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文档简介
1、稳转慢病毒一、所需试剂1、慢病毒载体(具体信息见附录及质粒的扩增提取)(大肠杆菌-80保存2-3年,质粒-20保存2-3年,病毒液-80保存1年)(1)载体质粒:两端的LTR、剪切位点、包装信号以及抗性或荧光基因、gag基因5端350bp的序列及位于env序列中的RRE,含宿主RNA聚合酶识别部分(2)包装质粒(psPAX2):包含了pol、gag包装成分(3)包膜质粒(pMD2.G):用其他病毒的包膜蛋白代替了env基因.三种质粒共同转染产生不具有自我复制力量的病毒载体。2、包装细胞:293T细胞3、菌株:大肠杆菌,用于提取质粒4、转染试剂:XTREME-GENE(-20保存,不行分装),一
2、种脂质与其他组份构成的混合物5、浓缩试剂(配好后4保存,原材料室温保存):5X PEG8000/NaCl溶液(聚乙二醇):NaCl 8.766 g; PEG8000 50g溶解在200ml Milli-Q纯水中,高压蒸汽灭菌*也可直接从公司买来病毒液(-80封口膜封口冻存管保存,4保存3天):滴度一般为108TU/ml6、10mg/ml polybrene(-20分装保存):溴化己二甲铵。是带正电的小分子,与细胞表面的阴离子结合,提高慢病毒对细胞的感染效率,通常加入polybrene 能提高感染效率210 倍。有肯定细胞毒性,需要摸索浓度(110g/ml)7、无血清培育基:optimen8、贴
3、壁细胞(复苏后3代以上的细胞)9、puromycin:嘌呤霉素,用于筛选稳转细胞二、具体步骤<一>病毒包装与收集(中皿,转染步骤类似于瞬转)第一天1、种板,10×105个293T细胞,加入全培育基双抗DMEM 4-5ml,过夜2、配制5X PEG8000/NaCl溶液称取NaCl 8.766 g; PEG8000 50g溶解在200ml Milli-Q纯水中;121摄氏度 30min 湿热灭亡 30min;保存在4其次天1、配管试剂加样量/l推举量/l、g合计A管PLKO.1/pCDH3206psPAX21pMD2.G2Opti200B管XTREME-GENE6206Op
4、ti200A+B混合室温静置20min2、加入2ml全培育基DMEM3、将1加入2,孵育10h,换成5ml全培育基第四天第五天:1、9:00和17:00各收取一次5ml培育液,共20ml(-80保存)2、过滤:用孔径为0.45mm的过滤器除去上清中的293T细胞3、加入5ml 5XPEG8000/NaCl溶液,每30min-1h上下摇匀一次4、4过夜第六天1、4,3500rpm,20min2、弃上清,倒扣纸上静置1-2min,吸干残余液体3、加入120-150l PBS,缓慢吹打,以防形成气溶胶4、50l分装,-80保存。<二>慢病毒转染靶细胞前期预试验MOI(步骤同正式试验)(见
5、三2,直接订购病毒液时才需要)细胞种类DU145PC322RV1LNCaPRWPE-1MOI2422前期测病毒滴度(稀释法,还有一种qPCR法见资料)1、第一天:预备96孔板,每孔加入10000个293T,为每个病毒预备20个孔(稀释10个浓度,各2个副孔)。放入37,5%CO2培育箱中培育。2、其次天:在EP管中做10倍梯度稀释,连续10个稀释度。稀释方法如下:每种病毒预备10个1.5ml EP管,每管加入207µl培育液,往第一个管中加入23µl病毒原液,混匀后,吸取23µl加入其次个管混匀。依此类推,做十个稀释度(1010-8)。吸取96孔板中原有的培育基,
6、加入含稀释好的病毒液。并做好标记。3、第三天:换液4、第四天:观看结果并计算滴度在荧光显微镜下观看结果,并数出最终两个有荧光的荧光细胞克隆数。假设为X和Y,则滴度(TU/ml)=(X+Y×10)/2/X孔的病毒液的含量(µl )×1000。(前面算出的是没l病毒量,所以乘于1000)第一天:1、种板(12/24孔板)需其次天为50%-70%,大约12孔板1×105细胞种类种板数收获细胞数DU145PC322RV1LNCaPRWPE-1其次天1、预备病毒液(可在第一天做):在冰上融解2、预备完全培育基和 Polybrene 混合物(1:1000-1:200
7、0稀释,终浓度在5-10g/ml之间),加入相应培育板中(6孔板2ml,12孔板1ml,24孔板500l)3、加入浓缩病毒液(12孔板30l-50l)(假如是直接购买病毒液需依据MOI确定病毒液量加入病毒液,自己包的病毒可以)4、培育过夜,对polybrene毒性敏感的细胞在4-6小时候换液第三天1、对细胞进行换液第五天1、用药物进行稳定株的筛选(具体筛选药物依据载体内的基因定,用氨苄青霉素0.5g/ml-10g/ml)2、需设置空白对比(未处理细胞加入相同浓度氨苄青霉素,党对比全部死光为筛选周期)第六天之后(依据筛选周期)1、换液传代2、观看GFP报告基因确定转染效率,或用qRT-PCR确定
8、转染效率三、留意事项及学问点1、名词解释(1)病毒感染复数(multiplicity of infection MOI):含义是感染时病毒与细胞数量的比值,即为每个细胞被多少个有活力病毒所感染2、慢病毒摸索时加入梯度(具体见自己的说明书)3、慢病毒的储存与稀释:可以将病毒临时放置于4 保存;如需长期保存请放置于-80(病毒置于冻存管,并使用封口膜封口) A病毒可以存放于-80 6个月以上;但假如病毒储存时间超过6个月,我们建议在使用前需要重新滴定病毒滴度 B反复冻融会降低病毒滴度:每次冻融会降低病毒滴度10%;因此在病毒使用过程中依据每次的使用量进行分装。4、慢病毒载体示意图1载体质粒(PLK
9、O.1 抑制载体,PCDH-GFP+puro过表达载体):(1)5LTR:long terminal repeat即长末端重复序列,不编码蛋白质,但含有启动子,增加子等调控元件(2)包组信号:LTR-通过包装细胞的RNA聚合酶转录为RNA,通过信号起始包装(3)启动子、酶切位点和抗性基因(amp氨苄青霉素puro嘌呤霉素)(4)stuffer:目的基因插入位点(慢病毒载体可插入5kbp左右)(5)GFP:green fluorescent protein绿色荧光蛋白(6)WPRE:Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) Posttranscriptional Regulatory Element 肝炎病毒转录后调控元件。转录后可形成三级结构,促进基因的表达(7)cPPT/CTS: 逆转录病毒顺式作用区域,其中该cPPT和CTS区域诱导三链结构(更新于2018.11)2包装质粒(1
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