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文档简介
1、DNAMAN的使用简介（V7.0） 主讲人：孟旭主讲人：孟旭 2015.03.31DNAMAN定义：、 DNAMAN 是一种常用的核酸序列分析软件，由美国 Lynnon Biosoft 公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件,可以用于多重序列比对、PCR 引物设计、限制性酶切分析、质粒绘图、序列同源性分析等，已成为一种普遍使用的DNA 序列分析工具。DNAMAN 功能简介： 将待分析序列装入Channal 以不同形式显示序列 DNA序列的限制性酶切位点分析 DNA序列对比分析 序列同源性分析 PCR引物设计 画质粒图谱一、以不同形式显示序列一、以不同形式显示序列以不同形式显示序列以不同形式显
2、示序列二、二、DNA序列的限制性酶切位点分析序列的限制性酶切位点分析三、序列同源性分析三、序列同源性分析序列同源性分析序列同源性分析四、画质粒图谱四、画质粒图谱核酸序列分析1、 核酸序列的检索核酸序列的检索 :80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 2、核酸序列的同源性分析、核酸序列的同源性分析 2.1 基于基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分软件的核酸序列同源性分析析 /blast/blast.cgi 2.2 核酸序列的两两比较核酸序列的两两比较 h
3、ttp://gorf/bl2.html 3、 cDNA的基因组序列分析的基因组序列分析 3.1 通过从通过从NCBI查询全部基因组数据库进行基因查询全部基因组数据库进行基因组序列的分析组序列的分析 /genome/seq/page.cgi?F=HsBlast.html&ORG=Hs 3.2 通过从通过从Sanger Centre查询基因组数据库进行查询基因组数据库进行基因组序列的分析基因组序列的分析 http:/www.sanger.ac.uk/HGP/blast_server.shtml 4、核酸序列的开放阅读框架分析、核酸序列的开放阅读框架分析 基于基于NCBI/ORF finder的的ORF分析分析 /gorf/gorf.html5、 基因组序列的初步分析基因组序列的初步分析 5.1基因组序列的内含子基因组序列的内含子/外显子分析外显子分析 /urllists/genefind.htm 5.2 基因组序列的启动子分析基因组序列
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