水稻重组自交系分子遗传图谱构建及分蘖角的QTL检测

1、Construction of Molecular Genetic Linkage MapBased on an RIL Population of Rice and Detectionof QTLs for Tiller AngleMain ContentsBackgroundMaterials and MethodsResults and AnalysisDiscussionBackground水稻是世界上重要的粮食作物之一。近年来，国内外众多学者利用 SSR、RFLP 等多种标记对多种作图群体构建了大量的水稻分子遗传图谱。这些图谱为水稻重要性状基因定位、基因克隆及分子育种等研究打下了坚实

2、的基础，并得到了广泛的应用。分蘖角度是水稻重要的株型性状，它对水稻群体的光能利用、分蘖能力、病虫害抗性及最终高产群体的构建等都产生重要的影响。Background目前，分蘖角度的 QTL 定位研究则相对较少，研究者利用 RIL 群体或 DH 群体在不同染色体上定位了一些分蘖角度的 QTLs。本研究通过构建亲本株型变异丰富的重组自交系群体，应用 SSR 分子标记构建遗传连锁图谱，并进行株型性状中分蘖角度的 QTL 定位，以探讨水稻分蘖角度的分子遗传基础，为水稻的株型育种提供参考依据。Material and Methods1.Construction of RIL (recombinant in

3、bred line) population2.DNA extraction3.Polymorphism screening and genotyping4.Determination of tiller angle5.Construction and analysis of molecular genetic linkage mapResults and Analysis Polymorphism analysis of parentsn利用 838 对 SSR 引物进行亲本间多态性筛选，共有 302 对检测到多态性，频率为 36. 04%。n选取分布相对均匀的141 对 SSR 引物对含24

4、0 个株系的RIL 群体进行基因型检测，通过 PCR、电泳和考带获得全部 141 个标记的分离数据。Results and Analysis Partial segregation analysis of markers in RIL populationu作图所用的 141 个标记中有68 个标记符合 1 1 的单基因理论分离比，占总标记数的 48. 2% ；73 个标记显著偏离 1 1 分离比，其中显著偏分离( P0. 05) 和极显著偏分离( P0. 01) 各占总标记的 51. 8% 和 40. 4% 。而且各染色体上均存在偏分离的标记，数目为 2 10 个，第3、第 9、第 10 和

5、 第 11 染 色 体 的 偏 分 离 概 率为 63.6% 70. 0% ，所以在第 3、第 9、第 10 和第11 染色体上存在标记偏分离的热点区域。u从偏分离的方向来看，偏向母本的标记有 19 个，而偏向父本的有 54 个，分 别 占 偏 分 离 标 记 的26. 0% 和 74% 。除第 4、第 5、第 6、第 7 和第 12 染色体上发生偏分离的标记较多偏向母本 TD70 外，其余染色体上大多偏向父本 Kasalath。Results and Analysis Analysis of genotype dataFig.1 Distribution of maternal allele

6、 frequency in the RIL populationResults and Analysis Construction of molecular genetic linkage mapResults and Analysis Construction of molecular genetic linkage mapFig.2 Linkage map of rice constructed in this studyResults and Analysis Construction of molecular genetic linkage mapFig.2 Linkage map o

7、f rice constructed in this studyResults and Analysis Construction of molecular genetic linkage mapFig.2 Linkage map of rice constructed in this studyResults and Analysis Phenotype analysis of tiller angleFig.3 Parent materials According to the genotype data of tiller angle, the tiller angle of TD70

8、was (8.720.51) and the average tiller angle of male parent Kasalath was(20.43 0.44) , with extremely significant difference. Results and Analysis Phenotype analysis of tiller angleFig.4 Distribution of tiller angle in the TD70/Kasalath RIL populationResults and Analysis QTL mapping for tiller angle 利用该 RIL群体共检测到分蘖角度的 3 个 QTL