学生如何提高专业英文阅读能力

1、学生如何提高专业英文阅读能力（转自施一公博客）序:此文针对本科生和一、二年级的博士、硕士生，对高年级的博士生和博士后也应该有 参考价值。从小到大,我感性思维多一些，不善于读书。85至89年在清华生物系读本科期间，从未 读过任何一种英文专业期刊.我受到的与英文阅读相关的训练一共只有两个。一是我在 1986年暑假期间选修的时任系主任的蒲慕明老师开设的生物英语系列讲座，隐隐约约 记得徜先生让我们阅读一些诸如DNA双螺旋发现之类的科普性英文文章，很有意思。但时 间较短，暑假过后也没有养成读英文文章的习惯.二是生物化学这门课。与现在的清华 生命学院形成鲜明对比，我上大学期间的所有基础课和专业课都是采用中

2、文教材、中文讲 课，只有郑昌学老师讲授的生物化学采用了 Lehninger的Principles of Bio c he mistry）,而且郑老师要求我们每个学生每次课后阅读1 0-20页教材。我们同学大多 感觉到专业英文阅读有所提高。19 9 0年4月至7月初,我在依阿华州Am e s小镇的I ow a State U n i versity度过 了初到美国的前三个月，其中大部分时间在Herb ert Fromm教授的实验室做轮转（rota tion）,跟随刘峰和董群夫妻两人做研究（刘峰现在U niversity of Texas Health Science Cen ter做教授）。当时

3、感觉最困难的就是读专业论文。有一次，Fromm教授要求我在组 会上讲解一篇Journal of Biological Chemistr y的文章，我提前两天开始阅读，第一遍 花了足足六个小时，许多生词只能依靠英汉词典，文章中的有些关键内容还没有完全读 懂，当时的感觉是JBC的文章怎么这么长、这么难懂？！真有点苦不堪言。为了能给Fr 0 mm教授和师兄师姐留下好印象，第二天又花了好几个小时读第二遍，还做了总结。第 三天我在组会上的表现总算没有给清华丢脸.但是，前前后后，真搞不清楚自己为了这一篇 文章到底花了多少时间！9 0年7月我转学到约翰霍普金斯大学以后，与本科来自北大的虞一华同在I PMB

4、progra m。虞一华大我一岁，来巴尔地摩之前已经在夏威夷大学读了一年的研究生，对于科研论 文的阅读比我强多了。他常常在IP MB的办公室里拿着科学和自然周刊津津有味 地阅读，看得我很眼馋，也不理解其中那些枯燥的文章有什么意思。他告诉我:他在读很有 意思的科学新闻。科学新闻能有什么意思、？虞一华给我讲了好几个故事:洛克菲勒大学校长 诺贝尔奖得主David Balti more如何深陷泥潭、人类基因组测序如何争辩激烈、HIV病 毒究竟是谁发现的，等等.我还真没有想到学术期刊上会有这么多我也应该看得懂的内容！ 从那时起，每一期新的科学和自然一到,我也开始尝试着阅读里面的新闻和研究进 展介绍，这些

5、内容往往出现在N ews & C omme nfResearc h N e wsN ews & view s ”Pers pectives”等栏目，文笔平实，相对于专业的科研论文很容易读懂.有时，我还 把读到的科研新闻讲给我的同事朋友们听，而同事的提问和互动对我又是更好的鼓励。除 T科学和自然，我也常常翻看科学美国人（S ci ent ific American。与细胞（Cell）、生物化学期刊（JBC）等非常专业的期刊不同，科学和自然里面有相当一部分内容是用来做科普教育的.科学周刊的“Perspectives”和 自然周刊的“News & V i ews”栏目都是对重要科学论文的深入浅出的介

6、绍，一般1 -3页，读起来比较通俗易懂，较易入门.读完这些文章后，再读原始的科学论文，感觉好 多了！而且可以把自己的体会与专家的分析比较一下，找找差距，有时甚至也能找回来一 点自信！从1 9 98年在普林斯顿大学任职到现在清华大学做教授，我总是告诉自己实验室的所有年 轻人（包括本科生、硕士生、博士生、博士后）下面这几点读科研论文的体会，也希望我的 学生跟我学：1 .请每位学生每周关注科学和自然。（生命科学界的学生还应该留心细 胞）.如果时间有限，每周花一个小时读读这两种周刊里的文章标题以及与自己研究领域 相关的科研论文的a b str a ct,即可!这样做可以保证一个学生基本上能够跟踪本领域

7、最 重要的发现和进展，同时开阔视野，大概知道其它领域的动态.2 .在时间充足的情况下，可以细读科学和自然里的新闻及科研论文。如果该科 研论文有News & Views或Perspectives”来介绍，请先读这些文章，这类导读的文章 会提炼问题，就好比是老师事先给学生讲解一番论文的来龙去脉，对学生阅读原始论文有很 大帮助。3c在读具体的科研论文时，最重要的是了解文章的主线逻辑。文章中的所有Figures都 是按照这个主线逻辑展开描述的。所以，我一般先读“ i nt r odu c t i on部分,然后很快地看 一遍F i gu r es。大概知道这条主线之后，才一字一句地去读esul t s

8、和dis c u ssi o n4 .当遇到一些实验或结果分析很晦涩难懂时，不必花太多时间深究，而力求一气把文章读 完。也许你的问题在后面的内容中自然就有解答。这与听学术讲座非常相似！你如果想每 个细行都听懂，留心每一个技术细节，那你听学术讲座不仅会很累，而且也许会为了深究一个 小技术环节而影响了对整个讲座逻辑推理及核心结论的理解。5 .对个别重要的文章和自己领域内的科研论文，应该精读。对与自己课题相关的每一篇论 文则必须字斟句酌地读.这些论文，不仅要完全读懂，理解每一个实验的细节、分析、结 论，还必须联想到这些实验和结论对自己的课题的影响和启发，提出自己的观点。6 .科学论文的阅读水平是循序

9、渐进的。每个人开始都会很吃力，所以你有这种感觉不要气 馁.坚持很重要，你一定会渐入佳境。当你有问题时或有绝妙分析时,应该与师兄师姐或找 导师讨论。7 .科研训练的一个重要组成部分就是科研论文的阅读。每一个博士生必须经过严格的科 研论文阅读的训练。除了你自己的习惯性阅读外，你应该在研究生阶段选修以阅读分析专 业文献为主的一至两门课，在实验室内也要有定期的科研论文讨论（Journal C 1 ub） o如果你的实验室还没有这种讨论，你们学生可以自发地组织起来。8。前面几条都是讨论如何提高科研论文的阅读能力，但是一旦入了门，就要学会crit i calread i ng.不要迷信已发表的论文，哪怕是

10、发表在非常好的期刊上。要时刻提醒自 己：该论文逻辑是否严谨，数据是否可靠，实验证据是否支持结论，你是否能想出更好的 实验，你是否可以在此论文的基础上提出新的重要问题？等等。天外有天，读科研论文是一件很简单、但也很深奥的事情.一般的学生常常满足于读懂、读 透一篇好的论文，优秀的学生则会举一反三、通过查找references纵深了解整个领域 的历史、现状，并展望该领域未来的可能进展。我从1990年对学术论文一窍不通到96年博士后期间的得心应手，还常常帮助同事分析， 自以为水平了得。但是有一件事让我看到了自己的严重不足，颇为羞愧。1 996年，是S MAD蛋白发现及TG F-b信号转导研究的最激动人

11、心的一年，哈佛医学院的Whitman实 验室在十月份的自然杂志上以“Artic 1 e”的形式发表了一篇名为A tran s cr i ption a I part n e r for M A D p roteins i n TGF-b sig n a lin g的文章。读完之后，正好遇 到TGF-b领域的著名学者Joan Mas sague,我对Jo an评论说：Im not s。sure why t his pap e r des erves a fu 1 1 arti c I e in N a tore. They j ust i d e ntif i ed ano t h e r Sm

12、ad-i n teract i ng p rotei n, and the d ata qualit y is m ed iocre.完全出乎我的意料,Joan 马上回应我：I disagree! This pap e r li n ks t h e c y to p lasmi c Smad protei n in t o the n ucleus and iden t ifies a tra n s c r ip t ion factor a s its interacting pro t ein. Now th e TGF - b signaling p a thway is c o m

13、plete. It is a b e a utif u I N a t u r e article!这件事对我触动极大:原来大师的视野 和品位远远在我之上.从那以后，我也开始从整个领域的发展方面来权衡一篇文章的重要 性，这件事对我今后为国际重要学术期刊审稿、自己实验室选择研究课题都起到了相当重 要的作用。如今,我阅读一篇本领域内的科研论文，非常顺利，而且常常可以看出一些作者没有想到或 分析到的关键点。回想从前，感慨万千，感谢蒲慕明、郑昌学、虞一华、John Desja ria is、Jeremy Berg、Joan M a s sague等一批老师和同事对我的帮助.我很留心， 也很用心.希望所

14、有的学生也能通过努力和坚持对英文科研论文的阅读得心应手！如何提高英文的科研写作能力（转自施一公的博客作为一个科研工作者，在国际学术期刊上发表科研论文是与同行交流、取得国际影响的必经 之路.有些国内的科学家，实验做得很漂亮，但常常苦恼于论文的写作力不从心，成为国际 交流的一大障碍.本文从博主的亲身体验出发，给博士生、博士后、以及年轻的PI提供一个 借鉴.文章最后做简短总结。我大学时的同班同学都知道，那时我的英语不算好（英语四级考试仅为良），写作尤其槽 糕。初到美国之时，对英文环境适应得很差，读一篇JBC的文章要五、六个小时，还常常 不理解其中一些关键词句的意思、，心里压力极大.很幸运，我在约翰霍

15、普金斯大学（Johns Ho pkins Univ e rs i ty）攻读博士学位时，19 91年4月遇到了学兄和启蒙老师John Desja r I a is.听了我的苦恼后,J。hn告诉我， Sp e nd 45 minute s every day reading Was hington Post, and you will b e c r u is i n g wi t h you r w r itt e n Englis h in t wo ye a rs”（每天花 4 5 分钟读华盛顿邮报，两年后你的写作能力会得心应手）。这条建议正合我意-我原本 就对新闻感兴趣！于是，我每天上午

16、安排完第一批实验后，都会在十点左右花一小时的时 间阅读华盛顿邮报，主要看A版（新闻版）。刚开始，我一个小时只能读两、三个短消 息或一个长篇报道,中间还不得不经常查字典看生词。但不知不觉间，我的阅读能力明显提 高，1 992年老布什与克林顿竞选总统，我跟踪新闻，常常一个小时能读上几个版面的消息 或四、五个长篇报道，有时还把刚看到的新闻绘声绘色地讲给师兄师姐听。.阅读直接提升了我的英文写作能力。看完一些新闻后，我常常产生动笔写自己感想的冲 动。9 2年巴塞罗那奥运会，中国游泳队取得了四金五银的好成绩，美国主要媒体纷纷指责这 是中国运动员服用违禁药物，但没有任何检测的证据,完全凭美国运动员的感觉。此

17、事让我 很气愤，我生平第一次给华盛顿邮报和巴尔的摩太阳报（The Balt i more S u n）各写了一封信，评论报道的不公平。没想到两天后巴尔的摩太阳报居然原封不动的 把我的信刊登在“读者来信”栏目，同事祝贺，我也洋洋得意。受到此事鼓励，我在此后三年 多的日子里，常常动笔，有些文章发表在报刊上（大部分投稿石沉大海），也曾代表中国留 学生写信向校方争取过中国学生的利益。有时还有意外的惊喜。95年的一天，一位朋友打 电话告诉我:今天出版的巴尔的摩太阳报上有我的评论文章!我急匆匆赶到街头买来5 份报纸，果然，在A版的倒数第二页，以15x15厘米的篇幅发表了我一个多星期前寄给报 社、本以为不会

18、发表的一篇抨击吴宏达的文章.以上是简述我个人英文写作提升的一段过程。但是，科研论文不同于读者来信，有其专业 特点、甚至是固定格式。1994年，我第一次完整地写科研论文，感觉很差。好不容易写完 的文章，连我自己都不愿意读第二遍；勉强修改之后，交给了老板Jeremy Berg。他拖了三 周没看我的文章，我实在忍不住了、去催他，上午9点，Jeremy告诉我：今天看!11点， 我去他办公室催，秘书拦住我，说Jere my正在办理重要事务，两点前不得打扰。我心里惴 惴，不知Jere my在干什么.下午一点半，J e r e my急匆匆过来找我，拿了一叠纸， This i s t he dr a ft.

19、Please I et me know what you think, we ca n a i m f or a Science r e p o rt0 ”（这是初稿，你看看如何，我们可以试试科学）我仔 细一看，天啊！ 一共7页，四个多小时Jeremy已经把文章的整体写完了，只是缺少Me th o d和r e f erences.让我郁闷的是，他根本没有用我的初稿。【其实，写文章贵在一气呵成.我也沿袭了 Je r e m y的风格。2006年1 0月，在我们处 于劣势的激烈竞争中，有两个课题面临被sc oop的危险，我曾经两次、一晚上赶一篇文 章.1 0月15日，傍晚8点左右开始写、通宵，第二

20、天早晨10点完成一篇按照细胞杂 志格式的论文，包括 abstract, introd uc t ion, res u It s , discu s s ion,仔细阅读一遍 后于下午4点半完成网上投稿。这篇文章最终发表在12月份自然的子刊结构与分 子生物学上（电子版于11月10日发表）。另一篇，10月18日，晚6点开始写、通 宵，第二天早晨8点完成，上午9点半完成投稿，最终发表在1 2月1 5日的细胞上。 当然，能通宵完成一篇文章,还有一个重要前提，就是对研究领域非常熟悉，对文章整体的 大概思路已经深思熟虑，所有的Figure s都事先做好了。这些前期工作即使全身心投入 也需要3 -4天。】从

21、1994年自己写第一篇科研论文的艰难到现在写起来得心应手、驾轻就熟，我总结出如下 经验：1。要写好科研论文，必须先养成读英文文章的习惯，争取每天3060分钟.刚开始可以选 择以读英文报纸、英文新闻为主，逐渐转为读专业杂志。我会在近期专门写一篇博客文章 介绍一套行之有效的增强读专业杂志能力的办法。2 .写科研论文，最重要的是逻辑.逻辑的形成来自对实验数据的总体分析.必须先讨论出一套 清晰的思路，然后按照思路来做图（FigU r e s ）,最后才能执笔。3 .具体写作时，先按照思路（即Figures）写一个以subhead i ng为主的框架,然后开 始具体写作。第一稿，切忌追求每一句话的完美，

22、更不要追求词语的华丽，而主要留心逻辑 （logicflow）,注意前后句的逻辑关系、相邻两段的逻辑关系.写作时，全力以赴,尽可能 不受外界事情干扰（关闭手机、座机），争取在最短时间内拿出第一稿。还要注意：一句 话不可太长。4 .学会照葫芦画瓢。没有人天生会写优秀的科研论文，都是从别人那里学来的。学习别 人的文章要注意专业领域的不同，有些领域（包括我所在的结构生物学）有它内在的写作 规律。科研文章里的一些话是定式，比如To i n ve s tig a t e t he me c h a n ism of. we pe rf o rmed These res u11 s suppor t the

23、 former, b ut not th e l after, hypothes i s UD e spite rece nt progress, h ow . remains to beelucida ted.等等。用两次以后，就逐渐学会灵活运用了。在向别人学习时，切忌 抄袭。在美国一些机构，连续7个英文单词在一起和别人的完全一样,原则上就被认为抄袭 （p lagiari s m）。5c第一稿写完后，给自己不要超过一天的休息时间，开始修改第二稿。修改时，还是以逻 辑为主，但对每一句话都要推敲一下，对ab s tract和正文中的关键语句要字斟句酌。学 会用“Th es a uru s （同义

24、词替换）以避免过多重复。第二稿的修改极为关键,再往后就不会 大改了。6c第二稿以后的修改，主要注重具体的字句，不会改变整体逻辑了.投稿前，一定要整体 读一遍，对个别词句略作改动。记住:学术期刊一般不会因为具体的语法错误拒绝一篇文 章，但一定会因为逻辑混乱而拒绝一篇文章。这套方法行之有效,我对所有的学生和博士后都会如此教导。我的第一个博士后是柴继杰， 1 99 9年加入我在普林斯顿大学的实验室。继杰当时的英文阅读和写作能力很差.我对他的 第一个建议就是：每天花半小时读英文报纸【难能可贵的是:他坚持下来了！经过几年的努 力，2004年继杰已经能写出不错的gran proposal, 2 006年他

25、的第一篇独立科研论文发 表在MolecularCell上，随后相继在自然发表两篇、在其它一流学术期刊发表十多 篇论文。写作能力开始成熟。发表论文是一件值得高兴的事情，但要明白：论文只是一个载体，是为了向同行们宣告你 的科研发现，是科学领域交流的重要工具。所以,在科研论文写作时，一定要连记于心的就 是:用最简单的话表达最明白的意思，但一定要逻辑严谨!其实，中文和英文论文皆如此！如何做一名优秀的博士生：（一）时间的付出序：我从获得博士学位至今已经整整1 6个春秋，但博士阶段的感受仍然历历在 目。我从指导自己独立实验室的第一个博士生到现在也已经13年了,其中的博士研究生和 博士后中己经有11人在美国

26、和中国的大学里担任独立实验室的PL他们的成长过程差别 极大，性格、能力也各有不同。应该说，没有任何一个学生可以简单地遵循另外一个优秀科 学家的足迹脱颖而出.从这个意义上讲，科学家的成功是不可能复制的。但是，优秀科学家 常常具备的共同特点应该对年轻学生有很大启发。本文主要来自我在2008年清华大学研究生入学教育里一次2。5小时的讲座,又综合 了一些随后的思考和总结。在那次讲座中，我一再强调，我的目的不是要求研究生完全按照 我讲的去做，而是希望从根本上冲击、振蒲一下研究生的思考角度，启发大家找到最适合 自己的成才之路.本文很长，分四部分陆续发表出来。】1。时间的付出。所有成功的科学家一定具有的共同

27、点，就是他们必须付出大量的时间和心血。这是一 条真理。实际上，无论社会上哪一种职业,要想成为本行业中的佼佼者，都必须付出比常人 多的时间。有时，个别优秀科学家在回答学生或媒体的问题时,轻描淡写地说自己的成功凭 借的是运气，不是苦干.这种回答其实不够客观、也有些不负责任，因为他们有意忽略了自 己在时间上的大量付出,而只是强调成功过程中的一个偶然因素，这样说的效果常常对年轻 学生造成很大的误导，因为有些幼稚的学生甚至会因此开始投机取巧、不全力进取而是等待 所谓的运气;另外一些学生则开始寻找他们的运气，把相当一部分精力和时间用在了与科学 研究无关的事情上而。说极端一点：如果真有这样主要凭运气而非时间

28、付出取得成功的科 学家，那么他的成功很可能是攫取别人的成果，而自己十有八九不具备真正在领域内领先 的学术水平.大约在十年前，著名的华人生物学家蒲慕明先生曾经有一封非常著名的emai 1在网上 广为流传，这封email是蒲先生写给自己实验室所有博士生和博士后的，其中的观点我完 全赞同。这封email写的语重心长，从中可以看出蒲先生的良苦用心。我无论是在普林斯顿 还是在清华大学都把这封email转给了我实验室的所有学生，让他们体会。其中的一段是这 样说的The most im p o r t an t t hing is what I consi d er to be suf f icien t

29、am o unt of time and e ffort i n t he lab w o rk. I me n t ion e d that a bout 60 hr wo r kin g time per wee k i s wh a t I c o n s i d e r the minim a I t ime a n average succ e s s fu I young scientist in thes e d a ys has to put into th e 1 ab work.I s u gges t that eve r yo n e p uts i n at I ea

30、 s t 6 hr c on c e n t rated bench w o rk an d 2+ hr re a ding a nd other researchrelated activity e a c h day. Read in g papers and bo o ks s h o u Id be do n e m o stly a f ter work.（我认为最重要的事情就是在实验室里的工作时间，当今一个成功的年轻科学家平 均每周要有60小时左右的时间投入到实验室的研究工作。.我建议每个人每天 至少有6小时的紧张实验操作和两小时以上的与科研直接有关的阅读等。文献和书籍的阅 读应该

31、在这些工作时间之外进行。）o有些学生读完蒲先生的email后告诉我，看来我不是做学术的料，因为我真的吃不 起这份苦.我常常回复道，我在你这么大年纪的时候，也会觉得长期这样工作不可思议。但在不知不觉之中，你会逐渐被科学研究的精妙所打动，也会为自己的努力和成绩骄傲，你 会逐渐适应这种生活方式！ ”这句话表而上是劝学生，实则是我自己的经历与体会。我从小就特别贪玩，并不喜欢学习。但来自学校和父母的教育与压力迫使自己尽量刻 苦读书;我高中就读于河南省实验中学，凭借着比别人更加刻苦的努力，综合成绩始终名列 前茅。1 9 84年全国高中数学联赛我获得河南赛区第一名,保送进入清华大学。大学阶 段，我保持了刻苦

32、的传统，综合成绩全班第一并提前一年毕业.但这种应试和灌输教育的结 果就是我很少真正独立思考、对专业不感兴趣。大学毕业时，我本没有打算从事科学研究, 而是一心一意想下海经商。阴差阳错之间，我踏上了赴美留学之路。可想而知，留学的第一年，我情绪波动很大，内心浮躁而迷茫，根本无心念书、做研 究,而是花了很多时间在中餐馆打工、选修计算机课程。第二年，我开始逐渐适应科研的 枯燥，并开始有了一点自己的体会，有时领会了一些精妙之处后会洋洋得意，也会产生原 来不过如此的想法，逐渐对自己的科研能力有了一点自信。这期间，博士研究生的课程全 部修完，我每周五天、每天从上午9点做实验到晚上7、8点，周末也会去两个半天。

33、到了第 三年，我已经开始领会到科研的逻辑，有点儿跃跃欲试的感觉，在组会上常常提问，而这种 入门”的感觉又让我对研究增加了很多兴趣，晚上常常干到11点多,赶最后一班校车从霍 普金斯医学院回Hom e wood cam p u s (我住在附近).1 993年我曾经在自己的实验记录 本的日期旁标注Th i s i s the 2 1 stcon secutive d a y o f work i ng in th e lab.(这是我连续第21天在实验室工作.)，以激励自己。其实，这多少有作秀之嫌， 因为其中的一个周末我一共只做了五、六个小时的实验。到第四年以后，我完全适应了实 验室的科研环境，也

34、不会再感受到枯燥或时间上的压力了.时间安排完全服从实验的需要， 尽量往前赶。其实，这段时期的实验时间远多于刚刚进实验室的时候，但感觉上好多了。研究生阶段后期，我的刻苦在实验室是出了名的。在纽约做博士后时期则是我这辈子 最苦的两年，每天晚上做实验到半夜三点左右，回到住处躺下来睡觉时常常已是四点以 后：但每天早晨八点都会被窗外纽约第一大道(FirstAvenue)上的汽车喧闹声吵醒，九 点左右又回到实验室开始了新的一天.每天三餐都在实验室，分别在上午9点、下午3点和 晚上9、1 0点.这样的生活节奏持续1 1天，从周一到第二个星期的周五，周五晚上做灰 狗长途汽车回到巴尔地摩(Baltimore)的

35、家里，周末两天每天睡上近十个小时，弥补过 去11天严重缺失的睡眠。周一早晨再开始下一个11天的奋斗。虽然体力上很累，但我 心里很满足、很骄傲，我知道自己在用行动打造未来、在创业。有时我也会在日记里鼓励自 己。我住在纽约市曼哈顿区65街与第一大道路口附近，离纽约著名的中心公园(Cent r al Par k )很近,那里也时有文化娱乐活动，但在纽约工作整整两年，我从未迈进中心公园 一步。我一定会把自己的这段经历讲给每一个我自己的学生听，新生常常问我:老师，您觉得 自己苦吗？我通常回答，只有做自己没有兴趣的事情时候觉得很苦.有兴趣以后一点也不 觉得苦。”是啊，一个精彩的实验带给我的享受比看一部美国

36、大片强多了。现在回想起当 时的刻苦，感觉仍很骄傲、很振奋！有时我想：如果自己在博士生、博士后阶段的那七年 半不努力进取，而是不加自制地看电影、读小说、找娱乐(当时的互联网远没有现在这么 内容丰富)，现在该是什么状况？做一个优秀的博士生，时间的付出是必要条件。如何做一名优秀的博士生:(二)方法论的转变【序：本文主要来自我在200 8年清华大学研究生入学教育里一次2。5小时的讲 座，又综合了一些随后的思考和总结.在那次讲座中，我一再强调，我的目的不是要求研究生 完全按照我讲的去做，而是希望从根本上冲击、振荡一下研究生的思考角度，启发大家找到 最适合自己的成才之路。本文比较长，将分四部分陆续在博客上

37、发表出来。这是第二部 分。第一部分请见：http: /b I og. s c i / home。dh p? mod=opa c e& u id=4 6 2 12 &do= b 1 0 g & i d= 4 84 4 16】2.方法论的转变要想在科学研究上取得突破和成功，只有时间的付出和刻苦，是不够的。批判性分析 (critical analy s is)是必须具备的一种素质.研究生与本科生最大的区别是：本科生以吸取学习人类积累的知识为主、兼顾科学研 究和技能训练;而博士生的本质是通过科学研究来发掘创造新知识，当前和以往学习的知识 都是为了更好地服务于科学研究。在以学习知识

38、为主的本科生阶段，提出问题固然重要， 但答案往往已经存在，所以问题是否critic al没有那么关键。博士生阶段则完全不同，必须 具备c r i tic a 1 a nalys i s的能力，否则不可能成为优秀的科学家。这一点,我称之为方 法论的转变。其实，整个大学和研究生阶段教育的实质就是培养cri t ical a nal y sis的能力，养成 能够进行创新科研的方法论。这里的例子非常多，覆盖的范围也非常广，在此举几个让我终 生难忘的例子。(1)正确分析负面结果(negative resu 1 ts)是成功的关键。作为生命学科的一名博士生，如果每一个实验都很顺利、能得到预料中的正而结果

39、(posi tive resul t s),除个别研究领域外，一般只需要6-24个月就应该可以获得 博士学位所需要的所有结果了。然而实际上，在美国，生命学科的一个博士研究生，平均 需要6年左右的时间才能得到PhD学位。这一数字本身就说明：绝大多数实验结果会与预 料不符，或者是负而结果(negativ e results ) 大多数低年级的博士生对负而结果 的看法很消极，直接影响了他们cri t i c a I a n a lys i s能力的培养。其实，只要有适当的对照实验(control experiments).判断无误的负而实验结果 往往是通往成功的必经之路。一般来说，任何一个探索型课题

40、的每一步进展都有几种、甚 至十几种可能的途径(hyp。thesis),取得进展的过程基本就是排除不正确、找到正确方向 的过程，很多情况下也就是将这几种、甚至十几种可能的途径一一予以尝试、排除，直到找 到一条可行之路的过程。在这个过程中，一个可信的(conelusive)负面结果往往可以 让我们信心饱满地放弃目前这一途径，如果运用得当，这种排除法会确保我们最终走上正确 的实验途径.从这个角度讲，负面的实验结果不仅很正常、也很有益于课题的最终成功。非常遗憾的是，大多数学生的负面结果并不令人信服，经不起逻辑的推敲!而这一点 往往是阻碍科研课题进展的最大阻碍.比如，按照一个常规的prot ocol操作

41、时不能得到 posi tive C。ntrol的相应结果，或者缺乏相应的对照实验，或者是对可信的实验结果在分 析和判断上产生了失误，从而做出负而结果或不确定（in conclusive results）的结 论，这种结论对整个课题进展的伤害非常大，常常让学生在今后的实验中不知所措、苦恼不 堪。我告诫并鼓励我所有的学生：只要你不断取得c o nc 1 u s ive的负面结果，你的课题就 会很快走上正路；而在不断分析负而结果的过程中所掌握的强大的逻辑分析能力也会使你 也会很快成熟，成长为一名优秀的科学家。我对一帆风顺、很少取得负而结果的学生总是很担心，因为他们没有真正经历过科研 cr i tic

42、 al ana 1 y s i s的训练。在我的实验室，偶尔会有这样的学生只用很短 的时间（两年左右，有时甚至一年）就完成了 PhD论文所需要的结果;对这些学生，我一定会 让他们继续承担一些富有挑战性的新课题，让他们经受负而结果的磨练.没有这些磨练，他 们很难真正具备cM tic al a naly s is的能力，将来也很难成为可以独立领导一个实验 室的优秀科学家.所以,不要害怕负面结果，关键是如何从分析负面结果中获取正确的信息。（2）耗费时间的完美主义阻碍创新进取。Niko 1 a Pavletich是我的博士后导师，也是对我影响最大的科学家之一，他有 着极强的实验判断力和思维能力，做出了

43、一系列包括p5 3、Rb、CDK complex. SCF c omplex. BRCA1等在内的里程碑式的研窕工作，享誉世界结构生物学界，31岁时即升任 正教授。19 96年4月，我刚到Nikola实验室不久，纯化一个表达量相当高的蛋白Sma d 4,两天下来，蛋白虽然纯化了，但结果很不理想：得到的产量可能只有应该得到的20%左 右。见到Nik。la,我不好意思地说：产率很低，我计划继续优化蛋白的纯化方法，提高产 率。他反问我：（大意）Why do you wan t to imp r ov e the yiel d ? Dont y ou h a ve enou g h pr o tei

44、n for c rys t al 1 ization t r i als?（你为什么想提高产 率？已有的蛋白不够你做初步的结晶实验吗？）我回敬道:I do h aveenough protei n fo r cry s talliza ti o n sere e n.But I n e ed to op t imize th e yield f ir s tsotha t I can accumu 1 ate more mate rials.（我有足够的蛋白做结晶筛 选，但我需要优化产率以得到更多的蛋白。）他不客气地打断我:No。 T h e yiel d is hig h eno ugho

45、You r time i s m o re impo r ta n t th an yield P Ie a se proceed to crystallization.（不对。产率够高了，你的时间比产率重要。请尽快开始结晶。） 实践证明了 Niko la建议的价值。我用仅有的几亳克蛋白进行crystalliz ation screen, 很快意识到这个const r uct并不理想，需要通过protein engi n eering除去其N一端较 flex i b Ie的几十个组:基酸。而除去N-端几十个氨基酸的蛋白不仅表达量高、而且生化性 质稳定，纯化起来非常容易，根本不用担心产率的问题。

46、在大刀阔斧进行创新实验的初期阶段，对每一步实验的设计当然要尽量仔细，但一旦按 计划开始后对其中间步臊的实验结果不必追求完美，而是应该义无反顾地把实验一步步推到 终点，看看可否得到大致与假设相符的总体结果。如果大体上相符，你才应该回过头去仔细 他的出行计划：但以我们对Nikola的了解，他十有八九是在写pape.后来，我们也意识 到，这样的事情发生在Nikola身上已经见多不怪了。在我离开Nikola实验室前，我带着始终没有完全解开的谜，问他：如果你不怎么读 papers,又不怎么去听讲座，你怎么还能做一个如此出色的科学家？他回答说：（大意）我 的时间有限，每天只有1 0小时左右在实验室，权衡利

47、弊之后，我只能把我的有限时间用在我 认为最重要的事情上，如解析结构、分析结构、与学生讨论课题、写文章。如果没有足够的 时间，我只能少读文章、少听讲座了。Niko la的回答表述了一个简单的道理：一个人必须对他做的事情做些取舍，不可能 而面俱到.无论是科研文献的阅读还是学术讲座的听取，都是为了借鉴相关经验、更好地服 务于自己的科研课题。在博士生阶段，尤其是前两年，我认为必须花足够的时间去听各相关领域的学术讲 座、并进行科研文献的广泛阅读，打好5 i t i cal thinkin g的基础;但随着科研课题的深 入，对于文献阅读和学术讲座就需要有一定的针对性，也要开始权衡时间的分配了。（4）挑战传统思维从