处理的格式 需要对数据做进一步 的准备 这方面内容在 Bibexcel 的帮助文件中有很多介绍 运行 Bibexcel 时 按下 F1 进入帮助系统 查询索引和条目 如下载 转换到 dialog 和数据准备 downloading convert to dialog preparing the data 在阅读分析步 骤之前阅读介绍部分有益无害 简短地说 准备数据包括如下步骤 首先 检查文件是否是 Windows 格式的结尾 如前所述 为了进行转换 利用 Bibexcel 左上角的窗口来导航来查看从 SCI 中获得 的数据 这些数据将在右侧标有 the list 的窗口上出现 在 Bibexcel 一般使用左上角的窗口来选择要处理的文件 在菜单中选择一个项目来执行任 务 或者点击 start prep 按钮中的一个 让你的数据变成 Bibexcel 的正确格式的第一步是选择好你的数据文件然 后点击 Misc Converttodialog convertfromWebofScience 菜单 如果没有这样处理过文件 则需要通过在左上角选择原始数据 使用 vie w file 查看文件按钮来检查 然后利用菜单命令 Misc Converttodialog convertfromWebofScience 最后会得到一个 doc 文件 与你原始文件同文件 名 只不过是以 doc 结尾 在抽取出你要进一步分析的字段之前 选择和查看这个文件 比如在每一 行的开头是否有完好的标签 PT AU SO CD PY 等 这些标签表明记 录的内容 是否有干净的行结束标识 和记录结束标志 ER 注意 Bi bexcel 如何把分号作为的字段中多个条目的分隔符 比如作者和引文 这些分 隔符会有助于以后分析中把各个条目分割开来 PT Journal AU Brown S Blackmon K TI Aligning manufacturing strategy and business level competitive strategy in new co mpetitive environments The case for strategic resonance SO JOURNAL OF MANAGEMENT STUDIES NR 190 CD 1998 IND WEEK 1207 P22 V247 1998 IND WEEK 1207 P24 V247 ADLER PS 1990 P55 CALIFORNIA MANAG SPR ANDERSON J 1991 V1 P86 INT J PRODUCTIO N OPE ZAJAC EJ 2000 V21 P429 STRATEGIC MANAGE J ZAJAC EJ 1989 V10 P413 STRA TEGIC MANAGE J BP 793 EP 815 PG 23 JI J Manage Stud PY 2005 PD JUN VL 42 IS 4 GA 929TJ J9 J MANAGE STUD OXFORD JN JOURNAL OF MANAGEMENT STUDIES 2005 V42 N4 P793 815 UT ISI 0004 ER 简单抽取字段简单抽取字段 查看 doc 文件的时候 你会注意到有一个叫做 TI 的字段 表示标题 其 他的如 AU 表示作者 PY 标识出版年 CR 或者 CD 标识引文等 每一个字段都可 以抽取出来形成一个文件用于进一步分析 例如 如果要分析论文的标题词 可以当作寻找将不同论文联系到一起的 关键词 最常用的单词是什么 这个时候 需要抽取出 TI 字段的内容 通过选择 doc 文件 如前面查看 文件时候的步骤 开始 将 TI 标签放到 old tag 旧标签 框内 左下角 从中间上部的 PREP 旁边的下拉菜单选择正确的数据格式 blank separate d field to treat each word alone 字段由空格分隔使每一个单词独立计数 然后按下 PREP 按钮来执行操作 产生一个新的 out 文件 这个 out 文件 用于进一步分析 按下 F1 查看进一步操作这些数据的帮助内容 利用左上角的 框来查看 out 文件 注意所需要的单词是如何保留下来的 还有对标题中含有 这些单词的来源文献的链接 第一列中的数字 这个程序功能强大的原因之 一 可以很容易地查看不同来源论文之间的链接 下面是一个 title out 文 件的例子 第一列的数字表示来源文献 1 Aligning 1 manufacturing 1 strategy 1 business level 1 competitive 1 strategy 1 case 1 strategic 1 resonance 2 Supply 2 operations 2 Parallel 2 paths 2 integrated 2 strategies 3 conceptual 3 synergy 3 model 3 strategy 3 formlation 3 manufacturing 4 Technology 4 portfolio 4 alignment 4 commercialisation 4 investigation 4 fuel 4 cell 4 patenting 你还可以用来自其他数据源 如数据库或者 excel 生成自己的 out 文件 然后用 Bibexcel 执行下面分析步骤 只要保证是同一格式并且是纯文本 基本分析基本分析 通过在选择和查看文件 屏幕左上角 产生了 out 文件中 如果升级了 可能叫做 oux 项目的频次 然后用左边中间的窗口中使用 whole string s ort descending start 生成一个 cit citation 频次文件 现在 我们就 可以打开 cit 文件查看哪些词在来源论文的标题中出现最多 我现在使用的文 件显示出 manufacturing 出现了 9 次 然后是 strategy 和 strategic 9 manufacturing 8 strategy 6 Strategic 4 management 3 operations 3 competitive 3 investigation 2 learning 2 Literature 2 relationships 2 links 引文分析引文分析 文献计量学中最为常用的方法之一就是引文分析 而 Bibexcel 使得数据 获取的步骤以及分析都相对容易 最大的问题往往是从原始数据中仅仅抽取出 部分所需要的引文信息 第一步是从 doc 文件中抽取全部引文信息 所以要重复上述步骤只是在 old tag box 窗口中用 CD 标签并且选择 any separated field 产生 o ut 文件 文件中列出每一条引文及其来源文献号 1 ADLER PS 1990 P55 CALIFORNIA MANAG SPR 1 ANDERSON J 1991 V1 P86 INT J PRODUCTION OPE 1 ANDREWS KR 1971 CONCEPT CORPORATE ST 1 ANSOFF HI 1965 CORPORATE STRATEGY A 1 PILKINGTON A 1998 V41 P31 CALIF MANAGE REV 1 ZAJAC EJ 2000 V21 P429 STRATEGIC MANAGE J 2 BEACH R 2000 V20 P7 INT J OPER PROD MAN 2 BESSANT J 2003 V23 P167 INT J OPER PROD MAN 2 BRAGLIA M 2000 V28 P195 OMEGA INT J MANAGE S 一般用户都愿意对全引文格式进行分析 但是最好是抽出来按照作者 标 题分别进行分析 还可以在使用 author title 和年代进行分析之前对数据进行 清洗 例如对一种缩写进行标准化 如果想要在 out 文件中抽出作者 首先查看 out 文件 在左面中部的面 板上选择被引作者 选择去掉重复和生成新的 out 文件 按下 start 开始按钮 生成一个 oux 文件 仅仅列出作者 或者至少是应该在作者字段位置上的条 目 如果文件格式正确的话 1 ADLER PS 1 ANDERSON J 1 ANDREWS KR 1 ANSOFF HI 1 BAHRAMI H 1 BAIN JS 1 BARNEY J 1 BARNEY JB 1 BATES KA 1 BEACH R 1 BERRY WL 1 BESSANT J 1 BOEKER W 2 COUSINS PD 2 CROSBY P 2 DANGAYACH GS 2 DSOUZA DE 2 DURAY R 2 DYER JH 2 ELLRAM L 2 ELLRAM LM 2 FARMER D 2 FEITZINGER E 2 FLYNN BB 3 GRANT RM 3 HAKSEVER C 3 HAMMER M 3 HART SL 3 HAX AC 3 HAYES RH 3 HENDERSON JC 3 HEWLETT CA 用户可能希望在进一步分析之前用 excel 或者其他软件来去掉第二个首字 母缩写 使得数据更加规范 我一般愿意使用 excel 的 分列 菜单把姓和名 字首字母缩写分开 然后用 LEFT 功能把第一个首字母缩写提出来然后与名字 C ONCATENATE 串联 在一起 这样一来 用文本编辑器或者 excel 可以把这 些数据一起放到与 Bibexcel 的 out oux 兼容的同一个纯文本格式的文件中 这样你就可以对其进行频数统计生成 cit 文件 如此一来可以发现高被 引作者 27 PILKINGTON A 11 HAYES RH 11 SKINNER W 9 HILL T 7 PRAHALAD CK 6 LEONG GK 6 MINTZBERG H 6 PORTER ME 6 STALK G 6 SWINK M 6 VOSS CA 6 BARNEY J 6 WOMACK J 6 HAYES R 从 out 文件还可以采用同样的步骤来抽取其他元素 比如出版物的标题 甚至一些元素的组合 Bibexcel 利用 SCI 中的条目格式来辨认所要抽取的部 分 所以如果想要期刊条目 你只需要获得那些带有有效的卷标和页码信息的 条目 这些工具小心使用 因为在 SCI 中的数据经常出现格式不正确的情况 共现和网络共现和网络 了解了来源文献或者引文中的各个字段的频数之后 一种有意义的探索是 了解引文或者字词之间的关系和网络 地图 这种探索在 Bibexcel 中叫做共现 在帮助文件的生成矩阵部分有介绍 可以用你需要的任何数据建立共现矩阵 比较有意义的共现包括标题词 作者 期刊名或者项目的组合 比如用 作者 期刊 年代 来确认某一篇论 文 我经常手工制作一个 out 样的文件输入给 Bibexcel 分析来自不同数据库 的专利数据的共现 共现分析中必要的步骤包括生成一个含有频数的 cit 文件 有助于选择 分析的项目 然后使用这个索引来分析 out oux 文件 在 coc 文件中生成共 现数据 然后这个文件可以转换成为类似 excel 四格表的矩阵 其中单元格的 数字是行和列标题的频数 在进行这种分析的时候 我们往往只是关心引文之间的关系是否存在而不 是一篇论文是否有很多引文 所以一般最好采取额外的步骤来去掉重复的条目 可以使用中间左边的框 对 out 或者 oux 去掉重复标识 生成一个新的文件 为了生成共现或 out 文件 首先查看 cit 文件 然后选择你要分析的单 词 作者 标题 引文字串 在主窗口中涂蓝 在 cit 文件中把要分析的条目 加亮之后 按照 Analyse Coocurrance slectunits via list box 操作 仅仅获得在 the list 窗口中的项目 然后 在左上角中选择你的 out 文件 不要查看该文件 因为你要保持你刚刚选择的单词加亮中 然后操作 Ana lyse Coocurrance make pairs via listbox 生成了 coc 或者共现文件 查看这个文件看看结果 coc 文件中包含共现频次以及配对的两个项目 例如对于作者共现文件 17 PILKINGTON A HAYES R 16 VOSS C HAYES R 15 HAYES R HILL T 14 MEREDITH J HAYES R 14 VOSS C MEREDITH J 14 HAYES R SKINNER W 13 VOSS C HILL T 12 PILKINGTON A HILL T 或者标题词共现文件 6 manufacturing strategy 4 Strategic Management 3 strategy competitive 2 strategy new 2 mass customisation 2 manufacturing study 2 strategy case 2 manufacturing competitive 2 strategy strategic 2 competitive case 2 competitive strategic 我个人一般使用像 UCINET 之类的程序对这些数据进行进一步的网络分析 因为 coc 文件与带有标记的 DL 格式数据文件类似 但是把频数放在最左边 而不是右边的一列 把数据转移到 UCINET 相对容易 如果你也想做这些分析 请阅读 UCINET 的帮助文件了解如何把数据输入到分析软件中去 我采用的步骤包括把 coc 文件输入到 excel 中去 剪切左侧一列的频数 并复制到右边 把所有三列剪切粘贴到一个文本编辑器 给文件添加标题使其 具有 DL 格式 比如 从 UCINET 中获得的结果往往会提供有关数据矩阵状态的清晰视图 如下 图 并且可以使用更多的分析工具 Pilkington 个体网的作者同被引图 引文耦合引文耦合 对于引文共现和同被引分析在描绘文献之间关系上还有一些争议 有人推 荐使用引文耦合 bibliometric coupling 书目对 引文耦合不是分析不同 被引文献之间的联系 而是显示和分析来源文献之间的联系 不用说 使用 Bi bexcel 中的共现单元方法也可以实现这种分析 今后的可能今后的可能 这只是我用 Bibexcel 完成自己工作时候所需要的步骤 等到你查看菜单 和帮助文件的时候你会很清楚认识到这个软件还可以做很多事情 Alan Pilkington 9 1 06 10 翻译 zilu85 引文共现与分析软件引文共现与分析软件 BibexcelBibexcel 瑞典科学家佩尔松 persson 开发的文献计量学研究软件 Bibexcel 7 用于 帮助用户分析文献数据或者是文本类型格式的数据 实现引文分析 Bibexcel 处理的数据来自集成在 ISI Web of Knowledge 平台上的数据库 包括 Web of Science 数据库 Derwent Innovation Index 数据库和 Medline 数据库等 Bibexcel 除了对来源于上述数据库中数据的相关知识单元 作者 关键词 参考文献等 做频次分析和排序外 还实现了知识单元的共现关系矩阵 将产生的共现数据 存入 excel 表格中 借助 Ucinet Netdraw 可视化软件 做进一步的可视化分析 Bibexcel 界面如图 1 所示 Bibexcel 构建知识单元共现关系矩阵处理流程如下 构建知识单元共现关系矩阵处理流程如下 Step1 打开 Bibexcel 出现上图所示的操作界面 在 select file here 这个框 口中选择数据源所在的文件夹 右边的窗口会显示出这个文件夹中的所有文件 选中合并后的文本文档 先点击 Edit doc file Repalce line feed with carriage return 点击 Misc convert to diologe format convert from web of science 会弹出一个对话框 点击 确定 就会生成一个后缀名为 doc 的文件 Step2 选中 doc 文件 点击 View file 按钮 The list 窗口就会显示这个文件 的内容 根据你要分析的知识单元 在 Old Tag 中填写相应的标签代号 作者 关键词 机构 参考文献 被引期刊的标签依次为 AU DE C1 CD CD 输入相应的标签后 在 Select field to be analysed 下拉列表框中选择 Any separated field 如果要分析被引期刊 在输入 CD 标签后 在 Select field to be analysed 下拉列表框中选择 JN Journal 然后点 Prep 按钮 在弹出的对 话框中 点击 确定 生成后缀名为 out 文件 Step3 选中 out 在 Frequency distribution 频率分布 下拉列表框中选择 相应的分析对象 如果分析作者共现 选择如果分析作者共现 选择 Author 如果分析关键词共现 如果分析关键词共现 选择选择 whole string 如果分析机构共现 选择 如果分析机构共现 选择 whole string 如果分析参 如果分析参 考文献共现 选中考文献共现 选中 Cited Reference 如果分析被引期刊共现 选择如果分析被引期刊共现 选择 whole string 选择相应的分析单元后 在下面的复选框中选择 Sorted descending 降序排列 点击 Start 按钮 在弹出的窗口中 点击 确定 生成后缀名为 cit 文件 Step4 选中 out 文件 在 Frequency distribution 下面的复选框中选择 remove duplicate 取消复制 和 make new out file 生成新的 out 文件 点击 Start 按钮 在弹出的窗口中 点击 确定 生成后缀名为 oux 文件 Step5 选中 cit 文件 点击 view file 在 The List 显示窗口中选择频次 较高的前多少位分析对象 然后点击 Analyze co occurrence select units via listbox 然后选中 oux 文件 点击 Analyze co occurrence make pairs via listbox 在弹出的窗口中 点击 否 此时生成后缀名为 coc 文件 Step6 选中 cit 文件 同样点击 view file 在 The List 显示窗口中选择 频次较高的前多少位分析对象 然后点击 Analyze co occurrence select units via listbox 然后选中 coc 文件 点击 Analyze make a matrix for MDS etc 在弹出的对话框中 按照提示 点 是 还是 否 选择生成方阵还 是下三角矩阵 生成的共现矩阵文件名为 ma2 将其打开 另存为后缀名为 xls 文件 一般用户都需要一个含有 coc 文件中项目的正方形矩阵 为了把 coc 文 件中数据列表转换为矩阵 像从前那样选择同样的单词加亮它们 使用 analy se coocurrance select units via listbox 然后选择你的 cit 文件 操作 analyse make a matrix 生成一个 ma2 结果矩阵文件 由于它仍然 是纯文本文件 可以用于其他程序中 将这些矩阵文件输入到 UCINET 等其他程序中的一个问题是 矩阵中只有 每一列的顶部带有标签而侧面行则没有 解决问题的办法就是重新构建矩阵 这就需要先把 ma2 文件转换并且保存为到 excel 文件 即打开该 excel 文件 先插入一个新的空列 再把顶部第一行拷贝下来 然后选择 edit 编辑 p aste special 选择性粘贴 transpose 转置 点击 确定 后就把标 签加到每一行的前面了 这就生成了一个带有完整标签的正方共现矩阵 更像 一个四格表可以输入到 SPSS 中进行因子分析 对项目进行统计分组 至此 文献数据知识单元共现关系矩阵构建完毕 Bibexcel 可以构建作者共 现矩阵 关键词共现矩阵 机构共现矩阵 参考文献共现矩阵 为了直观理解 各知识单元之间的共现关系 需要进一步借助可视化分析软件来实现 先使用 Ucinet 软件将 xls 转化为后缀名为 文件后 再借助 Netdraw 可视化软件将知 识单元之间的共现情况清晰的描绘出来 并分析图谱中节点的中介中心性和边 的关联强度等 Bibexcel 在共现分析中的优势与不足在共现分析中的优势与不足 Bibexcel 的强大功能在于知识单元的共现关系分析 对英文文献数据或专利 数据的共现关系分析已经取得令人满意的结果 如栾春娟 专利计量研究国际 前沿的计量分析 7 对 1995 2007 年期间