PubMed使用指南

医学文献资源检索与利用 PubMed数据库检索 中山大学医学文献检索教研室朱伟丽zhuweili 020 873304452011年5月 Outline 数据库概况数据库检索检索结果处理 yNCBI 1 PubMed 概况 纸质版 IndexMedicus IM美国医学索引 光盘版 MEDLARSonLine MEDLINE 网络版 PubMed 收录时间范围 1947 部分期刊回溯至创刊年 数据每日更新 Tuesday Saturday 世界上权威性的生物医学书目型数据库 收录全世界范围内70多个国家和地区近5000种生物医学相关期刊论文 主要收录英语语种期刊 少部分其他语种期刊 学科范围涵盖基础医学 临床医学 护理学 口腔医学 兽医学 营养卫生 药理和药剂学 预防医学 卫生管理 医疗保健和情报科学领域 2000年起新增生物 环境科学 海洋生物 植物和动物学 生物物理学和生物化学等生命科学领域 全球免费使用 部分文献免费获取全文 集成在NCBI平台 访问网址 1PubMed 概况 记录组成 OldMEDLINE PubMed OLDMEDLINE 1947 1965年间的MEDLINE数据 正在做回溯加工 补充主题词及部分全文链接 MEDLINE PubMed indexedforMEDLINE 标引了主题词被MEDLINE正式收录的文献数据 PreMEDLINE PubMed inprocess 已被MEDLINE录用 正处于加工标引状态的文献数据 Epubaheadofprint PubMed assuppliedbypublisher 由出版商提供的纸质版尚未正式出版的文献 大部分最终会转入PubMed inprocess 再正式转入MEDLINE 部分不在MEDLINE收录学科范围内的数据 最终会转化为PubMed assuppliedbypublisher PubMed状态 Publisher Supplied PubMed assuppliedbypublisher PubMed 由出版商提供但因其学科不在MEDLINE收录学科范围内 而最终未进入MEDLINE但保留在PubMed中的文献数据 OLDMEDLINE MEDLINE PreMEDLINE Epubaheadofprint suppliedbypublisher PubMed suppliedbypublisher 未入选数据 PubMed 标引主题词 入选数据 PubMED形成示意图 检索区 2PubMed 检索 基本检索 Limit限定检索 MeSH词检索 主题检索 检索史组配检索 ClinicalQueries 临床咨询模块 SingleCitationMatcher 单篇引文匹配 PubMed基本检索 支持布尔逻辑运算AND OR NOT支持截词检索 支持字段检索 如livercancer ti 支持短语检索 自动词语匹配 字段限定 词组 截词检索时该功能失效 案例1 自动词语匹配 请利用PubMed检索有关结肠造口术后患者的护理的相关文献 检索词 结肠造口术 colostomy护理 nursing colostomynursing 自动词语匹配 PubMed对检索用户输入的检索词 如果不限定检索字段 系统依次到MeSH转换表 刊名转换表 作者全名转换表 作者索引表 合作者全名转换表 合作者转换表进行词语的核对 转换和检索 如果在上述六个表中都找不到匹配的短语 系统将短语拆开 继续到这六个表中搜索 短语断开部分为AND关系 如果拆到的单词在上述五个表中还是找不到匹配词 将到所有字段中去搜索这些单词 单词之间的逻辑关系也是AND 案例2 截词检索 请利用PubMed检索有关肝移植患者术后生活质量的相关文献 检索词 肝移植 livertransplant 生活质量 qualityoflife livertransplant qualityoflife 案例3 精确检索 利用PubMed检索有关胎儿染色体异常的产前诊断研究 产前诊断 PrenatalDiagnosis胎儿染色体异常 FetalChromosomalAbnormalities PrenatalDiagnosis FetalChromosomalAbnormalities 案例4 字段检索 检索cell杂志上发表的有关干细胞移植方面的文献检索词 stemcelltransplant cell ta 常用字段 ti 题名 tiab 题名或摘要 au 作者 1au 第一作者 lastau 最后一位作者 ta 刊名 ad 地址 all 所有字段 majr 主要主题词 mh 主题词 PubMed限定检索 功能 a字段限定b时间限定c文献类型限定d语种限定e年龄性别限定f全文获取限定g检索子集限定 案例1作者与文献语种限定 检索2002年以来PubMed收录的葛坚教授发表的青光眼的中文文献 检索词 作者 gejian 2002年以后的作者检索可以用全称 主题概念 glaucomaLimits 2002 2010出版年限Chinese语种限定 作者检索tips 作者输入格式 姓前名后 姓用全称 名字用首字母 姓与名之间不加标点符号 如MichaelR Nash NashMR自动转换作者名检索 输入Smithj au 将检索出Smithja Smithjb Smithjr等作者精确检索 将作者名引起来 再加 au 如输入 smithj au 则仅检索出姓为Smith 名首字母为j的作者的文献 gejianglaucoma 案例2文献时间与类型限定 利用PubMed检索近十年来干扰素 治疗多发性硬化症的综述文献干扰素 interferonbeta多发性硬化症 multiplesclerosis限定 last10yearsReview 检索肝移植患者术后生活质量的研究 要求检索词出现在篇名中 检索结果可以获取全文 检索词 livertransplantation qualityoflife检索字段 篇名限定 linktofulltext 案例3全文获取限定 Livertransplantationqualityoflife 案例4文献子集限定 护理类杂志上发表的有关循证护理研究的文献检索词 evidencebasednursing检索字段 MeSH限定 subset nursingjournals PubMed 主题词检索 PubMed依据MeSH词表 医学主题词表 对所收录数据进行主题标引利用主题词检索可以提高文献检索效率MeSH网络版本集成在PubMed数据库中 案例 检索有关结肠造口 colostomy 患者的护理 nursing 的文献 colostomy 主题词注释 可组配的副主题词 主题词加权与扩展 入口词 主题词树 主要主题词限定检索 加权检索 检索近十年以来PubMed收录的甘精胰岛素治疗2型糖尿病的临床研究文献 检索词 甘精胰岛素 insulinglargine2型糖尿病 type2diabetesmellitus PubMed 检索史组配检索 同义词 如2型糖尿病noninsulindependentdiabetesmellitusNIDDMType2Diabetes Mellitus Adult OnsetDiabetesMellitusMaturity OnsetDiabetesMellitusStableDiabetesMellitusSlow OnsetDiabetesMellitusKetosisresistantdiabetes PubMed ClinicalQueries 为帮助临床医生更有效地获取PubMed数据库中一般疾病的病因学 预后 诊断 治疗及预防等方面的信息 PubMed设置了ClinicalQueries功能 该功能具备特殊的过滤器装置能将上述主题文献集中提供检索 PubMed SingleCitationMatcher 功能 输入题录信息 查找特定文献 参考文献补缺 注意 刊名要准确 缩写要标准作者字段第一作者与最后一名作者需用简写Example 查找 smithiesoliver发表在blood第12期上关Hematopoieticstemcells的文献的篇名 其他作者 页码等信息 3PubMed 检索结果处理 检索结果显示检索输出 保存全文链接 Linkout Summary 默认格式 包括作者 篇名 出处 相关文献链接Summary text summary的文本形式Abstract 篇名 作者 摘要 出处 主题词 全文链接标记等Abstract text 篇名 作者 摘要 出处MEDLINE 所有记录字段XML格式 PMIDlist可通过Display下拉菜单选择其它显示方式 七种检索结果显示格式 检索结果显示 检索结果输出 保存 剪贴板 Clipboard 临时保存 注意 Clipboard 剪贴板 最多只能保存500条最多可以保存8小时长期保存 应存到myNCBI的collection中 全文链接 LinkOut 4 PubMed MyNCBI 永久保存检索结果保存检索策略 追课题发展个性化设置 永久保存检索结果 注册登录 检索数据库 PubMed最近的操作 保存的文献 保存的检索策略 保存在collectionDM中的