如何查文献和读文献

1、做一名科学家做一名科学家 - -从查文献和读文献开始从查文献和读文献开始Jianbing Yan (严建兵）严建兵）National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement Huazhong Agricultural U 如何提高专业英文阅读能力如何提高专业英文阅读能力请每位学生每周关注科学和自然。（细胞）。如果时间有限，每周花一个小时读读这两种周刊里的文章标题以及与自己研究领域相关的科研论文的abstract,即可！在时间充足的情况下，可以细读科学和自然里的新闻及科研论文。如果该科研论文有“News

2、 & Views”或“Perspectives”来介绍，请先读这些文章，这类导读的文章会提炼问题，在读具体的科研论文时，最重要的是了解文章的主线逻辑主线逻辑。当遇到一些实验或结果分析很晦涩难懂时，不必花太多时间深究，而力求一气把文章读完。http:/ 如何提高专业英文阅读能力如何提高专业英文阅读能力对个别重要的文章和自己领域内的科研论文，应该精读。科学论文的阅读水平是循序渐进的。每个人开始都会很吃力，所以你有这种感觉不要气馁。坚持很重要。科研训练的一个重要组成部分就是科研论文的阅读。每一个研究生必须经过严格的科研论文阅读的训练。在实验室内也要有定期的科研论文讨论（Journal Clu

3、b）。一旦入了门，就要学会critical reading。不要迷信已发表的论文，哪怕是发表在非常好的期刊上。要时刻提醒自己：该论文逻辑是否严谨，数据是否可靠，实验证据是否支持结论，你是否能想出更好的实验，你是否可以在此论文的基础上提出新的重要问题？如何开始？如何开始？从一个感兴趣的科学家开始从一个感兴趣的科学家开始从一个感兴趣的科学问题开始从一个感兴趣的科学问题开始从一次高水平的学术会议开始从一次高水平的学术会议开始从自己的课题开始从自己的课题开始从一个感兴趣的科学家开始从一个感兴趣的科学家开始 蒲慕明所长关于文献选读有过经典的评述，蒲慕明所长关于文献选读有过经典的评述，他建议我们读文献不但

4、是要读懂内容，而他建议我们读文献不但是要读懂内容，而且要搞清来龙去脉，简单说就是且要搞清来龙去脉，简单说就是4个个W（Who, When, Where and Why)，谁在什么，谁在什么时候哪里为什么做这个工作。还有一点就时候哪里为什么做这个工作。还有一点就是选择性阅读，如今的文献量可以说浩如是选择性阅读，如今的文献量可以说浩如烟海，没有人也不需要读完本领域的所有烟海，没有人也不需要读完本领域的所有文献，要学会如何去辨别经典。文献，要学会如何去辨别经典。Doebley从1993在Curr Opin Genet Dev（2）发表第一篇综述以来，到最近CELL的一篇，一共写了7篇左右的综述，大都

5、围绕着进化这个话题尤其是分子进化，如果大家有心去看，就会发现他看问题的角度是越来越高，越来越清晰，这当然符合事物发展规律。而就玉米进化而言，2004年Annu Rev Genet（3）上的一篇无疑是最通俗易懂，但有最全面的一篇。如果有了这些背景知识的累积，再去读他的研究文献就会更加容易，同时也更容易理解他为什么和在什么背景下写这个综述。比如1998他在plant cell(4)的一篇关于转录水平的基因调节和物种进化综述，就在暗示作者对此前首次克隆的QTLtb1(5)可能有更深入的认识，果不其然随后作者1999在Nauture（6）的文章对该QTL的功能进行了深入分析，而该基因的作用方式在前面综

6、述里其实已经有很好的铺垫。 在我们对该领域有了初步了解后，我想任何一个读者都应该有这种兴趣去问，他是如何进入该领域的又为什么选择这个领域呢，他目前都在做些什么呢？前篇已经谈到过Doebley进入分子进化与玉米打上交道完全是机缘巧合，而他毅然放弃人类考古学的学位去读植物分类学，然后在拿到植物学的博士学位，作完博士后后又抓住机会毅然重新去读分子生物学的博士学位。而事实也证明这种全面的知识背景为他在该交叉领域里游刃有余提供了重要的保证。关于这一点，建议有兴趣的去读2004年他当选美国科学院院士后，PNAS上关于他的传记和评论（7）。 Doebley的研究历程给我们这样一个简单的理念，简单的实验也能回

7、答高深的科学问题。而对生活和科学的执著追求无疑是从平凡走向不平凡的最低保证。从一个感兴趣的从一个感兴趣的“科学问题科学问题”开始开始 图文并茂的告诉你，这样伟大的结合有什么生物学属性？图文并茂的告诉你，这样伟大的结合有什么生物学属性？ 是谁进入大学，让这个大学的女生报名人数狂增是谁进入大学，让这个大学的女生报名人数狂增85%？ 在众多美女中找到自己的在众多美女中找到自己的right one, 和一个转录因子去找自和一个转录因子去找自己的目标基因有什么不同？己的目标基因有什么不同？ 而一个平民变成万人瞩目的皇后，需要发生怎样的表观遗传而一个平民变成万人瞩目的皇后，需要发生怎样的表观遗传学变化？比

8、如任意一只工蜂都有可能成为母后，关键看你吃学变化？比如任意一只工蜂都有可能成为母后，关键看你吃什么。什么。 每对恋人都曾许下海枯石烂的诺言，但一夫一妻到底是基因每对恋人都曾许下海枯石烂的诺言，但一夫一妻到底是基因的作用，还是道德使然？的作用，还是道德使然？ 到底有没有忠贞不渝的爱情？到底有没有忠贞不渝的爱情？ 而英国皇室的爱情悲剧恍然发生在昨天。而英国皇室的爱情悲剧恍然发生在昨天。从一次高水平的学术会议开始从一次高水平的学术会议开始细胞生物和遗传学细胞生物和遗传学老学科但焕发了新活力,人工染色体将是一个研究热点,但竟然没有划在这个领域.转座子和表观遗传学转座子和表观遗传学研究热点,尤其表观遗传

9、学,什么都可以与这扯上.生物信息学生物信息学/数据库数据库/分析工具分析工具大会分了3个部分围绕这个主题展开讨论,许多新的算法，工具纷纷亮相,大规模的EST,CDNA,突变体库,尤其454测序结果的分析生物和非生物抗性生物和非生物抗性尽管目前还停留在重要基因的克隆和QTL定位和克隆上,但其重要性不言而遇.发育和生理遗传学发育和生理遗传学与其他模式生物比,玉米相关研究还比较滞后,主要围绕在突变体基因的克隆和功能分析上.其中小RNA的机制研究可以预期是热点。通过宏观综述给自己定位通过宏观综述给自己定位B publication)引文？引文？来源文献？来源文献？来源出版物？来源出版物？从一篇高质量论

10、文出发从一篇高质量论文出发探寻该领域发展道路探寻该领域发展道路Cited References越查越旧越查越旧Times Cited 越查越新越查越新Related Records 越查越深越查越深分析：分析：学科分布、发展趋势等学科分布、发展趋势等Cited ReferencesRelated RecordsTimes CitedCitingn Science Citation Index(科学引文索引科学引文索引)，数据回溯到，数据回溯到1900年，年，我校图书馆正式购买我校图书馆正式购买n 涵自然科学、工程技术、生物医学等所有科技领域涵自然科学、工程技术、生物医学等所有科技领域n 网络版

11、收录网络版收录7700多种期刊；每周收录多种期刊；每周收录2.5万多篇文献万多篇文献认识认识Web of ScienceSCI数据库概况数据库概况解读：解读：SCI在中国在中国 一个文献数据检索途径一个文献数据检索途径 一个学科发展了解途径一个学科发展了解途径 一种评价体系一种评价体系 一个量化统计的数据来源一个量化统计的数据来源一般检索一般检索通过主题、著者、期刊名称或著者地址等检索通过主题、著者、期刊名称或著者地址等检索引文检索引文检索通过被引著者、被引通过被引著者、被引来源和被引文献发表来源和被引文献发表年代等进行检索；只年代等进行检索；只可使用算符可使用算符“OR”输入引文著者，输入引

12、文著者，姓姓+ +空格空格+ +名的名的首字母首字母输入引文的输入引文的刊名缩写刊名缩写、书名缩书名缩写写或或专利号专利号输入四位数字的年代输入四位数字的年代高级检索高级检索允许用户直接键入专业的检索命令 例：TS=(nano* SAME “rare earth”) NOT AD=(china OR Japan)允许用户对已完成的检索策略进行组配检索可直接输入检索式序号；例：#1 AND #2 NOT #3允许将预存的检索策略列入检索式中打开“Open Saved history”即可用你所保存过的检索式进行检索WOS的检索方式的检索方式Topic包含文献标题、摘要、作者关键字、附加关键词例：

13、 neural network* AND pollut* Author可检论文的任意一位作者；姓 + 空格 + 名的首字母；可利用系统人名列表 例：龚旗煌gong qh钱永健(Roger Yonchien Tsien)Tsien RY Group Author采用全称、缩写或简称；可利用系统团体作者列表例： Aberdeen Lung Cancer Group HIV AIDS PRS TEAMPublication Name输入期刊的全称或缩写；可利用系统期刊列表例：PHYSICAL REVIEW LETTERSPHYS REV LETTAddress每个作者的地址都会在记录中列出；可利用系

14、统地址缩写列表；常用“SAME”运算符来检索作者地址为某大学某院系的记录例：Peking university, Department of Chemistry检索式： peking univ SAME chemWOS常用检索字段常用检索字段(Search Field )逻辑算符AND、OR、NOT优先算符( )；括号中嵌套越深的检索式越优先执行；括号中嵌套越深的检索式越优先执行通配符*零或多个字符零或多个字符例：使用例：使用“sul*ur”将检索将检索sulphur和和sulfur?零或一个字符例：使用“colo?r”将检索color和colour$只代表一个字符例：使用“en$obalst

15、”将检索entobalst和 endobalst近似检索SAME限定两检索词必须出现在同一句话中例: peking univ SAME chem“ ”如果要精确检索某个短语，应将其放置在引号内例: “molecular biological sensor model”WOS的检索语言及技巧的检索语言及技巧注：要使用半角符号注：要使用半角符号n追踪溯源：检索某个课题的综述文献追踪溯源：检索某个课题的综述文献n快速锁定本课题相关的高影响力的论文快速锁定本课题相关的高影响力的论文n分析研究发展趋势分析研究发展趋势n了解某特定课题在不同学科的分布情况了解某特定课题在不同学科的分布情况n了解与自己研究方

16、向有关的机构了解与自己研究方向有关的机构n密切关注该研究领域的顶尖研究小组所发表的论文密切关注该研究领域的顶尖研究小组所发表的论文nCited reference search帮助获取思路，激发研究思想帮助获取思路，激发研究思想让让WOS帮助你做论文选题及调研帮助你做论文选题及调研 ( OR )( )AND( OR )玉米株高数量性状位点玉米株高数量性状位点Web of Science检索使用示例检索使用示例Plant heightMaize corn“Quantitative trait locuslls”“QTL” AND二次检索二次检索结果排序结果排序结果分析结果分析引文跟踪服务引文跟踪

17、服务查看期刊影响因子查看期刊影响因子检索跟踪服务检索跟踪服务利用数据库的利用数据库的管理功能管理功能，跟踪课题最新进展，跟踪课题最新进展l如果你想追踪一篇你关注的文献，可定制如果你想追踪一篇你关注的文献，可定制“引文跟踪服务引文跟踪服务”l如果你满意这次检索，可定制如果你满意这次检索，可定制“检索跟踪服务检索跟踪服务” n 基本指数说明基本指数说明l影响因子影响因子(Impact Factor)l快引指数快引指数(Immediacy Index)JCR数据库数据库使用说明使用说明l某刊在前2年发表的文章在JCR出版年平均每篇文章的被引次数l反映刊出期刊论文的影响力l被WOS收录3年以上期刊才能计算其影响因子JCR数据库数据库影响因子影响因子(Impact Factor)Science 被引用次数 发表文章 2007年 23248 886 2006年 26523 885 合计 49771 1771IF：49771/1771=28.103JCR数据库数据库影响因子影响因子(Impact Factor)算法：算法：JCR前前2年发表文章在年发表文章在JCR出版年被引用次数出版年被引用次数/这这2年发表文章总数年发表文章总数l某刊在JCR出版年发表的文章同年被引的总次数除以该年在该刊上发表的所有论文数l反映：哪些期刊