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文档简介
1、原核表达体系的构建刘华彬,董浚键、实验材料1)植物材料:拟南芥2)载体及菌株:克隆及测序用载体为 pMD18-T ,购自 Takara 公司。宿主菌 DH5。原核表达载体 (pET30c ?)。3)PCR 引物:登陆 GeneBank查找目的基因序列,以目的基因序列为模板设 计引物。4)药品试剂:反转录试剂盒( TaKaRa),质粒小提试剂盒( TIANGEN ),胶 回收试剂盒, Taq DNA 聚合酶( TaKaRa),dNTPs(TaKaRa),限制性内切 酶( TaKaRa),T4 连接酶( TaKaRa),各种 DNA 和蛋白 marker,各种抗 生素类,、方法1)目的基因的获得(
2、 RT-PCR):拟南芥叶片 mRNA 逆转录 cDNA PCR 基因(详见王希朝那份) ;PCR 产物用 0.8%琼脂糖凝胶分离。先设计好 PCR 的引物和 PCR的反应程序。2)克隆载体的构建:. 目的基因的切胶回收: 在紫外灯下迅速用干净的手术刀切下含目的基因的琼脂糖凝胶块,放 入已称重的离心管中,在保证目的基因全部回收的同时,应尽量减少胶 的体积。 计算凝胶重量( 100 mg相当于 100 l),加入 3倍体积 solution DE-A, 75水浴 6-8 分钟,其间轻柔地颠倒离心管至胶完全融化。 加入 2倍体积 solution DE-B ,颠倒混匀,将溶液转移到吸附柱中,室 温
3、放置 1 min,12000 rpm离心 1 min。 取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,加入 600 l Wash solution,室温 12000 rpm离心 30 s。 重复步骤一次。 取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,室温 12000 rpm离心 1 min。 将吸附柱放入新的 1.5 mL 灭菌离心管中,在柱膜中央加入 30 l 75 预热的 ddH2O,室温放置 2 min,12000 rpm离心 1 min 。离心管中的液 体即为回收的目的基因片段,可立即使用或保存于 -20备用。. 目的片断与克隆载体 pMD18-T 连接:pMD 19-T Simple Vector ( T 载
4、体,小纸盒子中)Insert DNAdH2OSolution I (冰中融化,小纸盒子中,跟 T 载体一起)1ul2ul2ul5ul5ul(等量)16 反应 30min. E. coli DH5 感受态细胞的制备: 将 E. coli DH5在 LB 平板上划线培养过夜。次日,挑取单克隆,接 种到 5 mL LB 培养基中, 37,200 r/min 振荡培养过夜。 将过夜培养的菌液 1 mL 加入到 100 mL LB 培养基中 (1: 100),培养2-3 h至 OD600=0.5,转入预冷的无菌离心管中,冰上放置 10 min,然 后于 4下 3000 rpm 离心 10 min。 弃去
5、上清,用预冷的 0.05 mol/L 的无菌 CaCl2 溶液 10 mL 轻轻悬浮 细胞,冰上放置 20 min,4下 3000 rpm离心 10 min。 弃去上清,加入 4 mL 预冷的含 15%甘油的 0.05 mol/L 的 CaCl2 溶液, 轻轻悬浮细胞,冰上放置几分钟,即成感受态细胞悬液。 感受态细胞分装成 100 l 的小份,于冰上备用,或液氮速冻贮存于 -80。. 重组质粒转化 E. coli DH5(热击法)连接产物加至感受态 E.coli DH52(200ul)或( 100ul) 【非连接载体 加 2ul 】 【加入后离火远点轻轻用手拨】冰上放置 20min42水浴热击
6、 90s立即放置冰上 2min(勿震荡)于超净工作台加 800ul LB 培养液37, 150rpm 预培养 50min6000rpm离心 1min,吸除 800ul 上清;剩余液体用来悬浮沉淀涂布 LB+Amp 平板上, 37倒置培养 12h(于超净工作台吹干液体) 。 . 挑取白色单克隆菌落,重悬于 5 l ddH2O 中,取其中 1 l 用于 PCR鉴 定。 PCR反应体系和反应程序同上面获取目的基因的 PCR 一样。 . 重组质粒的提取( TIANGEN 质粒小提试剂盒,方法可以看试剂盒说明 书) 将以上剩余的 4 l 菌液接种到 5 mL 含 Amp 抗生素的 LB 液体培养基 中,
7、 37振荡培养过夜。 取 3 mL 菌液,室温 12000 rpm离心 1 min。 弃上清,加入 250 l Solution I ,重悬菌体细胞。 加入 250 l Solution,轻柔颠倒离心管 4-6 次。 加入 350 l Solution,轻柔颠倒离心管 6-8次,此时应出现白色絮状沉淀,室温 12000 rpm离心 10 min。 取上清(注意不要吸到蛋白) ,转入吸附柱,室温放置 1 min,12000 rpm 离心 1 min。 取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,加入 500 l Wash Solution ,室温 12000 rpm离心 1 min。 重复步骤一次。 取下吸
8、附柱,倒掉收集管中的废液,室温 12000 rpm离心 1 min。 将吸附柱放入新的 1.5 mL 灭菌离心管中,在柱膜中央加入 60 l 75 预热的 ddH2O,室温放置 2 min ,12000 rpm离心 1 min。离心管中的 液体即为质粒。可立即使用或保存于 -20备用。. 重组质粒的酶切鉴定酶切反应体系、 反应温度和反应时间根据内切酶的种类确定设计。 酶切 产物用 0.8%琼脂糖凝胶分离。. 重组质粒的目的基因的序列测定重组质粒由测序公司测序。 . 菌种保存取 500l 重组菌液加入等体积 50%的无菌甘油 ( 终浓度达到 25%),液氮 速冻, -80保存。3)目的基因的原核
9、表达. 原核表达载体的构建 克隆载体的构建: 必须考虑使用的克隆载体有无多克隆位点, 没有就要 特别设计一对上下游引物, 分别带上酶切位点, 以便插入原核表达载体 上相应的多克隆位点。构建克隆载体的方法参见上面步骤。 重组质粒和表达载体的酶切: 酶切反应体系、 反应温度和反应时间根据 内切酶的种类确定设计。酶切产物用 0.8%琼脂糖凝胶分离。 回收表达载体酶切片断和目的基因酶切片断:i. 在紫外灯下迅速用干净的手术刀切下含目的基因的琼脂糖凝胶块, 放 入已称重的离心管中, 在保证目的基因全部回收的同时, 应尽量减少 胶的体积。ii. 计算凝胶重量(100 mg相当于 100 l ),加入 3倍
10、体积 solution DE-A, 75水浴 6-8 分钟,其间轻柔地颠倒离心管至胶完全融化。iii. 加入 2 倍体积 solution DE-B,颠倒混匀,将溶液转移到吸附柱中, 室温放置 1 min,12000 rpm离心 1 min。iv. 取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,加入 600 l Wash solution,室 温 12000 rpm 离心 30 s。v. 重复步骤一次。vi. 取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,室温 12000 rpm离心 1 min。vii. 将吸附柱放入新的 1.5 mL 灭菌离心管中,在柱膜中央加入 30 l 75预热的 ddH2O,室温放置 2 min
11、,12000 rpm离心 1 min。离心 管中的液体即为回收的目的基因片段,可立即使用或保存于-20备用。 表达载体酶切大片断和目的基因的连接(根据连接酶说明书方法操作)连接反应体系反应液成分体积10T4 Buffer2.5 lddH2O15.5 lpET30c大片段2 lSTS(saIl/xhoI)4 lT4 Ligase1 lTotal25 l16过夜连接。 重组质粒转化 E. coli 宿主菌(根据表达载体确定) (热击法) 连接产物加至感受态 E.coli DH52(200ul)或( 100ul) 【非连接载 体加 2ul】 【加入后离火远点轻轻用手拨】冰上放置 20min42水浴热
12、击 90s立即放置冰上 2min(勿震荡)于超净工作台加 800ul LB 培养液37, 150rpm 预培养 50min6000rpm离心 1min,吸除 800ul 上清;剩余液体用来悬浮沉淀涂布 LB+Amp 平板上, 37倒置培养 12h(于超净工作台吹干液体) 转化菌的 PCR 鉴定(菌落 PCR) 转化菌的酶切鉴定:转化菌菌液扩大培养,提取质粒,双酶切检测。酶切反应体系、反应温度和反应时间根据内切酶的种类确定设计。酶 切产物用 0.8%琼脂糖凝胶分离。菌种保存取 500 l 重组菌液加入等体积 50%的无菌甘油 (终浓度达到 25%),液 氮速冻, -80保存。 . 目的基因在 E
13、. coli 表达载体宿主菌内的表达SDS-PAGE蛋白胶配制上层胶( 3%)下层胶( 12%)下层胶(10%) 下层胶 (7.5%)ddH2O1.085 mL1.5 mL1.85 mL2.25 mL上层胶缓冲液0.625 mL上层胶储备液0.75 mL下层胶缓冲液1.25 mL1.25 mL1.25 mL下层胶储备液2 mL1.65 mL1.25 mL20% SDS12.5 l25 l25 l25 l10%过硫酸铵(AP) 25 l50 l50 l50 lTEMED5 l7 l2 l7 lTotal 2.5 mL 5 mL 5 mL 5 mL在实验中,试用了不同浓度的下层胶,以获得最佳分离效
14、果。 IPTG诱导蛋白表达( 这个不确定 )i. 将重组菌在含对应抗生素的 LB 平板上划线培养过夜。ii. 次日,挑取单克隆,接种到 5 mL 含对应抗生素的 LB 液体培养基中, 37, 200 r/min 振荡培养过夜。iii. 将过夜培养的菌液 100 l 加入到 10 mL LB 培养基中 (1: 100), 200 r/min 振荡培养 3 h 左右至 OD600=0.6。iv. 培养完毕后,取 1 mL 菌液 12000 rpm离心,弃上清, 200 l PBS悬 浮。在剩余 9 mL 菌液中加 100 mmol/L IPTG 54 l 至终浓度 0.6 mmol/L ,此时记为
15、 0 h。v. 此后分别在 1 h,2 h,3 h,4 h,5 h,6 h,9 h 各取 1 mL 菌液,12000 rpm 离心,弃上清, 200 l PBS 重悬。加 2Loading buffer 后沸水 变性 5 min。vi. SDS-PAGE 检测蛋白表达。 检测重组蛋白可溶性( 好像做多克隆抗体不用检测蛋白可溶性? )i. 将重组菌在含对应抗生素的 LB 平板上划线培养过夜。ii. 次日,挑取单克隆,接种到 5 mL 含对应抗生素的 LB 液体培养基中, 37, 200 r/min 振荡培养过夜。iii. 将过夜培养的菌液 100 l 加入到 10 mL LB 培养基中 (1: 100), 200 r/min 振荡培养 3 h 左右至 OD600=0.6。iv. 加入 IPTG诱导至 6 h,4,10000 g离心 5 min。v. 去上
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