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文档简介

1、免疫印迹杂交(Western blot)(050302A)1仪器(1)制胶模具(2)跑胶及转膜装置(3)大小玻板(4)电泳电源(5)电磁炉2试剂:(1)Tris base、(2)SDS(3)BSA(购自Biotech)(4)Bis-acrylamide(亚甲双丙烯酰胺)(5)Acrylamide(丙烯酰胺)(6)Glycine(7)DTT(8)NaCl(购自BBI)(9)APS(购自Amresco)(10)Tween-20(温州清明化工厂)3溶液配制:(1)4 × sample Buffer终浓度Stock液10 ml 工作液0.25 M Tris-HCl, pH 6.82.5 M1

2、 ml8 % SDS20 4 ml0.2 M DTT1 M2 ml30 % glycerol100 3 ml少量的溴酚兰 1 ml管分装,-20 保存。4 ´上样缓冲液 0.5 mol/L Tris-HCl (PH 6.8) 2.5 ml 1 mol/L DTT 1 ml 甘油 1.5 ml SDS 400 mg 溴酚蓝 5 mg混匀后-20°C贮存备用。(2)30%储备胶溶液 丙烯酰胺(Acr) 29.2 g 亚甲双丙烯酰胺 0.8 g 混匀后加ddH2O2,37 °C溶解,定容至100 ml,棕色瓶存于4°C。(3)分离胶缓冲液1.5 M Tris-

3、HCL (pH 8.8)18.15 g Tris溶于适量的ddH2O2, 用HCL调节pH 8.8,定容至100ml,4°C保存。(4)浓缩胶缓冲液0.5M Tris-HCL(pH6.8) 6.05g Tris溶于适量的ddH2O2, 用HCL调节pH 6.8,定容至100ml,4°C保存。(5)10% SDS称取10 g SDS,加入双蒸水并定容至100 ml,搅拌过夜,置于室温防止析出。(6)10% APS称取0.2 g APS,加蒸馏水2 ml,-20°C保存。(7)电泳缓冲液 (Running Buffer,5 ´)Tris 15 gSDS 5

4、gGlycine 72 g 调节pH 8.3,定容至1 L临用时用双蒸水稀释成1×,可重复使用3-4次(可根据电泳的速度决定下次是否使用)。(8)转移缓冲液 (Transfer Buffer,5 ´ )Tris 15.15 gGlycine 72 gSDS 2.5 g调节pH 8.18.5,定容至1 L,临用时双蒸水稀释,800 ml 1×的转移缓冲液加200 ml甲醇(9)TBST缓冲液(10×)Tris·HCl (pH 7.6) 30.28 gNaCl 80.15 g Tween-20 10 ml 定容至1 L,临用时双蒸水稀释成1

5、5;,可重复使用2-3次。(10)封闭液10.5 mg BSA溶于10 ml 1´ TBST中,搅拌均匀。(11)封闭液2 10 g 脱脂奶粉溶于 100 ml的1×TBST(12)叠氮钠存储液(13)一抗稀释液4上样前准备:(1)稀释样本 确定要加的每孔样本体积(ml)及上样量(mg) 计算样本需要稀释的终浓度 确定每个样本需要稀释的总体积(ml),4×上样缓冲液的体积为 总体积/4(ml) 根据已经测定好的蛋白浓度计算需要的蛋白量(ml) 总体积蛋白量4×上样缓冲液需要加的ddH2O 以下表为例样本编号蛋白浓度样本量4×sampleddH2

6、O体积终浓度加样量加样本量(ug/ul)mlmlmlml(mg/ul)mlmgA15.03 14.91 7.57.59 302.50 1230A26.62 6.04 45.96 162.50 1230A33.69 10.83 41.17 162.50 1230A44.33 9.24 42.76 162.50 1230A53.50 11.42 40.58 162.50 1230A65.46 7.33 44.67 162.50 12304实验步骤:(1)制胶及安装:按照如下方式安装,安装好之后用水加满以检验是否安装正确。(2)做胶及安装:将水倒干净,按照配方配置一定量的分离胶溶液(8ml)和浓缩胶

7、溶液(5ml),过硫酸铵和TEMED在用前加入。分离胶溶液充分混匀后从一侧加入灌胶模具,上方留约1.5-2cm用于加浓缩胶,小心的在分离胶的表面加一层水(或水饱和的异丙醇),封住胶面,以促使聚合并保持胶面平整。室温放置40分钟到1小时后,可以看到一个界面,去掉上层覆盖液,然后灌制浓缩胶,并插入与模具大小相同,凝胶厚度相当的梳子。静止放置40-60分钟使凝胶聚合,按照如下方法放入电泳槽中(图中未插入梳子)。安装好制胶模具(根据厂家说明书安装)ß按下表配方灌制分离胶(Separating Gel),分离胶浓度视目的蛋白的大小确定(7.5 - 15 %)(为两块胶用量)7.5 %10 %1

8、2 %12.5 %15 %DdH2O3.83 ml3.2 ml3.35 ml2.4 ml1.83 ml30 %丙烯酰胺2 ml2.64 ml4 ml3.36 ml4 ml1.5 M Tris-HCl pH < 8.82 ml2 ml2.5 ml2 ml2 ml10 % SDS80 ml80 ml100 ml80 ml80 ml10 % APS80 ml8050 ml80 ml80 mlTEMED8 ml8 ml5 ml8 ml8 ml总体积8 ml8 ml108 ml8 mlß分离胶上覆盖去离子水或0.1%SDS,使分离胶与空气隔绝ß待分离胶聚合后弃上层水相,用去离子

9、水洗,吸水纸吸干ß按下表配方灌制浓缩胶(Stacking Gel)4 46%ddH2O3.05 ml4.8 ml2.5530 %丙烯酰胺0.67 ml1.064 ml1.20.5 M Tris-HCl pH 6.81.25 ml2 ml1.2510 % SDS50 ml80 ml5010 % APS50 ml80 ml50TEMED5 ml16 ml5总体积5 ml(两块胶)8 ml(四块胶)5然后马上插上10孔或15孔梳子,待浓缩胶聚合后,小心拔掉梳子ß蛋白样本在100煮35 min使蛋白完全变性,用台式离心机稍离心ß把凝胶装在电泳装置上,内外槽均加入1

10、0;running buffer,然后加样加样顺序应该根据实验设计,以有利于论文发表的顺利,并记录加样的编号如:marker、A1、A2、A3、A4、A5、A6加的样本尽可能在中间,两边如有加样孔多余,可加1×上样缓冲液,以减少跑胶边缘效应ß100V电泳直到溴酚蓝条带到分离胶底部ß剪下一块与凝胶同样大小的硝酸纤维素膜(大小可根据经验),放在transfer buffer中平衡在硝酸纤维素膜右上角以圆珠笔做一个标记(如“1”、“2”表示不同的胶)ß卸胶(小心,防止胶的破碎及玻片的损伤),以硝酸纤维素膜外面的纸做标记将胶修切成一样大小在胶的左上角(加样开始的

11、那端)切一个小口标记方向(不能影响样本)ß把胶放在transfer buffer中平衡片刻ß取一容器,容器中倒入一定量的transfer buffer,在容器中安置好转移装置,在阴极面(黑色面)放上泡沫垫,然后放三层滤纸,把凝胶放在滤纸上,硝酸纤维素膜盖在凝胶上,然后依次放好三层滤纸,泡沫垫,扣好转移装置,加入冷却冰盒后开始转膜操作。转膜可采用恒流,常用200300mA,一般时间约为60-120分钟(根据目标蛋白的分子量大小而决定电压及时间)。也可以进行预实验,转膜一定时间后以考马斯亮兰染色胶,观察是否有残留的样本。所有的层面之间必须保证没有气泡,胶和膜必须完全吻合胶左上角

12、的小切口与膜右上角的标记应对在一起ß转膜结束后,取出硝酸纤维素膜或PVDF膜,在1´TBST缓冲液中短暂漂洗ß放入封闭液中,温和振荡30-60分钟ß把膜放入第一抗体中,温和振荡30分钟后放入4冰箱过夜或室温下反应2小时ß回收第一抗体,在TBST中洗膜30分钟,中间更换TBST 23次ß把膜置于第二抗体(HRP标记)中,温和振荡12小时ß在TBST中洗膜23小时,中间更换4次以上ß依据膜的大小,取一定量的ECL溶液A液和B液,将膜在溶液中准确温浴1分钟ß沥干膜,用保鲜膜包裹后,置暗盒中,曝光2秒60分钟&#

13、223;显影,定影或者 (这两块请补充细化)把膜置于第二抗体(荧光标记)中,温和振荡12小时ß在TBST中洗膜23小时,中间更换4次以上5数据分析:X光片用扫描仪扫描,然后用MetaMorph软件读integrated OD值6注意点:(1)在使用4×sample buffer时,应使缓冲液充分融解再使用,不能有沉淀;(2)建议蛋白样品小份分装,用一次取一份,避免反复冻融和煮样品,如需第二次使用已用过的样本,应同样用100水煮,时间为1min;(3)加样时每块胶应有相应的蛋白分子量标准和对照,并保持对照的始终一致。在抗原非常熟悉以后,可以适当减少蛋白分子量标准的使用以降低成

14、本;(4)加running buffer时内外槽不能贯通;(5)做电转移时,泡沫垫、滤纸、凝胶、硝酸纤维素膜之间不能留有气泡,每加一层都要赶气泡。(6)第一次做电转移,对于转移时间不能确定时,可将转移后的胶进行考马斯亮兰染色,如染不出蛋白条带,说明转移已完全,否则需延长转移时间;(7)膜与胶的大小必须一样,否则影响转移效率;(8)所有反应时间应根据温度的高低适当调整;(9)曝光及显影的时间可根据条带及背景的情况适当调整;(10)第二抗体反应以后洗膜一定要彻底。(11)在加过硫酸铵和TEMED之前溶液最好抽气,防止溶解在溶液里的分子氧在聚合时产生气泡使胶不均一。(12)过硫酸铵和TEMED的量应

15、根据室温和聚合情况而定。(13)分离胶聚合后最好在4ºC放置12小时后再使用,以使凝胶充分聚合,改善电泳时的分辨率。(这一步有争议,有人认为4ºC可以使SDS析出,影响分离结果)(14) 上样体积不要太多,否则会影响旁边泳道的最终结果。7问题与对策Western blot实验过程比较简单,但在整个实验过程可以受到多个环节的影响,导致没有结果或者条带较弱,也可以出现背景过高,影响结果分析,我在此抛砖引玉,希望大家能够根据自己的经验对我的内容进行补充,以便于大家都能做好,但最重要的是做每一步实验时都要非常仔细。(1)没有条带或者条带弱: 蛋白样本:ü 蛋白在提取可能被

16、降解:此时可以在胶上负载不同浓度的样本,跑胶后以考马斯亮兰染色,正常时条带很多,呈现梯子一样的条带,如果蛋白被降解,阶梯状条带不明显,并且可在条带上出现连续的片状(如扫把扫过)。ü 加样时漏出,加样不足:可请经验丰富的人加同样的样本作为对照。ü 目的蛋白表达过低,此时可用阳性对照样本,如脑内表达较低的目的蛋白可以寻找表达较高的组织用于对照。 转膜不完整:ü 在转膜过程中由于试剂或者转膜电流、时间等因素导致转膜不完整:可在转膜结束后对胶进行考马斯亮兰染色,观察是否有蛋白留在胶上。 一抗、二抗效价过低ü 由于一抗的效价过低导致没有结果,此时可检测一抗的效价,

17、将一抗以推荐浓度作为中间浓度,往高、低各稀释成不同的浓度,如1:200、1:500、1:1000、1:2000、1:5000等,取稀释液10 ml直接滴在硝酸纤维素膜上,做好标记(如下图),等干燥后进行封闭®洗膜®二抗孵育®洗膜®显影。观察哪个浓度可以出现较好的显影,可取稍高的浓度用于实验。ü 由于二抗的效价过低导致没有结果,此时可检测二抗的效价,同上将二抗以推荐浓度作为中间浓度,往高、低各稀释成不同的浓度,如1:200、1:500、1:1000、1:2000、1:5000等,取稀释液10 ml直接滴在硝酸纤维素膜上,做好标记,等干燥后进行洗膜

18、®显影。观察哪个浓度可以出现较好的显影,可取稍高的浓度用于实验。 ECL、显影液、定影液ü 如果怀疑ECL失效或者敏感性降低,可选择荧光显影进行比较;ü 如果怀疑显影液、定影液,可以进行GAPDH等在暗室内可肉眼看到明显荧光的目的蛋白进行排除。另外:ECL显影和荧光显影可以相互交叉进行,使结果更加漂亮。(2)背景过高: 蛋白加样量过高:此时可选择一个样本,加不同的蛋白量,如2、5、20、30、50 mg/孔,取一个合适的加样量。 一抗、二抗浓度过高,此时可以参考点膜的结果。 洗膜时间过短,可延长洗膜的时间。 封闭不够完全,可增加脱脂奶粉或者BSA的浓度,或者在脱脂奶粉与BSA之间重新选择,或者增加封闭的时间。 洗膜不均匀,尤其是在同一个容器内有多张膜时,容易叠加,相互影响,可以在洗膜时多做观察,以确保每张膜都洗得比较充分,或者分开在不同容器内洗膜。8主要参考文献:(1)Luo JH, Wang Y, Yasuda RP, Dunah AW, Wolfe BB. The majority of N-methyl-D-aspartate receptor complexes in adult rat cerebral cortex contain at least three different subunits

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