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文档简介
1、Real-TimeRT-PCR常见问题分析1 1 .某一孔荧光信号特别强问题:同一批样品,其中某一个荧光信号特别强?原因:试剂配制时反应液没完全溶化,导致探针量在一管中增多;试剂配制时没有充分混匀致各管中各成分的量不同;也可能是 PCRPCR 仪热槽被荧光物质污染,这时就要清除热槽中的污染;2 2 . .扩增曲线有一向上或向下的尖峰MaMa问题:扩增曲线有一向上或向下的尖峰?原因:反应过程中电压不稳定;可能在 2020 循环左右仪器有停下或者仪器有开盖,使得光线突然增强;如果尖峰向下,也可能是卤素灯老化所致,这时应更换;DataandStandardsAllDyesLogScale歹AutoS
2、caleSmooth:3.3.部分样本扩增效率过低问题:部分样本扩增效率过低?原因:提取液残留,一定程度抑制了 PCRPCR 反应;反应液未严格取量混匀或分装不均匀;试剂失效;4.4.阴性对照或空白对照翘尾,可能原因:1 1、模板提取环境有污染。2 2、模板提取操作有污染。3 3、配液过程存在污染。问题:阴性对照或空白对照翘尾?原因:模板提取环境有污染;模板提取操作有污染;试剂配制过程存在污染;问题:直线型扩增曲线?原因:探针部分降解(探针降解原因:a.a.探针反复冻融一一稀释的探针可在 4c4c 保存至少3 3 个月,应避免反复冻融;b.b.探针在光线下暴露时间太长);反应液中有 PCRPC
3、R 抑制物;6 6.没有扩增曲线Component问题:没有扩增曲线?原因:PCPC 替数设置错误,在设计循环参数时将荧光信号读取时间设在反应的第一步,即stagestage1 1 阶段;电脑设定了自动休眠;AmpPlot问题:扩增曲线有一个下滑阶段?原因:基线选取范围不对,可试着将基线范围改大一些,这一问题常因试剂质量所致;8 8.扩增曲线断裂扩增曲线断裂问题:扩增曲线断裂?原因:基线选取范围不对,基线终点大于 CtCt 值,这通常是由于模板 DNADNA 浓度过高所致,因CtCt 值15,15,而基线范围仍取 3 315,15,其中包含部分扩增信号,导致标准差偏大,阈值过高,解决办法:减少基线终点至 CtCt 值前 4 4 个循环,重新分析数据9.9.样品浓度跨度过大样品浓度过高,至阳性样品扩增曲线在后面循环中呈一向下的直线,原因及解决办法同“扩增曲线断裂”。山坡形扩堵
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