液体活检专家共识ppt课件.ppt

液体活检的专家共识 军事医学科学院附属医院秦海峰 1 Content 2 Content 3 原癌基因 proto oncogene 癌基因活化 oncogene 基因变异类别 抑癌基因 tumorsuppressorgene TSG 功能缺失 活化 失活 基因突变扩增或缺失易位融合表观遗传修饰 其他基因Modifyinggene 调节功能异常 表达异常 4 分子标志物种类及其对应的检测方法 Bio specimen variationDNA mutation translocation CNV MSIDeletionRNA SinglegeneexpressionGeneexpressionprofileProteinSingleproteinProteinprofilingEpigenetic Methylationpattern TechnologyDNASequencing RT PCRqPCR aCGHFISH CISHRNAqRT PCRMicroarraytechniquesTaqMan geneexpressionarrayProteinIHC ELISA massspectrometryEpigeneticMS PCR bisulphate PCR sequencingMethylationmicorarray NGS 目前NGS检测变异类型 SNV Indels Rearrangement fusion CNV及少数表观变异 5 二代测序 NGS 技术应用于临床肿瘤精准医学诊断的共识 第一版2016 04 23 中国肿瘤驱动基因分析联盟 CAGC 中国临床肿瘤学会 CSCO 6 国内共识推荐NGS用于临床检测 首先我们非常清楚液体活检和NGS的哪些部分可以应用到临床 如小的PANEL可用于现在市场上CFDA已经批准的药物的检测 这些可以应用到临床 2016年3月5日第十三届中国肺癌高峰论坛吴一龙 共识 检测已知的 多个平行临床可药物抑制的靶点 液体活检技术推荐NGS方法共识 用于发现未知基因 探索疗效监测 预后判断和发现耐药机制等 液体活检技术建议使用NGS方法 2016年3月5日第十三届中国肺癌高峰论坛 7 共识中包括的9个内容 36项声明 8 Content 9 西方 2013ASCO 东方 370例中国肺腺癌 肺癌中已发现的驱动基因及频率 关注denovoUnkown 关注耐药后的变异 10 肺癌中已发现的驱动基因及频率 原发灶和转移灶的基因突变异质性 空间分布差异性 同一瘤灶内基因突变异质性 治疗前后基因突变异质性 时间分布差异性 11 肺癌瘤内异质性实例 肿瘤细胞之间存在较强的分子异质性 CancerGenomeLandscapes Science NewYork NY 2013 339 6127 1546 1558 12 Content 13 ASingleDominantMechanismofAcquiredResistancetoRociletinibisnotReadilyIdentifiable PresentedByLeciaSequistat2015ASCOAnnualMeeting 耐药机制的精准分析 14 15AZD9291treatedpts6casesofC797Smutations 40 Oxnard etal Natmed 2015 耐药机制的精准分析 15 耐药机制的精准分析 AcquiredresistancetoRociletinib12Ptswith13T790M samples 7samplesretainedT790M 3EGFRamp 6sampleslossofT790M 2conversiontoSCLC 2015ASCO 20cases FGFR3mut METamp AcquiredresistancetoAZD929115plasmaDNAsamplesfrom15pts6 15C797S E19del T790M5 15E19del T790M4 15E19delHER2ampBRAFmutNRASmutMETamp EGFR independent PresentedByChristineLovlyat2015ASCOAnnualMeeting 16 耐药机制的精准分析 CirculatingtumourDNAprofilingrevealsheterogeneityofEGFRinhibitorresistancemechanismsinlungcancerpatients PresentedByJacobJ Chabonat2016ASCOAnnualMeeting 17 耐药机制的精准分析 18 耐药机制的精准分析 19 EGFRmutT790MC797SL798I Oxnard etal Natmed 2015 ASCO2015 Lin NatGenet 2015 AliceShaw NEJM2015 TKI ALKfusion ALKC1156Y ALKL1198F C1156Y Bypass Bypass Bypass Bypass TKI TKI TKI TKI TKI 耐药机制的精准分析 20 Content 21 75 40 Liquidbiopsy bloodsamplingfortestingsasdoneinbiopsiedtissuesamples Circulatingmarkers DNACirculatingtumorcells CTCs ExosomeProteinsRNAPlateletsImmunecells TCRrepertoire LiquidBiopsyandCirculatingBiomarkers 22 AMNewman etal NatMed 2014 CAPP Seq targets521exonsand13intronsfrom139recurrentlymutatedgenes intotalcovering 125kb 0 004 ofthehumangenome 17NSCLCpts5000Xcoverage ctDNA超敏感深部测序 发现临床药物靶点 23 约3 4ALK融合为经典的EML4 ALK融合 但有1 4为与其他基因的融合 包括 STRN ALKCATSPERB ALKACVR1 ALKCLIP1 ALKDPH6 AS1 ALKKIF5B ALKRP11 320M2 1 ALKUGP2 ALK 燃石血检 10000Xcoverage ctDNA超敏感深部测序 发现临床药物靶点 BurningRockDx内部数据请勿拍照 24 AaronMNewmanetal NatMed 2014 突变谱动态变化反映实时肿瘤负荷大小基于NGS的ctDNA动态监测可实现定性与定量有机结合 准确反映肿瘤时空异质性 液体活检带来的动态监控 25 Zofia etal JournalofThoracic March2016 液体活检带来的动态监控 female aged60lungadenocarcinomawithbonemetastases 26 4 2 6 3 6 30 7 27 8 17 T790M出现 ALK融合消失 C797S出现 1stgenEGFR TKI 3rdgenEGFR TKI LiverPD 1stgenALK TKI 3rdgenEGFR TKI 2stgenALK TKI 3rdgenEGFR TKI PR LiverPD LiverPR OtherPD TP53 EGFR19del ALKfusion EGFRT790M 液体活检带来的动态监控 27 结合随访 动态监测 新方向 国际最前沿 COMPASS ctDNAOminibusMutationsPredictiveAssociation 是燃石医学使用其朗清NGS产品检测晚期NSCLC病人ctDNA从而进行疾病随访以及支持治疗决策的一个诊断行动 燃石医学血液检测产品的敏感性 特异性在前处理合适的情况下已达到国际领先水平是COMPASS行动开展的技术基础 液体活检带来的动态监控 28 晚期NSCLC 驱动基因异常 临床随访信息 B和IV期的NSCLC初治复治均可鳞癌 腺癌均可 身体状况和器官功能允许开展下一步抗肿瘤全身治疗尤其是靶向治疗已知具有至少一个明确的异常驱动基因 患者配合临床随访以及必要的治疗可以提供研究所需要收集的临床资料 液体活检带来的动态监控 目标人群 29 具有下列至少一个明确的基因异常EGFR 18 21号外显子COSMIC或TCGA收录的所有突变ALK 19内含子发生的任何重排融合ROS1 31 34号内含子发生的任何重排融合RET 11号内含子发生的任何重排融合MET