pbs系统使用文档

1、曙光信息产业有限公司地址：北京市海淀筐水磨西街開号电话.8610-62536383传真曙光信息产业有限公司地址：北京市海淀筐水磨西街開号电话.8610-62536383传真作业管理系统（PBS+MAUI）使用说明用户篇i曙光信息产业有限公司地址：北京市海淀筐水磨西街開号电话.8610-62536383传真曙光信息产业有限公司地址：北京市海淀筐水磨西街開号电话.8610-62536383传真、本文档符号说日H:1、命令、代码和超链接采用斜体五号字表示2、二、PBS脚本编辑pbs系统通过脚本方式提交作业，因此，在发起作业之前，需要编写pbs系统能够识别的脚本。1、作业脚本：1.1串行作业：(tes

2、t.pb)#!/bin/sh#PBS-Ntest/pbs任务名#PBS-lnodes=1:ppn=1/指定一个节点与一个处理器核心进行计算echoThisjobis$PBS_JOBID$PBS_QUEUEcd$PBS_O_WORKDIRtouchtest.tmp/修改为执行文件1.2并行作业：(test2.pb)#!/bin/sh#PBS-Ntest2/pbs任务名#PBS-lnodes=5:ppn=4/指定5个节点，每节点4个处理器核心进行计算#PBS-qgnode21cd$PBS_O_WORKDIR/opt/mpich1.2.7/bin/mpirun-np20-machinefile$PB

3、S_NODEFILE./cpi/修改为可执行并行文件1.3单进程多线程作业：#!/bin/sh#PBS-Ntest3/pbs任务名#PBS-lnodes=1:ppn=4cd$PBS_O_WORKDIR/划分1个节点，每节点4个处理器核心的计算资源2./XXX修改为可执行文件1.4多进程多线程作业:#!/bin/sh#PBS-Ntest3/pbs任务名#PBS-lnodes=5:ppn=1/划分5个节点，每节点1个处理器核心的计算资源让pbs自动扩充计算需要的线程#PBS-qgnode21cd$PBS_O_WORKDIR/opt/mpich1.2.7/bin/mpirun-np20-machin

4、efile$PBS_NODEFILE./XXX/修改为可执行并行文件2、pbs命令:2.1发作业$qsubtest.pb查看作业状态$showq查看节点状态$pbsnodes-a2.4删除作业$canceljobID3、其他特殊需求3.1当需要对作业运行所在节点进行预处理时，如需要在运行作业前source某个配置文件，可采用在pbs脚本中添加命令的方式实现，如下（红色为添加部分）:#PBS-Ntest#PBS-lnodes=3:ppn=1echoThisjobis$PBS_JOBID$PBS_QUEUEforiin$(uniq$PBS_NODEFILE)dorsh$isourceXXXX3曙光信息产业有限公司地址：北京市海淀筐水磨西街開号电话.8610-62536383传真曙光信息产业有限公司地址：北京市海淀筐水磨西街開号电话.8610-62536383传真donempirun执行实际任务!4、三