第9章 生物分类和鉴定

1、基基础础微微生生物物学学第九章第九章 微生物的分类微生物的分类 微生物分类是按微生物的亲缘关系微生物分类是按微生物的亲缘关系相似程度把微生物归入各分类单元或分相似程度把微生物归入各分类单元或分类群类群(taxon)，以得到一个反映微生物进，以得到一个反映微生物进化的自然分类系统、可供鉴定用的检索化的自然分类系统、可供鉴定用的检索表以及可给出符合逻辑的名称的命名系表以及可给出符合逻辑的名称的命名系统。统。所以微生物分类的具体所以微生物分类的具体任务任务就是就是分分类类（classification）、）、鉴定鉴定（identification）与）与命名命名（nomenclature）。）。微生

2、物在生物界的地位微生物在生物界的地位生物的界级分类学说，生物的界级分类学说，五界系统和三域学说五界系统和三域学说。1969年年whittaker提出生物分类的提出生物分类的五界五界系系统，包括统，包括原核生物界、原生生物界、真原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界菌界、植物界和动物界。 三域学说三域学说在在20世纪世纪70年代末美国伊利诺斯大学的年代末美国伊利诺斯大学的c.r.woese等人对等人对大量微生物和其他生物进行大量微生物和其他生物进行16s rrna和和18s rrna的寡核苷的寡核苷酸测序，并比较其同源性后，提出了一个与以往各种界酸测序，并比较其同源性后，提出了一个与以往

3、各种界级系统不同的新系统，称为三域学说。三域指的是细菌级系统不同的新系统，称为三域学说。三域指的是细菌域、古生菌域和真核生物域。域、古生菌域和真核生物域。 第一节第一节 微生物的分类单元微生物的分类单元 与其他生物的分类一样，微生物分与其他生物的分类一样，微生物分类的基本单元也是类的基本单元也是种种（species）。）。微生微生物种是显示高度相似性、亲缘关系极其物种是显示高度相似性、亲缘关系极其接近、与其他种有明显差异的一群菌株接近、与其他种有明显差异的一群菌株的总称。的总称。 一、种以上的分类单元一、种以上的分类单元 种以上的分类单元自上而下依次分力种以上的分类单元自上而下依次分力 7个等

4、级。个等级。 一个或多个种构成一属，一个或多个一个或多个种构成一属，一个或多个属构成一科，等等。属构成一科，等等。二、种以下的分类单元二、种以下的分类单元 鉴定微生物种时，只有在所有鉴别鉴定微生物种时，只有在所有鉴别特征都与已知的模式种相同的情况下才特征都与已知的模式种相同的情况下才能定为同种。能定为同种。 （一）（一）亚种亚种 （二）（二）型型 （三）（三）菌株菌株 第二节第二节 微生物的命名微生物的命名 微生物的名字有俗名（微生物的名字有俗名（common name）和学名（）和学名（scientific name）两种。）两种。俗名是通俗的名字，如结核分支杆菌俗称俗名是通俗的名字，如结核

5、分支杆菌俗称结核杆菌，铜绿假单胞菌俗称绿脓杆菌，结核杆菌，铜绿假单胞菌俗称绿脓杆菌，粗糙豚孢菌的俗名为红色面包霉等等。粗糙豚孢菌的俗名为红色面包霉等等。 采用双名法命名时，学名由属名和种名构采用双名法命名时，学名由属名和种名构成，用斜体表示。属名在前，而且第一个字母成，用斜体表示。属名在前，而且第一个字母要大写。种名在后，全部小写。要大写。种名在后，全部小写。学名后还要附学名后还要附上首个命名者的名字和命名的年份，但这些都上首个命名者的名字和命名的年份，但这些都用正体宇。如金黄色葡萄球菌（俗称用正体宇。如金黄色葡萄球菌（俗称“金葡金葡菌菌”）staphylococcus aureus rose

6、nbach 1884 。 第三节第三节 微生物的分类依据和方法微生物的分类依据和方法 微生物的分类微生物的分类依据主要有：形态特依据主要有：形态特征、生理生化特征、生态特征、抗原特征、生理生化特征、生态特征、抗原特征、遗传特征和化学分类特征等。征、遗传特征和化学分类特征等。现以现以细菌的分类依据为主来说明。细菌的分类依据为主来说明。一、常规分类法一、常规分类法 常规分类是根据微生物形态、生理常规分类是根据微生物形态、生理生化、生态和抗原等表型特征进行分类生化、生态和抗原等表型特征进行分类的方法，的方法，这是微生物分类鉴定中通常采这是微生物分类鉴定中通常采用的方法。用的方法。 二、遗传特征分类法

7、二、遗传特征分类法遗传特征客观地反映了微生物的亲缘关系，遗传特征客观地反映了微生物的亲缘关系，是微生物分类鉴定中一个可靠的特征。尤是微生物分类鉴定中一个可靠的特征。尤其在正式定为新属或新种时一定要有其遗其在正式定为新属或新种时一定要有其遗传特征的描述。传特征的描述。遗传分类法是指根据核酸分析得到的遗传遗传分类法是指根据核酸分析得到的遗传相关性所做的分类。相关性所做的分类。 三、化学特征分类法三、化学特征分类法化学分类法是应用电泳、色谱和质谱等化学分类法是应用电泳、色谱和质谱等分析技术，根据微生物细胞组分、代谢分析技术，根据微生物细胞组分、代谢产物的组成与图谱等化学分类特征进行产物的组成与图谱等化学分类特征进行分类的方法。分类的方法。 四、数值分类法四、数值分类法数值分类是根据数值分析，借助计算机数值分类是根据数值分析，借助计算机将拟分类的微生物按其性状的相似程度将拟分类的微生物按其性状的相似程度归类的方法。归类的方法。1微生物的分类单元有哪些？基本分类微生物的分类单元有哪些？基本分类单元是什