如何使用好PubMedPPT参考幻灯片

认识PubMed让它融入您的科研,主要内容,一、认识PubMed二、PubMed检索入门三、PubMed高级检索四、PubMed医学主题词表检索五、PubMed其他功能六、PubMed个性化服务,WebofScience,您的选择？,GoogleScholar,PubMed,Scopus,google,一、认识PubMed,/guide/,一、认识PubMed,PubMed与NCBI数据库的关系图,一、认识PubMed,标引质量高,更新速度快,信息量大,使用方便,选择PubMed的n个理由,一、认识PubMed,Medline,OldMedline,InProcessCitations,Recordsuppliedbypublisher,一、认识PubMed,一、认识PubMed,一、认识PubMed,/pubmed/,检索提问区,文献匹配,临床研究,特定主题咨询,期刊检索,主题检索,高级检索,一、认识PubMed,2.1单著者检索,2.1.1键入著者姓氏全称和名字的首字母全写或缩写如:MichaelHeuserHeuser,MichaelHeuserMMichaelHeuserau2.1.2利用高级检索中的“Author”检索,选下拉选项定位,二、PubMed检索入门,2.3.1直接输入您所要检索的关键词或主题词,英文单词或短语（大写或小写均可）,词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。如:acutemyeloidleukemia.,2.2著者与主题联合检索,2.2.1直接输入作者姓名与主题词,不用AND如:MichaelHeuserIDH,2.3单主题检索,二、PubMed检索入门,2.4期刊检索,2.4.1输入期刊名，ISSN，Medlinejounaltitleabbreviation如:naturemedicineTAORnatmedTA1078-89562.4.2用singlecitationmatcher中的期刊名称检索2.4.3用journaldatabase检索,二、PubMed检索入门,2.5.1布尔逻辑运算符(AND,OR,NOT)如：OncologyAND(treatmentORresearch)2.5.2截词符(*)用于相同词根的词如:bacter*2.5.3词组检索(“”)（必须是英文字符）如:“Singlecell”2.5.4通配符(?)如:“cell?”,2.5组配/截词/短语检索,二、PubMed检索入门,2.9PubMed检索字段标识,二、PubMed检索入门,2.10PubMed检索结果显示及处理,二、PubMed检索入门,二、PubMed检索入门,二、PubMed检索入门,2.11PubMed基本检索举例,维生素C对于普通感冒的防治作用“VITAMINC”ANDCOMMONCOLD,二、PubMed检索入门,检索2000-2005年以后有关Crohn病药物治疗研究的文献CrohnDiseasemhANDdrugtherapySubheadingAND2000EDAT:2005EDAT,检索事半功倍,检索框,三、PubMed高级检索,3.1Filter在这里可以进行以下设定：将搜索范围设定在一个特定的域。将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型,如综述设定只搜索包含摘要的文献。设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库（如AbridgedIndexMedicus或AIDS相关的条目）。需要注意的是：限制了出版物类型、年龄、人或动物、性别中的任何一项，检索将只在Medline中进行检索（因为这些特征限制只有Medline中才有）。,三、PubMed高级检索,三、PubMed高级检索,人或动物实验选择,性别选择,语种选择,期刊分类选择：核心临床医学牙科期刊护理期刊Medline期刊,年龄选择,出版物类型选择,三、PubMed高级检索,看到最近100次的查询结果。如果两次查询内容相同，PubMed会将头一次的去除。当点击ClearHistory可以将History中的所有内容清除,3.2History,三、PubMed高级检索,3.3Clipboard贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目。可以打印、保存、订购剪贴板中的内容。条目复选框选中，单击“sendtoclipboard”就可以将其加入剪贴板中。剪贴板中最大的储存数是500条。剪贴板中的内容在8小时内没有任何操作，将会自动消失。,三、PubMed高级检索,3.4Details即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了哪些词，并使用了什么样的检索规则和检索语法。,三、PubMed高级检索,Result区显示检索结果的记录总数，点击这个数字，可回到检索结果显示屏,Translation区显示检索词转换的详细情况,Database区显示检索的数据库,UserQuery区显示用户键入的检索词或检索式,对检索策略进行编辑,三、PubMed高级检索,文献太多，如何保证查全和查准？,四、PubMed医学主题词表检索,何为MeSH？MeSH是MedicalSubjectHeadings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。论述文献中心的主题词称主要主题词论述主题某一方面的内容的词称为副主题词,Mesh词表帮助您！,4.1MeSHDatabase的运用,词义解释,四、PubMed医学主题词表检索,检出结果限定在主要主题词可提高查准率,限制扩展检索，只需检索单个主题词,副主题词,4.2MeSH检索实例演示,miRNA在肿瘤治疗方面的应用,四、PubMed医学主题词表检索,五、PubMed其他功能,实现单篇文章的一对一检索,实现多篇文章的一次性检索,一次最多可检索PubMed中100条文献纪录,获得文献的PMID,检索结果更加贴近临床的需要,五、PubMed其他功能,五、PubMed其他功能,临床研究,系统回顾,医学遗传学,限定于各类不同的医学临床主题进行检索,五、PubMed其他功能,实现PubMed与核酸和蛋白质序列数据库、基因组数据库、分类学数据、图书等数据库之间的多向链接,多向查询,五、PubMed其他功能,与PubMed建立联系的网站，如某篇文献所对应期刊的出版商，文献全文、相关数据库及网站等。,五、PubMed其他功能,五、PubMed其他功能,免费期刊的获取,PubMed提供了免费全文期刊网址PubmedCentral/pmc/journals/向作者索要作者主页,五、PubMed其他功能,六、PubMed的个性化服务,保存检索式(生成URL或HTML实现共享),检索结果的分类过滤,特定功能的参数设置,六、PubMed的个性化服务,书目管理设置,经由2000多位专家学者的评价推荐，提供目前世界上最重要的生物学论文资讯及研究趋势。特色是收录每篇具有科学价值的文献，而考虑这些文献在哪在些期刊里发表,PubMed里检索出最核心的文献Facultyof1000与pubmed的完美结合,六、PubMed的个性化服务,目的:用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,举例:检索出关于“HepatitisC”并且所有影响因子大于10的文章,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,42,输入检索式，登陆MyNCBI（如果没有的话请注册）,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,临时注册的Testdxy，点击ManageFilters,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,点击Createcustomfilter,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,在弹出的对话框中输入包含所有影响因子大于10的期刊名的检索式,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,问题：检索式哪里来？自己输入岂不是要累死？,答案：用EXCEL和WORD强大功能自动生成。首先，下载2011影响因子EXCEL文件。（丁香园中有，免叮当，链接：,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,文件打开后如下。按影响因子排列，选择所有影响因子大于10的期刊名,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,新建WORD文档，开始菜单中选择性粘贴无格式的文本,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,Ctrl+H启用替换功能，在查找内容中输入p（其含义是段落标记，也就是回车符），替换为中输入”journalor”（注意包括引号，引号必须是英文字符）。替换所有后，删除最后的or”，在段首如入一个英文引号”。到此包括所有影响因子大于10的期刊名的检索式输入完毕,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,输入前文提到的检索式输入框，将本Filter起名为IF10，然后Save,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,重新回到pubmed主页面，输入检索式HepatitisC，选择刚才创建的IF10Filter,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,56344篇文献精简为4662篇大于10分的文章。大功告成！,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,其他,另外，还可以自己创立影响因子大于5的Filter，以及包含自己专业主要期刊的Filter。,用PubmedFilters功能实现对高影响因子文章的筛选,(“JAMSOCNEPHROL”TAor“KIDNEYINT”TAor“AMJKIDNEYDIS”TAor“NephrolDialTransplant”TA),用PUBMED的SaveSearch功能实现关注最新文章,membranousnephropathyand(“JAMSOCNEPHROL”TAor“KIDNEYINT”TAor“AMJKIDNEYDIS”TAor“NephrolDialTransplant”TA),PubMed其实还有更加丰富多彩的内容等着你去挖掘,/medlineplus/,查阅各种健康疾病相关的主题，医药信息。还有一部非常完善的在线医学词典。此外，你还可以浏览到很多有用的健康新闻。,六、PubMed的个性化服务,,GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学合作，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对PubMed检索结果进行探索、分析的工具。,六、PubMed的个性化服务,四个“W”,分析功能,六、PubMed的个性化服务,时间分析,国家分析,六、PubMed的个性化服务,城市分析,刊物分析,六、PubMed的个性化服务,作者分析,主题分析,六、PubMed的个性化服务,研究态势,地区分布图,六、PubMed的个性化服务,研究人员关系网,线条越多，线形越多，地位越重要,六、PubMed的个性化服务,附：文献检索经验谈,查准找高水平论文-阅读introduction和discussion。找高水平综述-了解整体情况。查新：查找引用重要综述或重要论文的最新文章（webofscience）。查找大牛课题组发表达最新文章。利用PUBMED的SaveSearch功能,了解常见杂志的影响因子选择阅读最重要的文献,NATMED22.864JAMSOCNEPHROL8.987NATREVNEPHROL7.943KIDNEYINT7.916CLINJAMSOCNEPHRO5.068AMJKIDNEYDIS5.294CURROPINNEPHROLHY3.964AMJPHYSIOL-RENAL3.612NEPHROLDIALTRANSPL3.371,如何查影响因子,文献检索举例,检索目的：miRNA21在肾脏纤维化中的作用。(microRNA-21ormiR-21)and(renalorkidney)andfibrosis,1、仔细阅读影响因子5的文章的introduction和Discussion,23篇文献，逐一阅读？如果要是几百篇怎么办？,不要把你的时间浪费在垃圾文章中！检索不是最终目的，阅读有价值的文章才是关键！,2、阅读相关review,(microRNA-21ormiR-21)and(renalorkidney)andfibrosisANDIF5,进一步检索LanHYAND(microRNA-21ormiR-21)，看有无fibrosis方面文章,高分文章，值得一看,SciTranslMed.201215;4(121):121ra18.,(microRNA-21ormiR-21)and(renalorkidney)andfibrosis从review入手,内容相关，但杂志质量太差,好综述，值得一看,是不是miRNA-21过于局限，是不是扩展成miRNA好一些？,扩展成：(microRNA)and(renalorkidney)andfibrosis,好综述，值得一看,KidneyInt81:61