传染病监测对POCT的需求

传染病监测对POCT的需求,CDC的传染病监测,发病和流行趋势分析发现暴发发现新病原深入了解传染病流行规律估计疾病负担，确定防控优先评估控制项目制订控制策略传染病防控行动,传染病监测多位点 多源 时间变化与连续 多机构与多学科-传染病的特点所决定,自然环境,传 播,监,测,人群,传染病的监测目标,传染病监测的信息来源,医院监 测网报 告,疾控机 构调查,媒体,病人自 主报告,传染病监测信息,监测与应对,Mission Impossible,为什么,细菌感染性腹泻,美国的监测：每年有超过五百万的细菌性腹泻发生。WHO：估计每年腹泻30-50亿人次，500-1000万病例死亡 ETEC所致病例（每年）：估计21亿，38万例死亡。 发展中国家：5岁以下婴幼儿腹泻的最主要病原菌。0-4岁ETEC腹泻发病率：0.5次/人/年；5岁ETEC腹泻发病率：0.1次/人/年。Jelinek and Kollaritsch. Expert Rev Vaccines 2008./ Wenneras C, et al. J Health Popul Nutr 2004. / Steffen R, et al. J Travel Med 2005. / Niyogi SK. J Microbiol 2005.The New England Journal of Medicine, 2009, 361;16:1560.,监测仍心存疑虑：家底不清,有多少病例？ 是什么病原？检测到细菌，是不是致病原因？ 单份血中检测到抗体，怎么判断？。,确诊 病例,采样检测,就诊,患者,检出率,就诊率,采样率,我们能发现多少传染病病例,- 疾病流行程度的估算- 疾病负担测算,传染病监测存在的问题,常见病多发病被忽略：- 急性健康损害低或病死率低- 病原种类多、检测困难,河南，2007， 1,526 例门诊病例,北京，2010.4-2011.12,4,803 例,深圳， 5年22,085 例腹泻病例,云南，2012， 797例门诊病例,腹泻病原谱复杂,既往流行而当前少见或罕见的疾病被忽略：疟疾 立克次体类感染。,传染病监测存在的问题,临床诊断标准缺乏特异性,传染病监测存在的问题,检测出的微生物是不是致病原因？,传染病监测存在的问题,病原确定依然是挑战, 病原体 条件致病菌混合感染？这些标本中存在大量的不同种类的细菌 正常定植菌完成（符合）哪些指标，可确定是疾病的病原？Kochs Postulates “科赫原则”，1890 细菌必须存在于每一个病例中细菌能够从病例中分离到并且纯培养细菌纯培养物接种健康敏感宿主能够复制出相同的疾病从实验感染的宿主中能够重新分离到这个细菌但也存在问题！,如何提高基层医疗单位的传染病诊断能力？多数病例到基层医疗单位就诊治疗 分级诊疗制度传染病网络直报是基于病原学定义疾病和分类、报告的,传染病监测存在的问题,发展普及传染病POCT技术 提高检测监测水平是敏感发现新发突发传染病疫情的重要依托,微生物基因组测序 推动POCT技术发展,国际人类基因组计划（HGP）,1990年启动，2003年完成，一个基因组花费27亿美元2014年：花费1千美元Reagent* cost per genome $797 Hardware price $137*DNA extraction, sample prep and labor $55-$65 Total Price = $989-$999Source: Illumina,诊断标识的选择,促进特异基因的选择 表面标识抗原的基因？ 毒力基因？,基于表面标识抗原（O抗原K抗原H抗原）的检测，还 是基于毒力因子的检测？O104：H4集聚黏附性大肠杆菌，产2型志贺毒素 检测O157还是O104？促进特异蛋白、糖结构区域的选择,拟态弧菌分离株携带了霍乱毒素基因，产生霍乱毒素。 那么，