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文档简介
1、精品1总 RNA 提取(1)液氮研磨或冰上匀浆实验材料;先将1ml Trizol 加到离心管中待用(2)将研磨好的样品加到离心管中混匀,室温放置5 min ;打开离心机预冷(3) 加 200 L氯仿,振荡 15 sec ,室温放置 3 min ,分层;(4) 4 o C,12,000 g,离心 15 min ;(5) 取上清,加 500 L异丙醇,混匀,室温放置 10 min ;(6) 4 o C,12,000 g,离心 10 min ;(7) 弃上清,加 1 mL75% 乙醇,漂浮洗涤沉淀,振荡充分;再用100% 乙醇清洗(8) 4 o C,7,500 g ,离心 5 min ;(9) 弃上
2、清,离心,用枪吸取多余液体,放在超净台里干燥后, 加 50 LDEPC水, 80 o C 保存。此操作中所用到的器皿均需经过DEPC 灭活 RNA 酶处理。提取的总RNA需经 RNA 电泳检测质量,并用紫外分光光度计测定浓度。OD 260 值为核酸的吸收值,OD 280 值为蛋白的吸收值, OD 260/280 值在 1.8-2.0 间一般说明该核酸蛋白含量在允许的范围内, 可正常使用;此外还有 OD 230 值为多糖和酚类的吸收值,比较干净的核酸OD 260/230 值能达到 2.2 左右。 RNA 浓度计算公式: 总 RNA 浓度(g/mL)=A 260 ×稀释倍数×4
3、0 。-可编辑-精品2 反转录 /cDNA第一链的合成纯化 RNA 以去除基因组DNA ,操作按 TaKaRa 公司的 PrimeScriptRTreagent with gDNA Eraser(Perfect Real Time)说明书进行。其体系为:Total RNA1 g5× gDNA Eraser Buffer2 LgDNA Eraser1 LRNase Free dH 2 O补齐至 10 L条件为: 42 o C,2min ;RNA 纯化后,即可进行反转录。其体系为:5×PrimeScript Buffer 2( for Real Time )4LPrimeScr
4、ipt RT enzyme mix1 LRT Primer Mix1 L上一步的反应液10 LRNase Free dH 2 O补齐至 20 L操作条件为:(1) 37 oC 放置 15 min ; (2) 85 o C, 5 sec ; (3) 4 o C 保存。3 PCR按 TaKaRa 公司的 Premix Taq Version 2.0 操作, PCR 反应体系如下:-可编辑-精品Premix Taq25 L模板5 L引物 1 (10M)1L引物 2 (10M)1LddH 2O18 LPCR 反应条件为: 94 °C预变性 5min ;94 °C变性 30s , 5
5、3 °C退火 30s ,72 °C延伸 30s ,循环 36 次; 72 °C延伸 10min 。PCR 反应完毕,取5L反应产物进行1% 琼脂糖凝胶电泳(若割胶回收则用 10 L反应产物)。4 基因克隆及测序4.1PCR 产物切胶回收将 PCR 产物用 1% 琼脂糖凝胶进行电泳,在紫外灯下观察并切下预期大小的 DNA 片段。使用 TIANGEN 公司的 Universal DNA Purification Kit割胶回收试剂盒进行纯化,步骤如下:(1) 平衡吸附柱: 向吸附柱 CB2 中(吸附柱放入收集管中) 加入 500 L平衡液 BL, 13,400
6、15;g 离心 1 min ,倒掉收集管中的废液,吸附柱CB2 重新套回收集管中;(2) 按 100 mg agarose 胶加入 100 L溶液 PC,置于 50 o C 中 10 min 左右,中途混匀几次,至胶完全融化;(3) 将样品倒入一个吸附柱 CB2 中(吸附柱放入收集管中) ,室温下 13,400×g 离心 1 min ,倒掉收集管中的废液,吸附柱CB2 重新套回收集管中;-可编辑-精品(4) 向吸附柱 CB2 中加入 600 L漂洗液 PW (加乙醇),室温下 13,400 ×g离心 1 min ,倒掉收集管中的废液,吸附柱CB2 重新套回收集管中;(5)
7、重复上一步骤;(6) 将吸附柱 CB2 放入收集管中,室温下 13,400 ×g 离心 2 min ,尽量除去漂洗液,将吸附柱置于室温放置数分钟,彻底晾干;(7) 将柱子套入一新的灭菌 1.5 mL 离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50 L 洗脱缓冲液,室温放置2 分钟, 13,400 ×g 室温离心 2 min ,收集到的洗脱液即为回收的DNA 纯化液;(8) 取 5L 的纯化液体进行 1% 琼脂糖凝胶电泳,以检查纯度,并测量溶液中 DNA 含量。4.2 目的片段与载体连接(1) 胶回收产物与 T 载体连接体系,参考 Takara 公司 pMD18-T 载体的试剂盒说明
8、书。在灭菌的 0.5 mL 离心管中配制如下溶液( 10 L:)回收 DNA4 LLigation Solution5 LpMD18-T Vector1 L(2) 16 oC 反应 30 分钟,所得产物保存于 4 o C 冰箱备用。4.3 连接产物转化 E.coli DH5(1) 将 5 L 连接产物加入到 100 LE.coli DH5 感受态细胞中,轻轻旋转离心管混匀内容物,冰上静置 30 min ;(2) 42 oC 水浴热激转化 90 sec ,立即放回冰上,放置 3 min ;-可编辑-精品(3) 每管加入 500 L LB 培养基(室温放置), 37 o C 160-180 rpm振荡培养 45-60 min,使菌体复苏并表达抗性基因;(4) 在含有 Amp ( 100 g/mL)的选择性平板上加入60-100 L 菌液,用无菌涂布棒轻轻涂布均匀后,用Parafilm膜封好;(5) 将培养皿正放, 37 o C 约 50 min ,待液体全部吸收后,倒置平板继续培养 10-16 h 。4.4 转化子的筛选及鉴定(1) 用无菌枪头挑取 LB 平板上 3-5 个单菌落,分别接种到 3.5 mL LB 液体培养基中(含 100 g/mL Amp ), 37 o C,16
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