pubmed检索策略

1、2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室1网络医学文献数据库PubM2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室2PubMed NCBI网站简介n1988年，美国的参议员 Claude Pepper 发起， 1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心（NCBI）nNCBI的任务: 建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并进行先进方法的研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。 促进全世界范围内生物技术信息收集的合作2022-6-16复旦大学图书馆

2、文献检索教研室3NCBI主页2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室4NCBI生物信息整合系统All databasen检索大分子生物学数据n获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列；n获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列；从核酸序列翻译到蛋白质的序列；n获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数据及大分子模式（MMDB）等其他生物信息数据库检索。nPubMed书目文献数据。2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室5PubMedn特点：1.免费提供题录和文摘2.提供与原文的网址链接(部分免费获取） 3.提供检索词自动转换匹配4.操作简便、快捷2022-6

3、-16复旦大学图书馆文献检索教研室6PubMed主要收录nMDENLINE：为美国国立医学图书馆创建的医学文献数据库n收录内容：MEDLINE主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献，包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学，基础研究和临床护理、公共卫生、卫生政策发展或者相关教育活动的内容。2000年起增加收录对生物医学的实习者、研究员和教育家至关重要的专业内容，包括生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室7PubMed 主要收录MEDLINE数据：n文献来源：MEDLINE数据来源于

4、全世界70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊，这些期刊大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee (LSTRC)评估挑选,以及美国国立医学图书馆和数据协作采集专家（各专业协会）推荐。近年数据涉及37种语种，回溯至1950年的数据涉及60种语种。数据库47%为美国本土出版的文献，90%为英文文献，79%的文献有著者撰写的英文文摘，（以上数据根据2007年11月数据库提供）。nMDENLINE数据题录标有PubMed-indexed for MDENLINE2022-6-16复旦大学图书馆文献

5、检索教研室8PubMed主要收录In process数据:n1996年8月开始，PubMed每天收录由MDENLINE的期刊出版商提供的尚未经规范处理的数据，该库中的记录只有简单的书目信息和文摘。该库中的数据每周一次转入MDENLINE。当进入MDENLINE时就会被标引MeSH（数据库规范控制词表详见MeSH Database内容）词、文献类型及其它数据。记录有 PubMed -in process的标记。 2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室9PubMed主要收录nOldMDENLINE 1950-1965年间的MEDLINE文档，收录发表的200多万篇文献，没有MeSH字段和摘

6、要，每条记录标有PubMed-OLDMDENLINE for Pre1966 nPubMed not MDENLINE 是PubMed 收录MDENLINE不收录的文档。每条记录标有PubMed。2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室10基本检索输入框特征栏提供辅助检索功能侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索执行检索PubMed主页主页2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室11n在检索栏中输入:n一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索）如：placenta growth oxygen genbacev on著者姓名,姓在前,名首字母在后。如: s

7、mith abaun刊名输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式如：clin exp immunolson布尔逻辑运算式： (运算符须大写）如 ：Stem ti AND neuroscience二.PubMed 基本检索规则2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室12多个检索词输入Moore AM撰写的有关接触性皮炎的文章2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室13刊名的输入（字段限定来源出SO）2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室14著者检索moore amau2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室15检索提问输入仅检索有文摘的文献2022-6-16复旦大学图书

8、馆文献检索教研室16n截词检索：treat*n强迫短语检索：“brca 1”（不再自动转换匹配和扩展检索）二.PubMed 基本检索规则2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室17n自动扩展检索n系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索，如：n输入“hypertension therapy,系统自动将高血压的药物治疗、饮食疗法，二.PubMed 基本检索规则2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室18PubMed记录字段说明文摘文摘第一著者单位地址第一著者单位地址出版商提供文献识别号出版商提供文献识别号著者群著者群版权说明版权说明参考评论文献参考评论文献合著者合著者文献参考评论文献参

9、考评论定稿版定稿版校样版校样版输入日期输入日期输入完成日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室19电子出版日期电子出版日期文献出版日期文献出版日期数据加入数据加入PubMed日期日期文献勘误文献勘误参考文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部著者姓名全部调研者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称作为文章主题的著者全称文献相关注释文献相关注释基金编号基金编号基因符号基因符号期编号期编号资助调研者资助调研者资助调研单位资助调研单位国际标准期刊号国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号美国立医学图书馆识别号期刊全称期刊全称2022-6-16复旦大学图书馆文献

10、检索教研室20最后修订日期最后修订日期规范词表词规范词表词规范词确立日期规范词确立日期系统组织的文摘系统组织的文摘版权拥有者版权拥有者题录提供机构的识别号题录提供机构的识别号病史相关与原始记录病史相关与原始记录其他关键词其他关键词提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构数据提供者机构数据提供者机构文章总页数文章总页数出版商提供数据时间出版商提供数据时间期刊出版国期刊出版国数据库文献编号数据库文献编号2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室21作为主题词的个人姓名作为主题词的个人姓名出版状态出版状态文献类型文献类型出版模式（纸张或电子）出版模式（纸张或电子） 参考文献数参考文献数已撤回的文

11、献已撤回的文献酶或化学物质代码酶或化学物质代码正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文献初版文献修订和再版的文章修订和再版的文章子专题文档子专题文档太空署提供的数据太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号分子序列访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写标准期刊缩写文献标题文献标题翻译标题翻译标题更新文献更新文献文献正在更新文献正在更新期刊卷号期刊卷号2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室22三.PubMed的辅助检索nLimits（检索限制选择）n字段限制：著者、刊名、篇名、滤过（filter

12、原文收藏处）等n数据输入时间：默认检索可回溯到1950年，限制选择30天-10年n7种文献类型限制n7种语种限制n12种子文档：(01年新增2种Space Life Sciences and Bioethics ）2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室23作者限定作者限定添加作者姓名输入框添加作者姓名输入框清除限定清除限定期刊限定期刊限定作者姓名索引选词作者姓名索引选词多作者逻辑多作者逻辑匹配选项匹配选项全文、免费全文、摘要限全文、免费全文、摘要限定定日期限定日期限定2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室24出版日期限定出版日期限定入库日期限定入库日期限定研究对象研究对象人人/

13、动物限定动物限定研究对象性别限定研究对象性别限定语种限定语种限定子文档限定子文档限定文献类型限定文献类型限定研究对象年龄限定研究对象年龄限定2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室25检索字段限定检索字段限定执行检索执行检索清除所有限定清除所有限定2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室26Previw/index（检索策略预览）n浏览检索式n改变检索式n（可用检索式编号#1 OR #2）n浏览索引（index）2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室27检索预览检索预览检索历史检索历史索引加词检索索引加词检索2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室28n检索式回顾n编

14、辑检索式n如#3 AND childHistory（检索史）2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室29检索历史回顾检索式检索时间检出篇数检索式编号可替代检索式进行输入检索如：#5 AND #62022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室30Details （匹配过程）n显示检索词转换匹配运算详细过程n用途：转换、确定规范词n如：liver cancer liver neoplasmsn修改检索策略2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室31检索明细检索明细数据库匹配过程数据库匹配过程检索词转换检索词转换显示用户输入的检索式显示用户输入的检索式2022-6-16复旦大学图书馆文献

15、检索教研室32修改检索策略n检索框中随时修改n“Limit” 、 “Preview/index”、 “History”、 “Details”功能实现。2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室33四.其他检索1.Mesh Databasen功能：n确定规范检索词n查看词义注释、树状结构表n副主题词、扩展、主要主题词 例：欲查2002-2008年肾衰竭（renal failure）饮食疗法(diet therapy)疗效观察(treatment outcome)的相关文献？2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室34PubMed基本检索植物生长素相关文献nplant *TI AND g

16、row*TI AND factor*TI2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室35PubMed基本查找植物生长素结果2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室36MeSH查找植物生长素相关文献2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室372022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室38MeSH 查找植物生长素结果2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室39详细结果2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室40检索分析n一般检索逻辑关系粗浅、修饰概念匹配不特定、检索词涵盖不全面n规范检索逻辑关系紧密、修饰概念匹配特定、下位词检索全面2022-6-16复旦大学图书馆文献

17、检索教研室41基本检索肾衰竭的饮食疗法2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室42结果中有些主要内容并非肾衰竭2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室43MeSH Database 规范主题词数据库检索规范主题词数据库检索肾衰竭饮食疗法课题肾衰竭饮食疗法课题1.输入检索词输入检索词3.点按规范词可获详细注解点按规范词可获详细注解2.执行浏览执行浏览2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室44主题词注释主题词注释可选副主题词可选副主题词限定作为限定作为主要主题主要主题词匹配词匹配不进行下位词扩检不进行下位词扩检2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室45该主题词所替代的该

18、主题词所替代的非规范词形式非规范词形式主题词树形结构主题词树形结构表：显示该词的表：显示该词的学科隶属关系学科隶属关系2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室46通过通过MeSH Database检索的结果，其中检索的结果，其中41篇综述文献篇综述文献检出结果更为专指2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室47进一步检索肾衰竭综合疗效观察（treatment outcome）2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室482.期刊数据库（Journal database）:n通过输入刊名、缩写名、等浏览期刊文献。n提供电子原文的超链键。2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研

19、室49期刊数据库检索2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室50输入待检期刊名得出期刊详细信息2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室513.临床警示（Clinical Alert）n1991年开始，NIH美国卫生健康研究所不定期公布能引起死亡率和致病率升高的临床试验项目重要新闻稿。2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室52五.检索结果输出n显示检索结果n保存检索结果n保存检索策略n打印检索结果2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室53显示字段选择（Display)nAbstract report:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PM

20、ID或UI、摘要。nCitation Report: 显示除上述内容外，加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。nMEDLINE Report: (最完整，有标识符）2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室54显示格式选择显示格式选择2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室55显示记录选择n单一记录：著者姓名n所有记录：选display旁的格式，及每页显示记录数n选定记录: 方框内打钩2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室56可获电子全文的链接可获电子全文的链接2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室57输出格式选择（send to）选中题录（或文摘）后nText当前网页文本格式，用浏览器文件保存nFile所有记录纯文本格式保存，用对话框保存nClipboad 剪贴板，暂存需下载记录，多项检索后一起保存。 最多允许存储500条，保留8小时。 nEmail: 通过邮件发送nRSS Feed：检索结果的RSS订阅，通过安装网络聚合器可接收最新检索结果，不必再次检索。nOther：全文传递服务等申请，需帐号、收费2022-6-16复旦大学图书馆文献检索教研室582022-6-1