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复杂网络研究中gml格式数据转换成邻接矩阵的方法 (2015-04-13 22:22:57)编辑删除转载标签：教育文化复杂网络研究中gml格式数据转换成邻接矩阵的方法1.首先到Newman的主页 /mejn/netdata/下载Gephi软件，这个需要java环境。图1.Newman主页上的Gephi图2.点击Newman主页Gephi后的页面2.然后打开安装好的Gephi软件图3. 安装好的Gephi软件图4. 打开后的软件界面3.然后点击：文件-打开-选中一个gml格式的文件-打开-确定图5.选择文件图6.打开文件的选择图7.打开文件后的界面4.点击：数据资料（图7左上角红圈内）-边-输出表格图8.数据资料界面图9.输出表格界面5.只选择Source和Target-点击确定-保存到桌面。此时在桌面你会发现一个电子表格（格式是csv），双击打开它。删除有汉字的第一行。这样就得到了这个网络的邻接表。图10.保存到桌面的输出文件图11.打开后的界面6.打开matlab-新建一个文件重命名为b-复制电子表格中的邻接表到新建的文件b中（图12）图12.复制邻接表到b中7.新建函数，代码如下functionb=ainc2adj(x)% 邻接表生成邻接矩阵if min(x)=0;x=x+1;endd=length(x);a=max(max(x);b=zeros(a,a);for i=1:dif x(i,1)=x(i,2);b(x(i,1),x(i,2)=0;elseb(x(i,1),x(i,2)=1;b(x(i,2),x(i,1)=1;endend8.在Command Window 中运行函数a=ainc2adj(b);最后就输出邻接矩阵a了。图13.运行函数图14.得到的邻接矩阵a提示：1.这是自己捉摸出来的笨方法，如果有大神看到这篇博文，请指点个比较简单的方法方便大家科研。2.这个软件也可以读取它输出的csv格式的文件，也就是那个邻接表，不过里边有汉字的第一行要删除。也就是说，读者如果想用Gephi软件读取自己的一个有邻接矩阵的网络，应该先把邻接矩阵转换成邻接表，然后把邻接表粘贴到csv格式的文件中，然后用Gephi打开就行了。最下面是邻接矩阵转邻接表的matlab代码（特别简单，自己也可以写）。3.大家可以百度Gephi软件教程，有很多。4.如果博文里边有错误，请大家指正。对于可能的错误先道个歉。邻接矩阵转邻接表matlab代码：function biao =adj2binc(a)%输入邻接矩阵，输出邻接表n=size(a,1);biao=;for i=1:n;for j=1:nif a(i,j)=1;bia
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