核酸检测ppt课件

核酸检测在血液筛查中的应用,深圳市血液中心,1,血液筛查是否需要进行核酸检测,2,无偿献血的新动态,“定期无偿献血者是低危的献血者”，但是“以体检为目的定期无偿献血者是高危献血者”而且这部分人群的献血队伍正在扩大。这部分人群窗口期的机率高于其他人群。因为在他们中间高危的传播行为经常发生。经过治疗后的HBsAg转阴，ELISA方法检测阴性的献血者。,3,NAT与ELISA互补,病毒变异免疫静默期实验操作失误病毒感染的窗口期,4,病毒检测窗口期,5,血筛用NAT试剂与临床用的不同,6,目的和要求不同,定性与定量临床使用核酸检测主要目的是定量监测，进行疗效分析。血筛用于病原体的定性筛查灵敏度和特异性临床在漏检与误差之间更重视误差血液筛查用核酸目的是保证用血安全，更重视漏检质控要求不同临床用与血液筛查用质控要求也不同。临床试剂以定量准确和防止误报为质控目标血筛用以防止漏检为主要目的阳性率也不同临床更多的阳性；血筛更多是阴性对自动化要求不同临床更多用于病人,单人份检测,标本量少血筛更多用于正常人，因此检测量不同，对自动化的要求也不同,7,血筛用NAT平台的要求,灵敏度HBV10IU/ml；HCV、HIV200IU/ml特异性核酸的特异性高，几乎没有方法学假阳性但要防止污染内标（内对照）为避免假阴性，要求每管阳性质控自动化大规模、高通量,8,关于灵敏度的几个问题,厂家宣传的灵敏度均指单人份检测，而非推荐pooling方案的实测灵敏度实际应用灵敏度=宣传灵敏度pooling数IU才有可比性：WHO标准品以及国家一级标准品均以IU为单位HCV、HIV窗口期浓度高，因此对灵敏度要求较低。美国FDA要求，HCV、HIV5000IU/ml能在pooling方案中被检出HBV的窗口期标本在30-300IU/ml之间，因此对灵敏度要求高低于灵敏度也有检出的可能，这与取样几率有关,9,血液筛查常用的NAT技术,10,核酸提取均使用磁珠法,磁珠提取的原理：将磁珠上标记特异性吸附核酸的物质特异性吸附核酸，并通过磁分离技术将病毒核酸从裂解液中提取出来步骤：裂解吸附洗涤洗涤洗涤洗脱优点：磁珠提取特异性高，受标本因素影响小，灵敏度高易于实现自动化缺点：成本较高、并需要一定的仪器(半自动、全自动)。完全手工工作量太大,11,实时荧光定量PCR技术原理,所谓的实时荧光定量PCR就是通过对PCR扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的分析。在实时荧光定量PCR反应中,引入了一种荧光化学物质，随着PCR反应的进行，PCR反应产物不断累计，荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环，收集一个荧光强度信号，这样我们就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化，从而得到一条荧光扩增曲线图。,12,实时荧光优点,特异性好引物、探针双重保证特异性方法学假阳性很少扩增检测同时进行，速度快，且不对扩增产物进行处理，不易污染荧光检测灵敏度高罗氏第二代的NAT试剂也是使用实时荧光检测,13,内标设计原理,内标为一已知低含量的与模板扩增效率相似的一段DNA片段，将它加入PCR反应液中，与模板共同扩增，以反应每管真实的扩增情况，如果内标和样品都未扩增出结果，则表示该管扩增无效，应重新做。,14,内标的作用：避免假阴性,内标的种类：同源、异源内标的作用：真实反应扩增效率避免假阴性：假阴性是目前血液筛查中最重视的问题之一，内标全程进行质量监控质控,15,核酸检测中遇到的问题与解决方案,16,人员素质和清洁很重要,血筛用NAT对低浓度要求太高，高灵敏度的试剂操作对人员要求高，同样的平台不同的实验员有很大的差距。平台建立初期会有较大问题对人员素质要求与自动化程度成反比实验室及仪器清洁很重要由于少有高浓度标本，因此大面积的污染不易发生。但由于试剂灵敏度高，如不随时注意清洁，污染有积累效应，会出现散发性样本污染，引起假阳性,17,采血样管的处理,玻璃器皿在使用前应高压处理，因为玻璃器皿常含有不易失活的RNA酶。最好是热灭菌，250烘烤4小时以上可使RNA酶永久性失活。异硫氰酸胍盐(Guanidinethiocyanate,GITC)可使DNA酶和RNA酶立即失活。,18,标本汇集,利用STAR工作平台,编制汇集软件。合理的Pooling方案,19,Pooling方案,灵敏度因素检出血液中最低的病毒含量与标本汇集数量呈正比成本因素试剂价格以test为单位，检测单位成本与pooling方案有关检测标本量及检测时间因素扩增检测量=提取量3(HBV、HIV、HCV)与仪器密切相关,20,影响灵敏度因素,Pooling方案内标的浓度标本的加样量磁珠的量和混匀模板制作过程的损失和提取量,21,批质控的选用及设定,使用低浓度样本为批阳性质控由于有内标进行每管阳性质控，因此批阳性质控主要目的是监控实验细微的系统误差。因此阳性质控浓度选择要低过低的质控会影响工作，因此不宜使用最低灵敏度浓度建议灵敏度的3-5倍较好多阳性和阴性质控不宜固定位置，最好随机分布由于有内标，多阳性质控偶有个别出现问题，实验结果也有保证,22,内标与结果的判定,内对照（IC）使质控成为每管质控使用双免荧光，保证内对照和样本反应条件绝对一致竞争性设计，保证受影响因素一致结果判断原则：样本检测阳性，无诊IC情况均报阳性样本检测阴性：内对照阳性，可以报阴性结果内对照阴性，需要复检通过软件自动判断，但建议要人工复核,23,核酸实验室管理软件,在实验室管理软件的基础上增加核酸检测的管理模块，实现计算机管理,检验结果自动控制。,24,NAT与ELISA检测的配合,1同步检测2先做常规检测，再做核酸检测,25,自动化要求,保证质量核酸检测对技术要求高，特别是血筛用对灵敏度要求更高，所以自动化保证质量的持续性进入计算机管理系统由于标本多，还要进行pooling。为便于管理，减少人为错误，最好使用全自动工作站，这样POOLING号、标本号都统一自动记录，不易搞错提高工作效率降低工作强度,缩短实验时间,26,自动化的进程,27,今后面临的问题,28,降低检测成本,实验室建设成本人员成本管理成本设备成本(各厂家的设备是否兼容，兼容性强的设备、试剂销路好)试剂成本质量成本,29,合理地进行集中化检测,提高检测质量降低检测成本集中的区域要考虑标本运送时间。,30,标本处理,标本留样和处理：也是核酸检测质量控制体系中的重要环节，否则在检测之前病毒核酸已降解，造成假阴性检测结果。临床基因扩增检验实验室工作规范临床用于RNA(如HCVRNA)扩增检测的血标本建议进行抗凝处理，并尽快(3小时以内)分离血浆，以避免RNA的降解。如未作抗凝处理，则抽血后必须在1小时内分离血清。全国艾滋病检测技术规范用于核酸定性检测时，采集的抗凝全血应在48h内分离PBMC和血浆，否则应在2448h内分离血浆和血细胞。,31,试剂的稳定性,试剂的灵敏度