分子生物学常用基本词汇表

1、英文名词中文名词解释A ( Aden i ne )腺瞟吟作为碱基的两种喋吟中的一种。act i ve S i te活化位点蛋白质三维表面催化作用发生的区域。a 1 i g nment比对为了确定两个同源核酸或蛋白质序列的累计 差异而进行的配对称为比对。a 1 i g nment Of a 1 i g nments比对的比对即比对的对象不是简单的序列，而是序歹J的 比对。al 1e1es等位基因一个基因的不同版本。a 1pha Carb Ona碳在氨基酸中与侧链（R-基团）相连的中心碳 原子。alter native SPI iCi ng可变剪接从一个单独的hnRNA生成两个或多个mRNA 分子

2、的过程。ami no term inus (N-termi na1)氨基端（N端）在一个多肽中，具有自由氨基的分子端，对 应于基因的5一端。an ti-parallei反向平行表示相反的方向；在双链DNA中，这意味 着如果一条链是5,到3,的，则其互补链方 向是3'到5'的。base Pa i r碱基对（1在双链DNA中喋吟和喀咤之间的相 互 作用（特别指A和T之间，G和C之间）；（2）双链DNA序列长度的基本单 位。beta turnsB转角在反向平行的B折叠片中，当B链反 转方向的时候蛋白质内部形成的u型结 构Bioi nformatics生物信息学应用信息科学的理论、方法

3、和技术，管 理、分析和利用生物分子数据。B i ocomput i ng生物计算本书中特指用计算机技术分析和处理生 物 分子数据。BaSiC Loca1Alig nment SearCh Tool ( BlaSt)基本的局部比对搜 索工具（Blast ）一种常用的序列数据库搜索工具。blott i ng and hybr i d i zat i On印迹和杂交将分子（通常是核酸分子）从凝胶转移 到膜上，接着用绑定有特定感兴趣的分子 的标记探针进行洗脱的过程。bootstrap test自举检验对置信程度进行量化的检验。branch and boundmethod分支约束法一种空间搜索方法，通过

4、约束条件减少搜 索空间，提高搜索效率。bran CheS分支在系统发生树中，通过分支连接两个节 点。C ( CytOSine)胞口密咤作为碱基的两种喀咤中的一种。CAAT boxCAAT 盒大多数真核启动子具有的一段短序列，其片 段模式为C-A-A-T ,通常出现在转录 起始位 点上游80个核甘酸的地方。许多因子可以 与CAAT盒结合。CarbOXy term i nus竣基端在多肽链中，含有粉酸基团（一CooH）的 分子端，对应于基因的3l端。CDNA(Comp 1ementaryDNA)CDNA (互补DNA)通过逆转录酶从RNA模板合成的DNAOCDNA 1ibraryCDNA文库从mR

5、NA序列中产生的所有DNA序列的 集 合。这种类型的文库只包含编码蛋白质的 DNA （基因）。Cen tra1 dogma中心法则从基因的核酸序列中提取信息并以此合成蛋 白质的过程（DNA? RNA? PrOtein ）。Character特征在系统发生树中，具有有限状态数的特征。Charged amino acid带电氨基酸在一定的生物PH值下，带有正电或负电的 氨基酸。ChrOmat i n染色质在真核生物细胞核内部由大量DNA以及 与此 相关的组蛋白组成的近似均匀混合物。chromosome染色体在原核生物，包含一个细胞基因组的DNA分 子称为染色体。在真核生物中，与蛋白质复 合在一起、

6、包含大量遗传信息的线型DNA分子。Cl One克隆无性繁殖，如生物体克隆、基因克隆等。CIO ning克隆在类染色体载体中插入特定的DNA 一段，使得它们可以在活细胞中得以保存并复制。COd i ng Seque nee编码序列DNA序列中为蛋白质编码的部分。COdOn密码子基因编码部分的二核昔酸组合，对应于一个 特定的氨基酸。Comp 1eme ntary互补的(1 )通过氢键连接的核甘酸对(G和C; A和T; A和U)；( 2 )核昔酸链的反向平行对。COmPUtat i Ona 1Molecular Bi01Ogy计算分子生物 学主要研究分子生物学数据的分析方法，开发 分析工具。COn

7、format io n构象蛋白质的空间构象。COnSen SUS Seqlle nee一致序列在两个或多个同源序列的每一个位置上多数 出现的核昔酸或氨基酸组成的序列COn SerVed Seqlle nee保守序列在进化过程中基本保持不变的核酸与蛋白质 序列，它们往往与特定的功能相对应。Co nt i g连续交叠群基因组测序过程中将许多短的序列片段链接 成很长的连续片段。COnV erge nt evo1ut i o n趋同进化指相似基因型或表型性状的独立进化。例 如，眼睛在各种生物体(如哺乳动物、软体 动物以及昆虫)中独立进化，结 构各异。core fold核心折叠构成蛋白质空间形状的基本模

8、式。CPG i s1 a ndCPG岛在哺乳类动物基因组中的一个500bp到 3000bP的区域，该区域中的二核昔酸CPG的 含量比其他区域的正常水平要图。通常，与 此相关的是真核生物管家基因的启动子区 域。CrySta1晶体由分子的规则排列组成的固体结构。dege neracy简并性指某些氨基酸可以被一个以上的二联密 码子编码的特性。den atured prote i n变性蛋白质指蛋白质因为受热作用或者去污剂或 尿 素等化学作用而失去了正常的三级 结构 和四级结构的结果。deoxyr ib Onll cleic acid (DNA)脱氧核糖核酸 (DNA )由相连的核甘酸组成的双链生物二

9、聚 体，其核昔酸含有脱氧糖基。DNA是遗传的分子基础。d i pept i de二肽由一个肽键连成的两个氨基酸。disulfide bond二硫键二硫键是蛋白质中两个半胱氨酸侧链 之 间形成的化学键。DNADNA参见脱氧核糖核酸。doma i n域（结构域）指蛋白质结构中相对独立的、具有特定 功能的空间区域。dot PlOt点阵图对两条序列进行图形化比较的方法。图 形中的一系列的斜线对应于序列相似的 区域。dyn amic PrOgram mi ng动态规划一种可以有效地探求一定复杂问题的各 种可能的解决方案的程序；它将一个问 题合理分解成一些小的子问题，然后 利 用部分计算解得到最终答案。f

10、ami Iy家族在整个长度范围内有多于50 %的氨基酸enhanCer增强子可以与真木亥转录因子特异性结合的DNA序 列 片段。增强子序列可以在任何一个方向上起 到逐渐增加转录水平的作用。en Zyme酶一种生物催化剂（通常是蛋白质），能通 过 降低活化能使特定的化学反应可以更快地进 行。EST ( EXPreSSedSeqlle nee tags )EST表达序列标 签从CDNA的5，或3,端获取的短的DNA 片段。euchromat i n常染色质指真核生物中组蛋白高度甲基化（乙酰 化？）并且DNA低度甲基化的开放染色质。exhaust i ve SearCh穷举搜索对问题所有可能的解进行

11、评估。exon外显子一个hn RNA分子的各个部分，它们被剪接后 连在一起形成mRNAoexpress i On prof i 1e表达谱基因在不同时空的表达模式。序列相同的蛋白质称为一个豕族。fold折叠通常和术语“结构模体”有近似的含义，但 是特别暗示在两个或更多的蛋白质中具有 相 似二级结构的大区域。fourfold dege nerate Site四重简并位点指那些改变一个核昔酸为任何其它二个中的 一个都对核糖体将氨基酸插入到蛋白质没有 影响的密码子位点。G ( Guanine)G （鸟瞟口令）两种喋口令中的一种。gap Pen a 1ty空位罚分为了减少序列比对中出现的空位，对空位

12、进 行减分的操作。gaps空位在两个具有共同祖先序列的比对中，为了反 映插入或删除所引入的一个或一些破折 号。GC COn te ntGC含量在DNA序列中，核昔酸G、C的组成相 对于 A、T的比例。gele1ectrophores i s凝胶电泳指在电场的作用下，使带电分子穿过聚丙 烯 酰胺、淀粉或者琼脂糖凝胶，从而根据 其大 小和带电性进行分离的过程。gene基因DNA或RNA中，代表特定功能的某一段核 昔 酸序列；一种遗传的功能单元，它控制 着一 个或多个性状的传递和表达。gene content基因内容一个基因组所包含的所有基因称为该基因 组 的基因内容。gene express i

13、On基因表达利用存储在DNA中的信息来合成RNA分 子， 进而生成相应蛋白质的过程。gene i de nt ificati on基因识别利用各种方法识别基因组中的基因序列。gene on to logy基因本体论关于基因和蛋白质知识的标准词汇，是今后 实现各种与基因相关数据的统一、进行数据 转换、开展数据挖掘的基础。gene order基因次序基因在染色体上的排列顺序。gene tree基因树基于同源基因分析得到的系统发生树。gen et i c map遗传图谱以具有多态性的遗传标记为“路标”，以遗 传学距离为图距的基因组图谱。genome基因组一个生物体全部遗传物质的总和。geno mic

14、s基因组学研究基因组序歹J,研究序与功能的关系， 研究基因组中所包含的遗传信息。geno mic 1 ibrary基因文库包含有基因组DNA插入的克隆片段集合。geno type基因型一个个体或群体全部或部分的基因组成。globa1 a 1i g nment全局比对在全局范围内对两条序列进仃比对打分的方 法。GU-AG ru1eGU AG规贝U这是一条与真核生物蛋白质编码基因相关 的规则，说的是RNA内含子序列5,端的起 始两个核甘酸总是5-GU-3;并且 其3,端的 最后两个核苦酸总是5'-AG-3'oha i rp i n turn发夹环在RNA链中自身反转允许形成分子 内

15、碱 基配对的位置。HaSh tab 1eHaSh 表一种数据结构，可以存储多个数值；不 像矩阵要用整型索引获取存在其中的 数，hash表可以用任何类型的值（包括 字符串）作为索引。Hidden MarkOV Mode 1s(HMM)隐马尔柯夫模型（HMM）在序列分析中常用的一种数学模型。heterochromat i n异染色质指转录停滞、紧密包裹着的染色质； 和高度DNA甲基化以及低度的组蛋白乙 酰化有关。heur i st i c methods启发式方法反复试验，利用经验解决问题的一种方 法。homo 1ogs同源序列具有公共祖先的序列。hor i z On ta1 gene tran

16、Sfer基因水平转移基因从一个物种传递到另一个物种的过 程。虽然病原体和转座子通常被疑似为 导致它的原因，但是基因这种运动的机 制仍然未知。HumanGe nom eDrOjeCt, HGP人类基因组计划通过全球合作，绘制人类基因组的全 部 序列图谱。housekeep i ng gene管家基因发育过程中在任何时间、在任何器官都 图度表达的基因。H-P (hydrophob i c-po1 ar) mode 1H-P （疏水极性） 模型以固定半径的单个原子表示蛋白质中的 一个氨基酸残基的简单网格模型。hydroge n bond i ng氢键由于极性共价键的作用，使得电荷作用 发生轻微分离而

17、形成的分子相互作用。hydroph i 1 ic亲水的很容易在水性溶剂中溶解；字面上理 解，就是和水易处的。hydrophobic疏水的难以和水分子相互作用，字面上就是厌 水的。hydrophobic amino ac i d疏水氨基酸含有一个全部由碳和氢组成的R基团的 氨基酸；它不可能和水分子形成氢键hydrophobic co 11 apse疏水折叠将一个多肽链折叠成一个压缩的构象， 从而使疏水残基远离溶剂的过程，简单 的说，是由疏水作用而引起的肽 链折® Oin del插入或删除插入或删除。i n ferred an CeStOr推断祖先通过系统发生树推断而得到的祖先。n fe

18、rred tree推断树对三个或三个以上的同源序列的系统发生关系 的描述，是它们真正关系的一个近似。i n format i ve有信息（位点）在简约性分析中的提供有用信息位点；与此 对应的是无信息位点。i n group内群（或内部物 种）一个物种或一个分歧不大的物种系列；与此相 对应的是外群。1n hibitor抑制剂任何可以降低酶促反应速度的物质。in itiati on comp 1 ex起始复合物一系列自身相互作用的转录因子形成复合 体，作用与一个基因的启动子区域，从 而促 进基因的转录启动。in itiator (1 nr) Seqllence起始J予列真核基因中与转录起始位点密切

19、相关的核 昔 酸；在人类中，该一致序列是51-YYCARR-31。i n Sert i on Seqllence插入序列指除了自身转座需要外不再包含有任何信息的 转座子元件；当被插入到一个基因中，它将破 坏其正常的结构以及基因的功能。nterna1 node内部节点在一棵系统发生树中，不对应真正数据的节 点，这样的节点代表两个或多个独立豕系的公 共祖先。in tr i ns ic terminator固有终止子在原核生物中终止转录的特殊信号；指在 新转录的RNA中可以形成二级结构的核甘酸序歹心其后跟随一串尿口密口定。i ntron内含子在剪切时被切除的内部序列；出现在真核基因 的初级转录物(h

20、nRNAS)中，而不是在mRNA 中。i sochores等值区在真核基因组中具有相似碱基比例的区域。junk DNA垃圾DNA没有意义的DNA序列；也指那些目前还不知道其作用的序列。lead compo Und先导化合物指在药物设计中一个可行的候选分子。LINEIi n kage mapI oca I a Ii g nmentLINE长散布(核)元件。连锁图谱见“遗传图谱”。局部比对一种寻找匹配子序列的序列比对方法。lock and key approach锁一钥方法两个对接分子的构象被固定的对接方法。log odds matr ix对数几率矩阵矩阵元素是每一个字符替换概率的对数的矩 阵。千

21、碱基kilobase(kb)DNA序列的长度单位，1000个碱基为Ikbomatch score匹配得分序列比较算法对相同字符匹配设置的得 分。maximum 1 i ke1i hood approach最大似然法指在一系列的序列比对中，考虑每一个字符 被替代的概率的一种系统发生学方法；也是 一种基于纯统计的系统发生重建方法。methy1 ati On甲基化微阵列一个甲基（-CH 3 ）附着在一个核甘酸 的 含氮碱基或者蛋白质上。microarray在一个固体基片上的已知位置固定了 DNA探 针的有序阵列。microsatel1 ite微卫星在基因组中很多非常短的核酸序列出现的区 域，例如串接

22、出现5-CA-3,的重复序列; 通常在个体间变化很大。MlAME (the mini mum i n format i On about a microarray exoer ime nt)mi nisate 11 itemismatch score微阵列实验的最 小信息为了实现微阵列数据共享和交流而制定的数 据存储标准。小卫星指在基因组中长度从5个碱基对到几十个 碱 基对重复序列串连出现的区域；在个体间 变化可能很大。失配打分在一个比对算法中，对于不相同的字符被比 对时所赋予的罚分。molecular c1ock分子钟这是一个有争议性的假设，指对于所有的进 化谱系，任何一段给定的DNA序列以

23、相同的 速率突变。molecular ClOneS分子克隆指一段DNA序列的多数相同拷贝，一般地 在 例如质粒或病毒等载体中进行，使得它们可 以在细菌培养物中生存并传播。mo 1 ecu 1 ar graphicsmo 1 ecu 1 ar mode 1i ng分子图形学分子图形学是进行分子模型化的一项重要技 术，由于分子图形学和其它计算化学方法的 相互结合，使得分子模型化方法取得 成功。分子模型化分子模型化是利用计算机模拟分子结构、研 究分子之间相互作用的一种技术。Mon te Car Io a 1 gor i thruMon te Car Io 算法一种尝试复杂问题的各种可能解的方法，例

24、如将能量最小作为评价一般解的方法。mot i f序列模式指核酸或者蛋白质序歹J中具有保守性的序 列 片段。multiple SeqUe nee a 1 i g nment多重序列比对二个或更多条序列的比对。mutatio n突变由于DNA复制或者修复错误导致核苦酸序 列发生的变化；严格地讲，通过选择性过滤 在物种代间发生的变化。nat i ve Structure天然结构在一个活细胞内，特定的蛋白质通常折叠 成的唯一结构。n atura1 Se1 eCt i On (Se1 eCt i On)自然选择个体间由于适应性的差异而形成的基因传 给子代的差异现象；导致等位基因频率改 变的进化。n ea

25、rest n e i ghbor ClaSSifier最近邻分类法一种根据物体特征相似性对它们进行分类 的一种统计学方法。n egat i ve regu1 at i负调控可以阻止基因转录发生的调控n eighbor-j Oining method邻近归并法一种聚类方法，在聚类之前，所有对象以 单个节点表示，然后逐步合并相邻节 点。nu Cleotide核昔酸核酸分子的基本单位，其组成方式为碱基- 戊糖-磷酸。n eura 1 n etwork神经网络一种可以通过学习来仿效一些神经元的功 能计算机程序；能够用来根据统计相似性 预测数据集的特定属性。n eutra1 mutat i on中性突变

26、不影响生物适应性的突变。NMRNMR核磁共振用于解析蛋白质结构的技术。no des节点在一棵系统发生树中，以节点代表一个分 类单元(物种、序列)。non dege nerate Site非简并位点突变总是导致蛋白质氨基酸序列发生替 换 的密码子位置。nonsynonym ous SUbSt itllt i on异义替换可以使氨基酸发生变化的密码子中核甘 酸 的替换。ope n read i ng frame (QRF)开放阅读框 (QRF)一段由密码子组成的核昔酸序列，在相同 阅读框中没有终止密码子出现。OPeratOr Seqlle nee操纵子序列原核生物调控蛋白结合的与基因启动子 相 关

27、的一段核昔酸序列。oper on操纵子包含有结构基因和调控兀件、在转录中产 生mRN分子的一组相关的基因。or i g i n at i onPen a 1ty起始罚分用来评估一系列新空位的罚分；序列比对 中空位罚分的一部分。ortho logs直向（直系）同源 物那些具有相似性的序列，由于物种形成事 件而使得它们从一个祖先序列独立进化。outgroup外群（外部参考物 种）指与一组生物体很少相关的一个物种或一 组物种。PAM UnitPAM单位一种进化单位；特别地，指被观察的对 象中每100个残基发生一个替换所需要 的平均进化时间。Pa i rWiSe Seque neeAlig nment

28、序列两两比对对两条序列进行编辑操作，通过字符匹 配和替换，或者插入和删除字符，使得 两条序列达到一样的长度，并使两条序 列中相同的字符尽可能地一一对应。para 1ogs共生（旁系）同源 物那些具有相似性的序列，它们都是被复 制的祖先基因的后裔。ParSim Ony简约性指只需少量突变事件激发就可以使一条 进化路径比其他路径更有优先权的过程Pattern di scr imi natio n an a 1ysis模式判别分析是一种统计方法，主要根据观察到的一 个或多个序列模式来对序列进行分类。PhySiCa1 map物理图谱关于基因组中特异性序列排列和间距的 信息，建立物理图谱实际上是为全基因

29、 组测序建立路标，是测序的前一人步工 作。PePtide肽一条含有多个氨基酸的链。PePtide bond肽键在肽连接中碳氮之间的共价键。PharmaCOge no mics药物基因组学一门利用个体的遗传信息获取最好的药 物疗效，同时具有最小副作用的研 究领 域Phe no type表型生物体由于和其基因型和环境相互作用 而产生的可见属性。PhOSPhOd i eSter bond磷酸二酯键连接一个核甘酸的磷酸基团和另外一个 的脱氧核糖的共价键。phy1oge net i c tree系统发生树对三个或三个以上基因或生物体之间的 进化关系的图形化表示。POint accepted mutat

30、i o n (PAM)点接受突变 （PAM）指被自然选择接受的突变。polar amino acid极性氨基酸通常指侧链上包含氧和（或）氮并且很1容易和水形成氢键的氨基酸。1po1 ar bond极性键在一个带全正电的分子和另一个带全负电的分子之间发生的相互作用。1POlyade ny 1 at i On多聚腺甘酸化指用一个基因核昔酸序列中不被读出的 一段长约250个碱基A组成的序 列替代真核hnRNA3,端的过程。|polyci str OniC多顺反子包含多个基因的遗传信息（顺反子）。1po1ymerase Cha i n react i On聚合酶链反应一种在体外快速、大量地合成给XE

31、DNA片 段的技术，首先将双链DNA分离成两个互 补的单链，再用DNA聚合酶将每一个单链合成双链，如此重复下去。PO1ynu C1eot i de多核甘酸一条核昔酸的聚合链；DNA或RNA分子。po1ypept i de多肽一条氨基酸的聚合链；蛋白质。POSitiscor iOn-SPeCifiC ng matr i x位置特异性打分 矩阵一个矩阵，矩阵中的每一个数表示某个特 定的氨基酸占据多序列比对中某个 位置的 频率。POSitiVe regu1 ati On正调控一个调控蛋白的结合使得RNA聚合酶更 容易启动转录的情况。Pr imary StrllCtUre一级结构组装成蛋白质的氨基酸序

32、列。1PriOnentn c i pa 1 Comp An a 1ys i s , PCA主成分分析是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方 法，它可以从多元事物中解析出主要影响 因素，揭示事物的本质，简化复杂的问 题。probe探针一块被标记的可以特异性和感兴趣的分 子发生相互作用的DNA （或RNA或抗 体）。promoter Seqlle nee启动子J予列指和一个基因相关联的可以被RNA聚 合 酶识别的序列。protei n backb one蛋白质骨架多肽链中的非侧链原子。PrOte i n e1ectrophores i s蛋白质电泳根据蛋白质的基本特征（如大小、带电 性）在电场下分离并

33、比较蛋白质的方法prote i n Seqlle nc i ng蛋白质测序对给定蛋白质的氨基酸进行测序的过 程；通常根据Edman方法，每次从多肽的 竣基端移走一个氨基酸。protei n thread i ng蛋白质结构预测 线索法首先假设多肽的构象，然后根据得到的结 构计算出其能量的方法。通过计算各种已 知结构的能量，可以得出与给定蛋白质序 列最符合的构象。因为该结构是假设的而 不是计算出来的，所以线索法有时指的就是“反向蛋白质折叠”。PrOteOme蛋白质组一个生物体的所有蛋白质总和。Proteomics蛋白质组学蛋白质组学是研究细胞内所有蛋白质 及 其动态变化规律的科学。PSelldO

34、gene伪基因发生突变之后失去功能以及转录活性的 基因。PSelldOk not伪结当环内的碱基和环外的碱基形成配对的 时候就是一个假结体；RNA吉构中最 难预 测的类型。PUr i ne喋口令碱基具有双环结构的核昔酸；通常指鸟 喋吟和腺喋吟。Pyr imid ine喀口定碱基具有单环结构的核甘酸；通常指胞 喀口定、胸腺喀口定和尿喀口定。quater nary StrllCtUre四级结构当若干个多肽相互结合时分子内部发生的相 互作用；相互作用的蛋白质形成的整体 结 构。read i ng frame阅读框在蛋白质编码基因中，以起始密码子开 始、终止密码子结束的一段线性密码子序列。regu1a

35、tory调控在特定的条件下允许或阻止一个基因的表 达；对应于结构蛋白。residue残基作为多肽链一部分的氨基酸；在关于蛋白 质或肽的语境中，残基通常指氨基酸restr ictio n en ZymeS限制性（内切） 酶指在匕们遇到特XE的核甘酸序列的时候在 DNA分子中引入双链缺口的蛋白质restr i ct i on mapp i ng限制性酶切图谱用两个或多个限制性酶进行同步消化来决 定DNA分子中的限制性酶识别序列 的相对 位置。restr ict io n Site限制性（酶切） 位点被限制性酶识别的核甘酸序列；限制性酶 识别位点。retropos On逆转录转座子一个被RNA媒介传

36、输的转座元件。retrotra nspositi On逆转录转座包含一个RNA媒介的转座。reversetran SCr i PtaSe逆转录酶一种用来将RNA变成DNA的特殊的 酶。r i bosome核糖体指负责催化翻译过程的蛋白质和rRNA的 复合体。r i bozyme核酶指可以加速特定化学反应(例如自切害U)的RNA分子。RNA ( RibOnucleic ACid )核糖核酸RNA是单链的核酸分子。RNA po1ymeraseRNA聚合酶负责转录的酶；将DNA分子中的信息转 移 到RNA分子中。rooted tree有根树含有一个被认为是公共祖先的节点、并且 该节点到其他节点只存在

37、唯一路径的一棵 系统发生树。sate 11ite DNA卫星DNA指相对于其他的基因组数据而言，重复性 很大、存储的信息量很少的真核DNA片 段。SCa1ed tree标度树指分支长度和相邻节点对之间的差异成比 例的系统发生树。scor i ng matr i x打分矩阵在序列比对中，用来对每一个非空位置进 行打分的矩阵。SeCOndary StrllCtUre二级结构指源自蛋白质一级结构的a螺旋、B折 叠等局部结构特征。Se1f-Orga n i z i ng MaP , SoM自组织映射神经 网络自组织特征映射是类似大脑思维的一种人 工神经网络模型，它是一种竞争学习算 法。Semi glo

38、bal a 1i g nment准全局比对指出现在序列头尾的空位不影响比对得 分 的序列比对。Seqllence序列(1 ) DNA或RNA分子核甘酸的线性 排列 或者蛋白质中氨基酸的排列；(2 )对分子 中的核苦酸或者氨基酸的线性排列进行定 序的操作。Seqlle nc i ng测序测定生物分子序列的过程称为测序。Ser i a 1 an a 1ys i s of gene express i on基因表达的系列 分析(SAGE)用来评估基因表达水平的实验方法。(SAGE)Side Cha in侧链附着在氨基酸中心碳原子的短链或者原子 基团。Si Ie ncer沉默子通过沉默子可以抑制基因的

39、表达，或对基 因进行有选择性的表达。SINESINE短散布（核）元件。SNPS ( Single nu Cleotide polymorphisms )SNPs （单核昔酸 多态性）SNPS对人类遗传学研究和医学应用具有重 要的意义，如人类种群遗传学的研究， 疾病易感性分析，药物基因组研究，个体 化医疗。SOM (Se1fOrga n i Zat i 0 n自组织映射神经 网络一种无监督学习方法，可以完成对物体的 聚类。SPeCieS tree物种树表示物种之间关系的系统发生树。sp1 i ceosomes剪接体真核生物中负责剪接的酶复合体。SPI iCi ng剪接指剪掉真核hnRNA内部序列

40、（内含子）再 将与之相邻的外显子连接起来的过程。Start cod On起始密码子引导原核和真核生物核糖体开始翻译mRNA 勺三联密码子（特别是AUG ）。Stem茎干一个RNA分子内部碱基配对的区域。stop cod On终止密码子不再使核糖体插入氨基酸而使mRNA翻译 终止的密码子（特别是UGA, UAG和UAA ） oStrUCtUral PrOtein结构蛋白通常指可以维持细胞或组织形状的蛋白 质，它们可以为骨骼或连接组织提供支撑 的硬骨架。STS ( SeqUence tagged Site )序列标记位点这些位点所对应的序列在基因组中可以作 为特定的标记。SUbStitUti On替换在一定水平上通过选择过滤的突变。SUm-Of-PairS (SP )逐对加和（SP）是一种多重序列比对的评价模型。SUPerfami1y超家族在一定程度上具有序列相似性，可以反映 远古进化关系的蛋白质家族的集合。SUPer-SeC On dary StrllCtUre超二级结构若干二级结构可能以