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文档简介

.,DNAreplication,.,关于DNA复制的基本问题:1、双螺旋DNA复制的基本模型2、参与DNA复制的蛋白质及其作用3、不同生物中的DNA复制,.,DNA复制模型,半保留复制(semiconservative)半不连续复制(semidiscontinuous)RNA引物复制方向双向复制bidirectional(普遍)单向复制unidirectional,.,Parentalstrands,Semi-conservative,Conservative,Dispersive,Daughterstrands,.,Meselson-Stahl实验,14N-14N,14N-15N,15N-15N,15NH4Cl,14NH4Cl,20min,40min,.,半不连续复制,连续复制,不连续复制,.,冈崎片段(Okazakifragment),脉冲标记实验3HdTDNAligase缺失实验,半不连续复制的证实,E.coli1000-2000nt真核生物100-200nt,DNA复制的方向与复制叉移动的方向前导链(leadingstrand)滞后链(laggingstrand),.,RNA引物,.,复制方向,复制子replicons复制叉replicationfork复制泡replicationbubbles复制起点origin原核生物/噬菌体/病毒DNA:1个真核生物DNA:50000100000个复制终点termini环状DNA的双向复制(复制),.,复制起点(origin),终点(terminus),.,参与DNA复制的蛋白质,1.DNA解旋酶(DNAhelicase)解开双链ATPaseDnaB(E.coli);PriA(somephage)2.DNA螺旋酶(DNAgyrase)断裂双链引入负超螺旋(swivelfunction)3.单链结合蛋白(singlestrandbindingprotein,ssb)防止单链退火gp32(T4phage);gp5(M13phage),.,4.引发酶(primase)DnaG(E.coli)引发体Primosome(primase/helicase)5.DNA连接酶(DNAligase)需要能量NAD(E.coli)/ATP(真核)T4DNAligase(平头)6.DNA聚合酶(DNApolymerase,Pol)PolI,IIandIIIdNTP底物;模板53不能从头合成,.,ThreeDNAPolymerases(E.coli),PolIDNA聚合酶35外切核酸酶(校正)53外切核酸酶缺口填充(大缺口)DNA损伤修复Nicktranslation(去除引物)PolII不是DNA复制必需的PolIII35外切核酸酶dnaQDNA聚合酶(必需)dnaE缺口填充(小于100bp),Klenowfragment,.,nick,结合PolI,引物移动/DNA合成,封闭缺口,降解的引物,DNAligase,Nicktranslation去除引物,5,5,3,3,parent,progeny,.,CompositionofE.coliDNAPolymeraseIIIHoloenzyme,.,.,解旋酶(DNAhelicase),单链结合蛋白(SSB:single-strandedbindingprotein),引发酶(DNAprimase),DNA复制的基本模式,.,.,细菌DNA复制,实验系统(experimentalsystems)DNA:噬菌体(x174/T4/T7)和质粒cell-freesystem:所有必须的蛋白质和其他因子,DnaA+ATP,DnaB,DnaC,OriC,(富含AT),.,细菌DNA复制起始,minichromosome(OriC+plasmid)复制起始复合体DnaA(起始点结合蛋白)DnaB(解旋酶)DnaC(装载解旋酶和引发酶)HU(识别并刺激OriC复制)Gyrase(促旋酶)SSBDnaA合成与生长速度相关,T,Origins,(快速生长的细胞内),.,细菌DNA复制延长,SSB,DnaGprimase,DnaBhelicase,PolIII(/),引发体(primosome),PolI、ligase,复制体(replisome)invivo,.,细菌DNA复制终止,AATTAGTATGTTGTAACTAAAGTTTAATCATACAACATTGATTTCA,terE/D/A,terC/B/F,Replicationfork1,Replicationfork2,tusgene产物,复制终止区:,200kb,(DnaBinhibitor),(23bp),.,.,DNA复制,真核生物DNA复制:起始,实验系统DNA:酵母(14000kb/400复制子)SV40(5kb,形成核小体)cell-freesystem:非洲爪蟾,复制期(S-phase)细胞周期(G1,S,G2,M,G0)细胞周期转换点G1/S(R点/哺乳动物,START/酵母)G2/MDNA损伤检查点,DNA复制检查点,纺锤体组装检查点,.,.,复制子簇(clusterofreplicons)20-50串联,同时通过S期早:常染色质,中:异染色质,晚:着丝点和端粒复制起始点酵母:ARS(autonomouslyreplicatingsequence)A区:含最短11bp的共有序列(富含AT);B1-3相邻元件ORC(originrecognitioncomplex),.,真核DNA复制的起始,.,F4真核生物DNA复制:延伸和终止,相关酶和蛋白质解旋酶:SV40largeTantigen(invitro)单链结合蛋白:RP-A,replicationproteinAMF1(53外切酶、除去引物)连接酶I(DNAligaseI)DNA聚合酶核小体重建:新、旧组蛋白组合核基质(nuclearmatrix):固定起始点簇、复制体,.,DNAPol:起始新链合成Pol/引发酶合成:RNA引物,2030ntDNADNAPol:前导链和滞后链的延伸PCNA(proliferatingcellnuclearantigen)slidingclamp保持聚合酶的持续合成能力RF-C(complex)催化PCNA装载DNADNAPol:可能延伸滞后链,其他功能DNAPol:DNA修复,.,3,5,3,3,5,5,DNAPol,引发酶,RF-C,DNAPol,PCNA,Helicase(Tantigen),RP-A,MF1,DNAligaseI,.,端粒复制,关于端粒的两个问题:1.复制后产生粘性末端(stickyend)、染色体不稳定2.染色体末端DNA短缩研究端粒的实验系统:质粒酵母线性质粒-ARS+CEN+TEL(四膜虫)端粒的结构与复制合成:Cn(A/T)mn1,m=1-4,.,端粒复制,RNAtemplate,.,polymerase,.,其他DNA复制方式,滚环形(rollingcircle)单链模板、3-OH缺口、线性多连体(多数复制子)噬菌体(例X174)/真核rDNA/细菌F因子,5,.,D-环型(D-loop,displacementloop)双链复制不同步,起始点异位动物线粒体/植物叶绿体DNA基因组,其他DNA复制方式,H,L,哺乳类D-loop:500-600bp线粒体:一个-多个叶绿体:2个,.,原核生物和真核

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