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文档简介
1、会计学1DNA的结构与功能的结构与功能2 元素组成C、H、O、N、P(恒定,9-10%)DNA约为9.9%,RNA约为9.4% 。 化学组成 基本结构单位核苷酸 核苷酸核苷/脱氧核苷磷酸核 酸戊糖碱基A、G、C、T(DNA)A、G、C、U(RNA)第1页/共37页3第2页/共37页4腺嘌呤脱氧核苷酸(dAMP )Deoxyadenosine monophosphate(DNA)磷酸脱氧核糖碱基糖苷键腺嘌呤核苷酸(AMP)Adenosine monophosphate(RNA)核糖第3页/共37页51. DNA的一级结构 DNA分子中各脱氧核苷酸之间的连接方式(3 -5 磷酸二酯键)和排列顺序叫
2、做DNA的一级结构,简称为碱基序列。 一级结构的走向规定为5 3 。5 3 第4页/共37页65 3 结构式结构式5 3 p p p pOH3 ACTG1 线条式线条式5 ACTGCATAGCTCGA 3 字母式字母式第5页/共37页7第6页/共37页81953沃森和克里克根据DNA纤维X射线晶体衍射图,提出了DNA分子结构的双螺旋模型。Francis Crick and James Watson (获1962年诺贝尔生理学医学奖)第7页/共37页9 两条链反向平行,围绕同一中心轴构成右手双螺旋。 相临碱基对间距离为0.34nm,每周螺距为3.4nm (10bp), d为 2nm。 双螺旋有两
3、种不同的沟(大沟和小沟)。大沟携带分子可识别信息,是蛋白质识别DNA碱基序列产生相互作用的基础。第8页/共37页10Maurice Hugh Frederick WilkinsRosalind Franklin第9页/共37页11Chargaff 在1950年总结出DNA碱基组成的规律: 腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等,即A=T 。 鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔数也相等,即G=C 。 嘌呤的总数等于嘧啶的总数,即A+G=T+C。 含氨基的碱基总数等于含酮基碱基总数,即A+C=G+T。第10页/共37页121. 碱基对间的氢键 2. 碱基堆积力 (1)相邻碱基对间的范德华力(2)碱基对间的疏水作用力3.
4、磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和,降低静电张力第11页/共37页13A-DNA 20 0.26 2.6 11 右B-DNA 6 0.34 2.0 10 右Z-DNA 7 0.37 1.8 12 左双螺旋 碱基倾角/(。) 碱基间距/nm 螺旋直径/nm 每轮碱基数 螺旋方向第12页/共37页14 单核苷酸形成的二级结构十字形结构十字形结构第13页/共37页15DNA三股螺旋结构(H-DNA)DNA三条链均为同型嘌呤或同型嘧啶,即整段的碱基均为嘌呤或嘧啶,其中两条链为正常双螺旋,第三条链位于双螺旋的大沟中。第三股链的存在可能使一些调控蛋白或RNA聚合酶等反式作用因子得以与该区段结合,因而阻
5、遏了有关基因的表达。第14页/共37页16第15页/共37页17DNA在细胞内以双螺旋为基础进一步旋转折叠成超螺旋结构。超螺旋正超螺旋负超螺旋盘绕方向与DNA双螺旋方向相同盘绕方向与DNA双螺旋方向相反 DNA超螺旋结构第16页/共37页18DNA超螺旋是由DNA拓扑异构酶(拓扑异构酶)产生的。环状DNA分子常以超螺旋结构存在,并以负超螺旋为主,有利于转录的起始。第17页/共37页19 真核生物DNA与蛋白质形成非常致密的复合物存在于细胞核内,基本结构式核小体。核小体DNA组蛋白H2A、H2B、H3、H4:八聚体核心组蛋白H1:连接区组组蛋蛋白白与与DNA的的结结合合第18页/共37页20第1
6、9页/共37页核小体链(核小体链( 11nm,每个核小体每个核小体200bp)纤丝(纤丝( 30nm,每圈每圈6个核小体)个核小体)突环(突环( 150nm,每个突环大约每个突环大约75000bp)玫瑰花结(玫瑰花结( 300nm ,6个突环)个突环)螺旋圈(螺旋圈( 700nm,每圈每圈30个玫瑰花)个玫瑰花)染色体(染色体( 1400nm,每个染色体含每个染色体含10个玫个玫瑰花瑰花200bp)-人的染色体压缩人的染色体压缩8000-10000DNA (2nm)第20页/共37页22 一般理化性质 核酸是两性电解质(磷酸和氨基),可发生两性解离。又由于磷酸具有较强的酸性,所以核酸的等电点较
7、低。DNA的等电点为44.5,RNA的为22.5; DNA为白色纤维状固体,微溶于水,不溶于有机溶剂:用乙醇沉淀核酸; DNA是线性高分子,粘度极大; 在中性或偏碱性缓冲液中,核酸带负电荷,在电场中向阳极移动; 在引力场中可下沉:超速离心法提取和纯化核酸。第21页/共37页23 强烈的紫外吸收由于核酸中碱基的共轭双键,所以对紫外有强烈吸收,最大吸收峰在260nm附近,常作为核酸的定性,定量分析。2202402602800.10.20.30.4波长(波长(nmnm)光吸收光吸收123核苷酸总吸收值核苷酸总吸收值变性变性DNA天然天然DNA第22页/共37页241.DNA或RNA的定量 若OD26
8、0=1.0相当于: 50 g/ml双链DNA 40 g/ml单链DNA(或RNA) 20 g/ml寡核苷酸2. 判断核算样品的纯度 DNA纯品:A260/A280=1.8 RNA纯品:A260/A280=2.0第23页/共37页25 DNA的变性 定义:某些理化因素会导致DNA双链互补碱基之间的氢键发生断裂,使双链DNA解离为单链。只改变DNA的二级结构,不改变它的核苷酸序列。 变性因素:过量酸、碱,加热,离子强度改变等。 变性后理化性质的主要改变: 粘度下降 比旋光度下降 OD260增色(增色效应)第24页/共37页26DNA变性的本质是双链间氢键的断裂第25页/共37页27 DNA的增色效
9、应 DNA变性时其溶液OD260值增高第26页/共37页28 解链曲线(melting curve) 解链温度(溶解温度,Tm)在解链过程中,UV吸收值的变化达到最大变化值一半时对应的温度,此温度时,50%DNA双链打开。 Tm值与DNA均一性和长短、碱基GC含量、溶液离子强度、相关,GC含量越高,Tm值越高。第27页/共37页29 Tm值的计算及应用 Tm=69.3+0.41 (G+C)/(G+C+A+T) 100% 小于20bp的寡核苷酸片段 Tm=4(G+C)+2(A+T)PCR退火温度比Tm值低46第28页/共37页30 DNA的复性 定义:DNA回复成双链结构,称为复性。 影响复性的
10、因素: 样品的性质、DNA片段的大小、DNA浓度、温度、离子强度等。 复性后理化性质的改变: 粘度增大;比旋光度变大; OD260下降(低色效应)第29页/共37页31热变性经冷却后即可复性,称为退火。高于Tm值5 复性 也称退火 缓缓慢慢冷冷却却迅迅速速冷冷却却第30页/共37页32 DNA是主要的遗传物质,决定细胞和个体的遗传型。 DNA是遗传物质的证据:(1)间接证据(2)直接证据第31页/共37页331. DNA通常只在核中的染色体上找到。2. 同一种生物的DNA 含量基本上是相同的,而配子的含量正好是体细胞的一半。3 . 同一种生物的各种细胞中,DNA在量上恒定,在质上也恒定。4 . 各类生物中,能改变DNA结构的化学物质都可引起突变。 DNA是遗传物质的间接证据第32页/共37页34第33页
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