R语言绘图基础ppt课件

R基础绘图一 基础绘图工具1 绘图函数2 绘图参数介绍3 画图面板分割4 图形保存二 图形案例三 其它图形包 2 R绘制的图形 3 绘制地图 左图maps包map 右图PBSmapping包addBubbles fields包实例spdep包实例 前言学习R绘图没有什么技巧 只有记住常用参数的含义及用法 知道怎么去查找未知参数的含义及用法 再就是多多绘图 什么东西用得多了 自然就熟了 如果需要更深入的了解 使用R帮助 R使用帮助 加上函数或参数名 例 plot legend demo graphics demo persp R绘图界面简介R的绘图界面中总共分为三部分 outermargins figureregion andplotregion figureregion包括plotregion 一 基础绘图工具1 绘图函数 在R中有两种绘图函数1 1高级绘图函数创建一个新的图形 1 绘图函数1 2低级绘图函数在现有的图形上添加元素 2 绘图参数介绍 plot cars font lab 2 main 主标题 sub 副标题 type p xlim c 7 20 ylim c 20 100 plot cars font lab 2 main 主标题 sub 副标题 type p xlim c 7 20 ylim c 20 100 axes F plot cars font lab 2 type p plot cars font lab 2 type l plot cars font lab 2 type b plot cars font lab 2 type o plot cars font lab 2 type h plot cars font lab 2 type s plot cars font lab 2 type S 其它常用绘图参数 3 画图面板分割 par是设置全局绘图参数的函数 ask par ask TRUE 产生新的绘图之前提示操作 new FALSE 默认 新图在下一个figureregion生成 TRUE 新图在当前figureregionmfcol mfcol c 3 2 3行2列分割图形界面 mfrow 以行的方式分割图形界面 mfg mfg c 2 2 3 2 图片在3行2列图形界面中第二行 第二列的位置 mar c a b c d 设置plotregion与figureregion底部 左边 上部 右边的距离 单位英寸 mai c a b c d 设置plotregion与figureregion底部 左边 上部 右边的距离 单位是文本行数 mgp c a b c 三个坐标轴成分的位置 轴文本标记 单位记号标记和轴位置与轴线距离 单位是文本行 par mgp c 1 6 0 6 0 mar c 3 3 2 1 X 1 10 Y 1 10cex type c 0 7 0 8 0 9 1 2 3 4 5 6 7 plot X Y col blue pch 16 cex cex type 绘图符号大小 1是正常大小cex axis 1 1 坐标轴刻度数字大小cex lab 1 2 坐标轴标签大小cex main 1 4 标题文字大小 cex sub 1 3 副标题文字大小font axis 3 坐标轴刻度数字字体 斜体font lab 2 坐标轴标签字体 粗体font main 4 标题字体 粗斜体 font sub 1 副标题字体 正常main 字体 xlim c 1 12 ylim c 1 12 text X Y adj 0 labels paste cex cex type col red cex 1 2 font 3 R的绘图符号 pch 1 25 R的绘图符号 par mgp c 1 6 0 6 0 mar c 3 3 2 1 pch type c 1 5 15 19 X 1 10 Y rep 6 10 plot X Y col 1 pch pch type cex 2 main pch font lab 2 text X Y adj 0 5 labels paste pch pch type srt 90 颜色名称 white black red yellow colors 数字代号 1 2 3 4 5 6 7 8颜色函数 rainbow heat colors terrain colors topo colors cm colors colors par mgp c 1 6 0 6 0 mar c 3 3 2 1 pch type c 1 5 15 19 X 1 10 Y rep 6 10 plot X Y col 1 10 pch pch type cex 2 main pch font lab 2 text X Y col 1 10 adj 0 5 labels paste pch pch type srt 90 控制连线的类型lty 1 实线 2 虚线 3 点线 4 点虚线 5 长虚线 6 双虚线控制线的宽度lwd 1为正常大小 1为增加宽度 par mgp c 1 6 0 6 0 mar c 3 3 2 1 X 1 10 Y 1 10line type c 1 6 line width seq from 0 6 by 0 6 length 6 plot X Y col blue pch 16 type n main linetypeandlinewidth font lab 2 cex lab 1 2 abline h 3 8 lty line type col colors 120 126 lwd line width text 3 8 3 8 adj 0 labels paste lty line type lwd line width col red cex 1 2 font 3 4 图形保存输出到文件pdf postscript xfig bitmap pictex cairo pdf svg png jpeg bmp tiff pdf plot pdf width 4 height 4 png plot png width 400 height 600 dev off 绘制完图形后关闭图形设备通过菜单命令保存图形 22 一般绘图步骤 1 打开绘图窗口 不绘制任何对象plot x y type n xlab ylab axes F 2 添加坐标点points x y 3 添加坐标轴axis 1 axis at seq 0 2 1 8 0 2 side 2 4 补齐散点图的边框box 5 添加标题 副标题 横轴说明 纵轴说明title main Maintitle sub subtitle xlab x label ylab y label 23 一般绘图步骤 二 图形案例 散点图 点线混合图 require stats head cars plot cars 1 cars 2 pch 16 col red xlab speed ylab dist type p font axis 2 font lab 2 cex lab 1 5 x seq 5 25 by 0 1 y 10 sin x 50 lines x y col green lwd 2 a 5 25 b 2 a 10 cos a points a b pch 15 col blue legend topleft pch c 16 1 15 lty c 1 1 1 col c red green blue legend c plotwithpoint lines points 散点图 并列散点图a read table file clipboard header T matplot a type o pch 15 18 lty 1 bg yellow lwd 2 xlab Position nt ylab Frequency font 2 font lab 2 cex lab 1 5 legend topright pch 15 18 lty 1 merge T legend names a col 1 4 散点图 坐标对数化 a array NA dim c 1000 3 a 2 sample 1 100000 1 1000 a 3 sample 1 100000 1 1000 plot a 2 a 3 log xy cex lab 1 4 cex axis 1 2 font lab 2 font axis 2 xlab R1 ylab RS pch col red cex 1 1 axes F axis 1 at axTicks 1 labels as integer axTicks 1 axis 2 at axTicks 2 labels as integer axTicks 2 title main R1VSRS box 条形图 标准条形图 abar barplot a 2 ylim c 0 1 2 max a 2 cex lab 1 5 names arg a 1 xlab Length nt font lab 1 5 ylab NumberofsmallRNAs space 0 9 col blue main Lengthdistribution ratio paste sprintf 2f a 2 sum a 2 100 sep text bar a 2 labels ratio adj c 0 5 0 cex 0 8 font 2 pos 3 abline h axTicks 2 lty 2 col rgb 0 0 0 0 5 box 条形图 堆积条形图 h read table acgt txt head T barplot t as matrix h ylim c 0 1 xlab Position ylab Frequency main Homosapiens col rainbow 4 font 2 cex lab 1 4 box legend topright legend c A G C T pch 15 col rainbow 4 条形图 邻接条形图barplot lines spline 条形图 ErrorBar条形图barplot 韦恩图draw circle 饼图 二维饼图pie 饼图 三维饼图pie3D 盒形图 箱线图 boxplot 频率直方图hist 热图heatmap library pheatmap pheatmap library