药学中的生物技术和方法2015-1-基因工程和干细胞技术

1、IV-Gene and stem cell technologyGene technology Gene Clone Gene Analysis and Identification Gene Transformation Gene EditingGene cloneGene libraryGenomic DNAmRNADNA fragmentscDNARestrictionenzymeDNA libcDNA libligationligationReversetranscriptionvectorTools for gene clone Restriction endonuclease DN

2、A polymerase and DNA ligase Vector: plasmid or l-phage Host cells PCR and RT-PCRPCR (Polymerase Chain Reaction)cDNA合成与RT-PCRMultiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles (MALBAC) for Single cell genomic sequencing 高通量DNA测序DNA analysis I: DNA hybridizationprobeDNA libpositive clonesScreen

3、ing the genomic library of trypanosoma cruziDNA analysis II: 实时荧光定量PCR技术（Real Time PCR）DNA测序: 基因分析的终极技术第一代第二代第三代第一代：第一代：Sanger法（法（DNA双脱氧链终止法-末端距离分析法）第二代：合成测序法第二代：合成测序法-高通量测序（碱基时序法）高通量测序（碱基时序法）左起：谢晓亮、乔杰、闫丽盈、汤富酬2014年9月19日，世界首例经MALBAC基因组扩增高通量测序进行单基因遗传病筛查的试管婴儿在北京大学第三医院诞生，这标志着我国胚胎植入前遗传诊断技术已处于世界领先水平。 2代半：

4、 Single-molecule real-time (SMRT) sequencing technology 单分子实时测序技术第三代：单分子第三代：单分子DNA读序（纳米孔技术）读序（纳米孔技术）蛋白质分析技术和蛋白组学Sample reserve蛋白序列蛋白序列物种物种转录后修饰转录后修饰蛋白质相互作用蛋白质相互作用基因导入系统 感受态细胞：直接转染载基因质粒 细胞模型：脂质体、电转染和病毒载体 整体动物：病毒载体 病毒载体： 插入整合型：逆转录病毒载体。但其存在潜在的安全性风险； 非整合型：慢病毒载体、腺病毒载体脂质体转染法慢病毒转染法植物细胞的基因转染基因编辑方法 已克隆的基因：PC

5、R法 细胞内基因： 1：PCR法 2：RNAi基因沉默法 3：sRNA指导定位编辑法PCR基因点突变技术RNAi基因沉默法实用中的shRNA基因沉默技术CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)/Cas9基因编辑技术报告基因技术I：荧光蛋白标签钱永健，下村修，Martin Chalfie报告基因技术II：信号转导检测Biotech. for Stem cells 干细胞具有自我更新和多能分化能力， 主要包括胚胎干细胞(ES) 、间充质干细胞(MS)和诱导多能干细胞(iPS)等 iPS由于其在疾病模型及再生医

6、学中的应用能力与胚胎干细胞类似，且不存在伦理问题，逐渐成为这一领域的新星。干细胞的诱导分化山中伸弥（Shinya Yamanaka），毕业于大阪市立大学。2006年首次利用4个转录因子Oct4、Sox2、c-Myc和Klf4将小鼠成纤维细胞重编程为胚胎干细胞样的多能干细胞，并验证了其具有与胚胎干细胞类似的多元分化能力和自我更新能力，从而建立小鼠诱导多能干细胞系。2012年，山中伸弥获得诺贝尔生理或医学奖。 诱导多能干细胞iPSiPS：方法和问题 Yamanaka四因子的经典iPS细胞诱导体系： 向体细胞转入4个转录因子Oct4/ Tet1 、Sox2、c-Myc和Klf4 化学小分子iPS细胞

7、诱导体系:丙戊酸、Parnate、 Repsox、FSK、DZNep和CHIR-99021 其中CHIR、FSK和Repsox 能够激活Sall4、Sox2 的表达，而DZNep能激活Oct4 的表达 iPS瓶颈问题 重编程效率低和培育周期长。四因子体系的诱导效率不足1%，化学小分子体系仅0.05% 免疫原性问题 基因不稳定性问题。iPS中存在着染色体的异常和更多的小突变 致瘤性问题干细胞技术和药物开发-I：干细胞用于药物筛选和临床前评价干细胞技术和药物开发-II：病人干细胞干细胞和药物开发-III：肿瘤干细胞（CSC/TSC） 肿瘤干细胞可通过细胞间肿瘤干细胞可通过细胞间通讯诱导正常干细胞向

8、肿瘤通讯诱导正常干细胞向肿瘤干细胞转化干细胞转化肿瘤干细胞（CSC/TSC）的特征 四个重要特征：1、自我更新的能力；2、多分化潜能；3、高增值能力；4、耐药性 多药耐药（multidrug resistance， MDR）是导致肿瘤治疗失败的主要原因之一。肿瘤干细胞一般处于静止期，高表达ABC外排转运蛋白，使化疗药物在肿瘤干细胞上无效。 白血病干细胞是 表面抗原鉴定：CD133+ 和CD44+ Warning：乳腺癌干细胞表型CK8+,14+,18+;Vimentin+，EGFR+与乳腺干细胞表型相同；脑肿瘤干细胞表型CD133+、musashi-1+、 Sox2+、melk+、 PSP+、

9、 Bmi-1+和nestin+ 与神经干细胞完全一致。 功能学方法鉴定： 细胞微球形成能力 多向分化能力 体内成瘤实验肿瘤干细胞靶向治疗的思路思考题什么是基因克隆？基因库有哪些种？分别有哪些特点？PCR的原理和应用有哪些？单细胞基因组扩增的技术有哪些？原理和特点是什么？什么是核酸杂交分析？如何用核酸杂交分析筛选目标基因？Real-time PCR的原理和技术要点是什么？第一代基因测序技术的原理和技术要点是什么？什么是合成测序法？其如何实现高通量测序的？谢晓亮和乔杰做了什么胚胎植入前遗传诊断技术的工作的？意义是什么？单分子基因测序的方法都有哪些？纳米孔测序技术的原理和应用是什么？蛋白质组学的技术路线和方法是什么？如何与基因组学研究相呼应？基因转染的方法有哪些？技术要点是什么？有哪些应用的风险？RNAi基因沉默技术的原理和技术要点是什么？目前的方法有哪些？如何用PCR技术制备定点突变的基因？什么是CRISPR/Cas9基因编辑法？其原理和技术要点是什么？有哪些应用？