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1、蛋白质化学2 蛋白质化学2.1 氨基酸2.2 肽2.3 蛋白质的分子结构2.4 蛋白质结构与功能的关系2.5 蛋白质的重要性质2.6 蛋白质的分类2.7 蛋白质的分离提纯及应用蛋白质是生命活动的体现者酶是以蛋白质为主要成分的生物催化剂结构蛋白参与细胞和组织的建成运动蛋白与肌肉收缩和细胞运动有关高等动物的抗体、补体、干扰素具有防御功能某些蛋白质具有运输功能，如血红蛋白、肌红蛋白激素及受体具有接受和传递信息的功能参与基因表达调控的蛋白质，如转录因子等种子储藏蛋白、卵白蛋白、血浆蛋白等储藏氨基酸和蛋白质Proteins have widely diverse forms and functions.

2、enzymes(酶), hormones(激素,荷尔蒙), antibodies(抗体), transporters(转运蛋白),muscle(肌肉), lens protein of eyes(眼睛晶状体), spider webs(蜘蛛网), rhinoceros horn(犀牛角), antibiotics(抗生素),mushroom poisons(蘑菇毒素).Erythrocytes（红细胞） contain a large amount of hemoglobins（血红蛋白）, the oxygen-transporting protein.电子显微镜下的蛋白质2.1 氨基酸2.

3、1.1 蛋白质氨基酸的结构及分类2.1.2 氨基酸的理化性质2.1 氨基酸2.1.1 蛋白质氨基酸的结构及分类2.1.2 氨基酸的理化性质L氨基酸光学活性介质入射光的偏振面 出射光的偏振面Gly, 甘氨酸Ala, 丙氨酸Val, 缬氨酸Leu, 亮氨酸Ile, 异亮氨酸Met, 蛋氨酸 甲硫氨酸非极性 aaLys, 赖氨酸 Arg, 精氨酸 His, 组氨酸碱性 aaAsp, 天冬氨酸 Glu, 谷氨酸酸性 aaSer, 丝氨酸Thr, 苏氨酸Cys, 半胱氨酸Pro, 脯氨酸Asn, 天冬酰胺Gln, 谷氨酰胺极性 不带电荷aaPhe, 苯丙氨酸 Tyr, 酪氨酸 Trp, 色氨酸芳香族 a

4、a2C 甘3C 丙 丝 半 色 酪 苯 组4C 天 天 苏5C 谷 谷 脯 缬 蛋6C 亮 异 赖 精Glycine (Gly, G)甘氨酸Alanine (Ala, A)丙氨酸Valine (Val, V)缬氨酸Leucine (Leu, L)亮氨酸Isoleucine (Ile, I) 异亮氨酸Methionine(Met, M)蛋氨酸Proline (Pro, P)脯氨酸Cysteine (Cys, C)半胱氨酸Hydrophobic, aliphatic amino acidsPhenylalanine (Phe,F)苯丙氨酸Tyrosine (Tyr, Y) 酪氨酸Tryptopha

5、n (Trp, W)色氨酸Hydrophobic, aromatic amino acidsArginine (Arg, R) 精氨酸Lysine (Lys, K) 赖氨酸Histidine (His, H) 组氨酸Aspartate (Asp, D) 天冬氨酸Glutamate (Glu, E) 谷氨酸Polar, charged amino acidSerine (Ser, S) 丝氨酸Threonine (Thr, T) 苏氨酸Asparagine (Asn, N) 天冬酰胺Glutamine (Gln, Q) 谷氨酰胺Polar, uncharged amino acid稀有氨基酸2.

6、1 氨基酸2.1.1 蛋白质氨基酸的结构及分类2.1.2 氨基酸的理化性质L氨基酸Henderson-Hasselbach equationpI = (pK1+pK2)/2An acidic amino acid pI=(pK1+pKR)/2A basic amino acid pI=(pKR+pK2)/2Phe, F, 苯丙氨酸; Tyr, Y, 酪氨酸; Trp, W, 色氨酸Lambert-Beers law:A=Log Io/I = ecle, extinction coefficient; c, concentration; l, optical lengthSequencing s

7、trategeThe polypeptide is to broken down into smaller fragments.The smaller fragments are then sequenced by Edman degradation.The complete sequence is assembled by analyzing overlapping fragments.2 蛋白质化学2.1 氨基酸2.2 肽2.3 蛋白质的分子结构2.4 蛋白质结构与功能的关系2.5 蛋白质的重要性质2.6 蛋白质的分类2.7 蛋白质的分离提纯及应用肽键肽单位氨基酸残基主链侧链氨基端，羧基端

8、2. Many short peptides have important biological activities2.1 Some short peptides, such as neuropeptides （神经肽）, act as neurotransmitters（神经传递素）, neurohormones（神经激素）, and neuromodulators. 2.2 Some short peptides act as antibiotics Gramicidin(短杆菌肽) A (15-residue) is a well studied peptide antibiotic

9、Its structure has been determined. It contains alternating L- and D-amino acid residues. It is not synthesized on ribosomes! 2.3 Many short peptides are used as defensive poisons.2.3.1 a-Amanitin (鹅膏蕈碱) (8-residue, circular) in mushroom is an extremely toxic peptide (inhibiting RNA polymerases II an

10、d III at olar levels!)2.3.2 Very toxic short peptides are also found in snake venom, spider.2.4 Many vertebrate hormones are small polypeptides. Insulin (胰岛素)(51-residue) is produced by the pancreas and acts to lower blood glucose level. Glucagon (胰高血糖素) (29-residue) is also produced by the pancreas

11、 and acts to increase the blood glucose level.2 蛋白质化学2.1 氨基酸2.2 肽2.3 蛋白质的分子结构2.4 蛋白质结构与功能的关系2.5 蛋白质的重要性质2.6 蛋白质的分类2.7 蛋白质的分离提纯及应用2.3 蛋白质的分子结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质构象和维持构象的作用力2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.4 蛋白质的三级结构2.3.5 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.6 蛋白质的四级结构蛋白质的分子量及肽链数蛋白质的氨基酸组成2.3 蛋白质的分子结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质构象和维持构象的作

12、用力2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.4 蛋白质的三级结构2.3.5 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.6 蛋白质的四级结构2.3 蛋白质的分子结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质构象和维持构象的作用力2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.4 蛋白质的三级结构2.3.5 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.6 蛋白质的四级结构2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.1 多肽链折叠的空间限制2.3.2 蛋白质构象单元 螺旋 折叠 转角 无规则卷曲2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.1 多肽链折叠的空间限制2.3.2 蛋白质构象单元 螺旋 折叠 转角 无规则卷曲2.3.3 蛋白质的二级结构

13、2.3.1 多肽链折叠的空间限制2.3.2 蛋白质构象单元 螺旋 折叠 转角 无规则卷曲Relative probabilities that a given amino acid will occur in the three common types of secondary structure.2.3 蛋白质的分子结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质构象和维持构象的作用力2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.4 蛋白质的三级结构2.3.5 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.6 蛋白质的四级结构2.3 蛋白质的分子结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质构象和维持构象

14、的作用力2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.4 蛋白质的三级结构2.3.5 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.6 蛋白质的四级结构2.3 蛋白质的分子结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质构象和维持构象的作用力2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.4 蛋白质的三级结构2.3.5 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.6 蛋白质的四级结构2.3 蛋白质的分子结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质构象和维持构象的作用力2.3.3 蛋白质的二级结构2.3.4 蛋白质的三级结构2.3.5 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.6 蛋白质的四级结构血红蛋白2 蛋白质化学2.1 氨基酸2.2

15、 肽2.3 蛋白质的分子结构2.4 蛋白质结构与功能的关系2.5 蛋白质的重要性质2.6 蛋白质的分类2.7 蛋白质的分离提纯及应用2 蛋白质化学2.1 氨基酸2.2 肽2.3 蛋白质的分子结构2.4 蛋白质结构与功能的关系2.5 蛋白质的重要性质2.6 蛋白质的分类2.7 蛋白质的分离提纯及应用2 蛋白质化学2.1 氨基酸2.2 肽2.3 蛋白质的分子结构2.4 蛋白质结构与功能的关系2.5 蛋白质的重要性质2.6 蛋白质的分类2.7 蛋白质的分离提纯及应用UltracentrifugationGel filtration chromatography交联的葡聚糖凝胶凝胶过滤层析凝胶颗粒 凝胶颗粒内部的网状结构Ion exchange chromatographyAffi