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文档简介
高通量测序的用途,高通量测序朱伟珊weishanleon,1,高通量测序的用途,基因组序列的物种进行重测序,鉴定SNP,indel及基因组结构变化;对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究,解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。,高通量测序朱伟珊weishanleon,2,高通量测序现状,第二代测序技术,又称超高通量测序。目前,科学家正为1000美元完成一个基因组测序而努力。多家研究单位正在为此展开竞争,而且进展比预期的更快。,高通量测序朱伟珊weishanleon,3,高通量测序原理,高通量测序方法原理示意图,高通量测序朱伟珊weishanleon,4,高通量测序平台,高通量测序的三大平台:Illumina公司的Solexa测序仪,罗氏公司(Roche)的454测序仪,ABI公司的SOLiD测序仪,高通量测序朱伟珊weishanleon,5,高通量测序特点,速度快通量高结果一致性好简便高效,高通量测序朱伟珊weishanleon,6,高通量测序在基因组上应用,应用于人基因组重测序动植物、细菌基因组测序,高通量测序朱伟珊weishanleon,7,高通量测序在mRNA表达谱的应用,将miRNA的标记与线性放大相结合,只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。,高通量测序朱伟珊weishanleon,8,高通量测序在microRNA中的应用,高通量、低成本易于寻找新片段及作用位点,高通量测序朱伟珊weishanleon,9,高通量测序在CHIP-CHIP的应用,相对refseq,染色质免疫沉淀以后的DNA直接进行测序,可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息相对ChIP-chip,ChIP-seq可以检测更小的结合区段、未知的结合位点、结合位点。,高通量测序朱伟珊weishanleon,10,高通量测序在甲基化的应用,对于DNA甲基化的检测,目前采用:甲基化DNA富集并结合高通量测序,可以检测到全基因组范围内的甲基化现象。特点:高效,准确,高通量测序朱伟珊weishanleon,11,特异片段测序,血浆DNA测序游离RNA测序,高通量测序朱伟珊weishanleon,12,未来-高通量测序会成为临床辅助工具,致病基因碱基突变,高通量测序朱
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