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文档简介
1、第一节第一节 化能异养菌的产能代谢化能异养菌的产能代谢 6.1.1 代谢和代谢途径 6.1.2 糖分解代谢途径 6.1.3 发酵 6.1.4 三羧酸循环 6.1.5 呼吸 代谢(metabolism)是对细胞所进行的各种生化反应的总称,代谢 是所有生理活动的化学基础;营养是代谢的物质和能量源泉; 细胞内各种生化反应相互联系,各种代谢物通过生化反应相互转换, 构成了细胞的代谢网络; 代谢途径(pathway):生理功能相关的若干个顺序排列的生化反应 构成一条代谢途径; 代谢途径的反应速率(代谢通量)受到严格调控; 6.1.1 代谢和代谢途径 根据代谢途径的反应特点和生理功能特点,细胞内众多的代谢
2、途径可概 括的划分为: 分解代谢(catabolism):以氧化分解反应为特征,将大分子或复 杂分子氧化分解为简单小分子,同时释放能量,为合成代谢提供前 体物和能量; 合成代谢 (anabolism):以还原合成反应为特征,利用小分子前 体物,消耗能量,合成大分子或复杂分子; 代谢途径的类型 细胞通过分解代谢,将营养物质转化为小分子“碳架”、氨基供体、巯 基供体、磷酸等前体物;同时产生能量(ATP)和还原力(NADPH); 也产生代谢废物; 细胞通过合成代谢,利用分解代谢提供的各种前体物,消耗ATP和 NADPH,合成各种细胞组分(大分子、复杂分子和小分子),以及进 行各种其它生理活动所需的代
3、谢产物; 代谢的结果表现为细胞营养、生长、发育、繁殖、衰老、凋亡等生命活 动特征; 代谢的基本生理功能 生化反应的类型和特点生化反应的类型和特点 l细胞有多少个酶,就有多少个生 化反应,但酶的类型,及所催化的 生化反应类型是有限的; 细胞内的化学反应几乎都是生化反应,反应由专一性的酶催化,即酶 促化学反应; 酶催化可以降低反应活化能,反应条件温和;酶与底物相结合催化反 应,具有催化专一性; 氧化还原反应是一类最重要的生化反应,反应涉及电子得失和能量转化; 失去电子为氧化,得到为电子还原;代谢物的氧化还原一般与电子载体 的氧化还原偶联; 氧化还原反应 l与细胞氧化还原反应偶联的电子 载体有: N
4、AD+/NADH NADP+/NADPH FAD+/FADH2 碳分解代谢(carbon catabolism):异养菌部分或彻底氧化分解有 机碳源,产生ATP、NAD(P)H、小分子碳架或CO2的分解代谢途径; 主要由以下代谢途径组成,它们构成异养菌的中心碳代谢(central carbon metabolism): 糖的吸收 糖分解代谢途径(糖酵解途径) 三羧酸循环 溢流代谢途径(发酵) 呼吸 6.1.2 糖分解代谢途径 各种有机碳源都有各自的运 输系统,但最终都进入中心 碳代谢途径进行氧化分解; 碳分解代谢的简并性 l微生物能够利用何种碳源,取决于 是否有相应的运输系统和进入中心 碳代谢
5、的分支代谢途径; 糖分解代谢途径:指氧化分解葡萄糖的代谢途径: 糖酵解途径:产能 磷酸戊糖途径:不产能 糖酵解(glycolysis)途径:将葡萄糖部分氧化分解为丙酮酸,同时 底物水平磷酸化产能的代谢途径; 广泛存在的糖酵解途径是EMP,还有存在于少部分微生物中的ED途径、 磷酸解酮酶途径等;由于EMP途径首先发现,所以糖酵解途径又特指 EMP; 糖分解代谢途径 糖酵解途径(EMP) 熟悉生化物质的化 学结构 熟悉生化反应类型 掌握代谢途径 理解生理功能 分解葡萄糖: 葡萄糖+ATP 1-磷酸葡萄糖+ADP(葡萄糖激酶) 1-磷酸葡萄糖 6-磷酸葡萄糖(变位酶) 6-磷酸葡萄糖 6-磷酸果糖(
6、异构酶) 6-磷酸果糖+ATP 1,6-二磷酸果糖+ADP(激酶) 1,6-二磷酸果糖3-磷酸甘油醛磷酸二羟丙酮 (醛缩酶) 磷酸二羟丙酮 3-磷酸甘油醛(异构酶) EMP的生化反应及生理目的(一) 氧化、释放能量、产ATP: 3-磷酸甘油醛 +2Pi 1,3-二磷酸甘油酸+2e+2H NAD2e2H NADHH(磷酸甘油脱氢酶) 1,3-2p甘油酸+ADP+Pi3-磷酸甘油酸+ATP(激酶) 3-磷酸甘油酸 2-磷酸甘油酸(变位酶) 2-磷酸甘油酸磷酸烯醇式丙酮酸(烯醇化酶) PEP+ADP+Pi 丙酮酸+ATP(丙酮酸激酶) EMP的生化反应及生理目的(二) 氧化反应是重要的生化反应,化合
7、物在氧化过程中,释放高能电子和 能量; 释放的高能电子还原氧化型的电子载体,产生还原态的电子载体; 释放的能量储存在高能化学键(磷酸键)中,形成高能化合物中间体; 3-磷酸甘油醛 +2Pi 1,3-二磷酸甘油酸+4e+4H 2NAD4e4H 2NADH2H 氧化反应 化合物在氧化分解过程中,形成的高能化合物中间体的高能键水解, 偶联ADP磷酸化形成ATP,这种产生ATP的方式叫做底物水平磷酸化; 1,3-二磷酸甘油酸 3-磷酸甘油酸Pi 磷酸稀醇式丙酮酸 丙酮酸Pi ADPPi ATP 底物水平磷酸化 一分子葡萄糖经EMP部分氧化分解,产生两分子丙酮酸,两分子 NADH ,净产生两分子ATP;
8、 Glc+2ADP+2Pi+2NAD+2Pyr+2ATP+2NADH+2H+ EMP氧化分解葡萄糖,底物水平磷酸化产生ATP,为细胞提供能量; 产生多种“C3”小分子碳架,提供合成代谢前体物; 产生NADH,可进一步通过呼吸产生ATP;也可以转化为还原力- NADPH; EMP的生理功能 存在于某些发酵单胞菌、假单胞菌、固氮菌等G-菌,以及极少数G+菌 中的糖酵解途径; 在代谢途径上,ED途径与EMP的区别在于:先葡萄糖进行氧化脱水, 然后再分解氧化产生丙酮酸; 在生理功能上,ED途径与EMP区别在于:一分子葡萄糖经ED途径氧化 分解,产两分子丙酮酸、一分子H2O、一分子NADPH和一分子NA
9、DH, 净产一分子ATP; ED途径兼有产NADPH(还原力)的生理功能; ED 途径 ED 途径 glc+ADP+Pi+2NAD(P)+ 2pyr+ATP+NADH+NADPH+H2O (KDPG特征性中间代谢物) 6-磷酸葡萄糖+NADP+ 6-P葡萄糖酸+NADPHH ( 6-磷酸葡萄糖脱氢酶) 6-P葡萄糖酸 2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖酸H2O (6-磷酸葡萄糖酸脱水酶) 2-酮-3-脱氧-6-P葡萄糖酸 3-P甘油醛+丙酮酸 (2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖酸醛缩酶) 3-磷酸甘油醛 丙酮酸+ATP+NADH ED途径的生化反应和生理功能特点 存在于某些严格厌氧或耐氧的乳酸细
10、菌中的一种糖酵解途径;葡萄糖分 解方式与EMP不同; 磷酸解酮酶途径可区分为两种途径: 己糖磷酸解酮酶途径(HK):产生小分子碳架、ATP、 NADH 戊糖磷酸解酮酶途径(PK):产生小分子碳架、ATP、NADH、 NADPH HK途径先分解、重排、再分解氧化;PK途径先部分氧化、异构、再分 解氧化; 磷酸解酮酶途径 HK途径 6-磷酸果糖 4-磷酸赤藓糖乙酰磷酸6-磷酸果糖 25-磷酸木酮糖 23-磷酸甘油醛2乙酰磷酸 碳架重排和异构 2丙酮酸+2NADH+4ATP 磷酸解酮酶 磷酸解酮酶 乙酸+ATP 2乙酸+2ATP 转酮酶、转醛酶 2果糖 2丙酮酸3乙酸+5ATP+2NADH PK途径
11、 6-磷酸葡萄糖 6-磷酸葡萄糖酸5-磷酸核酮糖 5-磷酸木酮糖 3-磷酸甘油醛 乙酰磷酸 丙酮酸+ATP+NADH 磷酸解酮酶 乙酸+ATP 葡萄糖丙酮酸乙酸+2ATP+NADPH+NADH+CO2 CO2+2NADPH 葡萄糖脱氢酶 葡萄糖酸脱氢酶 分解: (磷酸解酮酶) 6-磷酸果糖+Pi 4-磷酸赤藓糖乙酰磷酸(HK) 5-磷酸木酮糖+Pi 3-P甘油醛乙酰-P 氧化:(葡萄糖脱氢酶;葡萄糖酸脱氢酶)(PK) 6-磷酸葡萄糖+NADP+6-P葡萄糖酸NADPHH 6-P葡萄糖酸+NADP+5-P核酮糖+NADPH+H+CO2 底物水平磷酸化:(乙酸激酶) 乙酰磷酸+ADP + Pi 乙
12、酸ATP HK和PK途径的反应特点 采用磷酸解酮酶催化分解酮糖的方式氧化分解葡萄糖,可以提高产能 效率: HK途径分解一分子葡萄糖净产生2.5个ATP,但只形成一分子 NADH; PK途径先氧化,后酮解一分子葡萄糖净产生2个ATP,同时产生一 个NADPH和NADH,产生一个CO2; HK和PK途径存在只有底物水平磷酸化一种方式产能的专性厌氧或耐氧 菌中,尽量提高产能效率; HK和PK途径的生理特点 碳架重排反应:丙糖、丁糖、戊糖、己糖和庚糖之间相互转化的反应, 通过相互间转移二羟丙酮基(转酮)或羟乙醛基(转醛),实现分子重 排; 转酮反应:由转二羟丙酮基酶(转酮酶)催化: 4-P赤藓糖 6-
13、P果糖 7-P景天庚酮糖3-P甘油醛 转醛反应:由转羟乙醛基酶(转醛酶)催化: 7-P景天庚酮糖3-P甘油醛 5-P核糖5-P木酮糖 HK途径的碳架重排反应 碳架重排转醛和转酮反应 转酮酶 转醛酶 磷酸戊糖途径(HMP or PP):普遍存在的葡萄糖氧化分解途径,主要 生理功能为产生NADPH和C3C7的小分子碳架,没有底物水平磷酸化 产ATP功能; 氧化反应,将6-磷酸葡萄糖氧化分解为CO2和5-磷酸核酮糖 ,并产 生2个NADPH ; 非氧化还原的循环反应,将6个 5-磷酸核酮糖重排为5个 6-磷酸果糖; 总反应:Glc+12NADP+6H2O6CO2+12NADPH12H+ 磷酸戊糖途径
14、 磷酸戊糖途径的氧化反应部分 与PK途径的上半部反应完全相同,目的是产生 NADPH; Glc-6-Pi +2NADP+H2OCO2 +2NADPH2H+Ru-Pi 2.6-磷酸葡萄糖脱氢酶 3.6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶 磷酸戊糖途径的循环反应部分 转酮酶 转醛酶 转醛酶 65-P核酮糖 56-P果糖 56-P葡萄糖 代谢中间物为合成代谢提供 C3C7前体物 发酵(fermentation) :碳分解代谢的不完全氧化产物(丙酮酸、 NADH)转化为末端发酵产物,并排出细胞的代谢途径;也叫溢流代谢 (overflow metabolism) ; 发酵是中心碳代谢的一个组成部分,是在无氧条件下(不需
15、要氧)对糖 酵解的延续代谢,所以称为发酵,一般存在于厌氧菌和兼性厌氧菌中; 不同微生物的发酵代谢途径不同,产生的末端发酵产物也不同,由此构 成了各种发酵类型; 6.1.3 发酵 发酵的生理功能 细胞通过发酵,使糖酵解途径的产物-丙酮酸和NADH转化为末端发酵 产物,并排出细胞: 避免丙酮酸在胞内过量积累而产生毒害作用; 使NAD+ 再生,维持胞内NAD+/NADH平衡; 发酵与糖酵解途径共同构成了完整的葡萄糖部分氧化分解代谢,在这一 过程中,实现了底物水平磷酸化产能(发酵产能)、产生碳架的生理功 能; 这一代谢不需要氧参与,为厌氧菌和兼性厌氧菌采用; 乙醇发酵 乙酸发酵 乳酸发酵 丙酸发酵 丁
16、醇发酵 所有发酵的生理功能完全相同,但代谢途径和代谢产物各不相同,通常 以主要末端发酵产物命名发酵类型; 发酵反应必然包括还原反应,由NADH提供电子; 发酵的类型 乙醇发酵:从丙酮酸到乙醇,两步反应;丙酮酸脱羧生成乙醛和CO2, 消耗 NADH还原乙醛生成乙醇和NAD+再生,乙醇排出细胞; 乙醇发酵 总反应式:葡萄糖2乙醇2CO22ATP 丙酮酸 乙醛 CO2 丙酮酸脱羧酶 乙醛NADH乙醇NAD 乙醇脱氢酶 酿酒酵母在无氧条件下,通过EMP分解葡萄糖产生丙酮酸、 NADH和 ATP; 然后经乙醇发酵将丙酮酸转化为乙醛和CO2,排出细胞外;同时再生 NAD+; 利用上述代谢,使酿酒酵母在不需
17、要氧的条件下,完成分解葡萄糖,产 生碳架和ATP的生理功能;同时避免了不完全氧化的代谢中间物在胞内 的积累,以及胞内NAD+/NADH不平衡; 酿酒酵母的乙醇发酵 l运动发酵单孢菌(Zymomonas mobilis)为微好氧菌,在较低的氧分压下 生长;经ED途经分解葡萄糖为丙酮酸、 NADPH、NADH和ATP; l由于缺氧,部分丙酮酸不能彻底氧化,只能进入乙醇发酵途径:经脱羧反 应和还原反应,消耗NADH,产生乙醇和CO2; 总反应式:葡萄糖 2乙醇2CO2NADPHATP 运动发酵单胞菌的乙醇发酵 工业上利用酿酒酵母的EMP和乙醇发酵,或者利用运动发酵单孢菌的 ED途径和乙醇发酵,以葡萄
18、糖为主要原料发酵生产乙醇:工业乙醇、 医用酒精、食用酒精、各种酒类、燃料乙醇(fuel ethanol); 发展方向:以来自农产品废弃物的纤维素和半纤维素为发酵原料,进 行糖化和发酵过程相耦合的己糖和戊糖共代谢发酵;以降低乙醇发酵 成本,实现资源综合利用; 乙醇发酵的工业应用和发展方向 许多细菌具有乳酸发酵,特别是没有彻底氧化有机物的代谢途径的耐 氧菌,多采用乳酸发酵; 葡萄糖经糖酵解途径分解产生丙酮酸、 NADH和ATP;丙酮酸直接被 NADH还原为乳酸,排出细胞; 根据末端发酵产物的种类,乳酸发酵可分为同型和异型乳酸发酵; 乳酸发酵 丙酮酸 NADH乳酸NAD+ 乳酸脱氢酶 乳杆菌属(La
19、ctobacillus)时典型的进行同型乳酸发酵的菌属;经 EMP分解葡萄糖产生丙酮酸、 NADH和ATP;丙酮酸经乳酸发酵被转 化为乳酸排出细胞,同时NAD+再生; 总反应:葡萄糖2乳酸2ATP 这种乳酸发酵由于末端发酵产物只有乳酸一种产物,称为同型乳酸发 酵(homofermentation) ; 同型乳酸发酵 两歧双歧杆菌(Bifidobacterium bifidum)是严格厌氧菌,没有彻 底氧化有机物的代谢途径; 经HK途径分解葡萄糖,产生丙酮酸、乙酸(乙醇)、NADH和ATP; 乙酸或乙醇被直接排出细胞;丙酮酸经乳酸发酵转化为乳酸排出细胞; 由于末端发酵产物除乳酸外还有乙酸或乙醇,
20、被称为异型乳酸发酵 (heterofermentation); 总反应:2葡萄糖2乳酸3乙酸5ATP 两歧双歧杆菌的异型乳酸发酵 肠膜状明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)是兼性厌氧菌, 在无氧条件下经PK途径分解葡萄糖,产生丙酮酸、乙酸(乙醇)、 CO2、 NADPH、 NADH和ATP; 乙酸(乙醇)和 CO2直接排出细胞;丙酮酸经乳酸发酵,消耗NADH, 被还原为乳酸排出细胞; 由于末端发酵产物除乳酸外,还有CO2、乙酸或乙醇,也为异型乳酸 发酵; 总反应:葡萄糖 乳酸+乙酸+2ATP+NADPH+CO2 肠膜状明串珠菌的异型乳酸发酵 乙酰磷酸的代谢途径 当细胞
21、需ATP时,乙酰磷酸水解产生ATP和乙酸; 当细胞需要NAD时,在磷酸转乙酰基酶催化下 (phosphotransacetylase),乙酰磷酸变成乙酰辅酶A,然后消耗两 个NADH被还原为乙醇,同时NAD 再生; 乙酸CoA NADH 乙醛 HCoA NAD 乙酸磷酸HCoA乙酰CoAPi 乙醛NADH 乙醇 NAD 进行乳酸发酵的大多是G菌,主要分布在厚壁菌门芽孢杆菌纲:芽孢 乳杆菌属(Sporolactobacillus)、乳杆菌属(Lactobacillus)、片 球菌属(Pediococcus)、产乳酸球菌属(Lactosphaera)、明串珠 菌属(Leuconostoc)、乳球菌
22、属(Lactococcus); 以及属于放线菌门的双歧杆菌目(Bifidobacteriales)的双歧杆菌属 (Bifidobacterium); 乳酸发酵的真核微生物:米根霉(Rhizopus oruzae); 乳酸发酵的主要微生物属 能分解乳糖进行乳酸发酵的厌氧菌、兼性厌氧菌或耐氧菌细菌都称为 乳酸细菌; 乳酸细菌应用于乳品行业,主要以牛乳为原料发酵生产酸奶、干酪、 酸性奶油、酸性酪乳; 乳酸发酵的微生物用于乳酸的工业发酵生产,分为L-乳酸发酵和D-乳 酸发酵; L-乳酸用于合成可降解高分子材料聚乳酸,以及生产有机容 积乳酸乙酯; D-乳酸是医药中间体; 乳酸细菌及应用 肠杆菌科(Ent
23、erobacteriaceae)一类兼性厌氧的G杆菌,多数种 中心碳代谢包括EMP和甲酸或产气发酵; 甲酸发酵:丙酮酸裂解产生甲酸和乙酰辅酶A,甲酸为主要的末端发酵 产物,还有少量乙酸和乙醇; 如甲酸进一步分解则产生 CO2 和H2,为产气发酵; 甲酸裂解酶 丙酮酸HCoA乙酰CoA甲酸 CO2 H2 甲酸氢解酶 甲酸 甲酸发酵和产气发酵 E. coli是肠杆菌科埃希氏菌属(Escherichia)的模式种,是典型的兼 性厌氧的G杆菌; 在无氧条件下, E. coli 的中心碳代谢由EMP和混合酸发酵构成,既 产酸又产气,属异型发酵; l混合酸发酵产物包括:乳酸、琥珀酸、 乙酸、甲酸、乙醇、C
24、O2和H2; 大肠杆菌的混合酸发酵 甲酸 CO2 H2(偏酸性环境) 大肠杆菌混合酸发酵反应和酶 乙酰CoA 乙酰磷酸乙酸ATP 草酰乙酸3NADH苹果酸延胡索酸琥珀酸3NAD 乙酰CoA 2NADH 乙醛乙醇2NAD 乳酸脱氢酶 丙酮酸NADH乳酸NAD 甲酸裂解酶 乙酰CoA甲酸丙酮酸HCoA 丙酮酸羧化酶 草酰乙酸丙酮酸CO2 肠杆菌科肠杆菌属( Enterobacter )的典型种:产气肠杆菌 (Enterobacter aerogenes),EMP糖酵解; 丁二醇发酵 l在无氧条件下进行丁二醇发酵,末 端发酵产物除有少量乳酸、乙醇、 CO2和H2外,主要发酵产物为2,3-丁 二醇;
25、乙酰乳酸合成酶(acetolactate synthase)催化两分子丙酮酸缩合 脱羧,生成乙酰乳酸; 乙酰乳酸脱羧酶(acetolactate decarboxylase)催化脱羧,生成 3-羟基丁酮(acetoin); 羟基丁酮还原酶(acetoin reductase)催化,消耗NADH还原3-羟 基丁酮为2,3-丁二醇; 肠杆菌属细菌的丁二醇发酵反应 V.P.反应是鉴定丁二醇发酵的试验,出现红色为阳性反应,表示存在丁 二醇发酵; 原理:乙酰甲基甲醇在碱性条件下被氧化为二乙酰,二乙酰与精氨酸 的胍反应产生红色化合物; V.P.反应 枯草芽孢杆菌的异型丁二醇发酵枯草芽孢杆菌的异型丁二醇发酵
26、 枯草芽孢杆菌异型丁二醇发酵,产物包括:乳酸、乙酸、2,3-丁二醇 和痕量的乙醇; 用枯草芽孢杆菌代替酿酒酵母进行燃料乙醇生产是发展趋势之一; 丙酮丁醇梭状芽孢杆菌(Clostridium acetobutylicum)是厚壁菌 门梭菌科(Clostridaceae )梭菌属的典型种,为低GC的G专性 厌氧产芽孢菌; 丙丁梭菌的中心碳代谢只有ED途径和丙酮丁醇发酵途径,缺乏三羧酸 循环和呼吸; 丙酮丁醇发酵:末端发酵产物主要为丙酮和丁醇,同时还有甲酸、乙 酸、乙醇、丁酸、CO2和H2; 丙酮丁醇发酵 丙丁梭菌的丙酮丁醇发酵途径 丙酮酸 甲酸CO2(丙酮酸甲酸裂解酶) 丙酮酸 乙醛CO2 (丙酮
27、酸脱羧酶) 乙醛 乙醇(乙醇脱氢酶) 丙酮酸 乙酰CoACO2 (丙酮酸脱氢酶) 乙酰CoA 乙酰磷酸(磷酸转乙酰基酶) 乙酰磷酸 乙酸(乙酸激酶) 乙酰CoA 乙醛(乙醛脱氢酶) 乙醛 乙醇(乙醇脱氢酶) 丙酮丁醇发酵反应、酶和代谢产物(一) 2乙酰CoA 乙酰乙酰CoA (乙酰乙酰CoA 合酶) 乙酰乙酰CoA乙酰乙酸(乙酰乙酰CoA辅酶A转移酶) 乙酰乙酸丙酮CO2(乙酰乙酸脱羧酶) 乙酰乙酰CoAb-羟丁酰CoA( b-羟丁酰CoA 脱氢酶) b-羟丁酰CoA 巴豆酰CoA( b-羟丁酰CoA 脱水酶) 巴豆酰CoA 丁酰CoA(巴豆酰CoA 脱氢酶) 丁酰CoA丁酰-P丁酸(丁酰磷酸
28、转乙酰基酶和激酶) 丁酰CoA 丁醛丁醇(丁醛脱氢酶和丁醇脱氢酶) 丙酮丁醇发酵反应、酶和代谢产物(二) 用淀粉糖为原料,丙丁梭菌工业发酵生产丙酮丁醇在我国持续30年, 形成总溶剂生产行业;衰退近20年后,前年开始复苏,去年又衰退; 发酵生产丙酮丁醇的发展前景: 用纤维素降解糖,或半纤维素降解的戊糖代替淀粉水解糖为发酵原 料,发挥原料优势; 可以提高发酵产物中丁醇的比例,生产燃料丁醇替代目前使用的燃 料乙醇; 丙酮丁醇发酵的工业应用和发展前景 6.1.4 三羧酸循环 l三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle,TCA循环)是异养微生物彻底氧化 分解有机物,产生CO2、NAD
29、(P)H和FADH2的代谢途径; 是糖酵解途径的延续,将不完全氧化的有机物(丙酮酸),彻底氧化 为CO2而释放; 中间代谢物为合成代谢提供小分子碳架前体物; 有机物彻底氧化所释放的高能电子,还原电子载体,产生NAD(P)H和 FADH2,为氧化磷酸化产生ATP提供前体物; 受体再生 氧化 受体结合 氧化 底物水平磷酸 化 异构 TCA循环的代谢途径 丙酮酸脱氢酶 柠檬酸合成酶 顺乌头酸酶 异柠檬酸脱氢酶 a-酮戊二酸脱氢酶 琥珀酰辅酶A 合成酶 琥珀酸脱氢酶 延胡索酸酶 苹果酸脱氢酶 氧化 氧化 水合 TCA循环的反应特点 l丙酮酸氧化脱羧生成乙酰CoA,然后进入TCA循环; l乙酰CoA与受
30、体草酰乙酸结合,生成柠檬酸; l柠檬酸异构为异柠檬酸后,经两步氧化反应,脱掉两个CO2,生成琥珀酰 CoA和两个NAD(P)H ; l高能化合物琥珀酰CoA经底物水平磷酸化,产生GTP和琥珀酸; l琥珀酸经两步氧化,一步水合反应,再生为TCA的受体草酰乙酸,同时 产生NAD(P)H 和FADH2; TCA循环的酶循环的酶 柠檬酸合成酶 顺乌头酸酶 异柠檬酸脱氢酶 a-酮戊二酸脱氢酶 琥珀酸辅酶A合成酶 琥珀酸脱氢酶 延胡索酸酶 苹果酸脱氢酶 糖酵解途径与TCA循环总反应 EMP:葡萄糖2丙酮酸+2NA DH+2ATP 2丙酮酸2乙酰CoA+2CO2+ 2NADH TCA循环:2乙酰CoA 4C
31、O2 +6NAD(P)H+2FADH2 l总反应式: Glc10NA(P)D+2FAD 4ADP4Pi 6CO210NAD(P)H2FADH24ATP 呼吸(respiration):氧化NAD(P)H和FADH2 ,将高能电子的能量 转化为ATP的产能代谢途径; 氧化NAD(P)H和FADH2,再生NAD(P)+和FAD2+; 高能电子沿呼吸链传递,还原最终电子受体,形成呼吸产物; 高能电子在传递过程中,其能量转化为质子动力势(PMF); 质子动力势驱动ATP合成酶,氧化磷酸化合成ATP; 6.1.5 呼吸 呼吸链(电子传递链):是细胞进行呼吸的酶系统,由一系列具有氧 化还原功能的电子载体蛋
32、白,顺序排列在生物膜上构成; 呼吸链的一般组成: NADH脱氢酶复合物辅酶Q 细胞色素bc1复合物 细胞色素 c 细胞色素aa3(末端氧化酶复合物 ) 原核细胞的呼吸链位于细胞膜上,真核微生物的呼吸链存在于线粒体 的内膜上; 呼吸链 电子载体蛋白按照还原电位由高到低顺序排列; NADH脱氢酶复合物的电子载体为FMN、FeS;辅酶Q是具类异戊二 烯尾的苯醌衍生物;cytbc1的电子载体有血红素(heme )和FeS ; 其它cyt的电子载体都是血红素; 电子载体蛋白及电子载体 NAD(P)H脱氢酶复合物催化氧化反应; NAD(P)H + H+ + FMN+NAD(P) + FMNH2 FMNH2
33、(FADH2)+ 2Fe3+S FMN+(FAD2+)+2Fe2+S+2H+ 呼吸的反应过程NAD(P)H和FADH2的氧化 实现NAD(P)和FAD2+再生 呼吸的反应过程呼吸的反应过程电子传递电子传递 NAD(P)H和FADH2氧化释放的高能电子经呼吸链传递给最终(末端) 电子受体: NAD(P)H脱氢酶复合物催化辅酶Q 还原: 2Fe2+S + CoQ + 2H+ 2Fe3+S + CoQH2 cytb催化辅酶Q氧化,自身被还原; cytc1催化cytb氧化,自身被还原; cytc催化cytc1 氧化,自身被还原; cytaa3催化cytc氧化和末端电子受体还原,并形成呼吸产物; FeS
34、只接受电子被还原,2H+则被排到膜外;辅酶Q被FeS还原时,再从 基质中吸收2H+; cytb只接受电子, 2H+被排到膜外; cytc1在从基质中吸收2H+,还原cytc时, 2H+再被排出; 呼吸的反应过程呼吸的反应过程质子外排质子外排 高能电子沿呼吸链传递过程中,在三个位点有三对H+被排到膜外,形 成膜内外H+浓度差这种电势能,即质子动力势(PMF); 高能电子在经呼吸链传递过程中,电子能量逐步降低并转化为质子动力 势; 呼吸的反应过程质子动力势建立 氧化磷酸化(电子传递水平磷酸化):由质子动力势推动膜上的ATP合 成酶,使ADP磷酸化形成ATP; 通过呼吸(电子传递),高能电子的能量转
35、化为PMF;通过氧化磷酸 化,PMF的势能转化为ATP的化学键能; 2H+跨膜运输,驱动F1-F0ATP酶形成一个ATP; 氧化磷酸化 F1-F0ATP合成酶 氧化磷酸化由F1-F0ATP合成酶催化; F1-F0ATP合成酶由多个蛋白亚基构成, 其中F0位于膜上,F1位于膜内;中间 有质子通道; 当质子流穿过质子通道时,引起ATP 酶构象改变,使ADP磷酸化形成ATP; 有氧呼吸:分子氧作为呼吸的最终电子受体(terminal electron acceptor),在细胞色素aa3的催化下,接受电子被还原,形成呼吸 产物水的呼吸过程; NAD(P)H(FADH2) NAD(P)+(FAD2+)
36、+2H+2e O2 2H+ 2e H2O 呼吸的末端反应有氧呼吸 l进行有氧呼吸的微生物为好氧 微生物; 无氧呼吸:用除O2以外的其它氧化态无机或有机物作为呼吸的最终电子 受体,在末端氧化酶催化下被还原,形成呼吸产物的呼吸过程; 无氧呼吸存在于某些兼性厌氧或专性厌氧微生物中,根据呼吸的末端反 应不同,可分为许多类型: 硝酸盐呼吸、亚硝酸盐呼吸; 硫酸盐呼吸、硫呼吸; 二氧化碳呼吸、延胡索酸呼吸; 铁呼吸、锰呼吸; 呼吸的末端反应无氧呼吸 葡萄糖经糖酵解途径和TCA循环被彻底氧化为CO2,并释放出大量高能 电子而形成NAD(P)H或FADH2; 通过呼吸将NAD(P)H或FADH2重新氧化,使N
37、AD(P)+和FAD2+再生, 维持胞内NAD(P)+/ NAD(P)H和FAD2+/ FADH2平衡;并通过氧化磷 酸化,高效率产生ATP: 由于大量NAD(P)H或FADH2来自于TCA循环,所以呼吸和TCA循环不 可分割;当无最终电子受体时,呼吸停止,TCA也停止,减少NADH 的生成;然后开通溢流代谢,实现NAD+的再生,同时降低产能效率; 呼吸与中心碳分解代谢的关系 一对电子从NADH沿呼吸链传递到O2,共排出32H+,可以形成三个 ATP,即消耗一个氧原子,形成三个高能磷酸键(P/O3); 一对电子从FADH2传递到O2,排出22H+,可以形成两个ATP(P/O 2); 有氧呼吸的
38、产能效率P/O 氧化磷酸化: EMP:2NADH 6 ATP 2丙酮酸2乙酰CoA:2NADH 6 ATP TCA循环:6NADH18 ATP 2FADH24 ATP 底物水平磷酸化; EMP: 2 ATP; TCA循环:2ATP 总计:1分子葡萄糖34ATP4ATP38ATP 葡萄糖有氧呼吸产能的效率 E. coli的硝酸盐呼吸 E. coli是兼性厌氧菌,有氧时,有氧呼 吸; 无氧而有硝酸盐时,硝酸盐呼吸;末端 氧化酶为硝酸盐还原酶,最终电子受体 为硝酸,呼吸产物为亚硝酸; 无氧而无硝酸盐时,只进行混合酸发酵; B. subtilis为好氧菌,兼性无氧呼吸,硝酸盐和亚硝酸盐呼吸,呼吸产 物
39、为氨,称氨化作用(ammonification); B. licheniformis也进行硝酸盐呼吸,呼吸产物为氮;称为脱氮作用 (denitrification); 硝酸盐作为呼吸的电子受体而被还原的反应,也称为异化型硝酸盐还原 反应或者反硝化作用: 反硝化作用降低土壤肥力,用于污水处理; Bacillus. sp.的硝酸盐呼吸 硫酸盐呼吸:以硫酸盐、亚硫酸盐、硫代硫酸盐等氧化态含硫无机物作 为呼吸的最终电子受体,呼吸产物为硫化氢的无氧呼吸,也称为异化型 硫酸盐还原反应; 进行硫酸盐呼吸呼吸的细菌,统称为硫酸盐还原菌(sulfate- reducing bacteria,SRB),也属于脱硫
40、菌; 硫酸盐还原菌是造成腐败水体、物品恶臭的原因之一;可用于废水处理, 去除水中的硫酸; 硫酸盐呼吸: SO42- SO32-;S2O32- ;S;H2S; 硫呼吸: S H2S 硫酸盐呼吸 多数硫酸盐呼吸菌属于变形菌门 -d变形菌纲: 脱硫菌属(Desulfurella) 脱硫弧菌属(Desulfovibrio)脱硫单胞 菌属(Desulfomonas)脱硫杆菌属(Desulfobacter)脱硫球菌属 (Desulfococcus) 脱硫八叠球菌属(Desulfosarcina) 脱硫小杆 菌属(Desulfotalea) 厚壁菌门-梭菌目-消化球菌科(Peptococcaceae): 脱
41、硫肠状菌属(Desulfotomaculum)、脱硫芽孢弯曲菌属 (Desulfosporosinus) 硫酸盐还原菌的主要属 进行延胡索酸呼吸的细菌大多生活在牛的瘤胃中,呼吸产物主要为琥珀 酸;延胡索酸琥珀酸 在分类系统中属于d变形菌纲的琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae) 琥珀酸弧菌属(Succinivibrio) 厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum) 瘤胃杆菌属(Ruminobacter) 琥珀酸单胞菌属(Succinimonas) 延胡索酸呼吸的细菌属 所有产甲烷细菌进行CO2或碳酸盐呼吸,还原产物为甲烷(沼气发酵) 或乙酸;CO2CH4 产甲烷细菌都属于古生菌,在分类系统中归为广古生菌门 (Euryarchaeota phy. nov.) 甲烷杆菌纲(Methanobacteria class. nov.) 甲烷球菌纲(Methanococci class. nov.) 甲烷嗜高热菌纲(Methanopyri class. nov.) 产甲烷菌的CO2呼吸 铁还原菌以三价铁作为呼吸的最终电子受体,呼吸产物为二价铁;假 单胞菌和芽孢杆菌等很多细菌进行兼性铁呼吸菌; 专性铁呼吸菌有铁还原杆菌门(Deferribacteres)以及d变形菌纲的 铁还原单胞菌属(Ferrimomas); 专性铁还原细菌还能以高价锰作为电
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