微生物的代谢与发酵.ppt

1、Chap 5 微生物的新陈代谢,主要内容： 微生物独特的能量代谢 微生物独特的合成途径 发酵与代谢调节,1.微生物能量代谢 一、化能异养微生物的生物氧化和产能,生物氧化的主要途径和类型 途径：脱氢、递氢和受氢 类型(受氢体不同）： -(好氧）呼吸 -无氧呼吸 -发酵,（一）底物脱氢的主要途径,生物共有的三个主流产能途径 （EMP、HMP、TCA） 1、糖酵解途径（EMP）,2、磷酸戊糖途径（HMP）,3、三羧酸循环（TCA） 丙酮酸3CO2+4（NADH+H+）+FADH2 +ATP,4、ED途径（糖酵解替代途径） 微生物独特产能途径,ED,途径概貌,总反应式： C6H12O6+Pi+NADP

2、+NAD+ 2CH3COCOOH+ATP+NADPH+H+NADH+H+ 特点： 1）KDPG裂解关键反应 2）特征酶：KDPG醛缩酶 3）2丙酮酸分别来自KDPG裂解和3-磷甘油醛的转化 4）产能较低（1molATP+NADPH+NADH/1molGlucose）,生物学意义 1）EMP途径的替代途径 2)协调EMP、HMP、TCA途径 3）进行细菌酒精发酵,2010年，中国生物乙醇500万吨,成本低于3000元/吨,酒精发酵途径: 酵母菌:葡萄糖1,6-二磷酸果糖3-磷酸甘油 醛、磷酸二羟丙酮 丙酮酸乙醛 2乙醇 细菌：葡萄糖 6-磷酸葡糖酸KDPG 丙酮酸(3-磷 酸甘油醛丙酮酸)乙醛2

3、乙醇,细菌酒精发酵 代谢速率高、转化率高、副产物少、发 酵温度较高；但pH较高、较易染菌、耐乙 醇能力较低。,建议读物：,（二）递氢和受氢依据受氢体性质不同，生物氧化分为：呼吸(有氧呼吸）、无氧呼吸和发酵三种类型。,1、呼吸 好氧M产能方式 呼吸链 最终受氢体（O2） 原核生物P/O较低,2、无氧呼吸 又称厌氧呼吸，一类呼吸链末端受氢体为外源无机氧化物（少数为有机氧化物）的生物氧化。 主要微生物类群： -反硝化细菌 -反硫化细菌 -甲烷细菌 -某些兼性厌氧菌,无机氧化物为受氢体,有机氧化物为受氢体,NO3,无氧呼吸如：硝酸盐(呼吸)异化还原 在无氧条件下，某些兼性厌氧微生物无氧呼吸时利用硝酸盐

4、为受氢体还原为亚硝酸、NO,N2O或氮气的过程。,硝酸盐异化还原特点 -某些兼性厌氧微生物在无氧时，利用硝酸盐 为受氢体的产能方式，产能较低； -还原形成的亚硝酸盐通常会进一步还原为N2 ； -对卫生、环保、农业（肥力）的影响与利用,反硝化作用： 微生物在厌氧呼吸中把硝酸盐或亚硝酸 还原为气态氮(氮气)的过程。 （注意：不同于硝酸盐异化还原） 硝酸盐同化还原 硝酸盐为微生物吸收还原为氨态氮的过程。,Dentrification,The formation of gaseous nitrogen or gaseous nitrogen oxides from nitrate or nitrite

5、 by microorganisms.,硫酸盐呼吸：在无氧条件下，某些厌氧或兼性厌氧微生物无氧呼吸时利用硫酸盐为受氢体还原为H2S的过程。,APS ： 腺苷酰磷酸,总结： 无氧呼吸是厌氧和兼性厌氧微生物的一种产能反应， 不同于好氧呼吸，底物脱下的氢经呼吸链传递 给无机氧化物或有机氧化物；产能较少。 硝酸盐异化还原由兼性微生物进行的无氧呼吸， 为硝酸盐还原为亚硝酸或氮气的过程。 反硝化作用：厌氧呼吸中硝酸盐还原为氮气的过程。 自然界中进行无氧呼吸的主要方式还包括硫酸 盐呼吸、硫呼吸、碳酸盐呼吸、铁呼吸等。,3、发酵（fermentation） 定义 广义：利用微生物生产有用代谢产物的一类生产方式

6、。 狭义：在无氧条件下，底物脱下氢未经呼吸链而直接交给某一内源性中间代谢物，以实现底物水平磷酸化的生物氧化反应。,发酵示意图,3-P甘油醛,丙酮酸,乳酸,1,3-二磷甘油酸,产能反应（底物水平磷酸化）,（1）由EMP途径中丙酮酸出发的发酵 （乙醇发酵、乳酸（同型）发酵、丙酸发酵）, 混合酸发酵（甲酸、乙酸、乙醇、CO2、H2）, 2,3丁二醇发酵,丁酸发酵(丁酸；丙酮、丁醇；异丙醇等）,V.P.试验：某些微生物利用丙酮酸产生乙酰甲基甲醇，在碱性条件下脱氢形成二乙酰，与胍基化合物产生红色反应，可用于某些细菌的鉴定。,（2）通过HMP途径的发酵 异型乳酸发酵 （产物：乳酸、乙醇、 CO2等） A.

7、异型乳酸发酵经典途径 （磷酸转酮酶途径） 葡萄糖为原料:,核糖为原料: 产物为乳酸,乙酸,H20,ATP,B.异型乳酸发酵 双歧杆菌途径(主要部分),关键酶： 木酮糖磷酸转酮酶,乙酸来源:,（3）通过ED途径的发酵（细菌酒精发酵） （4）氨基酸发酵产能（Stickland反应) 丙氨酸氧化与甘氨酸还原的偶联,（丙酮酸+2甘氨酸3乙酸+ATP）,总结： 发酵为厌氧或兼性厌氧微生物在无氧下的底物水平磷 酸化的产能反应； 主要途径包括经EMP、HMP、ED途径和 Stickland 反应的发酵；如经EMP的6条发酵途径、VP反应； HMP的异型乳酸发酵；氨基酸氧化与还原偶联的发 酵 发酵具有重要的生

8、物学意义及在微生物学实践中的 应用价值。,二、自养微生物产ATP和产还原力 (一) 化能自养微生物,ATP和NADPH的产生 E -0.32 -0.06 0 0.26 0.28 0.82,-化能自养菌多数为好氧微生物，通过呼吸链传递电子和氢获得能量； -化能自养菌氧化的无机物氧还电位一般较高(能量水平较低)，故P/O值较低； -化能自养菌可通过消耗ATP逆呼吸链的方式获得还原力H。,硝化细菌的硝化作用 硝化作用：氨态氮经硝化细菌的氧化，转为硝酸态氮的过程。 亚硝化细菌： NH3+O2 HNO2+2H + +2e- 硝化细菌： HNO2 +H2O NO3 - +2H + +2e-,亚硝化细菌的产

9、能反应,硝化作用： 还原性无机物氧化直接与呼吸链相联。其过程比异养菌（经EMP/TCA等）简单。 呼吸链的组分简单，多样化；氢或电子直接进入。 产能效率（P/O）比异养菌低(无机物能量水平低)。,2、化能自养菌氧化产能的特点：,（二）光能营养微生物,1 非循环光合磷酸化,-产氧光合作用,产氧光合微生物（蓝绿澡）特点： 1）电子传递非循环 2）有氧下进行（光解水产氧） 3）PSI和PSII 两个光合系统 4）反应中可同时产生ATP和NADPH 5） H+质子来源于水的光解,2.循环光合磷酸化 1) 电子传递循环方式 2) 产ATP和NAD(P)H分 别进行 3) 不光解水、不产氧（仅有PSI）

10、4）还原力的H+质子来自 H2S、H2无机或有机物,（不产氧光合微生物： 光合细菌）,Cyt C2 偶联质子跨膜形成质子梯度,光合细菌 (红螺菌目) Bacteria that contain bacteriochlorophylls and can use light as an energy source. When growing under illumination the organism are anaerobic and do not evolve o2 during photosynthesis. some are also capable of growing in the

11、dark by respiring with oxygen.,区别： 1）菌绿素类型 2）电子供体 3）硫粒积累特征,光合细菌：红螺菌科、着色菌科、绿菌科、绿弯菌科,光合细菌（不产氧光合微生物） -光合作用器,光合细菌培养物,3、紫膜光合磷酸化 （不产氧光合微生物） 紫膜： 在低氧时，某些嗜盐菌的细胞膜合成含有菌视紫红质，因颜色呈紫色，故称为紫膜。 （视紫红质：视黄醛+视蛋白）,紫膜： 75蛋白（菌视紫红质） 25脂类,紫膜光合磷酸化,通过视黄醛分子光介导的异构化建立膜电位而进行的光合磷酸化。,建议读物：,建议读物：,2 分解代谢和合成代谢的关系 两用代谢途径 代谢物回补顺序 能补充两用代谢途

12、径中因合成而消耗 的中间产物的那些反应。,乙醛酸循环,生物学意义 1）TCA循环中4C化合物的补偿 2）乙酸为唯一C源微生物 的重要代谢途径 3）高效的琥珀酸形成途径,3 微生物独特合成途径 一.自养微生物的CO2固定 Calvin 循环 厌氧乙酰COA途径 逆向TCA循环 羟基丙酸途径,Calvin 循环（略） 6CO2通过Calvin 循环产生果糖-6-磷酸 2)核酮糖二磷酸羧 化酶、磷酸核酮糖激酶 为特征性酶 3）自养菌（生物）固定CO2的主要途径, 厌氧乙酰-辅酶A途径,主要特征： 1）分别合成甲基和羧基，后经乙酰- COA 合成终产物乙酸、丙酮酸 2）CO脱氢酶为关键酶；THF、B1

13、2等一碳 载体参加 4）某些专性厌氧的化能自养菌固定CO2 的主要途径（自养同型乙酸细菌、甲烷细菌）,二、生物固氮 大气中的分子氮通过微生物固氮酶的催化而还原成氨的过程。 生物固氮：130106吨 工业固氮：50106吨,（一）固氮微生物 1.自生固氮菌（Aztobacteria）,蓝藻 (念珠藻: Nostic ),2.共生固氮菌 （豆科植物）Rhizobium （非豆科植物）,地衣：子囊菌蓝藻 3.联合固氮 必须生长在植物根际、叶面或动物肠道等处才能更好地固氮的微生物。,Frankia,Azotospirillium,二、固氮的生化机制 N2+8H+1824ATP2NH3+H2+18-24

14、ADP+1824Pi 1.生物固氮要素 ATP (1:18) 还原力和传递载体 ：NADPH Fd、Fld 还原底物（N2） Mg+ 厌氧微环境 固氮酶,固氮酶,FeMoCo(固氮酶活性中心）,固氮酶生物学特性 1）还原N2、H+、C2H2等生物活性 2）由固氮酶（组分I；钼铁蛋白；固二氮酶）和 固氮酶还原酶（组分II；铁蛋白；固二氮酶还 原酶）共同组成时才具有生物活性 3）氧不可逆失活作用,2.活力测定乙炔还原法,3 固氮的生化途径,N2+8H+1824ATP2NH3+H2+18-24ADP+1824Pi,氨的去路,4.固氮酶的产氢反应（2H+H2） 固氮酶 2H+ -H2 氢化酶,（三）固

15、氮酶避氧机制 1.好气性自生固氮菌： -呼吸保护 -构象保护 2.蓝藻： -还原性异形胞 -其它,3.根瘤菌： -形成豆血红蛋白（存在于类菌体周膜内外）,根瘤,三、微生物结构大分子-肽聚糖的合成,(一) 细胞质中的合成 1）N-乙酰葡萄糖胺-UDP、N-乙酰胞壁酸-UDP 葡萄糖 N-乙酰葡萄糖胺-6-磷酸 （Gln、乙酰-COA） N-乙酰葡萄糖胺-UDP N-乙酰胞壁酸 -UDP,2）由N-乙酰胞壁酸合成 “park”核苷酸, park”核苷酸： 即UDP-N-乙酰胞壁酸五肽，细菌细胞壁合成的重要中间体，由N-乙酰胞壁酸和氨基酸（丙氨酸、谷氨酸等）和载体UDP在细胞质中合成形成。, “pa

16、rk”核苷酸的合成,1）在UDPM的 基础上合成； 2）UDP为载体 3）环丝氨酸抑制 D-Ala- D-Ala的合成,(二) 在细胞膜中的合成： 产物： 肽聚糖单体（双糖肽亚单位） 载体：细菌萜醇： （C55类异戊二 烯醇组成的类脂 载体）,肽聚糖单体合成途径,(三) 膜外的组装 自溶素作用,膜外组装：转糖基化作用；转肽作用,青霉素：与转肽酶结合； 万古霉素：与Ala-Ala结合,Carbapenem:碳青霉素烯,主要反应过程回顾,药物设计的意义 (肽聚糖合成的抑制) -青霉素： 竞争性抑制转肽酶活性中心 -环丝氨酸：抑制Park核苷酸5肽的合成 -万古霉素: 与肽聚糖五肽的D-Ala- D

17、-Ala 结合，抑制转肽酶作用 -杆菌肽： 抑制细菌萜醇的去磷酸化,青霉素抗菌机制 青霉素结构与肽聚糖单体五肽末端 D-Ala - D-Ala相似，竞争性地与转肽酶结合，阻碍了肽聚糖 单体间肽桥的交联， 引起细菌渗透性溶菌 （osmotic lysis)死亡。,四、微生物次生代谢产物的合成 次生代谢产物 在微生物生长的稳定期前后，由初生 代谢物为前体，通过复杂的代谢途径 合成的各种结构复杂的化学物质。,次级代谢特点： 1）初级代谢 产物为前体 2）一般生长后期产生 3）对产生者功能 不明确 4）代谢途径独特,建议读物:,次生代谢产物及相关基因的推断:,4 微生物的代谢调节与发酵生产 主要调控方

18、式： 1）通道控制作用 2）酶数量的控制 3） 酶活性的激活和抑制,一、微生物的代谢调节 (一）酶合成的调节（数量的控制）,组成酶:细胞中经常以较高浓度存在的酶。 诱导酶：只有当其分解底物或有关的诱导物存在时才会合成的酶。,根据调节基因产物作用划分:,负转录调控 调节基因产物是阻遏蛋白,阻止结构基因的转录。 II. 正转录调控 调节基因的产物是激活蛋白，促进结构基因的转录。,基因调控系统,操纵子,调节基因,启动基因，操纵基因,结构基因,(二)原核生物基因调控的基本方式 操纵子: 细菌基因表达调控的基本单位,包括 结构基因、操纵基因和启动基因。,乳糖操纵子,转录的负控制 调节基因的产物是阻遏蛋白,阻止转录。,负控诱导系统:阻遏蛋白不与效应物结合,阻止转录.,酶合成的阻遏 (负控阻遏系统:阻遏蛋白与效应物结合阻止转录)