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文档简介
1、评分实验报告课程名称生物医学统计分析实验名称方差分析 2专业班级姓名学号实验日期实验地点.2015 2016 学年度第2学期一、实验目的巩固掌握前次实验方差分析中的 : 1.均数差别的显著性检验 2.分离各有关因素并估计其对总变异的作用 3.分析因素间的交互作用 4.方差齐性检验 。 学习利用协方差分析消除混杂因素对分析指标的影响 。二、实验环境1 、硬件配置 :处理器 : Intel ( R) Core(TM) i7-3770 CPU 3.40GHz 3.40GHz安装内存 ( RAM ): 4.00GB系统类型 :64 位操作系统2 、软件环境 : IBM SPSS Statistics
2、19.0软件三、实验内容(包括本实验要完成的实验问题及需要的相关知识简单概述)( 1)课本第四章的例 4.5-4.9 运行一遍 ,注意理解结果 ;( 2)然后将课本第五章的例 5.1-5.2 运行一遍 ,注意理解结果 。三 、实验结果与分析例 4.5输出结果 :表 1不同温度 、产蛋期、鸡群对蛋鸡产蛋量影响的方差分析结果(主体间效应的检验)因变量 :产蛋量.专业 .专注.源III 型平方和df均方FSig.校正模型82.880 a126.9074.584.007截距12056.040112056.0408001.796.000产蛋期27.36046.8404.540.018鸡群22.16045
3、.5403.677.035温度33.36048.3405.535.009误差18.080121.507总计12157.0025校正的总计100.96024a. R 方 = .821 (调整R 方 = .642 )分析:1 )本实验主要是为了研究5种不同温度对蛋鸡产蛋量的影响,但由于不同的鸡群和产蛋期对产蛋量也有较大的影响,因此我们选用拉丁方设计 ;2 )本实验由于我们选中了“描述性统计 ”和 “Tukey 的多重比较方法 ”,因此输出结果中还有输出样本的描述统计量和产蛋期、鸡群和温度的多重比较结果,但由于本次实验主要是分析 3种因素对产蛋量的影响,并不研究到影响因素的具体细化部分,因此我们只选
4、取主体间效应的检验部分进行分析;3 )根据表 1可知 :产蛋期间的 F 4.540,P 0.018 0.05 ,鸡群间的 F 3.677 ,P0.035 0.05, 因此说明不同产蛋期和不同鸡群对产蛋量具有显著的影响;而温度间的F5.535, P 0.009 0.01,因此说明不同温度对产蛋期具有极显著的影响。4 )拉丁方设计要求每个区组的组数和试验因素的处理数都必须相等,且应假定 3 个因素之间不存在交互作用 ,因此在本次实验中需选择主效应模型。例 4.6输出结果 :表 2 两种饲料对产奶量影响的方差分析表 (主体间效应的检验 )因变量 :产奶量源III 型平方和df均方FSig.校正模型7
5、6.050 a116.9147.577.004截距4651.25014651.2505097.260.000饲料 A30.258130.25833.159.000时期 C.1621.162.178.685个体 B45.63095.0705.556.012.专业 .专注.误差7.3008.912总计4734.60020校正的总计83.35019a. R 方 = .912 (调整R 方 = .792 )分析:1 )本实验主要是为了研究新配方饲料对产奶量的影响,故设立了对照组与其进行对比,但由于试验的奶牛个体之间以及试验期间的差异都对试验结果有影响,为了尽可能地消除这种影响 ,因此我们选择 22 交
6、叉设计法 ;2 )本实验由于我们选中了 “描述性统计 ”,因此输出的结果中还有描述统计量,由于数据量过大 ,因此我们没有把运行结果粘贴过来,但我们可以从描述性统计量表得出不同饲料在不同时期和不同个体间的均值和标准差;3 )根据表 2可知 ,饲料间的 F33.159, P 0.0000.01,说明新配方饲料与对照饲料对平均产奶量的影响差异极显著,这里表现为新配方饲料的平均产奶量极显著高于对照饲料的平均产奶量 。 且我们可以看出按照 22 交叉设计方法进行试验的结果中已经较大的消除预饲期对试验结果的影响,但不同奶牛之间对产奶量的影响还是极为显著,因此消除效果并不好 ;4)在 2 2 交叉设计资料中
7、 ,因子间的交互作用包括在误差项,分析时应注意不要引入交互作用 ,应选择主效应模型。且本实验只分为两组,故不需要作均数间的多重比较。例 4.7输出结果 :表3 补饲配方 、用量、食盐对增重影响的方差分析表 (主体间效应的检验 )因变量 :增重源III 型平方和df均方FSig.校正模型86.787 a614.4642.000.370截距41629.601141629.6015757.013.000配方 A5228.7143.971.201.429用量 B15.10927.5541.045.489食盐 C14.24927.124.985.504误差14.46227.231总计41730.8509
8、校正的总计101.2498a. R方= .857(调整R 方= .429).专业 .专注.分析:1 )因为要全面对补饲配方、用量 、食盐 3 个因素进行实验,规模会很大 ,因此我们选用L 9 (3 4 ) 正交表进行正交设计,以减小试验规模,并且不使信息损失得太多;2 )本实验由于我们选中了“描述性统计 ”,因此输出的结果中还有描述统计量,由于数据量过大 ,因此我们没有把运行结果粘贴过来,但我们可以从描述性统计量表得出不同配方在不同用量和不同食盐内的均值和标准差;3 )据表 3可知 ,配方间的 F3.971,P0.2010.05,用量间的 F1.045 ,P0.4890.05,食盐间的 F 0
9、.985, P 0.504 0.05, 说明不同配方 、不同用量 、不同食盐对增重皆没有影响 ;4 )本实验还对补饲配方、用量、食盐采用 S-N-K 法进行多重比较,但由于数据量过大,因此我们没有粘贴过来 ,但我们从输出结果可以看出不同配方 、不同用量 、不同食盐间位于同一列 ,因此它们的均数之间不存在差异 ;5 )因为本实验是无重复观察值无交互作用,因此选择主效应模型。例 4.8输出结果 :表 4 温度、菌系、培养时间对根瘤菌生长影响的方差分析表主体间效应的检验因变量 :根瘤菌数源III 型平方和df均方FSig.校正模型306045.833 a934005.09335.052.000截距1
10、.563E711.563E716114.567.000A86877.778243438.88944.776.000B209211.1112104605.556107.825.000空列86.111243.056.044.957C5669.44422834.7222.922.112重复组4201.38914201.3894.331.071误差7761.1118970.139总计1.595E718校正的总计313806.94417a. R 方 = .975 (调整R 方 = .947 ).专业 .专注.表5 各温度间根瘤菌数均数的两两比较Student-Newman-Keuls a,bA子集N12
11、36834.1726972.5016989.17Sig.1.000.381已显示同类子集中的组均值。基于观测到的均值。误差项为均值方(错误 ) = 970.139a. 使用调和均值样本大小= 6.000b. Alpha = .05。表 6 各菌系间根瘤菌数均数的两两比较Student-Newman-Keuls a,bB子集N12326835.8316877.50361082.50Sig.1.0001.0001.000已显示同类子集中的组均值。基于观测到的均值。误差项为均值方(错误 ) = 970.139a. 使用调和均值样本大小= 6.000。.专业 .专注.b. Alpha = .05。表
12、7 各培养时间内根瘤菌数的两两比较Student-Newman-Keulsa,bC子集N126915.8336923.3316956.67Sig.118已显示同类子集中的组均值 。基于观测到的均值 。误差项为均值方(错误 ) = 970.139。a. 使用调和均值样本大小 = 6.000。b. Alpha = .05 。分析:1 )因为本实验目的在于考察温度、菌系、培养时间的主效应并筛选最佳组合,因此我们选用 L9 (34 ) 正交表进行分析 ;2 )本实验由于我们选中了 “描述性统计 ”,因此输出的结果中还有描述统计量,由于数据量过大 ,因此我们没有把运行结果粘贴过来,但我们可以从描述性统计
13、量表得出不同温度在不同菌系和不同培养时间内的均值和标准差;3 )根据表 4可知 ,温度间的 F44.776, P0.0000.01, 说明不同温度对根瘤菌的生长有极显著影响 ;菌系间的 F 107.825, P0.0000.01 ,说明不同菌系对根瘤菌的生长也具有极显著的影响 ;而时间间的 F2.922, P0.112 0.05, 说明不同培养时间对根瘤菌的生长不具有显著影响 。 正交表中的第三列(空列 )为各因子互相效应一部分数量的混杂 ,题中预先估计因子间无互作,这一列便可作误差看待 ,可与表中的误差项合并,以增加自由度 。合并后的误差自由df2 8 10, SSE86.1117761.1
14、117847.222,MSE784.722, 温度间的 F55.36,菌系间的 F133.30 ,时间间的 F 3.61。4 )由于不同培养时间对根瘤菌的生长作用不明显 ,因此我们应考察不同温度 、菌系根瘤菌均数的多重比较结果 ,选出最优组合 ,根据表 5 、表6 、和表 7 我们不仅可以得出不同时间的根瘤菌均数差异不大 、低温度和高中温度的根瘤菌均数差异大和三个菌系间的根瘤菌数均数差异大,还可以看出选择高温度和丙菌类为最优组合。例 4.9输出结果 :表 8 主体间效应的检验因变量 :试验结果.专业 .专注.源III 型平方和df均方FSig.校正模型6627.625 a51325.52523
15、.003.042截距55278.125155278.125959.273.001A1431.12511431.12524.835.038B21.125121.125.367.606AB4950.12514950.12585.902.011C210.1251210.1253.646.196BC15.125115.125.262.659误差115.250257.625总计62021.0008校正的总计6742.8757a. R 方 = .983 (调整R 方 = .940 )分析: 1)因为本实验不仅研究 A、 B、 C三种成分对发酵培养基的影响,且A与 B、B与C中存在交互作用 ,因此试验采用
16、L8 (27 ) 正交表进行设计 ;2 )本实验由于我们选中了 “描述性统计 ”,因此输出的结果中还有描述统计量,由于数据量过大 ,因此我们没有把运行结果粘贴过来,但我们可以从描述性统计量表得出每一种成分或成分组合在其他成分内的均值和标准差;3)表8为F检验的结果 ,其中 A因素的 F24.835,P 0.0380.05 ,说明 A 因素对抗生素有显著的影响 ;交互作用 AB的 F85.902,P 0.0110.05 ,说明 AB的交互作用对抗生素有显著的影响 ;而 B、C因素以及 BC交互作用的 F值分别为 0.367 ,3.646 ,0.262 , P值分别为 0.606 , 0.196
17、, 0.659 ,均大于 0.05 ,说明 B、 C因素以及BC交互作用对抗生素没有显著的影响,故应对 A与 B的水平组合进行多重比较 ,一选出 A与 B因子的最优水平组合;4 )由于本例各因子只有两个水平,组数少于 3,故无法进行均数间的两两比较。例 5.1输出结果 :表 9 描述性统计量因变量 :末重 y处理组均值标准 偏差N111.8167.9466012210.84171.3235312dimension12.06671.666971231411.15001.5192712总计11.46871.4348548.专业 .专注.表 10 误差方差等同性的Levene检验 a因变量 :末重
18、yFdf1df2Sig.663344.579检验零假设 ,即在所有组中因变量的误差方差均相等。a. 设计 : 截距+ 初生重 x +处理组表 11协方差分析结果表因变量 :末重 y源III 型平方和df均方FSig.校正模型59.295 a414.82417.013.000截距2.09212.0922.401.129初生重 x47.615147.61554.645.000处理组20.43536.8127.817.000误差37.46843.871总计6410.31048校正的总计96.76347a. R 方 = .613 (调整R 方 = .577 )表 12参数估计因变量 :末重 y参数95
19、%置信区间B标准 误差tSig.下限上限截距2.8401.1562.457.018.5095.171初生重 x7.200.9747.392.0005.2369.164处理组 =1-1.973.522-3.778.000-3.027-.920处理组 =2-1.238.401-3.086.004-2.048-.429处理组 =3-.163.408-.400.691-.986.660处理组 =40a.a. 此参数为冗余参数,将被设为零 。表 13 各处理组的校正 50 日龄平均重因变量 :末重 y.专业 .专注.dime.处理组95%置信区间均值标准 误差下限上限110.339 a.3359.663
20、11.016211.074 a.27110.52711.621nsion12.149 a.27011.60512.69331412.312 a.31211.68312.942a. 模型中出现的协变量在下列值处进行评估: 初生重 x = 1.3156.表14 各处理组的校正 50 日龄平均重多重比较因变量 :末重 y(I) 处理组(J) 处理组差分的95% 置信区间 a均值差值 (I-J)标准 误差Sig. a下限上限12-.735.446.107-1.634.164dimension23-1.810 *.436.000-2.688-.9314-1.973 *.522.000-3.027-.92
21、021.735.446.107-.1641.634dimension23-1.075 *.382.007-1.845-.3054-1.238 *.401.004-2.048-.429dimension111.810*.436.000.9312.6883dimension221.075*.382.007.3051.8454-.163.408.691-.986.660411.973*.522.000.9203.027dimension221.238*.401.004.4292.0483.163.408.691-.660.986基于估算边际均值a. 对多个比较的调整: 最不显著差别 (相当于未作调整
22、)。*. 均值差值在.05级别上较显著 。分析: 1 )因为本实验的初生重对分析试验结果会造成影响,且是成组设计 ,因此我们选择单向分组资料的协方差分析;2 )由表 9可知 , 4个处理组未校正50日龄平均重分别为11.8167 , 10.841,12.066,7, 和11.1500 ;标准差分别为0.94660 , 1.32353 , 1.66697 和 1.51927 ;3 )表 10位方差齐性检验结果,其中 P0.5790.05 ,因此说明在 0.05 的显著水平上 ,可以认为各组方差无显著差异;4 )表 11为协方差分析结果,其中初生重的F54.645,P0.0000.01,说明仔猪初
23、生重与 50日龄重间存在极显著的线性回归关系,说明初生重对50日龄重有极显著的影响,因而有必要进行协方差分析 ,即利用线性回归关系来校正 50日龄重 ,并对校正后的 50日龄重作方差分析 。 且其中经校正后的处理组的.专业 .专注.F 7.817,P 0.000 0.01,说明不同处理组间的 50日龄重有极显著的差异 ,故须进一步检验不同处理组间的差异显著性,即进行多重比较;5 )表 12为参数估计的结果,其中因变量 ( 50 日龄重 )对协变量 (初始体重 )的回归系数 B=7.200 ,两者成正相关关系,即初始体重越大,则 50日龄重会随之越大;6 )表 13为 4 个处理组校正 50 日
24、龄的平均重 、标准误差及相应的置信区间。 4个处理组校正 50日龄平均重分别为 10.339,11.074,12.149 和 12.312 ;标准误分别为0.335,0.271,0.270, 和 0.312 。 表下方的提示表明该校正50 日龄平均重是按初生重均为1.3156kg 的情形计算的 ;7 )表 14为 4 个处理组校正 50 日龄的平均重多重比较结果。结果表明 :饲粮 2、饲粮 3与对照饲粮 、饲粮 1比较 ,其校正 50日龄的平均重间存在极显著差异;饲粮 2与饲粮 1 ,对照饲粮 3 与饲粮 4 之间无显著差异 ,因此可知 4种饲粮以饲粮 2 、饲粮 3 的增重效果为好。例 5.
25、2输出结果 :表 15 主体间效应的检验因变量 :产量 y源III 型平方和df均方FSig.校正模型2003.155 a8250.39457.810.000截距17.271117.2713.987.071品种1561.4474390.36290.125.000区组4.96631.655.382.768株数 x220.3551220.35550.874.000误差47.645114.331总计19574.00020校正的总计2050.80019a. R 方 = .977 (调整R 方 = .960 )表 16各品种组的校正平均产量因变量 :产量 y品种95%置信区间均值标准 误差下限上限A23
26、.691 a1.49920.39326.990B34.923 a1.07532.55737.289C31.154 a1.17228.57533.734.专业 .专注.D16.232 a1.31813.33119.132E42.000 a1.04139.71044.290a. 模型中出现的协变量在下列值处进行评估: 株数 x = 12.00.表17 各品种组的校正平均产量多重比较表因变量 :产量 ydimenn1(I) 品种Adimension2Bdimension2Cdimension2Ddimension2Edimension2(J) 品种差分的95% 置信区间 a均值差值 (I-J)标准
27、误差Sig. a下限上限B-11.232 *1.679.000-14.927-7.536C-7.463 *2.187.006-12.276-2.650D7.460 *2.393.0102.19312.727E-18.309 *1.824.000-22.324-14.293A11.232 *1.679.0007.53614.927C3.768 *1.679.046.0737.464D18.691 *1.824.00014.67622.707E-7.077 *1.496.001-10.370-3.784A7.463 *2.187.0062.65012.276B-3.768 *1.679.046-7
28、.464-.073D14.923 *1.496.00011.63018.216E-10.846 *1.567.000-14.295-7.396A-7.460 *2.393.010-12.727-2.193B-18.691 *1.824.000-22.707-14.676C-14.923 *1.496.000-18.216-11.630E-25.768 *1.679.000-29.464-22.073A18.309 *1.824.00014.29322.324B7.077 *1.496.0013.78410.370C10.846 *1.567.0007.39614.295D25.768 *1.679.00022.07329.464基于估算边际均值*. 均值差值在.05级别上较显著 。a. 对多个比较的调整: 最不显著差别 (相当于未作调整)。.专业 .专注.分析 : 1 )由于本实验是随机分组,因此选用双向资料协方差分析;2 )表 15 为方差分析结果。结果表明 ,协变量株数的F5
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