Affymetrix基因芯片在肿瘤表观遗传学中的应用(其明第七讲2012)_第1页
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Affymetrix基因芯片在肿瘤表观遗传学中的应用，孙咨询部经理，长链非编码核糖核酸研究，HTARRAYMAN/MOUSE/RATGENE 2.0 ST ARRAY，CIS，TRANS，1，2，3，4，5，和，长非编码核糖核酸通过转录因子募集发挥作用的两种调控模式，以及反式调控：转录激活/转录抑制，1，2，3，4，5，和，ThisgenencoddesnoncodingNasandAnDnon-CodingNasfr omthisgenemayalsplayaroleinmyogenesissbymediatingthetransscriptionactivityofmyoblastdecisionprotein 1 .expressionofthisgenemayplayaroleinmultiplema lignanciesinclugbreastcancerandprostatecar .另外，216个核苷酸中的大部分核苷酸和亚基蛋白-编码的核糖核酸都没有显著的相关性，这表明这些核苷酸和亚基蛋白-编码的核糖核酸都是通过甲基化/转录因子芯片来发现的。自然医学2010年发现-分泌酶表达在阿尔茨海默病中高表达。表达导致稳定性和蛋白积累增加，这反映了ncRNA的毒性作用。发现一类非编码反义核糖核酸在与有义核糖核酸结合时能促进核糖核酸的翻译。通过研究小鼠基因的反义核糖核酸来鉴定这一功能。基因Uchl1与脑功能和神经退行性疾病有关，突变基因Uchl1与一些遗传性帕金森病有关。利用生物信息学和数据挖掘方法，研究人员还发现Uchl1的反义核糖核酸不是单一的情况，相反，它只是促进蛋白质表达的一大类哺乳动物反义核糖核酸的代表。这种促进蛋白质翻译的机制是基于增加信使核糖核酸和核糖体的结合。通过长链非编码核糖核酸，1，2，3，A，F，E，D，C，4，1，2，3，4，C，5，5，5，5，1，2，3，5，4，5，5，4，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5，5 预测长链非编码核糖核酸的功能/信号途径，所有长链非编码核糖核酸与信号途径的关系，长链非编码核糖核酸富集的功能/信号途径，长链非编码核糖核酸，富集关系，长链非编码核糖核酸靶向的功能/信号途径，长链非编码核糖核酸，靶向关系，研究方案，Affymetrix基因芯片在甲基化研究中的应用，人/小鼠/拟南芥/果蝇/酵母，甲基化与肿瘤的关系，ManelEsteller TilingArray，重叠瓦片覆盖全基因组的最高分辨率，甲基化芯片过程，结果，信号值，标准化算法，相关图，两个样本的相关系数，M-A图，标准化后，标准化前，结果，红色代表甲基化过度，蓝色代表甲基化
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