医学文献检索课综合实习报告.doc

医学文献检索课综合实习报告 TIM基因家族及其与自身免疫性疾病的关系Relationship between the TIM Gene Family and with Autoimmune Diseases姓名_徐鲁明 _ 学号_M201175567_专业_ _临床检验诊断_ 导师姓名_ _胡丽华_Email__ 成绩_华中科技大学同济医学院医药信息系 2011.10 课题中词汇的解释及拟解决的问题（关键词写出中英文）【拟解决的问题】T细胞免疫球蛋白及粘蛋白域蛋白(TIM)基因家族有调节Th1和Th2细胞介导的免疫应答的作用。Tim1有共刺激T细胞增殖，促进细胞因子分泌的作用；Tim2主要表达于Th2细胞上Tim3蛋白特异性表达于Th1细胞表面并且有抑制Th1细胞免疫功能的作用；Tim 4是Tim1的天然配体。在哮喘和多发性硬化症的小鼠模型中，影响Tim分子的功能就会改变疾病的表型。因此理解Tim分子如何调节Thl和Th2细胞效应功能的机制对免疫相关疾病的治疗和调变有重大意义。 【关键词】TIM gene family（T cell immunoglobulin domain and mucin domain, Tim）,T细胞免疫球蛋白及粘蛋白域基因家族解释：T细胞免疫球蛋白及粘蛋白域蛋白(TIM)基因家族有调节Th1和Th2细胞介导的免疫应答的作用。Tim1有共刺激T细胞增殖，促进细胞因子分泌的作用；Tim2主要表达于Th2细胞上Tim3蛋白特异性表达于Th1细胞表面并且有抑制Th1细胞免疫功能的作用；Tim 4是Tim1的天然配体。autoimmune diseases，自身免疫性疾病解释：自身免疫性疾病（autoimmune diseases）是指机体对自身抗原发生免疫反应而导致自身组织损害所引起的疾病。一、 CBMweb1检索年限：2003年至2011年2课题分析，找出主题概念、限定概念、特征词（人类、年龄、动物、性别等）主题概念为TIM基因家族、自身免疫性疾病，特征词为人类3检索途径：（注明是主题词还是自由词，建议两个词都试一下）TIM基因家族在CBM中没有主题词，故只能采用自由词4检索结果(罗列检索式)：（比较不同途径的检索效果）序号命中文献数检索表达式检索时间795#6 or #4 or #3 or #22011-11-26 21:05619缺省智能:tim基因2011-11-26 21:0159缺省智能:tim基因家族2011-11-26 20:5549缺省智能:tim-42011-11-26 20:51369缺省智能:tim-32011-11-26 20:39232缺省智能:tim-12011-11-26 20:301376缺省智能:tim2011-11-26 20:26直接使用TIM作为自由词检索，检索结果中有许多无关文献，而分别使用tim-1、tim-3、tim-4以及tim基因作为自由词，检索的准确性大大提高，故最终采用了#6 or #4 or #3 or #2。5浏览检索结果，写出四篇与课题内容相关性最高的文献记录：Tim基因家族及其与自身免疫性疾病和过敏性疾病的关系 作者： 夏义平; 崔天盆; 吴健民 作者单位： 华中科技大学同济医学院附属协和医院检验科,武汉市 430022 出处： 医学分子生物学杂志 2006; 3(5) : 357-360 相关链接： 主题相关 TIM基因家族在免疫和疾病中的作用 作者： 陈治中; 崔天盆; 胡丽华 作者单位： 华中科技大学同济医学院附属协和医院检验科,武汉 430022 出处： 中华微生物学和免疫学杂志 2007; 27(5) : 479-484 相关链接： 主题相关 Tim-3与自身免疫性疾病 作者： 李小丽(综述); 甘华(审校) 作者单位： 重庆医科大学附属第一医院肾内科, 400016 出处： 实用医学杂志 2009; 25(7) : 1170-1172 相关链接： 主题相关 Tim基因家族的研究进展及其与变态反应性疾病的关系 作者： 吴苗; 朱可建 作者单位： 浙江大学医学院附属邵逸夫医院皮肤科,杭州 310016 出处： 国际呼吸杂志 2007; 27(13) : 1018-1020 相关链接： 主题相关 二、 PubMed 1检索年限：未限定2课题分析，找出主题概念、限定概念、特征词（人类、年龄、动物、性别等）：主题概念为TIM gene及autoimmune diseases，特征词为human。3检索途径：（注明是主题词还是自由词，建议以主题词检索为主）使用主题词检索，主题词为HAVCR2 protein, human、HAVCR1 protein, human、TIMD4 protein, human以及autoimmune diseases4检索结果（罗列检索式）：（比较不同途径的检索效果）主题词途径：序号检索式结果#6Search (#3) AND #5 Limits: English27#5Search Autoimmune DiseasesMesh Limits: English258595#4(#1) OR #2) OR #3 Limits: English219#3Search HAVCR2 protein, human Supplementary Concept Limits: English77#2Search HAVCR1 protein, human Supplementary Concept Limits: English149#1Search TIMD4 protein, human Supplementary Concept Limits: English16自由词途径：序号检索式结果#4Search (#2) AND #3 27 #3Search Autoimmune Diseases353349#2Search tim gene636#1Search tim36755写出四篇与课题内容相关性最高的记录（一个完整的索引）：TIM genes: a family of cell surface phosphatidylserine receptors that regulate innate and adaptive immunity.Freeman GJ, Casasnovas JM, Umetsu DT, DeKruyff RH.Immunol Rev. 2010 May;235(1):172-89. Review.Increased Tim-3 expression on peripheral lymphocytes from patients with rheumatoid arthritis negatively correlates with disease activity.Liu Y, Shu Q, Gao L, Hou N, Zhao D, Liu X, Zhang X, Xu L, Yue X, Zhu F, Guo C, Liang X, Ma C.Clin Immunol. 2010 Nov;137(2):288-95.TIM gene family and their role in atopic diseases.Umetsu DT, Umetsu SE, Freeman GJ, DeKruyff RH.Curr Top Microbiol Immunol. 2008;321:201-15. Review.TIM-3 as a new therapeutic target in systemic lupus erythematosus.Pan HF, Zhang N, Li WX, Tao JH, Ye DQ.Mol Biol Rep. 2010 Jan;37(1):395-8. Review.索取原文（利用CNKI和外文全文库（可任选几种）1根据CBMdisc、PubMed检出的文献线索，到中、外文全文库中匹配相应的全文文献，写出检索方法和命中文献记录（至少5条记录（2篇中文，3篇英文）。在CNKI数据库中，在刊名字段限定医学分子生物学杂志，并在作者字段限定为夏义平，并限制时间为2006年到2006年，得到前文中提过的文献Tim基因家族及其与自身免疫性疾病和过敏性疾病的关系。在万方数据库中，直接在论文题目中限定Tim基因家族的研究进展及其与变态反应性疾病的关系，即检索到题目为Tim基因家族的研究进展及其与变态反应性疾病的关系的文献。在pubmed中可直接获得TIM genes: a family of cell surface phosphatidylserine receptors that regulate innate and adaptive immunity.的全文。Sciencedirect 用期刊名称得到全文ProQuest用文章名得到全文另外一篇相关性较高英文文献所在期刊均不能在全文数据库中找到，故仅仅有两篇通过全文数据库艾斯维尔获得。但是另有数文章可在pubmed的链接中获取全文。2直接根据检索课题中的概念到中英文全文库查找全文，写出检索年限、检索方法、检出篇数和命中文献题名（抄录相关性大的至少5条记录（2篇中文，3篇英文）。在ScienceDirect中检索含有TIM gene和autoimmune diseases的文献（检索年限不限），找到27篇在万方数据库中使用cql:/TIM and 自身免疫性疾病进行检索，找到23篇相关文献在中国期刊网中，对TIM和自身免疫性疾病分别在全文范围内进行逻辑且运算，找到10篇相关文献：其中第1、3、5、7篇相关性较高。五、比较利用上述文摘型和全文型数据库查找课题的优缺点。文摘型数据库使用过程中，信息量较大，检索方式较多，效率高，文献加工程度好。但是只有一部分文献有全文，许多参考价值较高的文献无法找到全文。全文型数据库使用过程中，信息量也较大，但是与文摘型数据库相比，文章数目较少。收录的大部分文献都有全文。在文摘型数据库中可以广泛获得科研题目的最全最新信息，并且获得所需要的文献，进一步在全文型数据库中获取全文，将两者配合使用，可以达到最好的效率。六、列出与本专业密切相关的期刊刊名（中外文各6篇，外文写出期刊全称）13中文：现代检验医学杂志中华医学检验杂志国际检验医学杂志中国医学检验杂志临床检验杂志中国输血杂志外文：AMERICAN LABORATORY JOURNAL OF CLINICAL LABORATORY ANALYSIS LABORATORY INVESTIGATION ARCHIVES OF PATHOLOGY & LABORATORY MEDICINE CRITICAL REVIEWS IN CLINICAL LABORATORY SCIENCESClinical Laboratory 八请谈谈学习本门课程的体会，是否达到你的预期值，并提出你的意见和建议和希望。（仅仅为改进教学做参考，不做成绩记载） 文献检索课两位老师的精彩讲述让我受益良多。不仅学到了