医学信息数据库检索指南5.doc

医学信息数据库检索指南5国外医学期刊全文数据库 一、OVID系统 OVID公司是世界著名的数据库提供商，目前已包涵医学、生物等多领域数据库上百个，如临床各科专著及教科书（BookOvid）、循证医学（EBM）、MEDLINE、EMBASE以及医学期刊全文数据库（journalsOvid full Text）等。后者集中了上千种重要的医学期刊，其中最早的可回溯至1993年，我校目前可使用的全文期刊有200余种（详见图书馆期刊目录）。（一） OVID系统的优点1 有基本、高级两种检索操作界面，图形界面直观易学；2 有关键词、著者、篇名词等多条检索途径；3 有多种检索结果的输出方式，可以选择打印、拷备或E-mail方式；4 可进行多库同时检索；5 所有数据库用同一检索程序并相互链接。数据库说明数据库名称及进入链接图1 OVID系统数据库选择界面（二）使用方法使用OVID全文期刊，可直接点击数据库名称进入，还可通过其它数据库如MEDLINE记录中的“Full Text”(全文链接)。 1检索界面界面、数据库及退出转换（上区） 基本检索界面：检索按钮其它限制(下区)关键词和著者输入框(中区) 图2 OVID基本检索界面 通过点击Basic图标或在检索登录时选择Basic可进入基本检索界面（图2）。该界面分为上、中、下三区。上区有3个检索图标，分别表示高级检索（Advanced）、转换数据库（Change Database）、退出系统（Logoff），点击后分别可以进入相应界面。中区有关键词(Keywords)、著者(Author)两个检索词输入框，用户可以在其中一个或两个输入检索词。下区是检索条件限制选择项，根据数据库的不同而有不同的选择内容：如最新记录(Daily Update)、全文记录（Ovid Full Text Available）, 原始论文（Original Articles）, 综述文献记录（Review Articles），文摘记录（Articles with Abstract）,出版年（Publication Year）等。 高级检索界面：高级检索界面（图3）是OVID系统默认的检索界面，当用户进入时，如不选择检索方式（Mode）则直接进入该界面。共分为四个区：上区为检索图标，共有10个。分别为著者（Author）、篇名词（Title）、期刊（Journal）、检索字段（Search Fields）、期刊浏览（Browse Journals）、联合检索（Combine）、限制（Limit）、基本检索（Basic）、数据库转换（Change Database）和退出（Logoff），点击任一图标均可进入相应界面。第二区位于检索图标与检索框之间，为检索史和检索结果显示区。不仅显示了检索式、检索条数，还有结果显示标识（Display），点击后可显示检出的题录等内容。表格下方有存储检索结果（Save Searches）、存储检索史（Save Search History）和删除检索结果（Deleted Searchs）三个功能选项。第三区即检索区，可在此区输入框中输入检索词进行检索。虽然只有一个关键词检索框，但并不意味此界面只有关键词检索功能，因其可输入任一字段的内容或检索式进行检索。如输入“Zhang JHAU”可检索该著者的所有文献。限制区(第四区)检索输入框(第三区)检索史与结果(第二区)检索图标(上区) 图3 OVID高级检索界面最后一区为检索限制区，同基本检索界面相似，选择后即可对检索结果进行限制。2主要检索途径 用户根据检索要求可点击检索界面上区的不同图标，选择不同的检索途径。 关键词途径（Keyword）是系统默认的检索方式。所谓“关键词”实际包括了篇名词、文摘词及文本词等。使用该途径检索文献，范围广泛，检索全面，不易漏检。检索时只需在检索框中输入检索词即可。OVID系统也支持命令（Commands）检索，通过输入检索运算式进行检索，其操作运算符有布尔逻辑算符、截词符和位置符：布尔逻辑符（AND，OR，NOT）的使用： 可直接连接检索词或检索表中的顺序号数字，如“lung cancer and therapy”或2 and 3 (2或3为检索式序号，见图3) ；截词符（$）：如查有关肝癌的文献，输入“liver cancer$”，可查出所有包括liver cancer, liver cancers等记录；位置符（ADJ）：可插在两个检索词之间使用，表示检索结果中含有的两个检索词必须相邻。如检索急性白血病的文献，可输入检索式“Acute ADJ Leukemia”; 如在ADJ后加数字，则表示两词相邻的单词数,如输入“Acute ADJ3 leukemia”, 则可检出所有类型的急性白血病，如：Acute lymphoblastic leukemia(急性淋巴性白血病); Acute Granulocytic leukemia(急性髓细胞性白血病)等。例1：如检索肺癌治疗方面的全文文献： 点击图书馆主页中的“OVID医学全文数据库”可进入其主页（）, 输入ID地址、密码，在下一页中点击Continue, 进入了OVID系统的数据库选择页面，选择“journalsovid.full text”进入医学期刊全文数据库的高级检索界面（系统默认）。（图3）； 在关键词输入框中输入检索词”lung cancer”, 点击Perform Search，可检出所有文摘和篇名中包括”lung cancer”的文献12597篇； 选择检索限制区中的”OVID Full Text Available”后，再点击Perform Search，可检出上述结果中包括”lung cancer”的全文文献3208篇； 在检索输入框中再输入检索词“therap$”,点击后查出所有和治疗有关的文献335587篇； 将上述式和式结果用“AND”连接，检索式“2 AND 3”，获得文献2046篇； 点击检索结果“2046”后的Display，可浏览检出文献的题录内容（见图8）； 点击文献题录下的文献全文(Ovid Full Text)链接，可显示某篇文献的全文（见图9）。 著者途径 (Author) 点击”Author”图标进入著者检索途径。只需按系统要求以“姓在前，名在后，姓是全称，名是缩写”的规则在著者检索框中输入欲检著者的姓名，即可查出所需文献。如检索我校乔健天教授的文献，可直接输入“Qiao jt”, 即可获得所需文献。 篇名词途径(Title)如需检索位于文献标题中的词汇，可点击”Tilie”图标进入检索界面，在篇名词检索框中输入检索词即可查出所需文献。如需检索“CD48”的文献，可在输入框中输入“CD48”，即可得到文献篇名中有该词的全部文献。 期刊名检索（Journal）输入期刊名称（全部或部分，但不用缩写），点击Perform Search, 在出现的按字顺排列的刊名表中选择所要期刊，点击Perform Search，就可获得该刊上的全文文献； 期刊浏览（Browse Journals） 用户可以不同的方式进行浏览：刊名字顺或学科分类。Ovid系统将收录的全部期刊分为临床医学(Clinical Medicine)、行为与社会科学(Behavioral & Social Science)、生命科学(Life science)、护理(Nursing)、物理学与工程(Physical Science & Engineering)等多个大类，其下又可分为若干细类。点击任一类目中的链接，不仅可以得知某学科期刊的收录情况，还可获得期刊目录及文献全文（见图4、图5）； 联合检索(Combine)指布尔逻辑算符的组配检索，可通过点击”Combine”图标进入该检索界面，检索时只需点击所选择的检索式，然后确定逻辑算符的种类即可。也可直接在检索框中输入检索式进行组配。（见例1）期刊目录收集期刊数量卷、期目录学科大类 图4 期刊浏览界面（按主题类目） 检索限定(Limit)对检索历史栏内选定的检索式或检索词进行各种限定。如限定检索结果为带摘要的文献、全文、文献发表年、文献类型等。在检索框下第四区也可直接选择限制内容，如限制检索结果在OVID全文数据库、最新记录、综述文献、有文摘、一定的出版年限等。 全文标识刊名及全文链接 图5 麻醉学收录期刊细目其它限制内容限制字段 图6 检索限制界面 例2： 检索近年有关肾衰的系统性综述文章及专著 点击journalsovid.full text, 进入医学期刊全文数据库的高级检索界面，在其检索框中输入“Kidney failure”, 点击Perform Search，检索结果为1571篇； 点击“Limit图标，进入限制检索界面，系统默认最新检索记录； 选择“Publication Types” 进行限制,点击其中的“Book or Media Reviews”,检索年限为1998年至2003年；检出符合检索课题的相关文献4篇(图7)； 浏览检索结果并下载： 点击“Display”按纽，显示检出的综述文献题录，点击每一题录下的“Ovid Full Text”, 则显示每篇文献的全文。 图7 检索结果显示 3下载方法 OVID系统为用户提供了多种下载方式： 打印(Print Preview)：通过打印机可直接将全文打印下来。但文章内的图片、表格需放大后单独处理。一般多使用“文件”菜单中的“打印”命令。 拷贝(Save Article Text)：将文献内容保存在硬盘或软盘上。下拉文件菜单，选择另存为，指定保存盘及文件名；也可直接从文章右侧兰色表格中的下 图8检索结果（题录）显示载方式OUTPUT中，选择拷贝文献命令SAVE ARTICLE TEXT进行保存。其它服务下载方式 图9 OVID系统全文格式 电子邮件(Email Article Text):直接将全文以E-mail的形式发至个人邮箱中。点击文中下载方式中的EMAIL ARTICLE TEXT，输入E-mail地址后，即可发送该文。三、BIOSIS数据库 （一）概况BIOSIS Previews 是世界生命科学研究领域中收录文献最多，覆盖面最广的数据库。除了收录生物学、植物学、动物学、微生物学文献外，还收录生物相关领域如医学、药理学、生态学以及生化学、生物物理学、生物工程学、免疫学、遗传学等内容。文献来自5，500种以上的专业期刊、图书、会议摘要及论文等。包括美国Biological Abstracts (1969 to present), Biological Abstracts/RRM (1980 to present) and BioResearch Index (1969 to 1979).三种手工检索工具的全部内容。 （二）特点1 收录全，内容多；2 使用OVID检索系统，界面统一，使用方便；3 提供检索术语转换索引和字段检索等。 （三）检索方法1基本检索：方法同OVID其它数据库，可选择使用关键词(Keyword)、著者(Author)、篇名词(Title)、期刊名(Journal)等检索途径（图5）。在输入框中输入检索词后，系统自动提供相关主题词，供用户选择（图6）； 图5 BIOSIS高级检索界面2字段(File)检索：BIOSIS提供约50个字段，其中许多字段可以检索（表1）：例1：检索有关人类免疫缺陷病毒（HIV）的综述文献和图书： 在输入框中输入“HIV”，点击”Perform seach”,进入主题词选择界面(图6)；选择“HIV”，点击“Continue”,获得文献3263篇，上述步骤也可以检索式“HIV.sh.”代替(图5)； 点击输入框下的检索限制”Review Articles”,获得HIV综述文献227篇； 输入检索式“Book.pt.”,获得全部图书记录。然后将此结果与的结果进行“AND”运算，获得HIV的全部图书。表1 常用字段检索字段全称及意义检索式举例ABAbstract 包括BA（76年-）和BA/RRM（85年-）data monitoring.abAFAll Searchable Fields所有的可检索字段Drug abuse.afAUAuthors著者索引Zaret$.auBTBook Title (English)书名（英文）hemoparasites.btCBChemicals & Biochemicals化合物与生化rab5 analysis.cbCYCountry国家名，（包括在著者地址中）canada.cyDSDiseases疾病名称（包括人、动物、植物）Myocardial infarction.dsGEGeopolitical Location地理名称Ivory coast.geGNGene Name基因名称.gnHWHeading Word 主题词Gastropoda.hw.INInstitution包括在著者、编者和发明者地址中的机构 mcgill.in.ISISSN刊登文献期刊的国际期刊标准号0021-5171.isJNJournal Name期刊名Journal of virology.jn. LGLanguages语种eng.lgMCMajor Concepts主要概念词Allied medical sciences.mcMFMeeting Informationv会议题目、地点、日期 jasper.mfMQMethods & Equipment方法与设备Scanning electron microscopy.mqOROrganisms生物体rodentia.orPNPatent Number包括专利国家的代码和专利号US 24587896.pn.PTPublication Type出版类型meeting.ptPYPublication Year出版年1997.pySHSubject Headings主题词echinoderms.shSOSource包括文献所有的基本信息，如刊名、书名、卷/期、出版年等 journal of virology.so.或1992.so. STSuper Taxa上位类目sarcodina.st.TNTaxa Notes包括生物体的常用类目及文献中提及的微生物名 marsupials.tn.nonvascular plants.tn.TWTextword包括篇名词、文摘词、关键词 ultrastructure.tw. 图6 OVID提供的相关主题词转换页3其它检索方法：除了上述常用的检索方法外，BIOSIS还有其它检索方法，如使用工具“TREE”。点击高级检索页上的“TOOLS”图标，选择TREE，在其输入框中输入一个检索词，就会出现与此检索词相关的可检索的其它词类，