网上生物医学信息资源检索

1、网络信息检索工具和技术 常用综合性搜索引擎 常用医学搜索引擎 常用生物医学专业网站 国内电子期刊数据库 国外电子期刊数据库,网上生物医学信息资源检索,网络信息检索是利用网络资源进行的信息检索。 网络信息资源大致可分为两类：一类是来自正式文献信息源的信息，内容可靠，质量高，一般都有检索平台。另一类是各类网站上的信息，这些信息包罗万象，良莠不齐，一般用搜索引擎等网络工具进行检索,概述,浏览 偶然发现：这是在网络上发现、检索的原始方法。 顺“链”而行：通过Web页的超级链接进行访问。 输入网址直接访问 利用搜索引擎 通过搜索引擎来查找自己想要的网址或信息是最快捷，也是最佳的检索途径,网络信息检索方法

2、,Internet网络（因特网）拥有包罗万象的丰富的信息资源，这些信息种类繁多、存储地点分散、杂乱无序，要想获得自己特定需要的信息，必须要掌握有效的网络信息检索工具和技术,网络信息检索工具和技术,网络上的工具包括有,基于菜单式的检索工具和基于关键词的检索工具，如Gopher、WAIS等。 最为常用的是基于超文本的检索工具，如IE浏览器可以采用WWW方式检索。 利用FTP可进行文件传输。 利用Telnet可以登录到远程的主机上。 网络上还有网络指南工具称为搜索引擎,是World Wide Web的缩写，它是采用超文本链接技术组织信息的分布式信息系统，是Internet中应用最广泛的网络工具之一,

3、E-mail,E-mail是Electronic Mail（电子邮件）的缩写，利用电子邮件可以收发文本、声音、图像、影视等信息。由于其成本低、速度快、使用方便，E-mail是网络上最常用的工具,FTP,文件传输（ Protocol， 简称FTP），这是一种实时的网络联机检索工具。它能方便地实现Internet上异种机、异种操作系统之间的文件传输。FTP根据指定的地址与远程FTP服务器连接，即可浏览到可供下载的文件目录，并根据自己的需要选择下载,Archie,Archie是一种自动标题检索软件，可周期性的连接世界各地的FTP服务器，并将这些服务器可供下载的文件的文件名和路径搜集在一起组成Arch

4、ie数据库，便于利用文件名和目录进行快速检索。 使用FTP可利用IE浏览器实现。在地址栏输入要访问的FTP服务器地址，采用匿名登录，就能看到服务器提供的文件目录，可选择下载,网络蚂蚁”（Netants,网络蚂蚁”（Netants）也是一种常用的快速下载工具，其下载速度快，下载文献时可产生5个连接（“蚂蚁”）同时分段下载，极大地提高了下载速度。 另一个特点是能实现断点续传，即如果一次下载中断，再次启动该任务时，软件能从上次中断的地方继续执行，节省下载时间，保证传输质量,搜索引擎,搜索引擎（Search Engine）是Internet上信息资源的检索系统，是查询信息最实用、最方便、最快捷的工具。

5、 一般的搜索引擎均提供两种方式供用户检索，一是提供将信息分类管理的树型结构，读者只需进入不同的目录层次即可查询。二是提供按关键词查询的全文检索,网上搜索引擎很多，每个搜索引擎均有其一定的收录范围和规模，索引方式也不同，没有任何一个搜索引擎能提供绝对完整全面的检索。因此，要想获得较为全面的检索结果，必须尽可能选用若干搜索引擎进行检索。 以下列举一些常用搜索引擎的网址供参考,综合性搜索引擎有,Google: Yahoo： Yahoo!中文：http:/ 百度搜索： 新浪网： 网易： 搜狐,常用医学主题搜索引擎,Biomednet： HealthAtoZ： Medical Matrix：.medma

6、/ Medwebplus,Telnet,Telnet即远程登录，利用这种方式，你可以登录到远程的主机上，就好象计算机是直接连接到远程服务器上的一个终端。 如果你出差时需要查询存放在单位主机里的资料时，就可以通过远程登录方式和本单位主机连接，即可调用存储在主机上的资料。当然，你必须具备连接服务器的条件，拥有服务器上的合法用户和口令,电子论坛,电子论坛是上网用户就某个感兴趣的问题交换信息的园地。 其表现形式为两类： 一是分散形式，如邮件列表（Mailing List）。任何发往邮件列表管理器的邮件均被复制并被发送给邮件列表中的所有成员。 二是集中式，如新闻组（Newsgroup）、

7、USENET、电子公告板（BBS）等。用户发送和阅读的信息集中在某台服务器上，由系统管理员管理,可从以下网站中查询生物医学方面的通讯组和电子论坛,近年来，全文检索系统、多媒体检索系统的发展非常迅速。 这些系统中存储的对象是信息源本身，而不是信息线索，有利于原始文献资源共享。 但由于信息占用空间大，响应速度较慢，多采用自然语言标引，易发生误检、漏检，尚有待进一步研究改进,Yahoo!（） 雅虎（Yahoo!）是全球知名度最高的搜索引擎之一，在全球共有24个网站，12种语言版本。雅虎首创的分类方法独特实用。并支持在检索结果中进行二次检索,常用综合性搜索引擎,Google（,Google的检索界面非

8、常简洁，同时也是众多国际知名门户网站搜索引擎技术提供商。 Google具有以下特点：检索网页数量达24亿，搜索引擎中排名第一； 支持多达132种语言，包括简体中文和繁体中文； 网站只提供搜索引擎功能，界面简洁典雅，速度极快； 专利网页级别技术PageRank能够提供准确率极高的搜索结果,可靠Google智能化的“手气不错”功能，提供可能最符合要求的网站； “网页快照”功能，能从Google服务器里直接取出缓存的网页。 具有独到的图片搜索功能；具有强大的新闻组搜索功能；等等,Lycos（,Lycos网站创立于1995年，是全球最受欢迎的知名网站群之一。 Lycos提供分类目录导航、关键词检索和高

9、级检索功能,Excite（,由斯坦福大学的学生开发的能在大型数据库中进行快速概念检索的搜索引擎,AOL（,AOL界面清新，使用了Google的技术，按目录方式查找十分便捷,百度搜索（,百度搜索引擎拥有世界上最大的中文信息库，总量达到4500万页以上。 百度搜索引擎技术被认为是第二代中文搜索引擎核心技术的代表，国内20多家网站如新浪搜索、搜弧、中国人等均使用了百度搜索引擎作为站点搜索的支持,新浪(,新浪网搜索引擎是面向全球华人的网上资源查询系统。其收录的资源相当丰富，目前共有20余万个网站，是互联网上规模最大的中文搜索引擎之一。 新浪网提供的查询服务有网站、网页、新闻、软件、游戏等。 提供的检索

10、功能有一般检索、进阶检索、高级搜索、图片搜索等。一般搜索提供“分类检索”和“关键词查询”两种查找方法,搜狐（,搜狐是国内最著名的中文搜索引擎之一，成立于1996年8月。已逐步发展成为最受用户喜爱的综合性门户网站，是目前国内影响力最大的分类搜索引擎。 搜狐提供的查询服务有网站、网页、新闻、网址、软件五类信息。 搜狐检索功能有关键词查询、分类查询（目录导航）、高级搜索三种,网易（,网易是国内较早成立的大型门户网站之一。它在与世界领先的搜索引擎技术商Google合作的基础上，正式启用自行研发的功能齐全的搜索引擎技术，并新增了关键词广告搜索服务。 网易提供目录、网站、中文网页、所有网页、新闻等信息的查

11、询服务。 提供分类检索（目录导航）、关键词检索功能，未提供多项目查询界面,BioMedNet（生物医学网，BMN） () BMN是常用的医学搜索引擎之一，由美国许多大学、政府机构、非盈利学术机构合作支持， Elsevier出版社经营。 同时，BMN可向用户免费提供包括MEDLINE、EMBASE在内的多个生物医学数据库，提供上百种生物医学期刊的全文和15000多篇综述文献，是检索生物医学资源的重要网站。 使用BMN前用户须经简单注册,常用医学搜索引擎,CliniWeb International (./cliniweb,是WWW临床信息的索引及目录表，可用英、德、法、西、葡五种

12、文字进行检索。可以通过PubMed直接连通MEDLINE进行检索,HealthAtoZ(,HealthAtoZ建立于1996年，是一个综合性的卫生与医学资源网站,版权归美国Medical Network Inc.(MNI)公司，提供50000多个网上卫生和医学相关网址的功能强大的医学搜索引擎。 HealthAtoZ所提供的资源都是经过医学专业人员手工编排。 HealthAtoZ的类目是按专题展开的，共有相关专题约130个,Health Web(,Health Web 是美国中西部地区卫生科学图书馆和相关机构合作开发的卫生资源指南系统。 HealthWeb提

13、供的列表内容主要是从基础到临床各个学科的名称，再加上其热门话题，共有约71个类目。 关键词检索提供基本检索和高级检索两种检索方式,Medscape(,Medscape是由美国Medscape公司创建于1995年6月，其目的是为临床医生和其他职业卫生工作者提供及时、丰富的临床信息，同时也为大众提供相关医疗卫生知识，是Web上最大的免费提供临床医学全文文献和继续医学教育资源（CME）的网站。 用户首次使用时,需免费进行注册。 Medscape提供专业聚焦的目录浏览和站点检索功能,MedWeb(.,MedWeb是美国埃默里大学卫生科学中心图书馆建立的生物医学资源导航系

14、统，提供按主题浏览和按关键词检索相关资源的功能。 点击MedWeb列表中的相关主题，即可得到相关主题的网站列表。 MedWeb的站点检索功能分快速检索和高级检索两种,Medwebplus(,Medwebplus是因特网上最大的卫生科学网站之一，版权归Flexis,Inc公司所有。 提供从主题目录、地理目录和关键词检索三种途径查找文献的功能,Medical Matrix（医源）（,Medical Matrix是由美国医学信息学会创办的全文智能型医学搜索引擎。目的是为了提高临床医务人员利用网上临床资源的效率。 Medical Matrix提供分类目录搜索和关键词搜索,37oC医学网（.cn,37医

15、学网是由第四军医大学建立的医学大型综合性网站。为临床医生、医学科研人员、医学院校师生提供各类国内外最新的医学动态信息、内容丰富的医学文献，以及医学继续教育服务及各类专题学术会议等全方位的医学信息服务。 采用先进的科学分类方法，全中文界面，有方便的网上查询，还有独特的关键词搜索等等，为中文用户提供了一种方便、快捷的医学信息获得手段,美国国家生物技术信息中心（NCBI） . 美国国家生物技术信息中心（National Center of Biotechnolgoy Information，简称NCBI）成立于1988年。 NCBI的主页分为四个部分：最上面的是工具栏

16、，左侧列出了NCBI提供的各种服务，中间部分是NCBI的最新消息，右侧是各种热点链接。 以下对NCBI的工具栏作一简要介绍,常用生物医学专业网站,PubMed PubMed可以免费获得MEDLINE和PREMEDLINE的文献信息，并通过记录间的相关链接，获取其相关基因、蛋白质序列以及蛋白质三维结构等信息,Entrez Entrez是NCBI 1991年开发研制的集成数据库检索系统，它包括的数据库有：PubMed、Nucleotide sequence database、Protein sequnec database （包括GenBank） 、Structrues、Genome、PopSet

17、、OMIM、Taxonomy、Books、 ProbeSet、3D Domains、UniSTS、SNP、CDD等。 从这些数据库中可以获取核苷酸序列、蛋白质序列、蛋白质三维结构、基因组信息、生物学门类以及MEDLINE和PREMEDLINE的信息,BLAST BLAST是Basic Local Alignment Search Tool的英文缩写，译为碱基局部对准检索工具，是由NCBI提供的一种序列类似性检索程序。序列的类似性比较，对确定新的基因以及对疾病的基因诊断及原因确定具有重要的意义。 利用BLAST还可以进行核苷酸序列、蛋白质序列等的同源性分析,GenBank GenBank由NCB

18、I负责管理，它是一个公共数据库，每两个月一个版本，提供所有公开发表的核酸和蛋白质序列及其生物学注释和书目文献等信息等。 在NCBI的主页上先点击Entrez，再点击Nucleotides，即可进入其页面,OMIM 人类孟德尔遗传联机数据库（OMIM），是人类基因和遗传疾病的目录数据库。它不仅包括基因和遗传疾病有关的文本信息、图片以及参考文献，还包括与Medline中的文献、GenBank中的序列、图谱以及其他数据库的链接。 Books 提供相关生物医学图书的查询。 TaxBrower 提供按生物学门进行检索或浏览其核苷酸序列、蛋白质序列、结构等功能,Structure NCBI的结构数据库，包

19、括X线结晶学和磁共振测定的结构数据，这些结构数据与序列数据、生物分类和PubMed中的文献建立了交叉链接。运用NCBI的3D结构浏览器和Cn3D，可以很容易地从Entrez获得分子的分子结构间相互作用的图像,美国国立卫生研究院（NIH,网址为：. 美国国立卫生研究院是世界一流的生物医学研究中心，在科研成果开发，生物医学信息数据库方面都居于世界前列。它为专业人员提供许多综合性与专科性科研与临床信息资源，也为公众提供许多卫生与病人教育资料,NIH主页包括的栏目有：卫生信息、科研资助、新闻与事件、科学资源、NIH下属机构、NIH介绍等。 从NIH可获取以下卫生信息（Health Inf

20、ormaiton,NIH汇集的卫生信息和数据库有：最近1年NIH卫生信息索引（NIH Health Informaiton Index）、网上免费数据库（MEDLINEPlus，PubMed，ClinicalT，Combined Health Information Database等）、NIH出版物、健康热线、药物信息、特别研究项目等,Clinical T 临床试验数据库 网址为：http:/ ClinialT 临床试验数据库是向病人、病人家属、公众和医务人员提供美国国内临床试验研究信息的数据库，创建于2000年，收录了由NIH、美国其他

21、联邦机构和全球范围内7万多个制药公司资助的将近6600多项临床试验研究信息,Combined Health Informaiton Database 综合卫生信息数据（.gov） 创建于1985年，是提供卫生信息和健康教育资源的书目型数据库。 文献数据来源于美国联邦政府下属的多个卫生机构，每季度更新一次，收录的文献类型包括：期刊论文、专著、教材章节、手册、培训指南、广告、报告、小册子、书目、视听资料及其他难以得到的文献资料,美国国立医学图书馆（NLM） .,美国国立医学图书馆（NLM）是世界上最大的医学图书馆。NLM不仅馆藏量大，而且网上医学信息资源丰富，提供包括Medl

22、ine在内的几十种数据库供互联网用户免费使用。 NLM主页包括的栏目有：卫生信息、图书馆服务、研究项目、更新和公告、一般信息,从NLM上的卫生信息（Health Information） 栏目可以检索以下常用数据库： MEDLINE/PubMed 著名的医学书目数据库，收录了4500种生物医学期刊。 MEDLINEplus 该数据库提供的信息包括卫生专题信息、NIH下属研究所的全文出版物、医学百科全书、药物信息、医学词典和词汇、主要医学学会链接、医生医院名录、统计资料、卫生设施、Medline中专题文献的检索链接等,DIRLINE（Directory of Information Resour

23、ces Online） DIRLINE（）是美国国立医学图书馆提供的在线数据库。可检索与生物医学有关的各种信息资源的地址和描述性信息。 LOCATORplus 可以查询NLM的图书、期刊、视听资料的馆藏目录。 Additional Information by Subject 列出其他主题信息的链接，包括艾滋病、寒带保健、生物伦理学等信息资源,美国疾病控制与预防中心（CDC） （.,美国疾病控制与预防中心（Centers for Disease Control and Prevention, CDC）是美国卫生与服务部（Depar

24、tment of Health and Human Services）的一个下级机构。 CDC的主页包含CDC介绍、公告、数据与统计资料、旅游者卫生、健康主题A-Z、出版物，软件与产品、培训与招聘、订购、其它站点等内容,世界卫生组织（WHO） （.int,WHO的主页对WHO进行了介绍并报道了最新消息，包括疾病爆发新闻、专题报道、会议消息、新闻等，此外还链接了国家、卫生专题、出版物、研究工具、WHO站点等,中国医学生物信息网(CMBI,（http:/,中国医学生物信息网(CMBI)是由北京大学医学部开发研制的综合性医学生物信息网。 其目的是结合我国实际，全面系统和有重点地搜集整理国际医学和生物

25、学的研究信息，并加以分析综合，为我国医学和生物学的教学科研医疗和生物高技术产业的开发提供信息服务,中国医学生物信息网的信息部分主要由医学新闻、最新文献、特别报道、lnsight、专题网页、今日临床、数据库等八部分内容组成，每一页下又有若干细类。 如专题网页里包括了近期热点如非典型性肺炎、干细胞、基因治疗等网页，内容丰富新颖。 数据库里包括了心血管病、生物活性多肽等多个医学数据库,中国医学生物信息网主页的左侧有多个网络工具的链接，如导航系统、网络资源及友情链接等，不仅为用户提供了许多通用和生物医学专用的搜索引擎，还提供了MEDLINE、中国生物医学文献数据库（CBMdisc）等多个生物医学文献数

26、据库的链接,国家科技图书文献中心,国家科技图书文献中心是根据国务院领导的批示于2000年6月12日组建的一个虚拟的科技文献信息服务机构，由中国科学院文献情报中心、工程技术图书馆（中国科学技术信息研究所、机械工业信息研究院、冶金工业信息标准研究院、中国化工信息中心）、中国农业科学院图书馆、中国医学科学院图书馆组成,互联网上的电子期刊大致可以分为两类：一类是免费资源，对用户免费开放；另一类是收费资源，需要付费注册才能使用。 国内主要电子期刊数据库有 中文科技期刊数据库（VIP） 中国期刊全文数据库（CNKI - CJFD） 万方数据库（万方数据资源系统）.cn,国内电子期刊数据库,OVID系统 医学期刊全文数据库() 共有上千种医学期刊，回溯至1993年 EBSCO期刊全文数据库() 共1200多种，其中生物医学期刊554种，回溯至19