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1、 生物化学 第一章 一、蛋白质的生理功能 蛋白质是生物体的基本组成成分之一,约占人体固体成分的45%左右。蛋白质在生物体内分布广泛,几乎存在于所有的组织器官中。蛋白质是一切生命活动的物质基础,是各种生命功能的直接执行者,在物质运输与代谢、机体防御、肌肉收缩、信号传递、个体发育、组织生长与修复等方面发挥着不可替代的作用。 二、蛋白质的分子组成特点 1.蛋白质的基本组成单位是氨基酸 编码氨基酸:自然界存在的氨基酸有300余种,构成人体蛋白质的氨基酸只有20种,且具有自己的遗传密码。 2. 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16。 每100mg样品中蛋白质含量(mg%):每克样品含氮质量(mg)6.2
2、5100。 3. 氨基酸的分类 所有的氨基酸均为L型氨基酸(甘氨酸)除外。 根据侧链基团的结构和理化性质,20种氨基酸分为四类。 (1)非极性疏水性氨基酸:甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、苯丙氨酸(Phe)、脯氨酸(Pro)。 (2)极性中性氨基酸:色氨酸(Trp)、丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)、半胱氨酸(Cys)、蛋氨酸(Met)、天冬酰胺(Asn)、谷胺酰胺(gln)、苏氨酸(Thr)。 (3)酸性氨基酸:天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)。 (4)碱性氨基酸:赖氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)、组氨酸(His)。 ?含有
3、硫原子的氨基酸:蛋氨酸(又称为甲硫氨酸)、半胱氨酸(含有由硫原子构成的巯基SH)、胱氨酸(由两个半胱氨酸通过二硫键连接而成)。 ?芳香族氨基酸:色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸。 ?唯一的亚氨基酸:脯氨酸,其存在影响-螺旋的形成。 ?营养必需氨基酸:八种,即异亮氨酸、甲硫氨酸、缬氨酸、亮氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、赖氨酸。可用一句话概括为“一家写两三本书来”,与之谐音。 氨基酸的理化性质 1. 氨基酸的两性解离性质:所有的氨基酸都含有能与质子结合成NH4的氨基;含有能与羟基结合成为COO的羧基,因此,在水溶液中,它具有两性解离的特性。在某一pH环境溶液中,氨基酸解离生成的阳郭子及阴离子的趋势相同,
4、成为兼性离子。此时环境的pH值称为该氨基酸的等电点(pI),氨基酸带有的净电荷为零,在电场中不泳动。pI值的计算如下:pI1/2(pK1 + pK2),(pK1和pK2分别为-羧基和-氨基的解离常数的负对数值)。 2. 氨基酸的紫外吸收性质 (1)吸收波长:280nm (2)结构特点:分子中含有共轭双键 (3)光谱吸收能力:色氨酸酪氨酸苯丙氨酸 (4)呈色反应:氨基酸与茚三酮水合物共加热,生成的蓝紫色化合物在570nm波长处有最大吸收峰;蓝紫色化合物(氨基酸加热分解的氨)(茚三酮的还原产物)(一分子茚三酮)。 肽的相关概念 (1)寡 肽:小于10分子氨基酸组成的肽链。 (2)多 肽:大于10分
5、子氨基酸组成的肽链。 (3)氨基酸残基:肽链中因脱水缩合而基团不全的氨基酸分子。 1 (4)肽 键:连接两个氨基酸分子的酰胺键。 (4)肽单元:参与肽键的6个原子C、C、O、N、H、C位于同一平面,组成肽单元。 21三、蛋白质分子结构特点 见表1-1。 表1-1 蛋白质分子结构的比较 一级结二级结三级结四级结各亚基间整条肽链中所蛋白质主链的局部空指蛋白质分空间排原子在三维空结构中氨基酸的不涉及氨基酸残的排布位侧链构列顺亚基聚表现形螺旋、折叠(结构域、层转角无规卷(锌指结构维系亚基间的)主次级键(疏水用级盐键氢键)二硫次范德华力脯氨酸的存在或者多谷天冬氨酸的存在都 螺旋的形成干扰-1.模 体:蛋
6、白质分子中,由两个以上具有二级结构的肽段在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象并发挥特定的作用。 2.锌指结构:是一个典型的模体,由一个-螺旋和二个反平衡的-折叠的3个肽段组成,具有结合锌离子的功能。 3.分子伴侣:能够可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开,引导肽链正确折叠的存在于细胞内的一类蛋白质,也对蛋白质二硫键正确形成起到重要作用。 四、蛋白质一级结构与空间结构的关系 1.一级结构是空间构象的基础,具有相似一级结构的多肽或蛋白质,其空间构象及功能也相似。 2.分子病:由于蛋白质分子一级结构发生改变,导致其功能改变而产生的疾病。 五、蛋白质空间结构与功能的关系 1.蛋白质空间结构由一
7、级结构决定,其空间结构与功能密切相关。 2.血红蛋白(Hb)由四个亚基组成,两个亚基,两个亚基。记忆要点如下: (1)血红蛋白分子存着紧张态(T)和松弛态(R)两种不同的空间构象。 (2)T型和氧分子亲和力低,R型与氧分子的亲和力强,四个亚基与氧分子结合的能力不一样。 (3)第一个亚基与氧分子结合后,使Hb分子空间构象发生变化,引起后一个亚基与氧分子结合能力加强(正协同效应)。 (4)肌红蛋白分子只有一个亚基,不存在变构效应 3.协同效应:指一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中的另一个亚基与配体的结合能力。促进作用则为正协同效应;反之为负协同效应。 4.变构效应:蛋白质分子的亚基与配体结合
8、后,引起蛋白质的构象发生变化的现象。 5.结构域:大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行使其功能,称为结构域。疯牛病:是由朊病毒蛋白引起的一组人和动物神经退行性病变,具有传染性、遗传性或散在发病的特点。生物体内含有正常的-螺旋形式的PrPc,转变为异常的-折叠形式的PrPSc具有致病性。 六、蛋白质重要的理化性质及相关概念 1.蛋白质的等电点:当蛋白质在某一pH溶液中时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,成为兼性离子,带有的净电荷为零,此时溶液的pH值称为蛋白质的等电点。 2 (1)体内的蛋白质等电点各不相同,大多数接近于pH5.0 (2)碱性蛋白质
9、:鱼精蛋白、组蛋白 酸性蛋白质:胃蛋白酶、丝蛋白 (3)蛋白质处于大于其等电点的pH值溶液中时,蛋白质颗粒带负电荷。反之则带有正电荷。 2.蛋白质胶体溶液稳定的两个因素:水化膜、表面电荷。 3.蛋白质的变性:在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,导致理化性质的改变和生物活性的丧失。 (1)变性的本质:二硫键与非共价键的破坏,不涉及肽键的断裂 (2)变性后特点:生物学活性丧失、溶解度下降、粘度增加、结晶能力消失、易被蛋白酶水解 (3)变性的因素:加热、乙醇、强酸、强碱、重金属离子及生物碱试剂等 (4)蛋白质复性:变性程度较轻,去除变性因素后,仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能 (
10、5)蛋白质的凝固作用:蛋白质经强酸或强碱变性后,仍能溶解于该溶液中。若调节pH值至其等电点时,变性蛋白质呈絮状析出,再加热,形成坚固的凝块。蛋白质的复性:若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性。 4.蛋白质的紫外吸收:含有具有共轭双键的三种芳香族氨基酸,于280nm波长处有特征吸收峰。 5.蛋白质的呈色反应: (1)茚三酮反应:蛋白质水解后可产生游离的氨基酸,原理同前 (2)双缩脲反应:肽键与碱性硫酸铜共热,呈现紫色或红色。氨基酸不出现此反应,当蛋白质不断水解时,氨基酸浓度上升,其双缩脲呈色浓度逐渐下降,因此可以检测蛋白质的水解程度。 七、蛋
11、白质的分离纯化 1.透 析:利用透析袋把大分子蛋白质与小分子化合物分开的方法。 2.超滤法:应用正压或离心力使蛋白质溶液透过有一定截留分子量的超滤膜的方法。 3.丙酮沉淀:0-4低温;丙酮的体积10倍于被沉淀蛋白质;蛋白质沉淀后应迅速分离。 4.盐 析:硫酸铵、硫酸钠或氯化钠等中性盐放入蛋白质溶液中,破坏水化膜并中和表面电荷,导致蛋白质胶体的稳定因素去除而沉淀。 5.免疫沉淀法:利用特异抗体识别相应的抗原蛋白,形成抗原抗体复合物,从蛋白质混合溶液中分离获得抗原蛋白的方法。 6.电 泳:蛋白质在高于或低于其等电点的溶液中,受到电场力的作用向正极或负极泳动。 (1)SDS-PAGE电泳:加入负电荷
12、较多的SDS(十二烷基磺酸钠),导致蛋白质分子间的电荷差异消失,此时蛋白质在电场中的泳动速率只和蛋白质颗粒大小有关,用于蛋白质分子量的测定。 (2)等电聚焦电泳:在电场中形成一个连续而稳定的线性pH梯度,电泳时被分离的蛋白质泳动至其等电点相等的pH值区域时,净电荷为零不再受电场力移动,该法用于根据蛋白质等电点的差异进行分离。 (3)层 析:待分离蛋白质溶液(流动相)经过一个固态物质(固定相)时,根据溶液中待分离的蛋白质颗粒大小、电荷多少及亲和力等,使待分离的蛋白质在两相中反复分配,并以不同速度流经固定相而达到分离蛋白质的目的。 7.阴离子交换层析:负电量小的蛋白质首先被洗脱 8.凝胶过滤:分子
13、量大的蛋白质最先洗脱 9.超速离心:既可分离纯化蛋白质也可测定蛋白质的分子量; 对于球形蛋白质而言,沉降系数S大体上和分子量成正比关系 2/3S(未知)/S(标准)Mr(未知)/Mr(标准) 八、多肽链氨基酸序列分析方法及关键试剂名称 氨基酸序列分析 1.步骤一:分析已纯化蛋白质的氨基酸组成 2.步骤二:测定多肽链的氨基末端与羧基末端为何种氨基酸。以前用二硝基氟苯,现多用丹酰氯 3.步骤三:将肽链水解成片段(表1-2)。 3 表1-2 三种肽链水解方式的比较 胰蛋白酶 胰凝乳蛋白质酶 溴化氢法 甲硫氨酸羧基侧精氨作用芳香族氨基羧基侧酸赖氨酸或的肽键的肽键部位 羧基侧的肽键 4.步骤四:测定各肽
14、段的氨基酸排列顺序,采用Edman降解法,试剂为异硫氰酸苯酯 5.步骤五:统计学分析,组合排列对比,得到完整肽链氨基酸排列顺序 通过核酸来推演蛋白质中的氨基酸序列的步骤: 1.步骤一:分离编码蛋白质的基因 2.步骤二:测定DNA序列 3.步骤三:排列出mRNA序列 4.步骤四:按照三联密码的原则推演出氨基酸的序列 蛋白质空间结构测定 蛋白质二级结构含量测定:圆二色光谱法,测-螺旋较多的蛋白质时,结果较为准确。 蛋白质三维空间结构测定:X射线衍射法和磁共振技术。 第二章 一、核酸的分类、细胞分布、核酸元素组成特点及碱基、核苷、核苷酸的化学结构 1.核酸是生物遗传的物质基础,是一切生物体所含有的最
15、重要的生物大分子之一。天然存在的核酸根据其分子的物质组成不同分为两大类:DNA与RNA。 2.核酸的元素组成:主要由碳、氢、氧、氮、磷组成,磷的含量较为稳定,占核酸总量的9-10%。 3.基本组成:核酸的基本组成是核苷酸。 糖核 苷核 基碱 核酸分子 核苷酸 酸磷 酸磷 二、核苷酸间的连接方式3磷酸基,未形成磷酸二酯键的一端;链中末端为5-或,5-磷酸二酯键;5末端是指在DNARNA3 -OH,未被酯化的一端;或RNA链中末端为3末端是指在DNA 端。5端到3各种简化式书写时都是53,其读向都是从左到右,所表示的碱基序列也都是从 RNA)性质的异同三、两类核酸(DNA与 2-1。详见表 性质的
16、比较RNA2-1 DNA与表中间是遗传信息编码区 DNA OH CCA 至3端为RNA 碱基组成分布 名称 脱氧核糖核苷酸 A、 胞 核 、T、CG 质胞 核糖核苷酸A、U、C、G 16S 小亚基 18S 质 胞 戊糖组成/核苷酸 类型DNA 脱氧核苷酸dATP表2-4 脱氧核糖-D-2- 、dTTPdCTPdGTP RNA其它小分子种类及功能-D-核糖 mRNA、tRNA、rRNAATP、UTP、CTP、 等 GTP 分布部位基本结构 98%2% 反向平行互补双螺旋 在细胞核中在线粒体中 90%分布于胞液 10%分布于细胞核单链无规卷曲 与蛋白质的结合主要与组蛋白结合与核蛋白体结合rRNA4
17、 的稀有碱基含有10-20%稀有碱基 不含有 tRNA 储存遗传信息主要生物学功能 传递及表达遗传信息 分子小,粘度小多元酸、线性高分子、粘度大理化性质 易在机械力作用下断裂2.0 /OD纯品时OD 1.8 280260 -磷酸二酯键 3,5连接键 光波最大吸收值 260nm附近 的高级结构形式的一级结构、二级结构要点及碱基配对规律,了解DNA四、DNA 。详见表2-2 DNA分子结构的比较2-2 表 DNA高级结构 DNA二级结构 DNA一级结构 DNA的双螺旋结构在双螺旋结构的基础上,进一步核苷酸的排列顺序 定义 折叠,在蛋白质的参与下组装成 为的致密结构核小体、核小体卷曲及柱状结构反向、
18、平行、互补、双链 结构特点 碱基的排列顺序 折叠等形成超螺旋形式二酯右手螺旋结构3,5-磷酸 DNA结构的多样性键 磷酸二酯键纵向:碱基的堆积力 稳定性的维系 横向:配对的氢键 RNA 的类型和其它小分子tRNA二级结构特点及rRNAmRNA五、 。rRNA结构特点见表2-3mRNA、tRNA、 。RNA种类及功能见表2-4其它小分子 的比较2-3 三种常见RNA表 rRNA tRNA mRNA RNA RNA 信使RNA 核糖体转运名称 蛋白质合成的直接模板主要功能核蛋白体的组成成分 氨基酸的运载载体 蛋白质合成的场所5% RNA的比例最多,占总RNA的约占总RNA的10%-15% 75%-
19、80% 约占总 链二级结构 状二级结构:三叶草形 花 单 型三级结构:倒L7 DHU至3端分别是5端带有mGpppN帽结构 从 真核原核 结构特点5环,T尾结构 环、反密码子环、3端带有polyA5S 28S、23S、大亚基 5S 能 功 称名 的前体核内不均一 hnRNA RNA 成熟mRNA 核内小RNA 的剪接、转运 snRNA 参与hnRNA 的加工与修饰核仁小RNA snoRNA rRNA 胞质小 scRNA/7SL-RNA RNA 蛋白质内质网定位合成的信号识别体组成成分5 六、DNA(热)变性、复性及分子杂交的概念。 a) DNA变性:在某些理化因素(温度、pH、离子强度)作用下
20、,DNA双链的互补碱基对之间的氢键断裂,使DNA双螺旋结构松散,成为单链的现象。 ? DNA变性只改变其二级结构,不改变核苷酸排列顺序。 ? DNA的增色效应:DNA变性过程中,在紫外区260nm处的OD值增加,并与解链程度有一定比例的关系。 ? DNA解链温度:DNA的变性从开始解链到完全解链,在一个相当窄的温度范围内进行,期间紫外光吸收值达到最大值50%的温度称为解链温度,又称融解温度(Tm)。 ? Tm值高低与其分子所含碱基中的GC含量相关,GC含量越高,Tm值越大。 b) DNA复性:变性DNA在适当条件下,两条互补链可重新配对,恢复天然的双螺旋构象。 ? 退火:热变性的DNA经缓慢冷
21、却后复性的过程。 c) 分子杂交:DNA变性后的复性过程中,如果将不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中,只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系,在适宜的条件下,就可以在不同的分子间形成杂化双链的现象。 七、核酸酶的概念及性质 a) 核酸酶:所有可以水解核酸的酶,根据酶解底物的不同分为DNA酶和RNA酶。 b) 核酸内切酶:可以在DNA或RNA分子内部切断磷酸二酯键的酶。 c) 核酸外切酶:仅能水解位于核酸分子链末端核苷酸的酶。根据其作用的方向性,分为5 3或35核酸外切酶。 d) 核 酶:具有催化功能的RNA分子,底物是核酸,属于序列特异性的核酸内切酶。 e) 催化性D
22、NA:人工合成的具有序列特异性降解RNA功能的寡聚脱氧核苷酸片段。 第三章 一、酶及生物催化剂的基本概念;酶的分子组成及相关概念如酶蛋白、辅助因子(辅酶、辅基)、全酶、酶的活性中心和必需基团等 见表3-1。 表3-1 酶及酶的相关概念 概 念 说 明 酶及核酶两个概念都要提 酶由活细胞合成,对其特异性底物起高效催化作用的蛋白质。是机体内催化各种代谢反应最主要的催化剂。 包括酶及核酶两个概念。核酶是具有高效、 特异催化作用的核酸,生物催化剂是近年来发现的一类新的生物催化剂,主要是参与RNA的剪接。 及。仅具有三级结构的酶 单体酶 寡聚酶 由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶 由几种不同功能
23、的酶彼此聚合形成的多酶复合物多酶体系 丙酮酸脱氢酶复合体 一些多酶体系在进化过程中由于基因的整合,多种不同催化功能多功能酶 嘧啶核苷酸从头合成的酶存在于一条多肽链中仅由肽链构成的酶单纯酶 脲酶、淀粉酶、脂酶等结合酶 由酶蛋白和辅助因子组成的酶 酶蛋白和辅助因子结合形成的复合物称为全酶只有全酶才有催化作用 与酶蛋白结合疏松的辅助因子,可用透析或超滤方法去除辅酶助辅 因子金属离子多为酶的辅基 与酶蛋白结合紧密的辅助因子,不能用透析或超滤方法去除辅基 羧基肽酶、黄嘌呤氧化酶 金属酶金属离子作为辅助因子,且与酶结合紧密,提取过程中不易丢失 金属激活酶 金属离子作为辅助因子,但与酶结合疏松已糖激酶、肌酸
24、激酶 6 酶的必需基团 酶分子中与酶活性密切相关的化学基团 酶的活性中心必需基团组成具有特定空间结构的区域,能与底物结构并将底物 转化为产物的区域,包含结合基团和催化基团 单纯酶与结合酶的活性中心但对单纯酶来说,活性中心就是酶分子在三维结构上比较接近的少数几个氨基酸残基,? 残基通过肽链的盘绕、折叠而在空间构象上相互靠近;活性中心的常见必需基团:His -羧基。残基的巯基及Glu残基的的咪唑基、Ser残基的羟基、Cys 对结合酶来说,辅酶分子或辅酶分子上的某一部分结构往往就是活性中心的组成部分。? 金属离子的作用 作为酶活性中心的催化基团参与催化反应、传递电子;? 作为连接底物与酶的桥梁,便于
25、酶对底物起作用;? 维持酶蛋白构象;? 中和阴离子,降低反应中的静电斥力。? 维生素在酶促反应中的作用 。详见表3-2 常见酶促反应中维生素的作用表3-2 维生素 辅酶形式学名 酶促反应中的作用B 硫胺素1 B核黄素2尼克酸PP TPP FAD、 FMN NADP 、 NAD酮戊二酸脱羧酶及转酮醇酶的辅酶, -丙酮酸脱氢酶多种氧化还原酶及递氢体的酶辅基参与递氢作用 脱氢酶的辅酶 B吡哆醛6B钴胺素 12 泛酸遍多酸磷酸吡哆醛 钴胺素 、辅酶AACP 氨基酸脱羧酶、转氨酶等的辅酶 烷基转移的辅酶多种酰基转移反应的辅酶 生物素H 叶酸 羧化酶辅酶FH 叶酸 4羧化酶的辅酶,参与 各种碳基团转移的活
26、性载体 的固定CO2 抗坏血酸抗坏血酸C 胶原中脯氨酰羟化酶、多巴胺?羟化酶等作用时提供还原物 二、酶促反应的特点与酶促反应机制的学说 酶促反应的特点 酶促反应具有极高的效率:降低反应的活化能,但不改变反应的平衡点。? 酶促反应具有高度的特异性:?生成一种特定的产仅作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应,? 绝对的特异性: 物。如脲酶和琥珀酸脱氢酶。 相对的特异性:作用于一类化合物或一种化学键。如脂肪酶、磷酸酶、蛋白酶等。? 乳酸;延L- 立体异构特异性:仅作用于底物的一种立体异构体,如乳酸脱氢酶催化? 胡索酸酶催化反式丁烯二酸与苹果酸间的裂解。 改变底物浓度进行调节。酶促反应的可调节性:酶
27、量调节; 酶催化效率调节; ? 酶促反应的高效不稳定性:由于酶的本质是蛋白质,易受理化因素的影响。? 酶促反应机制的诱导契合假说酶与底物接近时二者相互诱导、相互形变、相互适应。酶促反应的机制很复杂,在酶的 ?底物在活性中心内底物可发生邻近效应和定向排列,酶对底物可进行酸碱多元催化在, 酶活性中心的疏水性口袋里发生表面效应。 三、影响酶促反应动力学的几种因素及其动力学特点 3-3。影响酶促反应速度的因素见表 7 表3-3 影响酶促反应速度的因素 明说特影响因素 征 呈矩形双曲线V底物浓度 (VmaxS)/(Km+S) 符合米-曼氏方程 在底物浓度足够大的情况下酶浓度 与酶浓度呈正比 V 不是酶的
28、特征性常数有最适pH值,达到最大反应速度 PH值 不是酶的特征性常数有最适温度,达到最大反应速度温度 分不可逆性抑制与可逆性抑制引起酶催化活性下降但不引起酶蛋白变性的物质 抑制剂 使酶从无活性到有活性或使酶活性增加的物质激活剂 大多为金属离子 底物浓度对酶促反应速度的影响 值的含义:为酶促反应速度为最大速度一半时的底物浓度? Km 值是酶的特征性常数之一,只与酶的结构、底物和反应环境有关,与酶的浓度无关? Km值越小,酶与底物的亲和力越大,表示不需要很Km? 值可用来表示酶与底物的亲和力。Km 高的底物浓度就可容易达到最大反应速度。反之亦然。 ? Vmax是酶完全被底物饱和时的反应速度,与酶浓
29、度呈正比 ? Km与Vmax的测定:双倒数作图得到林贝氏方程: 轴的截距在y斜率是Km/Vmax,自变量是1/S,应变量是1/V, )(图是1/Vmax3-1 斜率 图3-1 酶浓度的影响 成正比SE时,酶促反应速度与E? 当 pH值的影响 值,酶催化活性最大,称为最适pH值。? 在某一pH值为值不是酶的特征性常数,大多数接近中性。少数例外(如胃蛋白酶,最适pHpH? 最适 )。1.8;肝精氨酸酶最适pH值为9.8 抑制剂的影响 酶的抑制剂:引起酶催化活性下降但不引起酶蛋白变性的物质。? 两种抑制性作用的比较表3-4 可逆性抑制 不可逆性抑制 非共价键结合方式 共价键 E S抑制剂的作用部位
30、、ES、 活性中心上的必需基团 如有机磷农药:丝氨酸上的羟基 重金属离子和砷化合物:巯基 可以否 能否通过透析或超滤去除 举例 有机磷农药、重金属离子 磺胺类等 3-5。? 三种可逆性抑制的比较,详见表 反竞争性抑制非竞争性抑制作用特征 无抑制剂 竞争性抑制 ES EE 、ES 与I结合的组分 减小增大Km动力学表观 Km 不变 参数 减小 减小不变Vmax Vmax 表 增大 不变增大Km斜率-林贝 /Vmax 氏作图 不变 增大减小 Km-1/ X轴截距 增大1/Vmax Y轴截距增大 不变8 3-5 三种可逆性抑制作用的比较 激活剂的影响 激活剂:使酶从无活性到有活性或使活性增加的物质。
31、? +2+Mg大多数为金属离子,如? ;有机化合物:如胆汁酸盐。、K2+Mg必需激活剂:为酶促反应所必需,否则检测不到酶的活性。例? 于已糖激酶。-Cl非必需激活剂:激活剂不存在时,仍能检测到一定的活性,例? 于唾液淀粉酶。 四、酶原与酶原的激活 酶 原:无活性酶的前体。例消化酶原、凝血酶原等。? ? 酶原的激活:酶原向酶的转化过程。实质是酶活性中心的形成或暴露过程。生理意义:保护自身不被酶破坏;保证酶在特定的部位与环境发挥作用;酶的贮存形? 式。 五、酶的快速调节与慢速调节的方式 快速调节包括变构调节与共价修饰调节变构酶:指效应剂与酶的非催化部位可逆的结合,使酶发生构象的变化而影响酶的活性,
32、其? 作用特点如下: 反应的方程曲线为S型曲线,非米氏方程的矩形双曲线。1. 2. 变构酶多为代谢途径的关键酶,催化的常为不可逆反应。 变构酶常由多个亚基组成,彼此间具有协同效应。3. 变构酶有催化部位和调节部位(而不是都具有催化亚基和调节亚基)。4. 变构调节是快速调节。5. 共价修饰:酶蛋白上的一些基团与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性。? 常见的共价修饰包括:磷酸化与去磷酸化、乙酰化与去乙酰化、甲基化与去甲基化、腺 6. 的互变等。与SSSH苷化与去腺苷化和 7.磷酸化与去磷酸化最为常见。 8. 共价修饰是快速调节。 ? 酶含量的调节:通过改变酶合成或降解以调节细胞内酶的
33、含量,属于慢速调节。 同工酶概念及应用同工酶:是指催化的化学反应相同,酶蛋白的分子结构、理化性质及至免疫学性质不同的一? 翻译的不组酶。由不同基因或等位基因编码的多肽链,或由同一基因转录生成的不同mRNA 同多肽链组成的蛋白质。 升高LDH19. 乳酸脱氢酶有五种类型,其中型在心肌细胞中最多;肝病时LDH5MM(CK3(BB(型);心肌含CK2MB型);骨骼肌含CK1CK 10.肌酸激酶()有三型:脑中含 型) 六、酶的命名与分类原则酶均有两个名称,系统名称应标明酶的所有底物与反应性质。推荐名称是从习惯名称中挑选而来,可分为六类:氧化还原酶类;转移酶类;水解酶类;裂合酶类;异构酶 合成酶类。
34、类; 七、酶在医学中的应用酶与疾病的关系密切。遗传性因素和许多疾病均可引起酶的质与量的异常以及活性的改9 变,并引发多种疾病。检验血液中酶活性的改变可以帮助诊断某些疾病。许多药物可通过改变人体或致病菌中酶的活性从而达到治疗目的。此外,酶还可以作为工具用于临床检验和科学研究。 第四章 一、 糖的主要生理功能 ? 提供能量是糖最主要的生理功能。 ? 糖还是机体重要的碳源,糖代谢的中间产物可转变成其他的含碳化合物。 ? 糖也是组成人体组织结构的重要成分,例糖蛋白、糖脂。 ? 糖的磷酸衍生物形成生物活性物质,例NAD、FAD、DNA、RNA、ATP等。 二、 糖无氧氧化的基本反应过程、能量生成、关键酶
35、调节及生理意义 糖的无氧氧化:又称糖酵解,葡萄糖在缺氧或供氧不足情况下,生成乳酸的过程。 ? 基本反应过程:分为两个反应阶段,全程在胞浆中进行 第一阶段:糖酵解途径,由一分子葡萄糖分解分成两分子丙酮酸的过程 记忆要点:反应的“一、二、三”。 一次脱氢:3-磷酸甘油醛1,3-二磷酸甘油酸 + NADH+H的氧化过程。 二次底物水平磷酸化过程:各生成1分子ATP 1,3-二磷酸甘油酸3-磷酸甘油酸 + ATP 磷酸烯醇式丙酮酸丙酮酸 + ATP 二次ATP消耗的反应: 葡萄糖 + ATP 6-磷酸葡萄糖 6-磷酸果糖 + ATP 1,6-二磷酸果糖 二个磷酸丙糖的生成:1,6-二磷酸果糖裂解为磷酸
36、二羟丙酮和3-磷酸甘油醛 二个ATP的净生成:2(底物水平磷酸化)2(磷酸丙糖)2(ATP消耗) 三次不可逆性反应,三个关键酶的参与 已糖激酶 催化 葡萄糖 6-磷酸葡萄糖 6-磷酸果糖激酶-1 催化 6-磷酸果糖 1,6-二磷酸果糖 丙酮酸激酶 催化 磷酸烯醇式丙酮酸 丙酮酸 第二阶段:丙酮酸还原生成乳酸,所需的氢原子由前述一次脱氢过程提供,反应由乳+酸脱氢酶催化,辅酶是NAD。 ? 糖酵解的调节:主要在三个关键酶上的调节(见表4-1)。 表4-1 糖酵解关键酶的调节 激活剂 抑制剂 附 注 ? -1 6-磷酸果糖激酶1,6-二磷酸果糖是该酶的正AMP、ADP ATP、柠檬酸 反馈激活剂1,
37、6-二磷酸果糖 ? 2,6-二磷酸果糖是该酶最强 2,6-二磷酸果糖的变构激活剂 丙酮酸激酶 1,6-二磷酸果糖 ATP、丙氨酸 6-磷酸葡萄糖已糖激酶 有四种同工酶,肝细胞中的长链脂酰CoA 型,称为葡萄糖激酶 ? 糖酵解的生理意义 ? 迅速提供能量,对肌收缩更为重要。 ? 成熟红细胞的供能。 ? 神经组织、白细胞、骨髓等代谢活跃的组织,即使不缺氧也多由糖酵解提供能量。 三、 糖有氧氧化的基本反应过程、能量生成、关键酶调节及生理意义 糖有氧氧化的定义:葡萄糖在有氧条件下彻底氧化生成水和二氧化碳的过程。 01 基本反应过程:分为三个反应阶段 ? 第一阶段:糖酵解途径生成丙酮酸,同前述糖酵解过程
38、 ? 第二阶段:丙酮酸进入线粒体后,氧化脱羧生成乙酰CoA ? 总反应式为:丙酮酸 + NAD+ 辅酶A 乙酰CoA + NADH+H + CO 2? 反应不可逆,由丙酮酸脱氢酶复合体催化 ? 参与反应的辅酶有:硫胺素焦磷酸酯(TPP)、硫辛酸、FAD、NAD、CoA ? 第三阶段:三羧酸循环及氧化磷酸化,生成大量的ATP和水 记忆要点:反应有“一、二、三、四”。 一次底物水平磷酸化反应 ? 琥珀酰CoA 琥珀酸 + GTP 二次脱羧基反应(同时伴随有脱氢反应) ? 异柠檬酸 -酮戊二酸 + CO + NADH+H 2? -酮戊二酸 琥珀酰CoA + CO + NADH+H 2 三次关键酶的催
39、化 ? 柠檬酸合成酶 催化 草酰乙酸 + 乙酰CoA 柠檬酸 ? 异柠檬酸脱氢酶 催化 异柠檬酸 -酮戊二酸 + CO + NADH+H 2? -酮戊二酸脱氢酶 催化 -酮戊二酸 琥珀酰CoA + CO + NADH+H 2 四次脱氢反应 ? 异柠檬酸 -酮戊二酸 + CO + NADH+H 2? -酮戊二酸 琥珀酰CoA + CO + NADH+H 2? 琥珀酸 延胡索酸 + FADH 2? 苹果酸 草酰乙酸 + NADH+H 糖有氧氧化的调节 见表4-2。 表4-2 糖有氧氧化的调节 激活剂 抑制剂 附 注 ATP 变构调节丙酮酸脱氢酶复合体 + AMP 共价修饰 乙酰CoA、NADH+H
40、 - - 非关键酶 柠檬酸合成酶 主要调节点、反馈抑制 ADP ATP异柠檬酸脱氢酶 、NADH 2+ATPCa、NADP、 酮戊二酸脱氢酶- 琥珀酰CoA 反馈抑制 巴斯德效应:糖的有氧氧化抑制糖酵解的现象。 三羧酸循环的意义 ? 氧化供能。 ? 三大营养素彻底氧化分解的最终代谢通路。 ? 是三大营养物质互变的枢纽。 ? 可为其他合成代谢提供小分子的前体CoA。 有氧氧化生成的ATP 表4-3 糖有氧氧化生成ATP的详细部位说明 反 应 辅 酶 ATP -1 葡萄糖葡萄糖 6-P-1 6-P-果糖 1,6-双磷酸果糖 *2 or 3 3-第一阶段 磷酸甘油醛 1,3-二磷酸甘油酸NAD 2
41、2底物水平个磷酸甘油酸二磷酸甘油酸1,3- 3- 2 1 拷 丙酮酸 磷酸烯醇式丙酮酸 底物水平1 2 11 2 3 NAD 乙酰CoA 第二阶段 贝丙酮酸 分2 异柠檬酸 -酮戊二酸 3 NAD 子2 CoA 3 NAD酮戊二酸- 琥珀酰 琥珀酰CoA 琥珀酸 第三阶段1 2 底物水平2 延胡索酸琥珀酸 FAD 2 2 苹果酸 NAD 3 延胡索酸 36 or 38 净生成,若经磷酸甘油穿个ATPNADH+H如果经苹果酸穿梭机制,可以产生3糖酵解过程中产生的* ATP分子。梭机制,则产生2个 磷酸戊糖途径反应过程及生理意义四、 磷酸戊糖途径的反应过程:在胞浆中进行,分为两个阶段NADPH+H
42、 第一阶段是氧化反应,生成磷酸戊糖、? 及CO2 6-P-果糖 第二阶段是基团转移反应,生成3-P-甘油醛和? + 6NADP6-P-葡萄糖总反应式:3? + 6NADPH+H+ 3CO果糖 + 3-P-甘油醛26-P-2 磷酸戊糖途径的生理意义 为核酸的生物合成提供核糖。? 作为供氢体参与多种代谢反应。 提供NADPH? 是体内许多合成代谢的供氢体。 NADPH 参与体内羟化反应。 NADPH 还用于维持谷胱甘肽的还原状态。 NADPH 糖原合成及分解的基本反应过程、部位、关键酶调节及生理意义。五、 。糖原合成与糖原分解见表4-4 糖原合成与糖原分解的比较表4-4 糖原合成 糖原分解 部 位
43、有活性的 关键酶无活性的 作用部位肝脏、肌肉 糖原合酶a( 糖原合酶b(磷酸化形式)-1,4-糖苷键、) 去磷酸化形式 糖苷键-1,6- 肝脏、肌肉 a(磷酸化形式)磷酸化酶b(去磷酸化形式)磷酸化酶 能量消耗增加一个糖分子,消耗ATP 2个不需要 生理作用 能量的储备维持血糖(肝) 酵解供能(肌肉) 糖异生概念、反应过程、关键酶调节及生理意义六、 糖异生概念:从非糖化合物(乳酸、甘油、生糖氨基酸)转变为葡萄糖或糖原的过程。 的异生糖能力 进行糖异生的主要器官是肝脏,肾脏具有肝脏1/10? 。糖异生的过程:记忆要点:反应有“一、二、三” 一次反应 草酰乙酸 ATP一次的消耗:丙酮酸 + CO
44、+ ATP 2 磷酸烯醇式丙酮酸+ GTP的消耗:草酰乙酸GTP 一次 二种转运草酰乙酸的途径 苹果酸穿梭机制:丙酮酸或生成丙氨酸的生糖氨基酸为原料异生糖时。? 谷草转氨酶生成天冬氨酸机制:以乳酸为原料异生为糖时。? 三次能障的绕行 磷酸烯醇式丙酮酸 草酰乙酸 丙酮酸? 催化)果糖(果糖二磷酸酶-1 6-P-1,6- 二-磷酸果糖 ? -6-磷酸酶催化)葡萄糖(葡萄糖葡萄糖 ?6-P- 21 糖异生的调节 ? 糖异生途径与糖酵解途径是方向相反的两条代谢途径。 ? 通过3个底物循环进行有效调节。 糖异生的生理意义 ? 维持血糖浓度恒定。 ? 补充肝糖原。 ? 调节酸碱平衡。 乳酸循环(Cori循
45、环) ? 概念:肌收缩(尤其氧供应不足时)通过糖酵解生成乳酸。乳酸通过细胞膜弥散进入血液后入肝,在肝内异生为葡萄糖。葡萄糖释入血液后又被肌摄取。如此形成的循环。 ? 形成原因:肝内糖异生活跃,且有葡萄糖6磷酸酶水解6磷酸葡萄糖释放葡萄糖; 肌肉糖异生活性低,且无葡萄糖6磷酸酶。 ? 生理意义:避免损失乳酸。 防止乳酸堆积引起酸中毒。 糖的三条分解代谢途径的比较见表4-5。 表4-5 三种糖分解代谢的比较 糖酵解 有氧氧化 磷酸戊糖途径 缺氧反应条件 胞液 部位 有氧 胞液、线粒体 胞液 已糖激酶、关键酶 6-P-果糖激酶1、丙酮酸脱氢酶复合体、柠檬6-P-葡萄糖脱氢酶丙酮酸激酶 酸合酶、异柠檬
46、酸脱氢酶、-酮戊二酸脱氢酶复合体 乳酸 CO和水 磷酸核糖、NADPH 产物 2能量生成 生理意义 个净生成36或38ATP 净生成2个ATP 没有ATP生成 迅速提供能量成熟红氧化供能三大营养素彻为核酸合成提供核糖细胞的供能某些代谢活跃的组织供能底氧化分解的最终代谢通路 三大营养物质互变的枢纽提供合成代谢反应的还原 当量 七、 血糖正常值、血糖来源与去路。激素对血糖浓度的调节 ? 血液正常值: 3.896.1mmol/L。 ? 血糖来源有三:食物消化吸收 肝糖原分解 糖异生 ? 血糖去路有四:无氧酵解 有氧氧化 磷酸戊糖途径 转化为脂肪、氨基酸 第五章 八、 什么是脂类,包括哪些物质 脂类:
47、脂肪及类脂的总称 ? 脂肪:甘油三酯或称三脂肪酸甘油酯。 ? 类脂:固醇及其酯、磷脂及糖脂,细胞的膜结构重要组分。 脂肪酸的来源有二 ? 来源一是自身合成如饱和脂肪酸及单不饱和脂肪酸。 ? 来源二由代谢物供给如必需脂肪酸,某些多不饱和脂肪酸。 九、 甘油三酯合成的两种途径和甘油的分解代谢 甘油三酯合成的两种途径 ? 原料:所需的甘油及脂肪酸主要由葡萄糖代谢提供,亦可通过食物供给。 ? 甘油一酯途径:小肠粘膜细胞,初始底物为2-甘油一酯,1,2-甘油二酯为中间产物。 ? 甘油二酯途径:肝细胞及脂肪细胞,初始底物为3-P-甘油,磷脂酸和1,2-甘油二酯为中间产物。 甘油的分解代谢 1 甘油 + A
48、TP 3-P甘油 (胞液中) 31 (胞液中)+ NADH+H 磷酸二羟丙酮(3-P甘油醛)2 3-P甘油 (胞液中)+ NADH+H 1,3-二磷酸甘油酸 33-P甘油醛 (胞液中)+ ATP 3-磷酸甘油酸 4 1,3-二磷酸甘油酸 (胞液中)+ ATP 丙酮酸 5 磷酸烯醇式丙酮酸 (线粒体)15 ATP 6 丙酮酸个(在胞液中的两次脱下2220个或由上可知,一分子甘油彻底氧化分解产生的ATP分子数为 ATP分子)2经不同的转运途径运输入线粒体中分别产生个或3个的NADH+H 脂肪动员的概念及特点十、脂肪动员:储存在脂肪细胞中的脂肪,被脂肪酶逐步水解为游离脂酸及甘油并释放入血供其它组织氧
49、化 利用的过程。 HSL,也是脂肪分解的限速酶关键酶:激素敏感性甘油三酯脂肪酶TSH ACTH、? 激活:脂解激素如肾上腺素、胰高血糖素、 E、烟酸? 抑制:胰岛素、前列腺素2 脂肪酸氧化过程的特点十一、 脂肪酸氧化的过程:三个步骤 CoA合成酶催化第一步:脂酸的活化,生成脂酰CoA,胞液中进行,脂酰? CoA + PPi 脂酰辅酶A 脂肪酸+ ATP + 肉碱脂酰转位酶(内、肉碱-依赖肉碱脂酰转移酶I(外膜上) 第二步:脂酰CoA进入线粒体 ? 是限速酶。II(内膜上)三种酶作用转运。肉碱脂酰转移酶I膜上)、肉碱脂酰转移酶 每一次氧化需要四个反应依次连续进行 第三步:脂酸的氧化 ? FADH
50、脱 氢:生成1 2 水: 加 2 NADH+H 再脱氢:生成3 为碳原子个数)(n解:生成一分子乙酰CoA和脂酰(n-2)CoA,4 硫 碳的软脂酸为例脂酸氧化的能量生成:以16 ATP分子个,脂酸活化时相当于消耗两个ATP,净产生129? 产生的总能量是131ATP 2n个碳原子的脂肪酸彻底氧化分解时可产生? 含有+ NADH+H分子分子、n-1个个n个乙酰CoA分子、n-1FADH2ATP 个ATP,净产生17n-7 + 3)(n-1)17n-5个故总产生12n + 2(n-1ATP 个14碳软脂酸分解,最终净产生114? 例 酮体生成过程的特点十二、 羟丁酸及丙酮酮体:乙酰乙酸、-+ +
51、 NAD-羟丁酸? 乙酰乙酸 + NADH+H 酮体代谢的特点:肝内生酮肝外用。 HMG CoA合成酶是合成的限速酶。? 肝内生酮:肝细胞内有生成酮体的酶, 注:肾脏也可以少量生成酮体。 肝外用酮:? 转硫酶(心、肾、脑、骨骼肌) 琥珀酰CoA1. 硫解酶(心、肾、脑、骨骼肌)乙酰乙酰CoA2. 乙酰乙酰硫激酶(心、肾、脑)3. 酮体生成的意义 为肝外组织(脑、肌组织)提供能源。? 脑组织在糖供应不足时,利用酮体供能。? 0.03-0.5 mmol/L。? 正常情况下,血中酮体为 酮体生成的调节 酮体生成增加:饥饿时,胰高血糖素增多,脂肪动员加强。? 41 ? 酮体生成减少:饱食后,胰岛素分泌
52、增多,脂肪动员减弱。 ? 丙二酯CoA抑制脂酰CoA进入线粒体,减少酮体生成。 十三、 脂酸的合成代谢 合成部位:肝、肾、脑、肺、乳腺及脂肪组织的胞液中。 合成原料:由糖代谢而来的乙酰CoA。 合成的过程:两大步骤 2+? 第一步:丙二酰CoA的合成,乙酰CoA羧化酶催化,生物素为辅基,Mn为激活剂 -乙酰CoA + ATP + HCO 丙二酰CoA 3? 第二步:脂酸合成,由7种酶蛋白的多酶体系(原核)或多功能酶(真核)催化 乙酰CoA + 7丙二酰CoA + 14NADPH+H 软脂酸(n16) 脂酸碳链的延长 ? 内质网脂酸碳链延长酶体系:主要方式,以丙二酰CoA为二碳供体。 ? 线粒体
53、酶体系:生成硬脂酸为主,乙酰CoA为二碳供体。 脂酸分解与脂酸合成的比较 脂酸分解与脂酸合成的比较见表5-1。 表5-1 脂酸分解与脂酸合成的比较 脂酸的分解(-氧化) 脂酸的合成 合成部位 脑组织外的所有组织,先胞肝、肾、脑、肺、乳腺及脂肪组织的胞液中主要代谢原料液,后线粒体 脂肪酸乙酰CoA 第一步:脂肪酸的跨膜运输主要代谢过程 第一步:丙二酰CoA的合成 第二步:脂肪酸的氧化 第二步:脂酸合成 肉碱脂酰关键酶 FAD所需的还原当量 CoA转移酶I 乙酰CoANADPH 、NAD羧化酶 丙二酸单酰CoA(第六版教材中称丙二酰 乙酰CoA 重要的中间产物CO 作为参加者2酰基载体 不是 是 ACP CoA Co 十四、 几种多不饱和脂酸及重要衍生物 ? 不饱和脂酸包括油酸、软油酸、亚油酸、亚麻酸和花生四烯酸。 ? 油酸、软油酸机体可以自身合成;
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