文献检索新思维

文献检索新思维 张发宝生物谷网站上海北岸信息技术有限公司 什么是真正的文献检索 检索 retrieve 查找 search find 有四层含义 1如何有效查找到所需文献2如何查全 查精所需文献3如何整理 归纳文献4从文献中得出有意义的结论 5S检索新理念 Select 选择合适的数据库Search 如何精确查找文献Sort 文献的筛选与归类Systematize 文献管理软件的使用Strategy 如何从文献中发现idea 一 Select 1期刊类 专利类 新闻类 会议类 书籍类等数据库 其它是专门的数据库 如药物数据库 中草药数据库 疾病数据库等 最常用的期刊类 中文 维普 万方 CNKI三大期刊知识库 超星 书生之家书籍库 英文 Pubmed SD EBSCO Springer NPG EiVillage CAS Kluwer 1关键词检索2组合检索 二次检索 回溯检索 二 Search 如何将检索到的文献进行筛选和归类 检索一直有一个问题 不熟练检索的同学往往拼命查资料 而熟悉检索的同学往往内容太多 大量时间在重复检索和查找已检索过的内容 正常 Search Sort 3 7往往 Search Sort 5 5 三 Sort 原则 1只保留重要的资料 不要什么文献都要 许多新手往往只要查到的资料 就一定要保存下来 哪怕仅仅是相关 时间长了 这些不重要的资料 往往占住你主要地方 2一定要精细分类 并录入数据库 传统的电脑中按文件夹分类已不能适应时代的发展了 务必要用合适的软件进行归类 3要分精读与速读两类 四 Systematize ReferenceManage和Endnote优点 处理英文较方便 前者属于老牌软件商了 但后者信息更新快 尤其是文献检索更新更快 近来应用更广 同时Endnote还能支持中文期刊的格式 这也是比较优秀的一面 不利 价格比较贵 界面为英文的 Noteexpress 这是国内近年来发展最快的一款软件 同类软件还有文献王 但前者运行效率更高 适用面更广 对中英文支持都非常完善 升级更快 值得期待 Strategy 如何从文献中发现Idea 文献怎么看 多看还是少看 看少了什么都不懂 看多了什么都不做了 走进文献 走出文献 出入法 1文章背后的故事2文章与文章间的idea沟通 许多文献你阅读完以后 觉得很完善 这一块似乎已经perfect了 实际上你需要更多思考这篇文章的缺陷 即使是CNS上的 同样有漏洞 这些漏洞有时是作者回避的 或尚未研究的东西 这里面就是新的idea来源 如何读出文章背后的故事 这非常重要 读文献有两个境界 一是入 二是出 先要按作者意思去读文献 读懂它 其次按作者的方法去自己假设 从更高角度看这篇文章 还有哪些不完善的地方 找到成功背后的失败 如ES细胞培养的例子 一开始文献是记录XXX培养成功 保持不分化状态 你认为很高兴 但你是否注意到他曾经失败过多少次 或者说正常培养就失败 那么这背后到底是什么因素导致成功 什么因子 有时有些文献中一句话 里面可能是一个大课题 如ES细胞在无血清培养下会向神经细胞方向分化 因此必需有血清培养 这是常识 但为什么呢 这就一个大课题 细胞凋亡需要ATP参与 是主动过程 这句话背后包含了这一层含义 ATP是凋亡必需的 但同样有另一个常识 细胞在死亡过程中ATP往往下降 这其中存在一个矛盾 就也是idea 逆向思维 案例1 低氧导致细胞死亡 这是常识 但是是否存在一种细胞 给它各种各样的刺激仍不会死亡 其机理是什么 案例2 为什么成年以后 心脏细胞 脑细胞不分裂了 而有些细胞却可以分裂 是不是因为细胞周期缺失了某些因子 如果人为补充这些因子又如何 案例3 细胞周期分裂大家都认为是G0 G1 S M 那么我们能逆向进行吗 案例4 大象细胞大还是细胞多 为什么案例5 蛇等有毒动物为什么不毒自己 蛇毒与Na通道关系 挑战经典 案例1 细胞周期中CyclinD是必需的 如果我knockout这个基因呢 案例2 大肠杆菌不能产生糖蛋白 这是基因工程上最头疼的难题 能否人为转入产生糖蛋白相关基因 让大肠杆菌也能产生人类的糖蛋白 案例3 癌症是干细胞 案例4 SiRNA CaM的发现案例5 TNF基因无法被SiRNA 比较延伸 将相似的文献做比较 总结异同案例1 做骨髓间质干细胞 MSC 分化时 A B 诱导向神经细胞分化C E 诱导向内皮细胞分化B F 诱导向脂肪细胞分化 B在MSC分化中作用 案例2 离子通道属性在高等生物神经细胞上研究已相对透彻 可以引出以下几个问题 1 特殊物种 线虫 果蝇 蛇 或一些突变体上呢 2 特殊类型细胞 肿瘤细胞 胚胎干细胞 肾上皮 4 同一通道放在不同细胞上呢 如NMDA受体转到肾上皮呢 交叉嫁接 如已知A B C和F G C 那么C可能是连接B G的关键 这里面可能会出现新的idea 案例1 如长期关节炎患者 往往冠心病发生少 如服阿斯匹林可以减少心脏病案例2 长期服用抗生素患者 患冠心病机率也下降 冠心病与支原体相关学说案例3 神经细胞中观察到同一种信号分子在细胞中不同位置作用不同 那么在其它细胞呢 案例4 睡眠足 白天记忆好 why hypothesis GABA对学习和记忆作用的多面性案例5 RA As2O3促白血病分化 低氧可以促进干细胞分化 Gapjunction 不要看不起gapjunction的工作 这是绝大部分工作的源头 也是必要的 要从gapjunction工作中发现更多线索 生物谷 检索能力加速器 充分利用网络进行学习和交流 生物谷是首选平台生物谷网站是生物行业最专业的网站 拥有网站 论坛 博客 面向不同人群的需求 中国生命科学论坛 交流中心 生物谷博客 个人信息中心 生物谷网站 信息获取源 论坛可以用来交流和学习 博客是整理资料的重要的地方 可以将自己有用的资料 心得 想法 放在博客中 不断回馈 交流 以获得更多的idea 如果将整理的内容放在博客中 时间长了 你会感觉很吃惊 它对