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文档简介

1、序列的提交/WebSub/?tool=genbankGenBank 序列提交要求序列提交要求向向GenBank提交的序列应该是由提交者确定和注释的新序列。提交的序列应该是由提交者确定和注释的新序列。来源于或用于构建非来源于或用于构建非GenBank 的第三方数据库的数据也可能用的第三方数据库的数据也可能用Bankit提交。提交。以下几种情形不允许提交到数据库以下几种情形不允许提交到数据库 序列长度小于序列长度小于200bp，除非它是完整的外显子、非编码，除非它是完整的外显子、非编码RNA （ncRNA）、微卫星或古）、微卫星或古DNA。人工拼

2、接的不连续的序列：例如拼接了多个外显子而没有内含子序人工拼接的不连续的序列：例如拼接了多个外显子而没有内含子序 列，或者内含子区域有误。列，或者内含子区域有误。仅有引物序列仅有引物序列仅有蛋白质序列仅有蛋白质序列单条序列标注多种分子类型，例如即标注为基因组序列，又标注为单条序列标注多种分子类型，例如即标注为基因组序列，又标注为mRNA序列序列表达序列标签（表达序列标签（EST），），ESTs应当通过应当通过dbEST系统进行提交。系统进行提交。基因组勘测序列（基因组勘测序列（GSS），），GSSs应当通过应当通过dbGSS系统提交。系统提交。序列标签位点（序列标签位点（STS），），STSs应

3、当通过应当通过dbSTSA系统提交。系统提交。GenBank序列提交需要的条件 通过登录系统注册MyNCBI 序列可以通过复制粘贴或文本形式上传（多条序列必须是FASTA格式） 提交序列公布的期限（是立即公布还是指定特定日期） 序列提交者、文章作者、题名等相应的参考文献等基本信息。 序列来源物种名称等描述信息 序列特征（例如CDS，gene，rRNA，tRNA，内含子，产物名称等）依次填入：名、姓、部门、机构、街道地址、城市、省份、邮编、国家、电话、传真、电子邮箱信息。点击继续 continue参考文献信息：填写序列提交者姓名、文章题名、发表状态等在该页面中，可以指定序列信息公布时间、说明序列

4、是否为16S rRNA，序列分子类型、拓扑结构、基因组信息完整性。分子类型分为基因组DNA，由cDNA到mRNA，基因组RNA，RNA前体，转运RNA，非编码RNA，小胞浆RNA，cRNA，其他RNA和其他DNA。拓扑结构为线性或环形。点击Continue后会跳出一个确认窗口，如果信息准确无误，则可以点继续，如果部分信息有误，则会指出错误位置。选择提交数据类型：Original 是由提交者直接提交，Third Party Annotation 是从其它数据库中第三方进行注释的序列。测序技术的选择传统的桑格的双脱氧测序方法，一般单条短序列测定都采用此方法。罗氏公司的高通量测序平台ABI公司的高通量测序平台线粒体线粒体线粒体：动质体线粒体：动质体质体：叶绿体、质体：叶绿体、apicoplast（原生动物（原生动物质体样细胞器）、有色质体样细胞器）、有色体、蓝色小体、

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