基因芯片的应用ppt课件.ppt

基因芯片,1,一什么是基因芯片,是通过微阵列技术，将高密度DNA片段阵列通过高速机器人或原位合成方式以一定的顺序或排列方式使其附着在如玻璃片等固相表面，以荧光标记的DNA探针，借助碱基互补杂交原理，进行大量的基因表达及监测等方面研究的最新革命性技术。,2,3,4,二基因芯片相关技术,从实验室走向工业化得益于：探针固相原位合成技术（合成探针分子）照相平板印刷技术（观察杂交信号）激光共聚焦显微技术,5,三基因芯片的应用（微观）,基因表达检测（拟南芥、酵母、人的基因组）突变检测（BRCA基因外显子11、CFTR基因、-地中海贫血、酵母突变菌株间、HIV-1逆转录酶、蛋白酶基因）基因文库作图（人类基因组单核苷酸多态性的作图）杂交测序（重叠序列探针与目的分子的杂交方推导出目的核酸分子的序列）基因组多态性分析（人类基因组单核苷酸多态性的鉴定、分型和线粒体基因组多态性的研究）,6,三基因芯片的应用（宏观）,疾病诊断（灵敏性和准确性；快速简便；同时检测多种疾病）药物筛选和新药开发环境保护（检测污染微生物或有机化合物的污染和危害，保护基因）司法（DNA指纹库、亲子鉴定）现代农业（寻找高产抗病虫抗旱抗冷冻的基因）,7,疾病诊断,1.癌症、心血管疾病、血液病、遗传性疾病、神经系统疾病、部分感染性疾病；免疫反应相关性疾病、毒物引起的损伤等2.中药方面研究天然药物对人体的作用机制筛选对人体有生物效应的单味天然药物、有效成分、天然药物配方,8,四基因芯片发展历史,9,五国内外知名生物芯片公司,1.Affymetrix昂飞公司(美国)世界上最有影响的基因芯片开发制造商2.PerkinElmer珀金埃尔默仪器公司珀金埃尔默是全球生化领域第三大供应商，在药物高通量筛选、全自动液体处理和样品制备以及遗传疾病筛查方面是世界第一大供应商3.博德基因芯片有限公司（上海）4.博奥生物芯片有限责任公司（北京）中国最早的生物芯片公司5.联合基因集团,10,11,生物芯片巨头-affymetrix,Affymetrix公司,Affymetrix公司已开发全套的生物芯片技术相关产品。基因芯片为寡核苷酸芯片（Oligo芯片）有极高的特异性和灵敏度，重复性好，假阳性率非常低，是目前世界上最先进的基因芯片。年产各类寡聚核苷酸基因芯片达到几十万张，占据了表达谱基因芯片科研市场的一半以上。极少数已经盈利的公司,12,联合基因集团,建立了中国第一个大规模人类基因数据库研制成功中国第一块基因芯片建立了国内第一个基于基因分析技术的新药筛选平台建立了国内第一套基因检测企业技术标准基因检测技术平台在行业内第一家通过“中国合格评定国家认可委员会（CNAS）认可”拥有世界上最大的黄种人疾病易感性基因数据库拥有国内最大规模的基因技术平台,13,六基因芯片产业链,制备基因芯片的步骤：1.芯片制备以玻璃片或硅片为载体，将寡核苷酸片段或cDNA作为探针按顺序排列2.样品制备生物样品往往是复杂的生物分子混合体，提取、扩增、标记3.杂交反应4.信号检测和结果分析,产业链一体化,14,定制生产,15,产业模式（定制、服务）,以上海博星基因芯片有限公司为例：该公司的产品和服务有：人基因表达谱芯片小鼠基因表达谱芯片大鼠基因表达谱芯片水稻基因表达谱芯