




版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
1、GaussView界面教程1】界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的 输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。除了可以自己构建输入文件外, Gview还可读入Chem3D HyperChemf口晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可 以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在 里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要 绘制的图形。FiIe EdH View Calculate Re5-jlt? Windows HP菜单栏?File 1主要功能是建
2、立,打开,保存和打印当前的文件?(Edit完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等?【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等?Calculate 直接向Gaussian提交计算?Results 接收并显示Gaussian计算后的结果?WindowjJ控制窗体,如关闭、恢复等?Help帮助快速工具栏Carbon Tetrahedral【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以 选择需要绘制的元素以及价态。 Element FragmentsS区因0300ShJ同N _回回IE叵旧Rb 5r Y I Zr 丽 Mo Tc Ru Rh P
3、d Ag Cd In 5n Sb Ta I Xe f " J卬回口网|t&h - |同3 回pt刈阳恒耻"Ei晒归同小打局叵局团圆国园I1回网包组网回回四回1回回回 画叵回叵国叵回叵回回回1Sslsct Carbon Fragniant::一=二=一/ J孤鸿图影Atom | 71 寸、【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物 残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基【左面第四个】 氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户 自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处n V用为向1田为% I
4、 ."J这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。艺b言昌陶,三割D fi'Xl兮 凝蚓弃3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】构建分子这里以构建一个问氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明1、开启 Gview2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯
5、环。单击左键,可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口;按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子的角度;滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;按住shift键,左键单击不放移动鼠标,可以移动分子;当工作窗口内有多个分子时(在构建大的分子时,这种情况很容易出现) 用Shift+Alt+鼠标左键组合,移动想要移动的分子;用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度;双击 七f图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】元素,回到工作窗 口在苯的任意一个【H】上单击,使之变成【F】双击X图标,从链姓库中选择【乙基】(第一个),然后点击间位上的H即可至此,分子式已经构建完成,Gv
6、iew存储个人常用分子的功能,双击view上的扃1 图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可。(注:我的程序此项功能不行,用户自定义基团)1-kR事“.电FkJLe¥r hfnibt A fulitr Fmwm,12 口Be, 50 e-Jetrgr, ne-utral, single!FWl_呼”阻/ UkHJfSrEFJL Edit Me/ Cakul- 加“* Windowi khlpf 田a rTk0u«ht aD /iXm/ScraKlV flr 电工中: :M.ZOI IJ.f 五HI查看分子坐标:单击Gview界面的总图标,查看分子的坐标至此,我们保存一下
7、我们构建好的问氟苯乙烷分子, 在绘图界面右键单击【File】【Save】然后选择保存路径即可。GaussView教程【3】向Gaussian提交计算上一讲我们已经构建好了一个问氟苯乙烷分子,现在打开问氟苯乙烷分子。点击 Gview界面上的【Calculate -【Gaussian Calculate Setup 筝心<|从对话框中我们可以选择许多参数,下面依次选择一下ClVI - GCaLcuLet ion Setupntla:lille Cui edMa洒i/ds.c EFvBb-ewnme£iivii tyCJkir-sfi/flillt : U 1Jot Tjjie Ha
8、tHdI Titis | Lft 0Ghp备1ra | 叼“( 诉口 |cl-nticr> I JL<d 1科Ei ui kAlI'Il IioziaL Ksywor-ls :Slhene : IpCDefauiC Schme)三 4ft|Subrsi L . . j Q.11 nk LsunJi QaruzeL | IdilL.,. | Eelaiii He faults, j加口 P【Job Type工作类型:【Energy能量】|【Optimization 优化】|【Frequency频率】|【Opt+Freq 优化+频率】|【Scan扫描】| Stability稳定
9、性】|【NMRg磁】,这里我们选择【NMR核磁【Method】方法:每种计算模式都提供了若干种方法,这里选择默认值即可Title】题目:这项可以根据自己的项目自行命名Link 0 给检查点文件命名其它选择默认即可选好后点击【Submit!提交至Gaussian,并保存。(最好存到安装文件所在磁盘)系统会询问是否提交至 Gaussian,选择【OH , Gaussian会自动开启并计算, 计算时间因硬件配置而异计算完毕后系统会提示关闭Gaussian,点击【是】计算完毕后会生成两个文件,.log的是系统日志,便于查看计算结果。这里我 们选择.chk文件【OH接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子, 表面上没什么不同,但这次我们 可以预言它的许多性质了,在 GView的主界面点击【Results -【Summary可以看到刚才的计算总结,点击【View File 1可以看到日志文件。彷 G2:MLVJ - Gaussian Calculation Summary因为我们刚才选择计算模式是 【NMR核磁,所以我们点击【Results 【NMR, 随即我们
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 素质教育学习心得体会模版
- 钢结构课程设计心得体会模版
- 保洁工作个人心得体会模版
- 三晋卓越联盟·2024-2025学年高三5月质量检测卷(25-X-635C)数学(B)
- 浙江省六校(杭州二中 温州中学 金华一中 绍兴一中 舟山中学 衢州二中)联盟2025届高三5月模拟预测卷语文试卷+答案
- 小家电安规基础知识讲义
- 初中学生家长教育孩子心得体会模版
- 凝血功能异常的临床护理
- 心梗护理方案
- 高血压活动总结模版
- 2025届云南省楚雄市重点名校初三一模物理试题(海淀一模)试卷含解析
- 记叙文阅读理解解析(课件)-部编版语文五年级下册阅读理解
- 2025年行政执法证资格考试必刷经典题库及答案(共130题)
- 超星尔雅学习通《红色经典影片与近现代中国发展(首都师范大学)》2025章节测试附答案
- 装修陪跑合同协议书8篇
- 土地测量服务投标方案(技术方案)
- 服务流程操作说明手册
- 七下18《井岗翠竹》公开课一等奖创新教案
- 公司增资扩股方案设计报告
- 气管套管滑脱的处理流程
- 基于数字孪生的SW水库数字化平台建设研究
评论
0/150
提交评论