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文档简介

第八讲:KEGGpathway和Primer3引物设计,KEGG是目前查询代谢途径网络和重建代谢途径网络做的最好的网络资源,主页,例:查询ABCtransporter代谢途径网络,点击主页重点的pathway,显示各种pathway,查找ABCtransporterpathway,点击查看ABCtransporterpathway,点击KOlist查看,点击5thlevel查看,Primer3引物设计,Primer3简单方便可以满足基本的引物设计需要,主页,例:对给定的一段DNA序列采用默认或特定要求参数设计引物,默认设计引物:输入DNA序列点击提交,查看结果,按需要修改参数设计引物,查看结果,作业:1.查看Two-componentsystem代谢途径网络2.对给定的seq1采用默认的参数设计引物3.对给定的seq2要求引物设计在1000-1100两边,且不能设计在100-200,1500-1840中,引物长度为21-25之间,引物退火温度在53-55直接,GC含量在40-64之间,

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