PCR仪原理及其应用

1、PCR仪的原理及其操作应用 1. PCR仪的技术原理 2. PCR仪的分类与应用 3. PCR仪的操作步骤1.PCR原理简介 PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶链式反应，主要用于DNA片段的体外扩增，基本原理类似于DNA的天然复制过程 ，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成。 PCR Cycle - Step 1 - Denaturation Template DNA by Heat (94oC)Target SequenceTarget SequencePCR原理示意图原理示意图模板模板DNA的变性：模板

2、的变性：模板DNA经加热至经加热至94左右一定时左右一定时间后，使模板间后，使模板DNA双链或经双链或经PCR扩增形成的双链扩增形成的双链DNA解解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备；备；PCR Cycle - Step 2 Temperature is lowered (Tm ) and primers anneal to target sequencesTarget SequenceTarget SequencePrimer 1Primer 253553533模板模板DNA与引物的退火与引物的退火(复性复性)：模板：模板D

3、NA经加热变性成单经加热变性成单链后，温度降至链后，温度降至55左右，引物与模板左右，引物与模板DNA单链的互补序列单链的互补序列配对结合；配对结合；PCR Cycle - Step 3 - At 72 o C Taq DNA polymerase catalyses primer extension as complementary nucleotides are incorporatedTarget SequenceTarget SequencePrimer 1Primer 253553533Taq DNAPolymerase引物的延伸：引物的延伸：DNA模板模板-引物引物结合物在结合物在

4、TaqDNA聚合酶聚合酶的作用下，以的作用下，以dNTP为反应原为反应原料，靶序列为模料，靶序列为模板，按碱基配对板，按碱基配对与半保留复制原与半保留复制原理，合成一条新理，合成一条新的的DNA 链。链。End of the 1st PCR Cycle Results in two copies of target sequenceTarget SequenceTarget Sequence每完成一每完成一个循环需个循环需24分钟，分钟， 23小时小时就能将待就能将待扩目的基扩目的基因扩增放因扩增放大几百万大几百万倍。倍。Target AmplificationNo. ofNo. Amplic

5、on CyclesCopies of Target122438416532664201,048,576301,073,741,8241 cycle = 2 Amplicon2 cycle = 4 Amplicon3 cycle = 8 Amplicon4 cycle = 16 Amplicon5 cycle = 32 Amplicon6 cycle = 64 Amplicon7 cycle = 128 Amplicon2.PCR仪的分类与应用 普通PCR仪：一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪，如果要做不同的退火温度需要多次运行。 梯度PCR仪：一次性PCR扩增可以设置一系列不同的

6、退火温度条件（温度梯度），因为被扩增的不同DNA片段，其最适退火温度不同，通过设置一系列的梯度退火温度进行扩增，从而一次性PCR扩增，就可以筛选出表达量高的最适退火温度，进行有效的扩增。主要用于研究未知DNA退火温度的扩增，这样节约成本的同时也节约了时间。 原位PCR仪：用于从细胞内靶DNA的定位分析的细胞内基因扩增仪，如病源基因在细胞的位置或目的基因在细胞内的作用位置等。是保持细胞或组织的完整性，使PCR反应体系渗透到组织和细胞中，在细胞的靶DNA所在的位置上进行基因扩增。 实时荧光定量PCR仪：在普通PCR仪的基础上增加一个荧光信号采集系统和计算机分析处理系统，就成了荧光定量PCR仪。其P

7、CR扩增原理和普通PCR仪扩增原理相同，只是PCR扩增时加入的引物是利用同位素、荧光素等进行标记，使用引物和荧光探针同时与模板特异性结合扩增。扩增的结果通过荧光信号采集系统实时采集信号连接输送到计算机分析处理系统得出量化的实时结果输出。普通PCR梯度PCR原位PCR荧光定量PCR四种四种PCRPCR仪示意图仪示意图 3. PCR的操作步骤 1.配置反应体系：引物、模板、buffer，dNTPs,酶，Mg2+,(如果是荧光定量PCR，则还有染料或探针）。 2.在PCR仪上设置程序：一般是94变性5min使模板充分变性,之后“94变性、退火退火（不同引物引物温度不同）、72延伸”共30-35个循环

8、，再72延伸10min， 使产物延伸完整，设置完程序后启动机器运行。 3.如果是常规PCR，则后面还有电泳实验，如果是荧光定量PCR则可以实时观察实验过程。PCR反应PCR反应条件PCR过程PCR的特点1234522557294时间（min）温度（）PCR反应PCR反应条件PCR过程PCR的特点适温延伸3高温变性1低温退火2重复13步2530轮目的DNA片段扩增100万倍以上DNA双螺旋DNA单链与引物复性DNA变性形成2条单链子链延伸DNA加倍模板DNA95PCRPCR的基本原理的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点50引物1引物2DNA引物PCRPCR的基本原理的基本原理PCR反应

9、条件PCR过程PCR的特点引物1引物2DNA引物72Taq酶Taq酶PCRPCR的基本原理的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点72第1轮结束第2轮开始PCRPCR的基本原理的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点955072TaqTaqTaqTaqPCRPCR的基本原理的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点72第2轮结束PCRPCR的基本原理的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点重复30轮后230=1,073,741,824模板DNA第1轮扩增第2轮扩增第3轮扩增第4轮扩增第5轮扩增第6轮扩增理想拷贝数=2n n 循环次数实际拷贝数=(1+x)n X 平均效率,

10、约为0.85 n 循环次数 最近自己做的PCR扩增实验1.提取样品中酵母菌的DNA2.配置好体系后用普通PCR仪进行扩增(所用引物是EF3和EF4)3.做琼脂糖凝胶电泳实验，并用凝胶成像仪观察DNA条带 用到的PCR扩增程序：(1)94 5min (2)94 45s 51 1min 72 2min 设置第二步共30个循环，最后72 保持10min PCR扩增程序设扩增程序设置置凝胶成像仪下凝胶成像仪下DNA条带图示条带图示1.PCR原理简介 PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶链式反应，主要用于DNA片段的体外扩增，基本原理类似于DNA的天然复制过程 ，其特异性

11、依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成。 普通PCR梯度PCR原位PCR荧光定量PCR四种四种PCRPCR仪示意图仪示意图 3. PCR的操作步骤 1.配置反应体系：引物、模板、buffer，dNTPs,酶，Mg2+,(如果是荧光定量PCR，则还有染料或探针）。 2.在PCR仪上设置程序：一般是94变性5min使模板充分变性,之后“94变性、退火退火（不同引物引物温度不同）、72延伸”共30-35个循环，再72延伸10min， 使产物延伸完整，设置完程序后启动机器运行。 3.如果是常规PCR，则后面还有电泳实验，如果是荧光定量PCR则可以实时观察实验过程。PCRPC