生物化学名词解释

.第一章 核酸化学 一、名词解释 核酸的变性：高温、酸、碱等破坏核酸的氢键，使有规律的双螺旋变成无规律的“线团”。 核酸的复性：变性DNA经退火重新恢复双螺旋结构。移码：在阅读过程中，如在mRNA单链上加上或删去一个核苷酸，就会引起读码发生错误，这种加上一个核苷酸或删去一个核苷酸的过程叫移码，移码可引起突变。DNA变性在某些理化因素作用下，DNA分子互补碱基对之间的氢键断裂，使DNA双螺旋结构松散，变为单链，即为DNA变性 DNA超螺旋（DNA supercoil） DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋。超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时，其超螺旋结构为正超螺旋，反之则为负超螺旋，负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。 hnDNA 即核不均一RNA，是mRNA的前体。 DNA复性指变性DNA 在适当条件下，二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象，它是变性的一种逆转过程。核糖体RNA（ribosomal RNA, rRNA）是一种具有催化能力的核糖酶，但其单独存在时不能发挥作用，仅在与多种核糖体蛋白质共同构成核糖体（一种无膜细胞器）后才能执行其功能。minor bases稀有碱基:核酸中含量比较稀少的碱基,可看作是基本碱基的化学修饰产物.环化核苷酸，即单核苷酸中磷酸部分与核糖中第三位和第五位碳原子同时脱水缩合形成一个环状二酯、即3，5-环化核苷酸，A- DNA又称A型DNA，为DNA双螺旋的一种形式，拥有与较普遍的B-DNA相似的右旋结构，但其螺旋较短较紧密。Z-DNA又称Z型DNA，是DNA双螺旋结构的一种形式，具有左旋型态的双股螺旋（与常见的B-DNA相反），并呈现锯齿形状。信使核糖核酸（mRNA,：一类用作蛋白质合成模板的RNA。 转移核糖核酸：一类携带激活氨基酸，将它带到蛋白质合成部位并将氨基酸整合到生长着的肽链上的RNA。tRNA含有能识别模板mRNA上互补密码的反密码。DNA的一级结构是指脱氧多核苷酸链中碱基的排列顺序。单核苷酸：核苷与磷酸缩合生成的磷酸酯称为单核苷酸。 RNA的一级结构指构成核酸的四种基本组成单位核糖核苷酸（核苷酸），通过3,5磷酸二酯键彼此连接起来的线形多聚体，以及起基本单位核糖核苷酸的排列顺序。核苷酸：是核苷与磷酸通过磷酸酯键结合形成的化合物，核酸的基本结构单位。 磷酸二酯键：是两个核苷酸分子核苷酸残基的两个羟基分别与同一磷酸基团形成的共价连接键。核酸：由核苷酸或脱氧核苷酸通过3-5磷酸二酯键连接而成的大分子。具有非常重要的生物功能,主要储存遗传物质和传递遗传信息。 核酸的一级核苷酸结构:是指DNA分子中各种脱氧核苷酸之间的连接方式和排列顺序。 6、DNA二级结构:是指构成DNA的多聚脱氧核苷酸链之间通过链间氢键卷曲而成的构象。 7、碱基互补规律:在DNA分子结构中,由于碱基之间的氢键具有固定的数目和DNA两条链之间的距离保持不变,使得碱基配对必须遵循一定的规律,这就是A(腺嘌呤)一定与T(胸腺嘧啶)配对,G(鸟嘌呤)一定与C(胞嘧啶)配对,反之亦然。碱基间的这种一一对应的关系叫做碱基互补配对原则。环化核苷酸:是指单核苷酸中的磷酸基分别与戊糖的3-OH及5-OH形成的酯键,这种磷酸内酯的结构成为环化核苷酸。Tm值:是指DNA热变形时,增色效应达到50%是的温度。 增色效应:DNA从双螺旋的双链结构变为单链的无规则的卷曲状态时,在260nm处的紫外光吸收值增加。 减色效应:是变形的核酸复性时,其在260nm处的紫外光吸收值降低甚至恢复到未变形时的水平。 分子杂交:是使单链DNA或 RNA分子与具有互补碱基的另一DNA或RNA 片断结合成双链的技术。Chargaff规则：DNA分子组成的规则：A=T，G=C。不同生物种属的DNA碱基组成不同。同一个体不同器官，不同组织的DNA具有相同的碱基组成。核苷酸从头合成途径：机体利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位和CO2等小分子化合物合成核苷酸的过程。 核苷酸补救合成途径：机体利用碱基、核苷为原料合成单核苷酸的过程。 核苷酸抗代谢物：指某些嘌呤、嘧啶、叶酸及氨基酸类似物具有通过竞争性抑制等方式干扰或阻断核苷酸的正常代谢，从而进一步抑制核酸、蛋白质的合成以及细胞增殖的作用，这些药物即为核苷酸抗代谢物。 细胞水平调节：通过细胞内代谢物浓度的变化，对酶的活性及含量进行调节的方式。 整体水平调节：在中枢神经系统控制下，机体通过神经递质、激素等对代谢进行综合调节的方式。第二章 蛋白质化学 肽：由两个或两个以上氨基酸借肽键连接而形成的链状化合物。活性肽(active peptide ):存在于生物体内，具各种特殊生物学功能的分子量比较小的肽。肽键平面（肽单元）：肽键中的C-N键具有部分双键的性质，不能自由旋转，因此，肽键中的C、O、N、H四个原子处于一个平面上，称为肽键平面或肽单元。Edman降解（Edman degradation）：从多肽链游离的N末端测定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被苯异硫氰酸酯修饰，然后从多肽链上切下修饰的残基，再经层析鉴定，余下的多肽链（少了一个残基）被回收再进行下一轮降解循环。两面角：是肽单位上-碳原子的C- 和C-C的旋转角度。GSH ：即谷胱甘肽，是由谷氨酸，半胱氨酸和甘氨酸通过肽键缩合而成的三肽。 功能蛋白质组（functional proteome） 指的是特定时间、特定环境和实验各种下，基因组活跃表达的蛋白质。 肽键（peptide bond ) 在蛋白质分子中，一分子氨基酸的-羧基与另一分子氨基酸的-氨基脱水缩合后而形成的酰胺键称为肽键。 基序/模体（motif） 模体属于蛋白质的超二级结构，由2个或2个以上具有二级结构的的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，并发挥专一的功能。一种类型的模体总有其特征性的氨基酸序列。 氨基酸残基在多肽链中的氨基酸，由于其部分基团参与了肽键的形成，剩余的结构部分则称氨基酸残基。它是一个分子的一部分，而不是一个分子。 维空间的排布位置。 别构效应（allosteric effect）当蛋白质（酶）与它的配体（某种小分子物质）结合后，引起蛋白质（酶）的空间结构（构象）发生改变，使其适合功能的需要，这种变化称别构效应或变构效应。 协同效应：具有四级结构的蛋白质，当一个亚基与其配体结合后，能影响蛋白质分子中萁他亚基与配体的结合能力。如果是促进作用则称为正协同效应；反之际，则为负协同效应。盐析（Salting out） 向某些蛋白质溶液中加入某些无机盐溶液后，可以使蛋白质凝聚而从溶液中析出，这种作用叫作盐析，可复原。两性离子：在同一氨基酸分子中既有氨基正离子又有羧基负离子。 必需氨基酸：机体内不能合成，必需从外界摄取的氨基酸. 等电点：氨基酸氨基和羧基的解离度相等，氨基酸分子所带净电荷为零时溶液的pH值。蛋白质的沉淀作用：蛋白质分子表面水膜被破坏，电荷被中和，蛋白质溶解度降低而沉淀 。 电泳：蛋白质分子在电场中泳动的现象。 沉降系数：一种蛋白质分子在单位离心力场里的沉降速度为恒定值，被称为沉降系数。构象:是指具有相同结构式和相同构型的分子在空间里可能的多种形态。构型:是指具有相同分子式的立体结构体中取代基团在空间的相同取向。 肽平面:是指多肽链或蛋白质分子中,组成肽键的C、O、N、H4个原子与两个相邻的碳原子共处一个平面。螺旋:蛋白质中常见的一种二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。 转角:是指在多肽链的主链骨架中,经常出现180度的转弯,这种结构常常连接两条反平行的折叠。 折叠:是指两条或多条几乎完全展开的条肽链,借助于链间形成的氢键,侧向聚集在一起的折叠的层状结构。 无规则卷曲:是指除了螺旋、转角、折叠这三种有规则的二级结构外,在球蛋白分子的多肽链主链骨架中还存在一些无确定规律性盘曲。蛋白质的一级结构: 是指蛋白质多肽链中氨基酸的残基从N末端到C末端的排列顺序即氨基酸序列。 蛋白质的二级结构:是指蛋白质多肽链主链上的某些肽段可以借助氢键形成一些有规则的构象。 蛋白质的三级结构:是指在二级结构、超二级结构乃至结构域的基础上,由肽链的不同区段的侧链基团相互作用,在空间进一步盘旋、折叠,形成包括主链和侧链构型在内的、近似球状的特征性三维结构。 蛋白质的四级结构:是指两个和两个以上具有三级结构的亚基,通过非共价键彼此缔合在一起而形成的三位构象。 简单蛋白质:又称单纯蛋白质,它被水解之后,只产生各种氨基酸。 结合蛋白质:由蛋白质和非蛋白质2部分组成,水解时除了产生氨基酸外还产生非蛋白部分。 蛋白质的变性作用:是指蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失。蛋白质的互补作用：把几种营养价值较低的蛋白质混合食用以提高营养价值的作用，称为蛋白质的互补作用。不同蛋白质的互补作用实质上是其氨基酸成分互相补充的结果蛋白质的复性:是指蛋白质的变形作用如果不过于强烈,当除去变形因素后,可重新恢复原来的天然构象,并恢复全部的生物活性。 亚基:寡聚蛋白和多聚蛋白这两种蛋白质中的肽链可称为亚基或亚单位。 超二级结构: 在蛋白质中某些相邻的二级结构单元常常相互靠近、彼此作用,在局部区域形成有规则的二级结构聚合体充当更高层次结构的构件。 结构域:是指对于较大的球状蛋白分子,它的一条长的多肽链在超二级结构的基础上进一步卷曲折叠,形成若干个空间上相对独立、且具有一定功能的近似球状的紧密球体。细胞色素：是以铁卟啉为辅基的结合蛋白质广泛存在于各种生物的组织细胞中因其为细胞内的色素物质，故名细胞色素。 细胞色素氧化酶：细胞色素a组中，a与a3不易分开。并且在呼吸链中细胞色素aa3结合在一起，直接将电子传递给氧，使氧还原成O2-与2H+结合生成H2O，故细胞色素aa3又称细胞色素氧化酶。 细胞色素P450：P450是一种属于细胞色素b组的色素，因其还原型与CO结合时，在450nm波长处有最大吸收峰，故名为细胞色素P450。 第三章 酶 必需基团：指与酶活性有关的化学基团，必需基团可以位于活性中心内，也可以位于酶的活性中心外。Km值是当酶反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度的大小。 共价修饰（covalent modification）酶分子上某些特殊基团在其他酶作用下，发生可逆的共价结合而被修饰，并快速改变的活性称共价修饰调节或化学修饰。米氏方程（Michaelis-Menten equation）表示酶促反应的起始速度与底物浓度关系的速度方程，VVmaxS/（Km+S）。酶：是由活细胞产生的在体内外都具有催化作用的一类生物催化剂。酶原与酶原激活：在细胞中合成或初分泌时酶的无活性的前体称作酶原。由无活性的酶原转变为有活性的酶的过程称酶原激活。变构剂：酶分子中除了具有活性中心外，还有能于调节物结合的别构中心的一类酶。活化能：一摩尔常态分子转变成活化分子所需要的能量。 共价修饰酶：调节剂以共价键与酶结合，有活性和非活性两种形式。诱导酶：当细胞内加入特定诱导物质后诱导产生的酶或含量显著增加的酶。全酶:酶分子中除蛋白质部分外,还含有对热稳定的非蛋白质的有机小分子或金属离子这类酶称为结合酶,或称为全酶。 酶的辅助因子:主要包括金属离子和小分子有机化合物,在酶促反应中主要决定反应的种类和性质,在反应中起到传递电子、原子或某些化学基团的作用。辅酶和辅基:辅酶是指以非共价键和酶蛋白结合的小分子有机物质,通过透析或超滤等物理方法可以除去。辅基是指以共价键和酶蛋白结合的小分子有机物质,不能通过透析或超滤的方法除去。巯基酶：酶活性中心中主要的必需基团是半胱氨酸巯基的酶又常称之为巯基酶。酶的必需基团：酶的活性中心中包含着酶蛋白多肽链中一些氨基酸残基上特有的基团它们有的是结合基团主要是通过酶与底物的结合有的是催化基团主要是酶催化底物起化学反应但两者之间也没有明显的界限故总称之为酶的必需基团。酶活力:又称酶活性是指酶催化化学反应的能力。 米氏常数:酶促反应速度达到最大速度一半时的底物浓度。激活剂:提高酶活性的物质。 抑制剂:能使酶分子的某些必需基团发生变化,从而引起酶活性的下降,甚至消失,使酶反应下降的物质。 诱导剂：加速酶合成的化合物称为诱导剂。阻遏剂：减少酶合成的化合物称为阻遏剂。不可逆抑制作用与可逆抑制作用:可抑制作用是指抑制剂以非共价键与酶蛋白的基团结合,能用透析等物理方法除去的抑制作用。不可抑制作用是指某些抑制剂通常以共价键与酶蛋白中的基团结合,而使酶失活,不能用透析等物理方法除去的抑制作用。竞争性抑制作用:抑制剂的结构与底物结构相似,能与底物竞争结合在酶的活性中心,从而降低或抑制酶活性这种抑制作用称竞争性抑制剂,这种抑制作用称竞争性抑制作用。 非竞争性抑制作用:有些抑制剂可与酶活性中心以外的必需基团结合,不影响酶与底物的结合,抑制剂和底物可同时结合在酶分子上,形成酶-底物-抑制剂复合物,不能释放出产物,使酶活性丧失,这种抑制剂称为非竞争性抑制剂,这种抑制作用称为非竞争性作用。 酶的专一性:即酶的特异性是指酶催化特定底物发生一定的化学反应生成特定产物的特征。 酶的特异性：酶对催化的底物有较严格的选择性，即一种酶仅作用于一种或一类化合物或一定的化学键，催化一定的化学反应生成一定的产物。酶的这种特性称酶的特异性。酶的活性中心:是指酶分子中直接与底物结合,并和酶催化反应相关的部位活性中心也称活性部位。 多酶体系:由几个酶彼此嵌合形成的复合体称为多酶体系。 寡聚酶:由几十甚至几十个亚基组成,相对分子质量在35000至几百万的酶称为寡聚酶。 16、同工酶:催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构,理化性质和免疫学性质不同的组酶。 酶的比活力:又称比活性,是指每毫克酶蛋白所具有的活力单位。 别构效应:当调节物与酶分子上的相应部分结合后,引起酶的构像改变而影响酶的催化活性,这种作用叫变构效应又称别构效应。 别构酶:即变构酶,是重要的调节酶,其分子除了含结合部位和催化部位,还有调节部位调节部位可与调节物结合,改变酶分子的构变,并引起酶催化活性的改变。 逆转录酶：能使RNA逆转录成DNA的酶，称为逆转录酶。该酶又称为RNA指导的DNA聚合酶。共价调节酶:是体内调节酶活性的又一重要的酶,有些酶分子的某些氨基酸残基能够与某些团基发生可逆的共价结合,从而引起酶活性的变化,这类酶称共价调节酶。变构调节 (allosteric regulation)：小分子化合物与酶分子活性中心以外的某一部位特异结合，引起酶蛋白分子构象变化，从而改变酶的活性，这种调节称为酶的变构调节或别构调节。被调节的酶称为变构酶或别构酶，使酶发生变构效应的物质，称为变构效应剂，包括变构激活剂和变构抑制剂。 化学修饰调节：（chemicalmodification）酶蛋白肽链上某些残基在酶的催化下发生可逆的共价修饰，从而引起酶活性改变，这种调节称为酶的化学修饰。主要包括：磷酸化去磷酸化；乙酰化脱乙酰化；甲基化去甲基化；腺苷化脱腺苷化；SH与SS互变等；磷酸化与脱磷酸是最常见的方式。酶的变构效应：当小分子的变构剂与酶活性中心以外的调节亚基结合后，使酶的空间构象发生改变，从而影响酶的活性，这种现象称为酶的变构效应。酶的变构调节：某些物质（变构剂）能与酶分子上的非催化部分结合，诱导酶蛋白分子构象发生改变而改变其活性。酶的化学修饰：某些酶分子上的一些基团，受其它酶的催化发生化学变化，从而导致酶活性改变。结合酶：由蛋白质和非蛋白质部分所组成的酶。单纯酶：仅有氨基酸所组成的酶，没有非蛋白质的部分。维生素：是机体维持正常功能所必需，但在体内不能合成，或合成量很少，必须由食物供给的一组小分子有机化合物。微量元素：每人每日的需要量在100mg以下的元素。脂溶性维生素：是一类不溶于水、而溶与有机溶剂的维生素，在食物中与脂类共存。水溶性维生素：是一类易溶于水、在体内不易储存，已从尿中排出的维生素。DNA印渍技术（Southern blotting）：是将基因组DNA经限制性内切酶消化后进行琼脂糖凝胶电泳，再利用毛细作用将胶中的DNA分子转移到NC膜上进行杂交反应的技术。主要用于基因组DNA的分析。探针：用同位素、生物素或荧光染料标记DNA分子的末端或全链的一段已知序列的多聚核苷酸称为探针，可用于检测已固定在膜上的DNA或RNA片段的同源序列。蛋白质的检测常用抗体作为探针。基因芯片：是指采用原位合成或显微打印手段，将数以万计的DNA探针固化于支持物表面上，产生二维DNA探针阵列，然后与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号来实现对生物样品快速、并行、高效地检测或医学诊断。激素水平调节：通过器官或细胞分泌的激素对某代谢进行调节的方式称为激素水平调节 第四章 糖代谢 乳酸循环：是指肌肉缺氧时产生大量乳酸，大部分经血液运到肝脏，通过糖异生作用肝糖原作用再生成葡萄糖补充血糖，血糖可再被肌肉利用。发酵 ：厌氧有机体把糖酵解生成NADH中的氢交给丙酮酸脱羧后的产物乙醛，使之生成乙醇的过程。 肝糖原分解：指肝糖原分解为葡萄糖的过程。糖类: 糖类使多羟基醛或酮及其缩聚物和衍生物的总称。糖蛋白: 糖蛋白是一类由糖和多肽或蛋白质以共价键连接而成的结合蛋白。糖苷: 糖苷是由单糖或寡糖通过糖苷键与配基（如醇类、酚类、醛类或含氮碱等）结合而成的糖衍生物。糖脂: 是一个或多个单糖残基通过糖苷键与脂类连接而成的化合物是生物膜的组成成分之一。糖酵解途径:葡萄糖和糖原分子分解至生成丙酮酸的阶段。 糖酵解:在细胞质中,无氧条件下葡萄糖分体成乳酸,并产生ATP的过程,又称糖的无氧分解。 糖的有氧氧化:在有氧条件下,葡萄糖分解生成二氧化碳和水并释放能量的过程。 糖异生:非糖物质转变为葡萄糖或糖原的过程。磷酸戊糖途径:在某些组织中,以葡萄糖的6-磷酸为起始物,经过一些列酶促反应,生成二氧化碳,无极磷酸和DADPH。 三羧酸循环:在线粒体中,乙酰COA和草酰乙酸缩合生成柠檬酸,经历一系列酶促反应重新生成草酰乙酸,而将乙酰COA彻底氧化生成水和二氧化碳,并释放能量。 糖原: 糖原是由葡萄糖组成的非常大的有分支的高分子化合物，是动物体内葡萄糖的储藏形式。巴斯德效应（Pasteur effect）有氧氧化抑制糖酵解的现象。第八章 生物氧化：生物氧化：生物体内有机物质氧化而产生大量能量的过程。细胞色素：是一类以铁卟啉为辅基的催化电子传递的酶类，有特殊的吸收光谱而呈现颜色。 呼吸链：有机物在生物体内氧化过程中所脱下的氢原子，经过一系列有严格排序的传递体组成的传递体系进行传递，最终与氧结合生成水，这样的电子或氢原子的传递体系称为呼吸链。 氧化磷酸化 ：在底物脱氢被氧化时，电子或氢原子在呼吸链上的传递过程中伴随ADP磷酸化生成ATP的作用。磷氧比；消耗一个原子的氧所要消耗的无机磷酸的分子数底物水平磷酸化：在底物被氧化的过程中，底物分子内部能量重新分布产生高能磷酸键，由此高能键提供能量使ADP磷酸化生成ATP的过程称为高能化合物：指水解可释放的能量能驱动ADP磷酸化生成ATP的化合物。解偶联剂：一种使电子传递与ADP磷酸化之间的紧密偶联关系解除的化合物。化学渗透学说：是一种理论，认为底物氧化期间建立的质子浓度梯度提供了驱动ADP和磷酸形成ATP的能量 。高能键: 水解时能释放5000cal以上自由能的键。第九章 氨基酸代谢氮平衡：指机体摄入氮与排出氮的对比关系，反映体内蛋白质的代谢情况。PAPS：是3-磷酸腺苷-5-磷酸硫酸的英文缩写，也称活性硫酸根，其性质比较活泼，可使某些物质形成硫酸酯。 活性甲硫氨酸：也称S-腺苷甲硫氨酸，由甲硫氨酸腺苷转移酶催化甲硫氨酸与ATP作用生成。活性甲硫氨酸可作为甲基供体提供甲基，使受体物质甲基化。必需氨基酸 (essential amino acid) 指体内需要而又不能自身合成，必须由食物供给的氨基酸，共有8种。非必需氨基酸：动物体自身能够由简单的前体合成，不需要由饲料供给的氨基酸。一碳单位 (one carbon unit) 某些氨基酸代谢过程中产生的只含有一个碳原子的基团，称为一碳单位。 氨基酸代谢库(metabolic pool):食物蛋白经消化吸收的氨基酸（外源性氨基酸）与体内组织蛋白降解产生的氨基酸（内源性氨基酸）混在一起，分布于体内各处参与代谢，称为氨基酸代谢库。 生酮氨基酸（ketogenic amino acid）分解代谢过程中能转变成乙酰乙酰辅酶A的氨基酸，共有亮氨酸、赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸5种。生糖氨基酸（glucogenic amino acid）能通过糖异生转变成葡萄糖的氨基酸。 鸟氨酸循环 (orinithine cycle) 尿素生成的过程由Hans Krebs 和Kurt Henseleit 提出，称为鸟氨酸循环，又称尿素循环(urea cycle)或Krebs- Henseleit循环。 苯酮尿症（phenylketonurics，PKU）是一种常见的氨基酸代谢病，是由于苯丙氨酸代谢途径中的酶缺陷，使得苯丙氨酸不能转变成为酪氨酸，导致苯丙氨酸及其酮酸蓄积并从尿中大量排出。 联合脱氨基作用（transdeamination） 转氨与脱氨相偶联而脱出氨基的作用称联合脱氨基作用，亦称转氨脱氨基作用。 肝昏迷：氨进入脑组织，与其中的-酮戊二酸结合成谷氨酸，也可进一步与谷氨酸结合生成谷氨酰胺。这样，氨可使大脑细胞中的-酮戊二酸含量减少，导致三羧酸循环减慢，使ATP生成减少，引起大脑功能障碍，严重时可发生昏迷，称为肝昏迷或肝性脑病。苯丙酮尿症，若肝脏中缺乏苯丙氨酸羟化酶，则体内的苯丙酮酸含量增多，尿中排出量也增多，称为苯丙酮尿症。高氨血症：肝功能严重损害时，尿素合成受阻，血氨升高，称高血氨症。丙氨酸-葡萄糖循环 (alanine-glucose cycle) 丙氨酸和葡萄糖反复的在肌和肝之间进行氨的转运，故将这一途径称为丙氨酸-葡萄糖循环。 氧化脱氨基（oxidative deamination）氨基酸先经过脱氢生成不稳定的亚氨基酸，然后水解产生-酮酸和氨，此反应成为氧化脱氨基作用。 转氨基作用 (transamination) 在转氨酶作用下，某一氨基酸的-氨基转移到另一种-酮酸的酮基上，生成相应的氨基酸，原来的氨基酸则转变成-酮酸的过程。 尿素的肠肝循环 血液中的尿素渗入肠道，受肠菌尿素酶水解而生成氨的过程。 -谷氨酰基循环 (-glutamyl cycle) 指通过谷胱甘肽的代谢作用将氨基酸吸收和转运的过程。 蛋氨酸循环SAM通过转甲基作用，将甲基转移给甲基接受体后，其本身转变为S-腺苷同型半胱氨酸，进而又转变成同型半胱氨酸，同型半胱氨酸可接受N5-CH3-FH4分子中的甲基再生成蛋氨酸。从蛋氨酸活化为SAM到转出甲基以及再生成蛋氨酸的全过程称为蛋氨酸循环。甲硫氨酸循环(methionine cycle)： 甲硫氨酸和ATP作用转变成S-腺苷甲硫氨酸（SAM），SAM是甲基的直接供体，参与许多甲基化反应，与此同时产生S-腺苷同型半胱氨酸进一步转变成同型半胱氨酸，后者可接受N5CH3FH4的甲基重新生成甲硫氨酸，形成一个循环过程称作甲硫氨酸循环。其生理意义是：SAM提供甲基以进行体内广泛存在的甲基化反应；N5CH3FH4提供甲基合成甲硫氨酸，同时使N5CH3FH4的FH4释放，再参与一碳单位的代谢。嘌呤核苷酸循环：嘌呤核苷酸循环是心肌、骨骼肌的一种重要的脱氨基方式，这种脱氨基作用是通过连续转氨将氨基转移到草酰乙酸分子上，生成天冬氨酸，然后冬氨酸与IMP综合生成腺苷酸代琥珀酸，腺苷酸代琥珀酸裂解后生成延胡索酸和AMP，AMP脱氨生成IMP，IMP再参与循环。-磷酸甘油穿梭(-glycerophosphate shuttle)：在哺乳动物的脑、骨骼肌中，当胞液的NADH较多时，在胞液中磷酸甘油脱氢酶的作用下，使磷酸二羟丙酮还原成磷酸甘油，后者通过线粒体外膜，再经位于线粒体内膜胞液侧的磷酸甘油脱氢酶的催化下，氧化生成磷酸二羟丙酮和FADH2。磷酸二羟丙酮可传出线粒体外膜至胞液继续进行穿梭，而FADH2则进入琥珀酸氧化呼吸链同时生成1.5molATP。（1、存在于脑和骨骼肌；2、过程可用图示；3、NADH被转运入线粒体进行氧化磷酸化；4、最终生成1.5molATP） 苹果酸-天冬氨酸穿梭 (malate-asparate shuttle)：该穿梭机制存在于心肌和肝中，胞液中的NADH在苹果酸脱氢酶的作用下，使草酰乙酸还原生成苹果酸，后者通过线粒体内膜上的-酮戊二酸载体进入线粒体，又在线粒体内苹果酸脱氢酶的作用下重新生成草酰乙酸和NADH。NADH进入NADH氧化呼吸链，生成2.5molATP。线粒体内的草酰乙酸经谷草转氨酶的作用生成天冬氨酸，后者经酸性氨基酸载体转运出线粒体，再转变成草酰乙酸，继续进行穿梭。（1、存在于肝和心肌；2、过程可用图示；3、NADH被转运入线粒体进行氧化磷酸化；4、最终生成2.5molATP）蛋白质的腐败作用（putrefaction of protein）：蛋白质消化过程中，一部分不被消化，一部分消化产物不被吸收。肠道细菌对这部分蛋白质及消化产物的分解，称为蛋白质的腐败作用。第十一章 含氮小分子的代谢名词解释：氮平衡:指正常人摄入氮等与排出氮，反映正常人的蛋白质代谢情况。转氨基作用:在转氨酶作用下，一种氨基酸的氨基转移到另一种酮酸上生成新的氨基酸，原来的氨基酸则转变为酮酸，此过程成为转氨基作用。联合脱氨基作用:指氨基酸与酮酸和谷氨酸，经L谷氨酸脱氢酶作用生产游离氨和酮戊二酸的过程，是转氨基作用和L 谷氨酸氧化脱氨基作用联合反应。嘌呤核苷酸循环:指骨骼肌中存在的一种氨基酸脱氨基作用方式，即通过嘌呤核苷酸循环脱去氨基的作用。尿素循环:尿素循环即鸟氨酸循环，是将有毒的氨转变为无毒的尿素的循环。肝脏是尿素合成的重要器官 。嘌呤核苷酸的从头合成途径：利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位、二氧化碳等小分子物质为原料，经过一系列酶促反应合成的过程。嘌呤核苷酸的补救途径：是利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷，经过简单的反应过程合成的途径。胆汁酸的肝肠循环（bile acid enterohepatic circulation）：在肝细胞合成的初级胆汁酸，随胆汁进入肠道，协助脂类物质的消化吸收后，受肠菌作用转变为次级胆汁酸。肠道中各种胆汁酸约95%被肠道重吸收经门静脉入肝，并同新合成的胆汁酸一起再次被排入肠道，这一过程被称为胆汁酸的肠肝循环。意义：将有限的胆汁酸反复利用以满足人体对胆汁酸的生理需要。 胆素原的肠肝循环(bilinogen enterohepatic circulation):肠道中有少量的胆素原可被肠粘膜细胞重吸收，经门静脉入肝，其中大部分再随胆汁排入肠道，形成胆素原的肠肝循环。只有少量经血液循环入肾并随尿排出，胆素原接触空气后被氧化成尿胆素,后者是尿的主要色素。第十二章 物质代谢的联系与调节第十三章 DNA的生物合成复制基因：能够表达和产生蛋白质和RNA的DNA序列，是决定遗传性状的功能单位。基因：DNA分子功能片断中相应的碱基顺序。基因组：细胞或生物体的一套完整单倍体的遗传物质的总和。复制：细胞中的 DNA分子必须进行自我复制，将亲代DNA的遗传信息准确地传递到子代DNA分子中，这一过程称为DNA复制。第二信使：能将细胞外信息转导到细胞内，在细胞内传递特异信号的信号分子。核糖体：由rRNA与核糖体蛋白共同构成，分为大、小两个亚基。核糖体的功能是作为细胞内蛋白质的合成场所。在核糖体中，rRNA和核糖体蛋白共同为mRNA、tRNA与氨基酸的复合物、翻译起始因子、翻译延长因子等多种参与蛋白合成过程的分子提供了识别和结合部位。多聚核糖体：一条mRNA分子可以同时结合多个核糖体，形成一串核糖体，成为多聚核糖体。反义核酸：同某种天然的信使RNA（mRNA）反向互补的RNA分子称为反义核酸（反义RNA）。A site:A部位也称氨酰基部位或受位,主要位于核糖体大亚基上,是接受氨酰基-tRNA的部位。 P site:P部位又称肽酰基部位或供位,主要位于核糖体小亚基上,是肽酰基-tRNA移交肽链后,tRNA释放的部位。端粒：是指真核生物染色体线性DNA分子末端膨大成粒状的结构，像两顶帽子那样盖在染色体两端，因而得名。端粒在维持染色体的稳定性和DNA复制的完整性有重要作用。点突变：DNA分子上一个碱基的变异，可分为转换和颠换两种。半保留复制（semiconservative replication）DNA的复制方式，亲代双链分离后，每条单链均作为新链合成的模板。因此，复制完成时将有两个子代DNA分子，且每个分子的核苷酸序列均与亲代分子相同。 拓扑异构酶DNA拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶，能够催化DNA链的断裂和结合，从而控制DNA的拓扑状态，以克服DNA复制过程中解链时产生的扭结现象。 复制叉（replication fork）DNA复制时在DNA链上通过解旋、解链和SSB蛋白的结合等过程形成的Y字型结构称为复制叉。在复制叉处，作为模板的双链DNA解旋，同时合成新的DNA链。 黏性末端：限制性核酸内切酶交错切割双链DNA，产生具有数个特定碱基的单链尾巴，称为黏性末端。解链温度melting temperature:双链DNA 融解彻底变成单链DNA的温度范围的中点温度。端粒酶（telomerase） 是基本的核蛋白逆转录酶，可将端粒DNA加至真核细胞染色体末端。 限速酶（关键酶）：是指在整条代谢通路中催化反应速度最慢的酶，它不但可以影响整条代谢途径的总速度，而且还可改变代谢方向。前导链（leading strand） 与复制叉移动的方向一致，通过连续的5-3聚合合成的新的DNA链。 后随链（lagging strand） 与复制叉移动的方向相反，通过不连续的5-3聚合合成的新的DNA链。 互补链：按照核酸中碱基互补的原则，两条核苷酸单链在一定条件下能相互作用，形成双链核苷酸链，它们彼此之间称为互补链。有义链：DNA双链在转录过程中与转录形成的mRNA序列相同（T对应U）的那条单链叫做有义链或正义链（sense strand）。反义链：基因的DNA双链中，转录时作为mRNA合成模板的那条单链叫做模板链或反义链终止因子，1D(Rho)因子分子量为50000，在体内以四聚体形式存在，主要是帮助RNA聚合酶识别模板上的终止信号，停止转录，故又称终止因子。cDNA链：在逆转录酶的作用下，以4种dNTP为底物，利用RNA作为模板，合成一条与模板互补的DNA链，称cDNA链。单顺反子（monocistron）：真核基因转录产物为单顺反子，即一条mRNA模板只含有一个翻译起始点和一个终止点，因而一个基因编码一条多肽链或RNA链，每个基因转录有各自的调节元件。多顺反子：原核细胞中，数个结构基因串联排列成一个转录单位，转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质，称为多顺反子 单顺反子：真核细胞的一个mRNA分子只编码一种蛋白质，称为单顺反子半不连续复制 (Semi-ondisctinuousreplication) DNA复制的基本过程，指DNA复制时，前导链上DNA的合成是连续的，后随链上是不连续的，故称为半不连续复制。 Klenow片段（Klenow fragment） E.coli（大肠杆菌）DNA聚合酶I经部分水解生成的C末端605个氨基酸残基片段。该片段保留了DNA聚合酶的5-3聚合酶和3-5外切酶活性，但缺少完整酶的5-3外切酶活性。 引发体（primosome） 蛋白复合体，主要成份是引物酶和DNA解旋酶，是在合成用于DNA复制的RNA引物时装配的。引发体与DNA结合后随即由引物酶合成RNA引物。转录：以DNA的模板链为模板，以4种NTP为原料，在DNA指导的RNA聚合酶的催化下，按照碱基互补的 翻译是根据遗传密码的中心法则，将成熟的信使RNA分子（由DNA通过转录而生成）中“碱基的排列顺序”（核苷酸序列）解码，并生成对应的特定氨基酸序列的过程。反转录（reverse transcription） 反转录是以反义RNA为模板通过反转录酶合成DNA的过程，也称逆转录，是DNA生物合成的一种特殊方式。 滚环复制（rolling-circle replication） 噬菌体中常见的DNA复制方式。亲代DNA的一条链在复制起点处被切开，其5端游离出来。这样，DNA聚合酶便可以将脱氧核糖核苷酸聚合在3-OH端。当复制向前进行时，亲代DNA上被切断的5端继续游离下来，并且很快被单链结合蛋白所结合。因为5端从环上向下解链的同时伴有环状双链DNA环绕其轴不断的旋转，而且以3-OH端为引物的DNA生长链则不断地以另一条环状DNA链为模板向前延伸，因而称为滚环复制。 双向复制（bidirectional replication） DNA合成时从一个单独的复制起始点上形成两个复制叉，然后相背而行，这种复制方式称为双向复制冈崎片段:DNA双链中，合成方向与复制叉移动方向不同的单链，其在合成时，先形成小的DNA片段，称为冈崎片段滞后链 DNA的两条链是反向平行，而DNA两条单链的复制方向是从53端方向，所以一条单链的合成方向与复制叉移动方向相反，是不连续合成的，其先合成一个个片段然后再连接成链。这条单链称为滞后链中间产物学说：中间产物学说是目前公认的用来解释酶降低活化能、加速化学反应的原理的学说。该学说认为，在酶促反应中，底物先与酶结合形成不稳定的中间物，然后再分解释放出酶与产物。酶和底物形成过渡态的中间物时，要释放出一部分结合能，从而使得过渡态的中间物处于较低的能及，使整个反应的活化能降低。第十四章 RNA的生物合成转录一 名词解释转录单位：DNA链的转录起始于DNA模板的一个特殊起点，并在一终点处终止，此转录区域称为转录单位。一个转录单位可是一个基因，也可是多个基因。断裂基因：真核生物的基因内部编码序列被非编码序列相间隔，这种基因结构成为短裂基因内含子：真核生物的断裂基因中的非编码序列称为内含子。其转录产生的RNA片段在RNA的修饰过程中被剪切掉。外显子：真核生物的断裂基因中的编码序列称为外显子。其转录产生的RNA片段在RNA的修饰过程中保留下来并编码肽链。启动子：在基因上游的特殊碱基序列，一般包括RNA聚合酶的识别、结合位点和转录的起始位点。 不对称转录：对于某个基因来说，在转录进行时，DNA双链中只有一条链可作为模板，指导合成与其互补的RNA，此DNA链称模板链，另一条链不能作为转录的模板称为编码链。但同一个DNA分子不同基因的模板链并不是全在同一条DNA单链上，这种转录方式称为不对称转录。 遗传密码：mRNA分子上从53方向，由起始密码子AUG开始，每3个核苷酸组成的三联体，决定肽链上某一个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号，称为三联体密码，也叫密码子。密码子：mRNA分子上，相邻的三个核苷酸组成三联体，它对应于一个氨基酸，此三联体称密码子。反密码子：存在于tRNA的反密码环中，可与mRNA上相应的三联体密码子形成碱基互补，从而tRNA能将氨基酸携带至核糖体上参与蛋白质合成。摆动配对：mRNA分子上的密码子和tRNA分子上的反密码子配对结合时，密码子的第3个碱基和反密码子的第一个碱基结合是不严格遵照碱基互补原则的，此现象称摆动配对。 分子病：由于DNA分子上基因的遗传性缺陷，引起mRNA异常和蛋白质合成障碍，导致机体结构和功能异常所致的病症称为分子病。 信号肽：未成熟分泌性蛋白质中可被细胞转运系统识别的特征性氨基酸序列。有碱性N末端区、疏水核心区及加工三个区段。 基因表达：遗传遗传信息从DNA传递给RNA和以mRNA为模板翻译成蛋白质的过程。 基因表达调控：指对基因组中某一个基因或一些功能相近的基因表达开启、关闭和表达强度的调节。其调控可发生在多级水平，以转录水平的调节最重要。 基因组：指含有一个生物体生存、发育活动和繁殖所需要的全部遗传信息的整套核酸。 管家基因：某些基因产物对生命过程都是必需的或必不可少的。这类基因在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达，通常被称为管家基因。顺式作用元件：是指可影响自身基因表达活性的真核DNA序列。分为启动子、增强子及沉默子等。 反式作用元件：为一类细胞核内蛋白质因子，主要功能是使基因开放或关闭，通过与特异的顺式作用元件相互作用，反式激活另一基因的转录，故称反式作用因子。 增强子：远离转录起始点（130kb），增强启动子转录活性的DNA序列，其发挥作用的方式通常与方向、距离无关。结构基因是一类编码蛋白质或RNA的基因调节基因regulator gene ：控制另一些远离基因的产物合成速率的基因。高度重复顺序（highly repetitivesequence），由较短的顺序105107次直线连结而成，其中含随体DNA等。中等程度的重复顺序（moderately repetitive sequence），为有300500个核苷对的大致相同的顺序单拷贝基因：基因组中仅出现一次的基因称单拷贝基因，多为编码蛋白质的结构基因。单拷贝DNA 就是单一序列，就是说这段DNA序列的碱基组成及排列顺序在整个基因组里是唯一的,没有其他序列与之相同, . 常常构成为蛋白编码的结构基因，更确切的说是外显子部分中心法则：DNA通过复制将遗传信息由亲代传递给子代通过转录和翻译将遗传信息传递给蛋白质分子从而决定生物体的表型。DNA的复制、转录和翻译过程就构成了遗传学的中心法则DNA处于生命活动的中心。 反中心法则：在RNA病毒中其遗传信息贮存在RNA分子中遗传信息的流向是RNA通过复制将遗传信息由亲代传递给子代通过反转录将遗传信息传递给DNA再由DNA通过转录和翻译传递给蛋白质。第十五章 蛋白质的生物合成翻译第十六章 基因表达的调节概念：基因表达：是指基因转录成mRNA ，然后进一步翻译成蛋白质的过程。结构基因；可被转录为mRNA，并被翻译成各种具有生物功能的蛋白质的DNA序列。调节基因；某些可调节控制结构基因表达的DNA序列。操纵子；原核生物基因能表达的调节序列或功能单位，有共同的控制区和调节系统，它包括结构基因和控制部位。负调节 指开放的乳糖操纵子可被调节基因能的编码产物阻遏蛋白所关闭。分解代谢产物阻抑；当大肠杆菌利用完葡萄糖后再激活乳糖操纵子，从而利用乳糖继续生长。反义RNA：指能与mRNA互补结合从而阻断mRNA翻译的RNA分子，它是反义基因和或基因的反义链转录产物，对基因表达的调节是一种翻译水平的调节。第十七章 核酸技术概念：基因诊断：应用DNA重组技术对基因组DNA进行分析，一判断某种遗传疾病是否存在基因能缺陷。 DNA指纹图谱；由于同一家族的小卫星DNA重复单位含有相同或相似的核心序列。于是用小卫星DNA作为探针，可以同时和同一物种的多种酶切基因组DNA片段杂交，或得具有高度个体特异性的杂交图谱，其特异性向人的指纹一样因人