PubMed简介 (2)

Internet生物医学信息资源及其检索 PubMed简介认识PubMed文献PubMed检索特点PubMed检索功能 重点 PubMed特征栏功能介绍 重点 PubMed检索结果的处理PubMed主题词检索 重点 MyNCBI个性化服务 一 PubMed简介 概况 网址 http www ncbi nlm nih gov pubmed或http www ncbi nih gov pubmed或http pubmed gov com org net 由美国国立医学图书馆 NationalLibraryofMedicine NLM 国家生物技术信息中心 NationalCenterforBiotechnologyInformation NCBI 向因特网用户提供免费MEDLINE检索服务 1997 6 26 收录70余个国家4900多种生物医学期刊的题录与文摘 是世界上最权威的医学数据库现有1950年以来的1650多万篇文献的记录 其中MEDLINE记录1400多万条 目前每年增加60余万条文献记录在全部记录中有76 的文献为英文 在2000年以来的记录中90 的文献为英文 收录中文刊60余种 概况 的外部链接功能 提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接 如Nucleotide Protein Genome OMIN Structure Taxonomy等 提供美国国立医学图书馆多种资源的链接提供相关文献 RELATEDARTICLES 的链接提供其它外部资源的链接 如生物医学期刊网站全文链接 NCBI资源 外部链接 二 认识PubMed文献 作者AU 题名TI 来源SO PubMed中文献的类型 状态 数据类型 状态 PubMed除了1966年以前的OldMedline 其余文献按处理过程分4种类型 或状态 摘要和免费全文链接图标 在题录 Summary 显示格式下 分别以如下图标表示该记录是否有摘要或是否可免费获得全文 并提供相应的链接 三 PubMed检索特点 检索特点 检索运算符AND NOT OR必须大写 vitamincORzinc ANDcommoncold支持截词检索 但对词组无效 如bacter 可以检出以bacter为词干的单词bacteria bacterium等最多600个单词 截词检索时 系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩展功能将不再被执行 如 heartattack 将不映射到MeSH词MyocardialInfarction 检索特点 强制检索 双引号 或限定字段 endocrinedisruption endocrinedisruption注意 所有的 都必须是英文状态下输入 常用字段 Affiliation AD Author AU 姚开泰 yaokaitai yaokt yaokaitai yaok tanj au 与 tanj au 不同Language LA chinese la 或chi la 前3个字母 MeSHSubheadings SH 自动扩展下位副主题词 如需关闭该功能 使用 sh noexp MeSHTerms MH 自动扩展下位主题词 如需关闭该功能 使用 mh noexp 常用字段 PublicationDate DP 1998 03 dp 1998 dp 1996 1998 dp 1998 01 1998 04 dp PublicationType PT review pt Title TI TextWords TW 包括Title Abstract MeSHTerms MeSHSubheadings ChemicalSubstanceNames PersonalNameasSubject等字段Title Abstract TIAB 常用字段组成 标识符字段名称中文释义TITitle题目AUAuthor作者ADAffiliation作者单位ABAbstract文摘DPPublicationDate出版日期TAJournalTitleAbbreviation刊名缩写MHMeSHTerms主题词PTPublicationType出版类型 四 PubMed检索功能 检索 1 自由词智能检索在检索框中键入一到多个单词 如键入 vitamincANDcommoncoldhepatitisbAND diagnosisORtherapy 检索词可出现于PubMed各记录中的标题 摘要等全部字段 检索 2 作者姓名书写格式西方人姓名书写格式 Firstname MiddleName Lastname 美国肯尼迪总统名为 JohnFrankKenedy Kenedy为Lastname 姓 Frank为Middlename 比较少看到 多看到JohnF Kenedy 中间名缩写了 如果看到姓名中间有逗号 则逗号前一定是姓 如 Kenedy JohnF 检索 2 作者姓名书写格式中国人姓名格式 Lastname Firstname 如 钟世镇 就有如下拼写形式可供检索 Shi zhenZhong ShizhenZhongZhongshi zhen Zhong shizhenZhong shi zhen zhongszShizhenZhong zhongshizhen zhongs 检索 3 期刊检索检索时可输入期刊全名 如 molecularbiologyofthecell 系统自动转换为 molbiolcell JournalName 也可输入期刊标准缩写形式 如 molbiolcell 或期刊的ISSN 国际标准出版物编号 如 1059 1524 如果期刊名是一个单词或恰好是MeSH词表中的词 如GeneTherapy Science Cell等 则必须在刊名后加 ta 期刊名称字段标识符 检索 3 期刊检索如果杂志全名中包括括弧或方括号 键入时应该予以取消 例如杂志名为 JHandSurg Am 检索时应转成 JHandSurgAm 中文期刊 用汉语拼音 NanfangyikedaxuexuebaoBeijingdaxuexuebaoZhonghuaneikexuezazhi 五 PubMed特征栏功能介绍 一 Limits限定检索 作者 Author 系统有提示期刊 Journal 全文 FullText或FreeFullText 日期 Dates 人类或动物研究 HumansorAnimals 文献类型 TypeofArticle 性别 Gender 语种 Languages 年龄 Ages 文献子集限定 Subsets 自由词可以结合以上各种限定进行 限定检索窗口全貌 添加作者检索 添加期刊检索 限定记录有全文 免费全文或摘要 限定记录有全文 免费全文或摘要 文献发表时间限定 记录添加到PubMed时间限定 人类与动物限定 性别限定 文献语种限定 文献子集限定 文献类型限定 研究对象年龄组限定 检索字段限定 检索举例 姚开泰院士2001年以前发表的有关鼻咽癌 nasopharyngealcancer 方面的文献姚开泰 2001年以前 nasopharyngealcancer yaokaitaiYaokaitaiYaoktYaok 如果仅检索某个人的文献 最好是这几种形式都用上 如果还有其他检索条件 最好 Yaok 的形式也用上 注意 一次Limits检索结束后 将前面的 取消 二 Preview Index功能介绍 Preview Index只显示最近的三次检索史 而用History按钮可以查看最近100次的检索史 三 History功能介绍 各检索式之间可以进行逻辑组配 特征栏功能介绍 Clipboard 四 Clipboard功能介绍 将每次满意的检索结果暂时保存至此最后集中处理 下载存盘或发E mail 最多500条记录 断开连接后保存8小时 Details 显示计算机响应的本次检索式 点击 URL 五 Details功能介绍 http www ncbi nlm nih gov entrez query fcgi cmd PureSearch db pubmed details term effect 5BAll 20Fields 5D 20AND 20 28 28 22magnetic 20resonance 20imaging 22 5BTIAB 5D 20NOT 20Medline 5BSB 5D 29 20OR 20 22magnetic 20resonance 20imaging 22 5BMeSH 20Terms 5D 20OR 20MRI 5BText 20Word 5D 29 20AND 20Review 5Bptyp 5D 20AND 20 222005 02 13 2000 01 22 5BEDAT 5D 20 3A 20 222005 03 15 2000 01 22 5BEDAT 5D 保存该检索式至收藏夹 六 PubMed检索结果的处理 检索结果的处理 显示格式结果排序文本显示保存 最多10000篇 打印发送至Email订购原文 题录格式 作者 题名 出处 Sendto text Sendto Files Sendto Email 七 PubMed主题词检索 MeSH MedicalSubjectHeadings 记录中的医学主题词 MeSH 是由标引员为PubMed中的Medline文献所人工指定的词ascorbicacid是MeSHTerms 而vitaminc则不是标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH词 通常一篇文章可有多个MeSH词 PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献 MeSH词独有特征 主要MeSH词 MAJORTOPIC MeSHtermasmainsubjectofthearticle 次要MeSH词扩展 EXPLODE chosenMeSHtermandallmorespecificunderlyingMeSHterms副主题词 SUBHEADINGS 主题词等级排列 检索时可以将其下位词的文献都检索出来 一个主题词可以处在不同的类目下 SubHeadings副主题词 对一个主题词的多个方面进行修饰限定的词 又称限定词 例如 hepatitisb这个主题词涉及到的病因 病理 诊断 治疗 放射照相术 微生物学等多个方面 目前有83个副主题词并非每个主题词都能和83个副主题词组配 SubHeadings副主题词 MeSH词优点 不同拼写 paediatric pediatric同义词 tumor tumour cancer neoplasm 进入主题词检索界面 两个途径 糖尿病 Diabetes 的治疗 therapy 方面的文献 自由词检索的结果 第一步 输入检索词 糖尿病 Diabetes 的治疗 therapy 方面的文献 主题词检索开始 第二步 确定主题词 第三步 确定副主题词 第四步 检索 检索结束 如果想更准确 如果第二个概念无法作为第一个概念的副主题词 糖尿病的心理治疗 mentalhealing 方面的文献 尽量寻找与第二个概念相关的第一个概念的副主题词 如果找不到 就将此处选择上 此时 此处输入第二个概念 如果匹配的主题词只有一个 就自动转到副主题词界面 没有合适的副主题词 选择此处 检索 阿司匹林 aspirin 引起胃溃疡 stomachulcer 的文献 检索 阿司匹林引起胃溃疡的文献 点击 MeshBrowser 进入MeSH浏览器的首页在提问框中输入aspirin 点击 Go 按钮 显示该主题词的定义及其在词表中的位置 点击正确的相应主题词可做如下3种选择 选择副主题词adverseeffects RestrictSearchtoMajorTopicheadingsonly 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