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文档简介

1、NetworkX是一个用Python语言开发的图论与复杂网络建模工具,内置 了常用的图与复杂网络分析算法,可以方便的进行复杂网络数据分析、 仿真建模等工作。我已经用了它一段时间了,感觉还不错(除了速度有 点慢),下面介绍我的一些使用经验,与大家分享。一、NetworkX及Python开发环境的安装首先至U HYPERLINK /pypi/networkx/T%5e /pypi/networkx/T networkx-1.1-py2.6.egg, 至 U HYPERLINK /projects/pywin32/ /projects/pywin32/下 载pywin32-214.win32-py2

2、.6.exe。如果要用 Networkx 的制图功能,还要去 下 载 matplotlib 和 numpy , 地 址 分 别 在 HYPERLINK /projects/matplotlib/ /projects/matplotlib/和 HYPERLINK /projects/numpy/filesZo /projects/numpy/filesZo 注意都要用 Python 2.6 版本 的。上边四个包中,pywin32、matplotlib和numpy是exe文件,按提示一路 next,比较容易安装。而NetworkX是个egg文件,安装稍微麻烦,需 要用easyinstall安装。具

3、体方法:启动 DOS控制台(在“运行”里输入cmd ),输入 C:Python26Libsite-packageseasy_install.py C:networkx-1.1-py2.6.egg, 回车后会自动执行安装。注意我是把networkx-1.1-py2.6.egg放到了 C 盘根日录,读者在安装时应该具体根据情况修改路径。安装完成后,启动“开始-程序-ActiveState ActivePython 2.6 (32-bit)- PythonWin Editor”,在 shell 中输入:import networkx as nxprint nx如果能输出:说明Networkx已经安装

4、好了,可以正常调用。关于Python语言,如果没有接触过可以找一本Python的语法书来看看 (推荐Python精要参考(第二版),网上有电子版)。这个语言很简单 易学,只要有点编程基础,几天就可以学会它,然后就可以自如的运用 它调用 NetworkX 了。二、建立图或网络1、无向图在PythonWin的Shell里输入:import networkx as nx #导入NetworkX包,为了少打几个字母,将其重 命名为nxG = nx.Graph() #建立一个空的无向图GG.add_node(1) #添加一个节点 1G.add_edge(2,3) #添加一条边2-3 (隐含着添加了两个节

5、点2、3)G.add_edge(3,2) #对于无向图,边3-2与边2-3被认为是一条边print G.nodes() #输出全部的节点:1, 2, 3print G.edges() #输出全部的边:(2, 3)print G.number_of_edges() #输出边的数量:1这样就可以建立一个简单的无向图了。如果你的数据是存在文件里的, 可以循环从文件中读取节点和边添加到G中。2、有向图有向图的建立方式和无向图基本类似,只是在上述代码的第二行,将G =nx.Graph()改为G = nx.DiGraph()。需要注意的是,此时再添加边3-2 与边2-3,则被认为是两条不同的边(可以试着运

6、行上述代码,自己查 看结果)。同时,有向图和无向图是可以相互转化的,分别用到Graph.to_undirected() 和 Graph.to_directed()两个方法。3、加权图(网络)有向图和无向图都可以给边赋予权重,用到的方法是 add_weighted_edges_from,它接受1个或多个三元组u,v,w 作为参数, 其中u是起点,v是终点,w是权重。例如:G.add_weighted_edges_from(0,1,3.0),(1,2,7.5)添加0-1和1-2两条边,权重分别是3.0和7.5。如果想读取权重,可以使用get_edge_data方法,它接受两个参数u和v, 即边的起

7、讫点。例如:print G.get_edge_data(1,2) #输出weight: 7.5,这是一个字典结构,可以 查看python语法了解它的用法。三、调用图算法NetworkX提供了常用的图论经典算法,例如DFS、BFS、最短路、最 小生成树、最大流等等,非常丰富,如果不做复杂网络,只作图论方面 的工作,也可以应用NetworkX作为基本的开发包。具体的算法调用方 法我就不介绍了,可以浏览 NX 的在线手册 HYPERLINK /reference/algorithms.html%ef%bc%8c%e5%af%b9%e6%af%8f%e4%b8%aa%e7%ae%97%e6%b3%95%e9%83%bd%e6%8f%90%e4%be%9b%e4%ba%86 /reference/algorithms.html,对每个算法都提供了 详细的帮助文档和示例。下面只给出一个最短路算法的例子:path=nx.all_pairs_shortest_path(G) #调用多源最短路径算法,计算图G所 有节点间的最短路径print path02 #输出节点0、2之间的最短路径序列:0, 1, 2四、小结这是我作为NetworkX学习笔记的第一部

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