分子生物学之名称解释

1、分子生物学：分子生物学是从分子水平研究生命本质为目的的一门新兴学科，它以核酸和蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信息和细胞信息传递中的作用为研究对象，是当前生命科学中发展最快并正与其它学科广泛交叉与渗透的重要前沿领域。报告基因（reporter genes）：特指其编码产物能被快速检测，常用来判断外源基因是否已经成功导入寄主细胞、器官或组织的一类特殊的基因。复杂大分子：一种以上的大分子以共价或非共价键相结合。核蛋白：核酸和蛋白质的结合体（端粒酶、核糖核酸酶P）。糖蛋白：糖和蛋白质的结合体，是细胞膜的重要组分，并介导细胞与细胞间的识别。糖脂：糖和脂以共价键相结合，在脑细胞和神经细胞的膜中含量特别

2、丰富。顺反子（cistron，又叫作用子）是由互补测验定义的遗传功能单位，是一个基因功能不可分割的单位。突变子（muton）是基因突变时，产生突变的最小单位。一个突变子可以小到只是一个核苷酸对。重组子（recon）是基因重组时，可交换的最小单位。交换有时也只有一个核苷酸对。中心法则：指遗传信息的这种由DNARNA蛋白质表达方式。基因：能够表达出一个有功能的多肽链或功能RNA分子的核酸序列。基因家族：一组功能相似且核苷酸序列具有同源性的基因。它们可以串联排在一起，形成基因簇；也可以位于不同的染色体上。结构基因（structural gene）：指可编码RNA或蛋白质的一段DNA序列。调控基因（r

3、egulator gene）：指参与其他基因表达调控的RNA和蛋白质的编码基因。 重叠基因（overlapping gene）：指在同一段DNA顺序上，由于阅读框架不同或终止早晚不同，同时编码两个以上基因的现象。隔裂基因（split gene）：指一个基因内部被一个或更多不翻译的编码顺序即内含子所隔裂。跳跃基因（jumping gene）：即转座因子，指染色体组上可以转移的基因。内含子：在DNA序列中，不出现在成熟mRNA中的片段。外显子：在DNA序列中，出现在成熟mRNA中的片段。 假基因（pseudogene）：同已知的基因相似，处于不同的位点，因缺失或突变而不能转录或翻译，是没有功能的基

4、因。基因表达：就是将基因携带的生物信息释放出来，供细胞利用的过程，或将生物的遗传信息作为性状或特征表现出来的过程。 RNA基因：编码RNA分子的DNA序列。核苷酸（nucleotide）：由一个或多个磷酸分子与核苷共价结合而成。DNA的一级结构：指由数量很多的4种基本核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连接的直线或环形分子。正超螺旋：DNA旋转的方向与双螺旋方向相同。具正超螺旋的DNA处于过旋状态。（左手超螺旋）负超螺旋：DNA旋转的方向与双螺旋方向相反。具负超螺旋的DNA处于欠旋状态。（右手超螺旋）连接数 Lk（Linking number）：DNA分子两条链间交叉的数目。盘绕数 Tw （Twist

5、ing number）：双螺旋本身的螺旋数。扭曲数（超螺旋数） Wr（Writhing number）：围绕超螺旋轴扭曲的圈数。连接数=盘绕数+扭曲数；Lk= Tw+ Wr拓扑异构体：具有相同连接数但空间结构相异的双链DNA分子。拓扑异构酶：能调控DNA分子超螺旋水平的酶。拓扑异构酶I：在一条链的磷酸骨架上产生断裂，每次断裂使Lk变化1，一条链穿过缺口。利用水解磷酸二酯键提供能量，不需要额外的能量。拓扑异构酶II：在2条链的磷酸骨架上都产生断裂，每次断裂使Lk变化2。反应由ATP提供能量，2条链穿过缺口。核小体：染色质的基本结构单位，在真核生物细胞内，DNA三级结构与组蛋白八聚体共同组成核小体

6、。回文序列：相邻反向重复序列通称为回文序列。核小RNA(SnRNA)：发现于真核生物细胞核中，与前体mRNA剪接成成熟mRNA的过程相关。核仁小RNA（snoRNA）：发现于真核细胞核的核仁区，在rRNA分子的加工过程中起到核心作用（比如在某个核苷酸位点上加上一个甲基）。微小RNA（miRNA）和短干扰RNA（siRNA）：是调控个别基因表达的小RNA。长非编码RNA（long noncoding RNA,，lncRNA）：长度在200 nt以上的RNA分子，不编码蛋白质。变性：在某些理化因素作用下，DNA分子互补碱基对之间的氢键断裂，使DNA双螺旋结构松散，变成单链。碱变性：当pH 11.3

7、时，碱基的互变异构态发生变化，由酮式向烯醇式转化。这种变化影响到特定碱基间的氢键作用，结果导致DNA双链解离，称为碱变性。DNA热变性：加热可使DNA和RNA中双链部分氢键的断裂，从而导致变性。增色效应：主要指DNA从双螺旋结构变为单链的无规则卷曲状态时在260nm处的吸收值增加的现象。减色效应：通常指变性的DNA在重新形成双螺旋结构时，其在260nm处的吸收值不断降低的现象。DNA的溶解温度（Tm）：指在DNA热变性中，DNA在260nm处的光吸收达到最大吸收值一半时的温度。DNA复性：在一定条件下，变性的DNA的互补碱基对间氢键重新形成，恢复原来的双链状态，称为复性。热变性DNA经缓慢冷却

8、后即可复性，也称为退火。核酸杂交：利用变性、复性技术使不同来源的核酸互补序列结合形成双螺旋结构的过程。例：Southern杂交、Northern杂交。核酸的分子杂交（hybridization）：在DNA复性过程中，双链分子的再形成既可以发生在序列完全互补的核酸分子之间，也可以发生在碱基序列部分互补的不同的DNA之间或DNA与RNA之间，这种现象称为分子杂交。全保留复制（Conservative replication)：亲代双链合成暂时分开，完成后重新形成双链，子代双链完全由新合成的子链形成。分散复制（Random dispersive replication)：新形成的双螺旋由部分亲代DN

9、A和部分子代DNA组成。半保留复制（Semi-conservation replication)：亲代DNA两条链解开，分别作为模板指导互补子链的合成。每个子细胞接收亲代DNA双链中的一条。复制子（replicon）：单独复制的一个DNA单元，一个复制子只含有一个复制起始点。复制起始点（Origin of replication）：DNA链上独特的具有起始DNA复制功能的碱基序列。复制泡：DNA合成时从复制起点开始向一边或两边移动，形成的泡状中间产物。复制叉(replication fork)：复制时DNA双链解开分成二股单链，新链沿着张开的二股单链生成，复制中形成的这种Y字形的结构称为复制叉

10、。前导链：合成方向与复制叉移动的方向一致，通过连续的5-3聚合反应合成的新的DNA链。后随链：合成方向与复制叉移动的方向相反，通过不连续的5-3聚合反应合成的新的DNA链。冈崎片段：是在DNA半不连续复制中产生的长度为1000-2000 nt的短DNA片段，能被连接形成一条完整的DNA链。半不连续复制：先导链连续合成，后随链断续合成的方式，称为半不连续复制。DNA解链酶（DNA helicase）：通过水解ATP获得能量，作用于氢键，使DNA双链解开成为两条单链。单链结合蛋白（SSB蛋白）：一种与单链DNA紧密结合的蛋白，它的结合可以保证被解链酶解开的单链在复制完成前保持单链的结构。核酸酶：切

11、除多核苷酸链中磷酸二酯键的的酶。内切酶：断裂内部二酯键的酶。内切酶作用产生核酸片段。外切酶：切除末端核苷酸的酶。外切酶从分子的末端切除，产生单核苷酸。DNA聚合酶：合成DNA的酶，完成DNA链的延伸。Klenow片段：用枯草杆菌蛋白酶处理DNA聚合酶I，可获得两个片段，大片段的分子质量约68 kDa，保留聚合酶活性和3-5外切核酸酶活性，又叫Klenow片段。引发酶: 依赖于DNA的RNA聚合酶，其功能是在DNA复制过程中合成RNA引物。引发体 (Primosome): 引发酶和另外6种蛋白质 (Dna B, DnaC, n, n, n和 I) 组装而成的多蛋白复合体。复制体 (repliso

12、me)：DNA复制的多蛋白复合体, 包括Poly III的全酶二聚体，引发酶，解链酶，SSB和其它辅助因子，其体积与核糖体的大小类似。细胞周期：指从一个母细胞产生两个子细胞的过程。端粒酶：是一种通过合成端粒重复序列来维持真核生物染色体末端的酶，是一种逆转录酶。突变(mutation)：是一个DNA分子在碱基序列上发生的可遗传的变化，表现在碱基的改变或碱基数目的增加或减少上。突变体(mutant)：不同于正常或野生型形式的个体。如：His-酵母，白眼果蝇。点突变：单个碱基的变化，碱基对既不增加也不减少，而是发生了替换 (substitution)。转换(Transition)：嘧啶与嘧啶，嘌呤与

13、嘌呤的替换，如A/TG/C, T/AC/G。颠换(Transversion)：嘧啶与嘌呤，嘌呤与嘧啶的替换，如A/TC/G，T/AG/C。沉默突变(silent mutation)：不影响氨基酸序列。发生在非编码区， 非调节区或密码子的第三位。中性突变(neutral mutation)：突变的密码子编码不同但性质相似的氨基酸。错义突变(missense mutation)：编码的氨基酸序列发生改变，可能无作用也可能致死。无义突变(nonsense mutation)：形成新的终止密码子，编码截短了的蛋白。移码突变(frameshift mutation)：碱基的插入或缺失引起读码框（ORF）

14、的改变。温度敏感突变(temperature-sensitive mutation)：突变蛋白质在某一温度有活性，在另一温度下失活。渗漏突变 (leaky mutation)：某些氨基酸的变化使得蛋白活性显著降低，但不是完全丧失。光修复：在可见光下，环丁烷嘧啶二聚体在光复活酶的作用下修复成嘧啶单体的过程。切除修复：损伤部位被切除，然后由DNA聚合酶合成新的DNA填补，并由DNA连接酶封口。错配修复：是切除修复的一种特定形式，用于修复在复制中错配并漏过校正检验的任何碱基。重组修复：又称为复制后修复，它发生在复制之后。机体细胞对在复制起始时尚未修复的DNA损伤部位可以先复制再修复，即先跳过该损伤部

15、位，在新合成链中留下一个对应于损伤序列的缺口。SOS修复：指DNA受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种DNA修复方式，修复结果只是维持基因组的完整性，提高细胞的存活率，但留下的错误较多，故又称为错误倾向修复，使细胞有较高的突变率。DNA重组：指由于不同DNA链的断裂和连接而产生的DNA片段的交换和重新组合，形成新的DNA分子的过程。同源重组：两个DNA分子同源区段间的相互交换。位点专一性重组：指在能识别特定的核苷酸序列的重组酶作用下，非同源DNA的特异片段之间的重组。转座重组：指转座子移到基因组的新位点。Holliday中间体：联会的染色单体在特定位点被酶切，两条游离的3末端交叉移动到

16、对方的断头5端，交叉连接，分支迁移，在交叉点形成的四分支结构称为Holliday中间体，交叉点也叫Holliday交叉点。分支迁移：交叉点沿连接形成的双链DNA左右移动，称为分支迁移。RecA蛋白：一种多功能蛋白质，它参与大肠杆菌所有的同源重组途径，有单体和多聚体两种形式。倒置现象：在位点专一性重组中，当重组位点方向相反时，位点间会出现倒置。可移动遗传因子：是基因组中可以自己从一个位点转移到另一个位点的核苷酸序列。转座子 (transposon, Tn)：能将自身转座至同一细胞中其它DNA序列上许多不同位点的一段DNA。它们可以从基因组的一个部位直接转移到另一个部位，这个过程称为转座。逆转录转

17、座子：以RNA为中介，逆转录成cDNA后进行转座的可移动元件。插入序列（insertion sequences, IS ）：具有末端反向重复序列的DNA元件，通常1 kb，含有一个转座酶基因。复合转座子：指两端的组件由IS元件组成，中间夹着一个或多个结构基因如某些抗药性基因或其它功能基因。复制型转座：转座子在转座过程中被复制，转座完成后，在供体位点有一个拷贝，在受体位点有一个拷贝。非复制型转座：转座子直接从一个位点跳跃到另一个位点，在供体位点留下一个缺口。自主因子（antonomous elements）：具有自我切除和转座能力。由于自主因子的持续活性，它们可以插入到任何位点产生一个不稳定或可

18、突变的等位基因。非自主因子（non-antonomous elements）：是稳定的，它们自己并不能转座，能否转座取决于有无与非自主因子同家族的自主因子的存在。遗传图谱：指应用遗传学技术（遗传重组）构建的能在基因组上显示基因和其它序列特征位置的线性排列图，反映了基因或标记间的相对距离和顺序。cM物理图谱：指应用分子生物学技术直接分析DNA分子，从而构建的能显示包括基因在内的序列特征位置的图谱，它反映了基因或标记间的实际距离。bp，kb，Mb。DNA分子标记：简称分子标记，指具有相对差异的等位基因的DNA多态性标记，是DNA水平上遗传变异的直接反映。限制性片段长度多态性（restriction

19、 fragment length polymorphism，RFLP）：用限制酶酶切基因组DNA时，在同一种生物的不同个体间出现含同源序列的酶切片段长度的差异。随机扩增多态性（Random amplified polymorphic DNA，RAPD）：用随机短引物进行DNA的PCR扩增，若DNA的遗传特性发生变化，PCR产物表现其差异性，经电泳分离后，就可检测出被扩增的DNA多态性。简单重复序列Simple sequence repeat, SSR, Microsatellite (微卫星)：指重复单位相对较小（2-8 bp的基序），由于重复单位数目的变化而形成的多态性。序列标签位点Sequ

20、ence tag site, STS：指序列已知，染色体定位明确，且可用PCR扩增的单拷贝序列。单核苷酸多态性（Simple nucleotide polymorphism, SNP）：基因组中的某些位点上，有些个体只有一个核苷酸与其它个体不同，这种分散在基因组中的单个碱基的差异就称为SNP。荧光原位杂交（FISH）：原位杂交是以标记的DNA分子为探针，检测完整染色体的一种杂交分析方法。通过荧光标记显示出DNA标记在一条染色体中的位置的方法。转录 ( transcription ) ：生物体以DNA为模板按53方向合成RNA的过程。起始点 (start point)：合成第一个RNA碱基的位置

21、，用“+1”表示。启动子 (promotor)：位于转录起始点前，和RNA聚合酶结合的一段DNA序列。终止子 (terminator)：使RNA聚合酶终止转录的一段DNA序列。转录单元 (transcription unit)：从启动子到终止子间的一段DNA序列。上游序列：转录起始点前面的序列，用 “-” 表示。下游序列：转录起始点后面的序列，用 “+” 表示。初级转录本：刚转录完成的RNA产物。转录泡：RNA聚合酶与启动子结合后形成的DNA解旋区。转录泡可和RNA聚合酶一起沿DNA链移动，RNA合成在转录泡内进行。流产起始：转录起始后直到形成9个核苷酸短链的过程是RNA聚合酶通过启动子的阶段，此时RNA聚合酶一直处于启动子区域，新生RNA链与DNA模板链的结合不够牢固，很容易从DNA链上掉下来并导致转录重新开始，这一过程称为流产起始。启动子清除：一旦RNA聚合酶成功地合成9个以上核苷酸并离开启动子区域，转录就进入正常的延伸阶段，这一过程称为启动子清除（ 最短要1-2s，是一个较长的过程）。氢键互补学说：启动子区DNA双螺旋结构的碱基上既有氢键供体又有氢键受体。由于它们分别处于双螺旋的大沟和小沟内，因此具有特定的构象。而酶分子中也有处于特定空间构象的氢键受体和供体，当它们与启动子中对应的分子互补时就形成氢键，相互结合。共有序列：是根据保守性序列总结出的一