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文档简介

1、 PubMed PubMed PubMed是美国是美国NLM所属的国家所属的国家生物技术信息中心(生物技术信息中心(NCBI)开发的一开发的一个以个以Web方式向用户提供服务的生物方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统,医学文献检索系统,是是出版商提供的书目信息出版商提供的书目信息 PreMedlineOLDMEDLINE(1950-1965)MEDLINEl收录范围:收录范围:来源于美国和世界上来源于美国和世界上7070多个国多个国家和地区、家和地区、5050种语言的种语言的7395种种(截止到现截止到现在在)权威权威生物医学生物医学及相关学科期刊,内容及相关学科期刊,内容涉及生物医学各个

2、领域;涉及生物医学各个领域;85%以上以上原文为原文为英语,英语,80%记录有文摘,记录有文摘,5%免费全文。免费全文。目前记录已达约目前记录已达约2200万条,约万条,约40万篇万篇/年年 。l回溯时间:回溯时间:1966年至今年至今。l记录中有记录中有indexed for MEDLIEN标记标记l学科范围学科范围:l基础生命科学基础生命科学临床生命科学临床生命科学 l生物科学生物科学 解剖学解剖学l组织学组织学化学与药物化学与药物l心理学心理学社会医学社会医学l农业农业 医技设备学医技设备学 l医技工业学医技工业学 医学信息学医学信息学使用词表:使用词表:MeSH(医学主题词表)(医学主

3、题词表)l 是一种由是一种由正在加工处理正在加工处理中的文献记录组中的文献记录组成的数据库,这些新记录还未被或正在标引,成的数据库,这些新记录还未被或正在标引,暂时存放在暂时存放在PreMEDLINE数据库中。数据库中。每天更每天更新新,经过标引(增加主题词、文献类型、数据,经过标引(增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段)以后转入库存取号等字段)以后转入Medline,一旦记一旦记录被转入到录被转入到Medline数据库,就被从数据库,就被从PreMEDLINE数据库中删除。数据库中删除。记录中有记录中有PubMed-in process的标记。的标记。Pre-Medline最新信息最新信

4、息MedlineNew DataCollectPubMedProcess一周以后一周以后 出版商提供的书目出版商提供的书目信息信息(Publisher-Supplied Citation ) 出版商直接向出版商直接向PubMed提供的非提供的非Medline收录的电子刊物,记录标有收录的电子刊物,记录标有Record as supplied by publishers标标记。(如:记。(如:Science或或Nature中的地质学中的地质学文献等)。文献等)。 标记不同,出自分库亦不同标记不同,出自分库亦不同Nucleotide:DNA序列数据库序列数据库Protein:蛋白质序列数据库蛋白质

5、序列数据库Genome:基因组序列数据库基因组序列数据库Structure:分子结构模型数据库分子结构模型数据库OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库人类孟德尔遗传学在线数据库PMC: PubMed中心,免费中心,免费全文期刊检索全文期刊检索 与与NCBI其它数据库的链接其它数据库的链接3.特点特点|获取生物医学权威期刊最多 世界上70多个国家的7395种权威期刊|多种检索方法,多条检索途径|时效性极强(每周更新)|回溯年代久远(1950年至今)|利用MeSH作为转换词表,标引质量高|部分文献可以免费获取全文|检全率、检准率高免费进入免费进入PubMedPubMed途径:途径:http:/ ht

6、tp:/ /PubMed /sites/entrezl主页结构主页结构PUBMED提供了词汇自动转换功能:提供了词汇自动转换功能: MeSH转换表转换表期刊转换表期刊转换表短语表短语表作者姓名索引作者姓名索引逻辑运算符检索逻辑运算符检索(1)逻辑运算符: OR、AND、NOT 运算顺序:ORANDNOT,可用()改变检索词的处理顺序。(2)截词符:*。eg: cell*:cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词的文献

7、。(3)利用字段标识符进行限定检索: 检索式格式:检索词A字段标识B,检索在字段中含有检索词A的文献。 如: hepatitisTI,smith AU,cellTA。(4)“ ”,将短语做为不可分割的整体进行检索。 如:“OXYGEN FREE RADICALS ”注意:注意:AND 必须大写、必须大写、 和和“ ”必须为英文或中文半必须为英文或中文半角。角。Pubmed简单检索实例简单检索实例例一例一 查找有关查找有关“肝癌和肝炎的关系肝癌和肝炎的关系”的文献,英文的文献,英文 “liver cancer ” 和和 “hepatitis” 检索结果显示检索结果显示显示检索策略显示检索策略l例

8、二例二 查找作者查找作者 Hemila h著作的文献著作的文献在西文文献里,著者的署名一般名在前姓在后,在西文文献里,著者的署名一般名在前姓在后,例例:著者著者“Henry Hemila”应转换成应转换成“ Hemila h”,后加著者字段限定来检索,后加著者字段限定来检索,注意:姓在前,名在后注意:姓在前,名在后 姓全称,名缩写姓全称,名缩写检索框检索框预览预览检索史检索史限定检索限定检索30个字段Limits (限定)限定)Publication Types:有有7种类型种类型Languages:提供常用的提供常用的7种语种种语种Ages:共有共有13个年龄段个年龄段Gender:男性、女

9、性男性、女性Human or AnimalSubsets(子集):子集):11个主要子集个主要子集Dates:可检索可检索1965年至今的文献年至今的文献限定检索限定检索索引检索索引检索PubMed高级高级检索实例检索实例 例例: : 查找关于查找关于“锌对于锌对于2岁岁婴儿婴儿(即出生(即出生至至23个月个月)成长的作用成长的作用”(要求时间(要求时间200020002002008 8)的英文文献)的英文文献 步骤一,确定关键词步骤一,确定关键词Zinc Infant Growth,把它们输入检索框。把它们输入检索框。 步骤二,限定时间。点击步骤二,限定时间。点击。在其中的。在其中的Publ

10、ication Date的输入框内输入的输入框内输入FROM2000 TO2008 . 步骤三,限定语种。在步骤三,限定语种。在Languages下拉菜单下拉菜单内选择内选择English。lMeSH Database:l例例1:从主题途径查找:从主题途径查找FK506副作用副作用l例例2:从主题途径查找从主题途径查找肾移植肾移植的文献的文献l例例3:从主题途径查找阿司匹林治疗高血压的:从主题途径查找阿司匹林治疗高血压的文献文献l检索流程检索流程l第一步:主题分析第一步:主题分析 英文转换英文转换lFK506 adverse effectslkidney transplantation点击点击

11、MeSH Database Mesh界面界面 输入检索词输入检索词 GoFK506第二步:第二步:选定该主题词选定该主题词 主题词轮排表主题词轮排表点击该主题词点击该主题词 主题词细节屏主题词细节屏 主题词轮排主题词轮排提示相关词提示相关词主题词轮排表主题词轮排表第三步:第三步:主题词细节屏主题词细节屏(主题词词义注释、副主题词、主题词词义注释、副主题词、加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构)加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构) 选择合适的副主题词选择合适的副主题词选择加权或不扩展选择加权或不扩展 send to 主题词细节屏主题词细节屏主题词词义注释主题词词义注释主题词细节屏主题词细节

12、屏副主题词选择副主题词选择主题词词义注释主题词词义注释加权检索加权检索不扩展检索不扩展检索曾用词曾用词药理作用药理作用树状结构树状结构曾用词曾用词入口词入口词树状结构树状结构药理作用药理作用 选择发送方式选择发送方式Search Box with ANDSearch Box with ORSearch Box with NOT 第四步:第四步:search box 点击点击 search PubMed 检索结果检索结果search box题录格式界面题录格式界面逻辑组配(逻辑组配(#4 and #6)l例:检索利用阿司匹林治疗高血压的文例:检索利用阿司匹林治疗高血压的文献。献。l分析:本课题包

13、含两个主题词,即阿司分析:本课题包含两个主题词,即阿司匹林(匹林(aspirin)aspirin)和高血压和高血压(hypertension)(hypertension),阿司匹林(,阿司匹林(aspirin) aspirin) 组配副主题词治疗应用(组配副主题词治疗应用(theraputictheraputic use)use),高血压应组配副主题词药物疗法,高血压应组配副主题词药物疗法(drug therapy)drug therapy),两条检索式之间用,两条检索式之间用andand联接。联接。 Pubmed主题词检索的功能:主题词检索的功能: (1)理解词义和收入词表的时间)理解词义和

14、收入词表的时间 (2)限定副主题词限定副主题词 ,提高查准率。提高查准率。 (3 3)加权检索加权检索,提高查准率。提高查准率。 (4)了解树形结构了解树形结构, ,扩展检索,扩展检索,提高查全率提高查全率 (5 5)了解同义词,提高查全率。)了解同义词,提高查全率。 lJournal Database (期刊数据库期刊数据库)l 可输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号(ISSN)检索特定期刊的编目信息;l检索: PubMed中收录关于高血压(hypertension)的期刊有哪些?l引文匹配器(Single Citation Matcher) nursing,2008,38(12):61 Pu

15、bMed | 1、检索结果的显示与标记| 2、检索结果的保存及定购 检索结果显示检索结果显示默认为题录格式默认为题录格式每页显示每页显示20条记录条记录结果显示格式结果显示格式每页显示记录数每页显示记录数结果排序方式结果排序方式纯文本方式显示纯文本显示记录纯文本显示记录文摘显示格式文摘显示格式MEDLINE格式格式可链接到可链接到SpringerLink数据库数据库获取全文获取全文 ,但是是收费的但是是收费的可链接到可链接到PubMed中心获中心获取免费全文取免费全文 全文链接图标全文链接图标选择选择“File”,可完成将记,可完成将记录保存为文件;录保存为文件;选择选择“clipboard”,可将记,可将记录保存在剪贴板;录保存

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