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文档简介

PubMed,南方医科大学医学信息学教室张政宝tel e-mail : newinfo man PubMed简介PubMed文献PubMed检索特征PubMed检索功能(重点) PubMed特征栏功能介绍(重点) 处理PubMed搜索结果PubMed主题词搜索(重点)关于MyNCBI个性化服务网站: http:/www.NCBI.NLM.NIH.gov/PubMed或/pubmed或http:/org; net )是美国国家医学图书馆(NationalLibraryofMedicine-NLM )国家生物技术信息中心(nationallenterforbiotechnologyinformation-NCBI ) 为互联网用户提供免费的MEDLINE搜索服务(1997-6-26 ),收录了70多个国家4900多种生物医学期刊的问题目录和摘要, 世界上最有权威的医学数据库是目前1950年以来1650多万篇文献记录(其中MEDLINE记录超过1400万篇),目前每年增加60多万篇文献记录,全部记录中76%的文献为英语2000年以来记录的90%为英语中文刊60多种,概况, 例如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等,它们收集外部链接功能,并提供到由NCBI开发的分子生物学数据库的链接。 美国国立医学图书馆提供了许多资源的链接提供了相关文献(RELATEDARTICLES )的链接,提供了其他外部资源的链接,如生物医学期刊网站的全文链接、NCBI资源。 除了、外部链接、二、PubMed文献、作者AU、标题TI、源SO、PubMed中的文献的类型(状态)、数据类型(状态)、PubMed是1966年以前的OldMedline以外,其馀的文献按处理过程分为4种类型(或状态)、和摘要和免费全文链接的图标“Summary”显示形式分别用以下图标表示该记录中是否存在摘要,是否能够免费获得全文,提供对应的链接:3,PubMed检索的特征,检索的特征,检索运算符AND,NOT,OR (可视化) andcommoncold支持短语搜索(* ),但对于短语无效。 如bacter*,以bacter为词干的单词bacteria、bacterium等最多可以检出600个单词。 在截距检索中,系统的自动词匹配功能和MeSH自动扩展功能不再运行。 例如,heartattack*不映射到MeSH语言MyocardialInfarction。 搜索特征,并且必须用英语输入双引号“”或限定字段“endorinedisrution”endocrinedisrution注意事项:“、()、-全部。 常用字段,AffiliationADAuthorAU :姚开泰(yaokaitai-yaokt,yaokaitai-yaok) tanjau与“tanjau不同的语言 la :Chinese la (前三个字符) MeSHSubheadingsSH :自动扩展子主题词关闭此功能的步骤sh:noexpMeSHTermsMH :自动扩展子主题词关闭此功能的步骤mh:noexp、公用字段1998年199663336301998DP; 1998/013364998/04 DP 发布类型 pt :查看 pt 标题 ti 文本words tw :标题、垂直、网格、网格子标题, 包含chemicalsubstanames的PersonalNameasSubject等字段Title/AbstractTIAB、4,PubMed检索功能,检索,1,自由字智能检索在检索框中输入1多个单词, 例如vitamincandcommonoldhepatitisband (diagnosisortherapy )检索词出现在PubMed的各记录的标题和摘要等所有字段中。搜索、2、作者名标记形式西方人名标记形式: Firstname、MiddleName、Lastname。 肯尼迪总统的名字是JohnFrankKenedy,Kenedy是Lastname。 Frank是Middlename,比较少,JohnF.Kenedy多,中间名被省略。 看到名字之间有逗号,逗号前一定有姓。 例如Kenedy,JohnF .检索,2,作者名标记形式中国人名形式: Lastname,Firstname。例如,钟世镇上有Shi- shizhenzhoungshi-Zhen; 222200生态生态生态生态生态生态生态653期刊的标准缩写形式(例如molbiolcell )和期刊的ISSN (国际标准出版物编号: 1059-1524 )。 如果期刊名称是单词或正好是MeSH语言表单词,则GeneTherapy、Science、Cell等必须在期刊名称后面加上ta (期刊名称字段标识符)。 搜索,3,期刊搜索杂志的全名如果包含括号或方括号,输入时应取消。 例如,杂志名为: JHandSurgAm,搜索时为: JHandSurgAm .中文期刊,汉语拼音: nanfangyikexuexbaobeijingdaxuebaozhonguakexuezhi,五、PubMed特征栏的功能介绍,(一) Limits限定检索,作者(Author ) :系统为期刊全文(FullText或FreeFullText )日期(Dates )人或动物研究(humminoranimrals )文献类型(type of ) 可以将性别(Gender )、语言(LanguAges )、年龄(ages )、文献子集限定(Subsets )自由语进行组合。、限定检索窗口的全貌、作者检索、期刊检索、限定记录为全文、免费全文或摘要、限定记录为全文、免费全文或摘要、文献发表时间限定、记录为PubMed时间限定、人与动物限定、文献语言限定、文献子集限定、文献类型限定、 研究对象年龄组限定检索域限定,检索例如姚开泰院士2001年以前发表的关于鼻咽癌的文献姚开泰,2001年以前,nasopharyngealcancesr,yaokaitaiYaokaitaiYaoktYaok,某个个人的如果还有其他搜索条件,请以“Yaok”的形式使用。 注:一次Limits检索结束后,取消上一次。(2)在preview/index功能的介绍中,preview/index只显示最近的3次检索履历,History按钮可以显示最近的100次检索履历。 (History功能的介绍,各检索式之间可以进行逻辑性的分组。 特征栏功能介绍-Clipboard,(4)clipboard功能介绍,将每次满意的检索结果通过至今为止的最后的集中处理(下载磁盘或电子邮件)最多保存500条记录,切断连接后保存8小时,Details :显示计算机的响应URL (详细资料功能介绍,http:/www.NCBI.NLM.NIH.gov/entrez/query.fcgi? cmd=pursearchzhongshizen,ZhongShizhen)2.近半年儿童白血病治疗英文文献。 (child,children; leukemia; therapy)3.1998年以来80岁以上老年人胆石症的诊断文献。 (cholelithiasis; 请参阅diagnosis )、7,PubMed主题词搜索,MeSH(MedicalSubjectHeadings )。 教材P18-23记录的医学主题语(MeSH )是指标员为PubMed中的Medline文献手工指定的语言ascorbicacid为MeSHTerms,vitaminc并非指标员使用能够正确记述文章内容的最相关的MeSH语言。 一篇文章通常可以包含多个MeSH词。 PubMed为可以自动搜索与所输入的搜索词语对应的MeSH词语的用户提供主要MeSH词语(majtopic ),该主要MeSH词语允许用户利用单个MeSH词语查找关于该主题的所有文献,以及MeSH词语特定特征: mesmethemasaminessbecommentoryofthearticle (* )二次MeSH语言扩展(explode ):chosenmethemerandallmesperesecurlingmeshtermers副主题语言(子头部) 、辅助主题词是限定一个主题词的多方面的词,也称为限定词。 例如,hepatitisb主题词涉及病因、病理、诊断、治疗、放射线照相术、微生物学等多个方面。 现在83个副主题词,并不是每个主题词都能对应83个副主题词。辅助主题词,MeSH词的优点,不同拼法:paediatric/pediatric同义词:tumor,tumour,cancer,neoplasm,进入主题词检索画面的两条路线。 有关、治疗糖尿病(Diabetes )的文献。自由语检索的结果,第一步:输入检索语。 关于糖尿病(Diabetes )治疗(therapy )的文献。 开始主题词检索,第二步:确定主题词,第三步:确定副主题词,第四步:检索,检索结束,如果想变得更准确? 如果、和第二个概念不能成为第一个概念的副标题。 有关糖尿病心理治疗的文献。 尽可能找到与第二概念相关联的第一概念的副主题词,如果找不到则选择此处,此时在此输入第二概念,如果有一个匹配的主题词则自动转到副主题词接口,如果没有合适的副主题词则选择此处搜索“阿司匹林胃溃疡文献”,以查找、阿司匹林引起胃溃疡的文献,单击“阿司匹林胃溃疡文献”,访问MeSH浏览器的首页,在问题框中输入aspirin 单击正确的主题词后,有三种选择: restrictsearchtomajortopicheadingsonly,选择子主题词adverseeffects; DoNotExplodethisterm选择sendto-searchboxwithAND,输入第二个搜索词stomachulcer,单击go,然后单击主题词stomachulcer 选择SH并单击chemicalinduced的send to- searchboxwithand PubMed search 按钮后,MeSH浏览器会通知您输入的词不是主题词,并显示相应的MeSH词。 ClinicalQueries,该功能项目具有特殊的过滤装置,可将检索结果限定为病因、诊断、预后、治疗、临床预处理等。 有助于临床医生更有效地利用Medline数据库。ClinicalQueries :8,MyNCBI个性化服务,MyNCBI,存储检索式,定期发送最新的相关文献。 设置搜索过滤器以使搜索结果更个性化。 保存检索结果的文献。 1 .存储检索式,注意大小写,1 .存储检索式,设定、2 .检索过滤器,查找能够通过、检索

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