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文档简介
分子生物学在白血病中的应用,2016-3-8融合基因实验室,一、白血病相关基因改变的常见类型,融合基因,基因突变,基因表达异常,1.融合基因:所谓融合基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾相连置于同一套调控序列(包括启动子、增强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。,概念,Chr9,Chr22,ABL,BCR,BCR-ABL融合基因,2.基因突变:错义突变(点突变)插入突变缺失突变移码突变,错义突变(点突变):,DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。如:JAK2V617FJAK2基因mRNA水平(cDNA水平):第1849位点G突变为T蛋白水平:第617位氨基酸位点由缬氨酸(V)突变为笨丙氨酸(F),插入突变:,较长片段的DNA的插入而发生突变,但不改变阅读框如:NOTCH1H1590-L1592insFGPNOTCH1基因mRNA水平(cDNA水平):c.47754776ins(TGGGCC)蛋白水平:H1590-L1592insFGP,缺失突变:,较长片段的DNA的缺失而发生突变,但不改变阅读框如:JAK2N542-E543delJAK2基因mRNA水平(cDNA水平):c.1624-1629del6bp蛋白水平:N542-E543缺失N、E氨基酸,移码突变:,DNA片段中某一位点插入或丢失一个或几个(非3或3的倍数碱基对时,造成插入或丢失位点以后的一系列编码顺序发生错位的一种突变。如:CALRL367fs(46)突变CALR基因mRNA水平(cDNA水平):c.1179_1230del52bp蛋白水平:第367位氨基酸(亮氨酸)位点发生移码,在367位点起后的46位氨基酸终止。,癌基因或抑癌基因表达异常如:WT1定量,3、基因表达异常,二、白血病基因检测的临床意义,1、辅助诊断2、指导治疗3、评估预后4、微小病变残留检测,三、白血病相关基因分类,BCR-ABLFLT3-ITDJAK2V617FC-KIT,PML-RARaNPM1RUNX1AML1-ETO,DNMT3ATET2ASXL1/ASXL2IDH1/IDH2,SF3B1SRSF2U2AF1,Class1增殖,Class2分化,Class3表观遗传,Class4剪切因子,四、白血病相关常见基因,AMLCMLMPN,ALLCLL,MDS,AML相关基因异常,融合基因:,1、PML-RARa:95%AML-M3分为三型L型、S型、V型PLZF-RARaNPM1-RARa2、AML1-ETO:40%AML-M2(主要为M2b)3、CBF-MYH11:90%AML-M4Eo4、MLL-AF17MLL-AF6AML-M4/M5MLL-AF9,AML相关基因异常,基因突变:,FLT3-ITDNPM1(A/B/D型)c-KitIDH1IDH2ASXL2NRASKRASP53DNMT3A,基因定量分析:,WT1定量,FLT3-ITD:AML-M3中发生频率较高,c-Kit:50%AML1-ETO阳性AMLCBF-MYH11阳性AML,ASXL2:AML1-ETO阳性AML,CML相关基因异常,BCR-ABL:95%CMLCML特异marker亚型:cDNAProteinb3a2、b2a2型P210e19a2型P230e1a2型P190,MPN相关基因异常,PV、ET、PMF的诊断,BCR-ABL排除早期慢粒,PV:JAK2V617FJKA2exon12ET:JAK2V617FMPLCALRPMF:JAK2V617FMPLCALR,BCR-ABLJAK2V617FMPLCALRJAK2exon12,MDS相关基因异常,WT1定量DNMT3ATET2ASXL1SF3B1SRSF2RUNX1,SF3B1:主要见于50-70%环形铁粒幼增多性贫血,SRSF2:主要见于CMML,ALL相关基因异常,BCR-ABL:35%成人ALLTEL-AML1:儿童ALL预后好E2A-PBX1:预后不好MLL-AF4:婴幼儿多见,NOTCH1:预后好FBXW7:预后不好PTENNRASKRAS,B-ALL,T-ALL,CLL相关基因异常,P53NOTCH1,
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